Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2WS40

Protein Details
Accession V2WS40    Localization Confidence Medium Confidence Score 11
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-170LSSRSQRWTRRNAAKKEEKKKEEPKKLSKEERFTKIRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
130-164KKKSLSSRSQRWTRRNAAKKEEKKKEEPKKLSKEE
Subcellular Location(s) nucl 10.5, cyto_nucl 10.5, cyto 9.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
KEGG mrr:Moror_8759  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MTDRPGEFWKNEKMDLLLAFDPEAKKVTWGDFVDNFKMLFEPLDTALEAQLKLQDLKMKERADEYMYQFLYLAKQTGYNDAAQIIAFKRGLPRSLVLKIMTRPEGAPTTIKDWMSAAIIFDESYKQALEKKKSLSSRSQRWTRRNAAKKEEKKKEEPKKLSKEERFTKIRALVNDQMEEEKSMLLDLMEQEGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.32
3 0.31
4 0.23
5 0.19
6 0.19
7 0.2
8 0.19
9 0.17
10 0.18
11 0.13
12 0.15
13 0.16
14 0.17
15 0.21
16 0.22
17 0.25
18 0.29
19 0.33
20 0.33
21 0.32
22 0.3
23 0.23
24 0.22
25 0.18
26 0.13
27 0.1
28 0.09
29 0.09
30 0.1
31 0.1
32 0.1
33 0.11
34 0.12
35 0.11
36 0.1
37 0.1
38 0.11
39 0.11
40 0.12
41 0.16
42 0.16
43 0.22
44 0.29
45 0.28
46 0.28
47 0.29
48 0.3
49 0.28
50 0.31
51 0.29
52 0.28
53 0.27
54 0.26
55 0.24
56 0.23
57 0.2
58 0.16
59 0.13
60 0.07
61 0.09
62 0.1
63 0.13
64 0.14
65 0.13
66 0.12
67 0.12
68 0.12
69 0.09
70 0.1
71 0.07
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.12
76 0.13
77 0.14
78 0.14
79 0.15
80 0.17
81 0.18
82 0.2
83 0.17
84 0.18
85 0.19
86 0.2
87 0.2
88 0.17
89 0.15
90 0.16
91 0.16
92 0.15
93 0.15
94 0.13
95 0.15
96 0.18
97 0.17
98 0.15
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.12
103 0.09
104 0.07
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.12
114 0.19
115 0.24
116 0.28
117 0.32
118 0.39
119 0.44
120 0.48
121 0.53
122 0.56
123 0.6
124 0.65
125 0.7
126 0.72
127 0.74
128 0.79
129 0.78
130 0.8
131 0.8
132 0.78
133 0.79
134 0.81
135 0.84
136 0.86
137 0.87
138 0.84
139 0.84
140 0.86
141 0.87
142 0.87
143 0.87
144 0.87
145 0.87
146 0.89
147 0.9
148 0.88
149 0.87
150 0.84
151 0.83
152 0.78
153 0.69
154 0.67
155 0.63
156 0.6
157 0.53
158 0.52
159 0.5
160 0.49
161 0.49
162 0.43
163 0.38
164 0.34
165 0.31
166 0.24
167 0.17
168 0.13
169 0.11
170 0.1
171 0.08
172 0.08
173 0.08