FuNGI

V2XCM0

Protein Details

Accession

V2XCM0

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
412-435	KDCPDAPKKDKRKQEEPRKMTKEE	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
418-433	PKKDKRKQEEPRKMTK

Subcellular Location(s)

nucl 13.5, cyto_nucl 11.5, cyto 8.5, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR021109 Peptidase_aspartic_dom_sf IPR005162 Retrotrans_gag_dom IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR000477 RT_dom IPR041577 RT_RNaseH_2 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding
KEGG	mrr:Moror_7674 -
Pfam	View protein in Pfam PF03732 Retrotrans_gag PF17919 RT_RNaseH_2 PF08284 RVP_2 PF00078 RVT_1 PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50878 RT_POL PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd00303 retropepsin_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3 cd01647 RT_LTR

Amino Acid Sequences

MGLDKTSRRNEQQLEKDIAEAETRWRGQPTQSISNPGGRAIPPLTRASRRELLTPLQSPSLTSQQLTETQAEGPETRRTSTPSFTPTGLTTTEQEEEPSPNTLKPSDSDTLNISTDSQEELDPFQRLLQGLKNSPRSPKIQTEAMAEDKKPSGSRPRKEEPVAEEAVIGSAMPVQVVSAVKEVKAALPRAFTGTQKDAKKFLREVLIYVALNPKAFPDDRSKKLFLLSYMTDRPGEFWKNDKTDLLLAFDPDAEKVTWSEFLDDFRTSFEPLDPALKAQLDLKDLKMKERADEYTYQFTYLAKQTGYNDAAQIVAFKRGLLRSLVFKIMTRPEGAPTTIKDWMNAAIIFDESYKQALEYGKTWDDEHGGKKPQRSFRKKEDVAIKQIGEIDRKEYMSKGLCFRCGRSGHRIKDCPDAPKKDKRKQEEPRKMTKEERFAKIRALVNDQLKEDKDFLIDLMEQEAKMDRNSMHIPLKYKVGTKDIETKALLDSGAGGRFISPSIARTLGKRWIRLPEKIRVFNVDGTANKTAWITHVVELEFQIAGKEFRENFMISGIGDEEMILGLPWLRHHNPVINWETGEIQFQPRQWIQIKRFMGILDTLEPEVLIGAKTTASQEMAHQHQTVKKEIEELIPNYLLGYKDRFEKGKAERFPPSRTYNHAIDLKPDFIPRNCKLYPLSPIEQQEQDKFLEENLRKGYIQKSKSPMASPFFFVAKKEKGALRPTQDYRELNKGTVKNAYPLPLISELLDKLKGATVFTKLDLRNGYNNVRIKDGDQWKAAFKTNRGLFEPTVMFFGLSNSPATFQAFMNDVLSDFIDEGWCVVYMDDILVFSKNPEEHRERTERLMRRLKEHDLFLKPEKCEFDVTEVVFLGMVIRPGYIAMDPIKLAGIADWEPPQTVKGVCAFLGFGNFYRKFIGKYAHITRPLNDLLQKNRKFEWTAQCQIAFELLKAKFLSEPILVMPDVDKPFVIEADASKWATGAVLRQKGIDGEWHPCGYLSKSLSPTERNYEIYDQELLAIYRALMEWRHYLMGGKFKIVILSDHKNLTYFRTAQKLNRRQVRWSLFLLEFDLGLVHVPGKSISQADALSR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.7
2	0.63
3	0.59
4	0.51
5	0.44
6	0.36
7	0.27
8	0.24
9	0.26
10	0.27
11	0.28
12	0.3
13	0.31
14	0.33
15	0.41
16	0.43
17	0.45
18	0.46
19	0.5
20	0.5
21	0.54
22	0.5
23	0.43
24	0.39
25	0.3
26	0.31
27	0.28
28	0.29
29	0.26
30	0.32
31	0.38
32	0.41
33	0.43
34	0.47
35	0.51
36	0.5
37	0.5
38	0.48
39	0.48
40	0.49
41	0.5
42	0.45
43	0.41
44	0.39
45	0.36
46	0.36
47	0.37
48	0.31
49	0.27
50	0.26
51	0.26
52	0.3
53	0.31
54	0.28
55	0.22
56	0.22
57	0.23
58	0.24
59	0.22
60	0.21
61	0.26
62	0.26
63	0.27
64	0.28
65	0.32
66	0.34
67	0.37
68	0.4
69	0.38
70	0.39
71	0.37
72	0.38
73	0.34
74	0.32
75	0.29
76	0.26
77	0.22
78	0.22
79	0.23
80	0.21
81	0.22
82	0.21
83	0.22
84	0.21
85	0.24
86	0.22
87	0.22
88	0.24
89	0.24
90	0.24
91	0.22
92	0.27
93	0.26
94	0.26
95	0.26
96	0.27
97	0.29
98	0.28
99	0.26
100	0.21
101	0.18
102	0.17
103	0.17
104	0.15
105	0.12
106	0.12
107	0.15
108	0.17
109	0.18
110	0.17
111	0.17
112	0.18
113	0.18
114	0.2
115	0.23
116	0.26
117	0.32
118	0.4
119	0.48
120	0.48
121	0.55
122	0.57
123	0.56
124	0.56
125	0.57
126	0.54
127	0.51
128	0.5
129	0.49
130	0.48
131	0.51
132	0.48
133	0.4
134	0.38
135	0.34
136	0.34
137	0.3
138	0.3
139	0.34
140	0.41
141	0.49
142	0.54
143	0.61
144	0.67
145	0.7
146	0.7
147	0.65
148	0.61
149	0.55
150	0.46
151	0.38
152	0.3
153	0.26
154	0.2
155	0.13
156	0.07
157	0.05
158	0.05
159	0.05
160	0.04
161	0.04
162	0.07
163	0.08
164	0.09
165	0.11
166	0.12
167	0.12
168	0.14
169	0.14
170	0.16
171	0.2
172	0.23
173	0.21
174	0.22
175	0.23
176	0.27
177	0.29
178	0.26
179	0.28
180	0.31
181	0.37
182	0.41
183	0.43
184	0.45
185	0.48
186	0.53
187	0.48
188	0.47
189	0.47
190	0.42
191	0.41
192	0.38
193	0.38
194	0.31
195	0.31
196	0.31
197	0.24
198	0.23
199	0.21
200	0.17
201	0.17
202	0.18
203	0.2
204	0.25
205	0.33
206	0.39
207	0.46
208	0.47
209	0.43
210	0.46
211	0.46
212	0.36
213	0.34
214	0.31
215	0.31
216	0.31
217	0.32
218	0.3
219	0.27
220	0.28
221	0.28
222	0.29
223	0.24
224	0.27
225	0.34
226	0.36
227	0.38
228	0.36
229	0.33
230	0.33
231	0.32
232	0.3
233	0.22
234	0.19
235	0.18
236	0.18
237	0.16
238	0.12
239	0.13
240	0.09
241	0.09
242	0.09
243	0.1
244	0.12
245	0.13
246	0.15
247	0.14
248	0.16
249	0.18
250	0.18
251	0.17
252	0.17
253	0.18
254	0.16
255	0.16
256	0.15
257	0.13
258	0.14
259	0.16
260	0.14
261	0.13
262	0.14
263	0.14
264	0.13
265	0.15
266	0.17
267	0.17
268	0.19
269	0.2
270	0.25
271	0.26
272	0.29
273	0.32
274	0.31
275	0.3
276	0.34
277	0.34
278	0.31
279	0.36
280	0.36
281	0.38
282	0.37
283	0.35
284	0.3
285	0.27
286	0.27
287	0.25
288	0.22
289	0.15
290	0.17
291	0.18
292	0.24
293	0.25
294	0.22
295	0.19
296	0.17
297	0.17
298	0.15
299	0.15
300	0.1
301	0.11
302	0.11
303	0.1
304	0.13
305	0.13
306	0.15
307	0.15
308	0.16
309	0.17
310	0.2
311	0.22
312	0.2
313	0.2
314	0.23
315	0.25
316	0.25
317	0.23
318	0.21
319	0.21
320	0.23
321	0.24
322	0.21
323	0.19
324	0.21
325	0.25
326	0.24
327	0.21
328	0.2
329	0.2
330	0.2
331	0.19
332	0.15
333	0.1
334	0.1
335	0.1
336	0.09
337	0.09
338	0.07
339	0.07
340	0.07
341	0.06
342	0.09
343	0.1
344	0.12
345	0.12
346	0.17
347	0.18
348	0.19
349	0.19
350	0.18
351	0.19
352	0.2
353	0.22
354	0.23
355	0.29
356	0.31
357	0.36
358	0.43
359	0.49
360	0.57
361	0.64
362	0.66
363	0.69
364	0.77
365	0.73
366	0.73
367	0.73
368	0.68
369	0.66
370	0.62
371	0.52
372	0.41
373	0.42
374	0.37
375	0.29
376	0.24
377	0.19
378	0.17
379	0.18
380	0.18
381	0.15
382	0.18
383	0.2
384	0.22
385	0.26
386	0.26
387	0.32
388	0.33
389	0.34
390	0.37
391	0.37
392	0.38
393	0.42
394	0.5
395	0.5
396	0.58
397	0.6
398	0.55
399	0.6
400	0.59
401	0.57
402	0.56
403	0.57
404	0.55
405	0.61
406	0.69
407	0.68
408	0.73
409	0.72
410	0.75
411	0.78
412	0.83
413	0.84
414	0.81
415	0.84
416	0.82
417	0.78
418	0.75
419	0.7
420	0.69
421	0.64
422	0.63
423	0.56
424	0.51
425	0.5
426	0.48
427	0.46
428	0.38
429	0.37
430	0.36
431	0.36
432	0.37
433	0.34
434	0.31
435	0.27
436	0.26
437	0.22
438	0.17
439	0.13
440	0.11
441	0.1
442	0.09
443	0.09
444	0.07
445	0.09
446	0.09
447	0.08
448	0.08
449	0.09
450	0.08
451	0.08
452	0.1
453	0.08
454	0.12
455	0.13
456	0.17
457	0.2
458	0.21
459	0.25
460	0.24
461	0.28
462	0.25
463	0.27
464	0.25
465	0.25
466	0.24
467	0.23
468	0.32
469	0.29
470	0.31
471	0.28
472	0.26
473	0.23
474	0.22
475	0.19
476	0.09
477	0.09
478	0.07
479	0.07
480	0.06
481	0.06
482	0.06
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.05
487	0.06
488	0.08
489	0.1
490	0.1
491	0.11
492	0.14
493	0.21
494	0.24
495	0.25
496	0.26
497	0.33
498	0.37
499	0.42
500	0.44
501	0.44
502	0.48
503	0.49
504	0.47
505	0.42
506	0.4
507	0.34
508	0.32
509	0.25
510	0.19
511	0.2
512	0.21
513	0.17
514	0.15
515	0.14
516	0.12
517	0.11
518	0.13
519	0.11
520	0.11
521	0.13
522	0.13
523	0.13
524	0.13
525	0.13
526	0.09
527	0.08
528	0.06
529	0.05
530	0.05
531	0.05
532	0.08
533	0.07
534	0.08
535	0.1
536	0.1
537	0.1
538	0.1
539	0.1
540	0.07
541	0.08
542	0.07
543	0.05
544	0.05
545	0.04
546	0.04
547	0.03
548	0.03
549	0.03
550	0.02
551	0.03
552	0.03
553	0.04
554	0.09
555	0.1
556	0.12
557	0.13
558	0.17
559	0.18
560	0.24
561	0.26
562	0.23
563	0.22
564	0.21
565	0.21
566	0.17
567	0.17
568	0.11
569	0.11
570	0.12
571	0.12
572	0.16
573	0.15
574	0.19
575	0.23
576	0.3
577	0.31
578	0.38
579	0.38
580	0.35
581	0.35
582	0.31
583	0.26
584	0.19
585	0.17
586	0.1
587	0.1
588	0.09
589	0.08
590	0.08
591	0.07
592	0.06
593	0.05
594	0.04
595	0.03
596	0.03
597	0.03
598	0.04
599	0.05
600	0.05
601	0.06
602	0.06
603	0.08
604	0.12
605	0.15
606	0.16
607	0.17
608	0.18
609	0.21
610	0.23
611	0.25
612	0.22
613	0.2
614	0.2
615	0.21
616	0.22
617	0.23
618	0.21
619	0.2
620	0.18
621	0.18
622	0.16
623	0.16
624	0.13
625	0.1
626	0.11
627	0.1
628	0.14
629	0.17
630	0.18
631	0.18
632	0.25
633	0.31
634	0.38
635	0.41
636	0.4
637	0.46
638	0.49
639	0.51
640	0.5
641	0.48
642	0.42
643	0.44
644	0.45
645	0.39
646	0.41
647	0.42
648	0.36
649	0.35
650	0.34
651	0.3
652	0.26
653	0.26
654	0.24
655	0.2
656	0.28
657	0.26
658	0.32
659	0.3
660	0.31
661	0.31
662	0.32
663	0.36
664	0.34
665	0.35
666	0.32
667	0.34
668	0.35
669	0.37
670	0.35
671	0.31
672	0.26
673	0.24
674	0.21
675	0.19
676	0.17
677	0.21
678	0.2
679	0.23
680	0.23
681	0.25
682	0.23
683	0.26
684	0.32
685	0.32
686	0.35
687	0.36
688	0.39
689	0.42
690	0.44
691	0.45
692	0.42
693	0.39
694	0.37
695	0.33
696	0.29
697	0.27
698	0.25
699	0.24
700	0.25
701	0.22
702	0.22
703	0.23
704	0.25
705	0.28
706	0.34
707	0.38
708	0.38
709	0.43
710	0.45
711	0.46
712	0.49
713	0.47
714	0.45
715	0.48
716	0.43
717	0.37
718	0.41
719	0.38
720	0.33
721	0.36
722	0.33
723	0.27
724	0.28
725	0.28
726	0.22
727	0.21
728	0.22
729	0.17
730	0.17
731	0.14
732	0.14
733	0.13
734	0.14
735	0.14
736	0.11
737	0.1
738	0.12
739	0.12
740	0.11
741	0.12
742	0.14
743	0.15
744	0.16
745	0.22
746	0.2
747	0.24
748	0.25
749	0.26
750	0.28
751	0.31
752	0.33
753	0.33
754	0.38
755	0.35
756	0.34
757	0.32
758	0.29
759	0.34
760	0.38
761	0.35
762	0.33
763	0.34
764	0.35
765	0.37
766	0.41
767	0.35
768	0.3
769	0.35
770	0.37
771	0.39
772	0.38
773	0.4
774	0.34
775	0.35
776	0.34
777	0.25
778	0.23
779	0.19
780	0.16
781	0.12
782	0.14
783	0.11
784	0.11
785	0.11
786	0.1
787	0.11
788	0.12
789	0.13
790	0.12
791	0.11
792	0.12
793	0.12
794	0.13
795	0.12
796	0.12
797	0.11
798	0.1
799	0.1
800	0.08
801	0.07
802	0.06
803	0.06
804	0.05
805	0.05
806	0.05
807	0.05
808	0.05
809	0.05
810	0.05
811	0.05
812	0.05
813	0.05
814	0.05
815	0.05
816	0.06
817	0.06
818	0.06
819	0.1
820	0.12
821	0.14
822	0.21
823	0.27
824	0.3
825	0.38
826	0.44
827	0.43
828	0.49
829	0.56
830	0.56
831	0.6
832	0.66
833	0.61
834	0.61
835	0.64
836	0.64
837	0.59
838	0.57
839	0.55
840	0.5
841	0.53
842	0.54
843	0.54
844	0.47
845	0.47
846	0.45
847	0.39
848	0.37
849	0.33
850	0.31
851	0.3
852	0.29
853	0.26
854	0.23
855	0.21
856	0.17
857	0.16
858	0.11
859	0.07
860	0.07
861	0.06
862	0.06
863	0.06
864	0.06
865	0.07
866	0.06
867	0.08
868	0.09
869	0.1
870	0.1
871	0.1
872	0.11
873	0.09
874	0.09
875	0.07
876	0.09
877	0.09
878	0.11
879	0.12
880	0.12
881	0.13
882	0.13
883	0.14
884	0.13
885	0.12
886	0.12
887	0.14
888	0.15
889	0.15
890	0.15
891	0.15
892	0.13
893	0.15
894	0.15
895	0.13
896	0.21
897	0.21
898	0.21
899	0.24
900	0.25
901	0.24
902	0.27
903	0.31
904	0.27
905	0.35
906	0.42
907	0.46
908	0.52
909	0.52
910	0.5
911	0.5
912	0.47
913	0.42
914	0.4
915	0.39
916	0.42
917	0.51
918	0.54
919	0.51
920	0.52
921	0.53
922	0.51
923	0.54
924	0.54
925	0.52
926	0.55
927	0.55
928	0.53
929	0.48
930	0.45
931	0.41
932	0.31
933	0.22
934	0.23
935	0.2
936	0.22
937	0.22
938	0.23
939	0.2
940	0.2
941	0.23
942	0.16
943	0.16
944	0.14
945	0.16
946	0.15
947	0.14
948	0.14
949	0.17
950	0.18
951	0.17
952	0.16
953	0.15
954	0.16
955	0.16
956	0.16
957	0.1
958	0.1
959	0.13
960	0.17
961	0.17
962	0.16
963	0.15
964	0.15
965	0.14
966	0.14
967	0.17
968	0.22
969	0.27
970	0.27
971	0.28
972	0.29
973	0.29
974	0.29
975	0.29
976	0.23
977	0.23
978	0.27
979	0.27
980	0.26
981	0.26
982	0.28
983	0.24
984	0.27
985	0.26
986	0.28
987	0.32
988	0.36
989	0.4
990	0.43
991	0.45
992	0.45
993	0.45
994	0.42
995	0.42
996	0.42
997	0.39
998	0.37
999	0.33
1000	0.26
1001	0.23
1002	0.22
1003	0.18
1004	0.14
1005	0.13
1006	0.1
1007	0.09
1008	0.09
1009	0.1
1010	0.1
1011	0.13
1012	0.16
1013	0.18
1014	0.19
1015	0.18
1016	0.23
1017	0.25
1018	0.33
1019	0.31
1020	0.29
1021	0.29
1022	0.28
1023	0.3
1024	0.26
1025	0.26
1026	0.24
1027	0.3
1028	0.32
1029	0.34
1030	0.34
1031	0.34
1032	0.34
1033	0.35
1034	0.36
1035	0.33
1036	0.34
1037	0.4
1038	0.44
1039	0.51
1040	0.61
1041	0.66
1042	0.68
1043	0.74
1044	0.72
1045	0.71
1046	0.77
1047	0.76
1048	0.7
1049	0.63
1050	0.6
1051	0.51
1052	0.49
1053	0.44
1054	0.34
1055	0.26
1056	0.21
1057	0.17
1058	0.11
1059	0.1
1060	0.09
1061	0.07
1062	0.07
1063	0.08
1064	0.08
1065	0.09
1066	0.12
1067	0.12
1068	0.13
1069	0.15

V2XCM0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer