Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2WMD7

Protein Details
Accession V2WMD7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
72-91GSSTPKPKPREERTQTQMMIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR043128  Rev_trsase/Diguanyl_cyclase  
IPR000477  RT_dom  
IPR041577  RT_RNaseH_2  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG mrr:Moror_5689  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13975  gag-asp_proteas  
PF17919  RT_RNaseH_2  
PF00078  RVT_1  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50878  RT_POL  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00303  retropepsin_like  
cd09274  RNase_HI_RT_Ty3  
cd01647  RT_LTR  
Amino Acid Sequences MSSLLGHEEMTDIKEHPVEETQNNSTPESIAEESPANKNFRPPEEKNENLPEESTSSSFFSAYEEETMSKGGSSTPKPKPREERTQTQMMIEISTAVLEEMEKKKNKESKVAAPDPFEGDRKDTKRVMEEGTESKDLQSQEWRNAIDAEAQIKIEEAKMTDRADNYINDFRVMADESGYDDQALIHIFCKGLPNSLSAKILNQPQGRPADLEGWYKAAIRYDEQYKYYEAVQKPKRFRITDDKKKKVSINHMTNQLSEEERKKYMANGRCFRCAKQGHMSRDCPTKTGGDRKEEKKKLSAREAYVKIQAIVREQEAQEQTELLDIMEAEAKQSRNSMHIPLSYNDEIGKVGTNALLDSGAGGLFMSPEKATKLGLGRKQLPHQIKVFNVDGTANKTAWITQSVTANYTIGTKQMTDTFLISGLGKEDVILGLPWLQKYNPEVDWITGRTTFPSKRYIKIPRVHGILDFEASEELIHRVDIRAKLSTSQRLEHSVEKVSPDAPAEIPSYLSQYHGQFEDKEAERFPISRPCDHAIKLKLEFMPQDCKVYSLMALEQTELDAFLKENLHKGYIRKSKSPMASPFFFVGKKEKGKLRPTQDYRRLNHGTVKNAYPLPLVSDLIDKLKDATIFSKLDLRNRYNNVWIKDGDQWKAAFKTNRGLFEPTVMFFGLMNSPATFQAFMDDVLQDFMAEGWCLVYMDDILIYSEMAEQHRDRTIRLLQRLKEQDLYLKPHKCKFDVQEIDFLGLVIKPGQISMDPTKLAGISDWPAPKTVTGVRSFTGFTNFYRKFIGNYLAIAKPLYDLTKKGIPFNWTKDCEMAFQTLKRRFQQEPVLQLPDPKKVFIIETDASKWASGGVLRQQGPDGELHPCGYISHAFDATERNYEIYDRELFTIVCALETWRHHLMEGPHPVTVLCDHKNLTYFRTAQKLNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.16
3 0.18
4 0.22
5 0.26
6 0.27
7 0.32
8 0.35
9 0.4
10 0.42
11 0.4
12 0.35
13 0.31
14 0.28
15 0.28
16 0.25
17 0.19
18 0.19
19 0.21
20 0.23
21 0.29
22 0.33
23 0.32
24 0.31
25 0.38
26 0.42
27 0.48
28 0.55
29 0.53
30 0.58
31 0.64
32 0.67
33 0.67
34 0.7
35 0.65
36 0.57
37 0.53
38 0.45
39 0.37
40 0.36
41 0.29
42 0.22
43 0.2
44 0.19
45 0.18
46 0.16
47 0.16
48 0.15
49 0.15
50 0.15
51 0.15
52 0.15
53 0.16
54 0.17
55 0.15
56 0.13
57 0.11
58 0.13
59 0.18
60 0.24
61 0.33
62 0.43
63 0.52
64 0.57
65 0.66
66 0.73
67 0.75
68 0.8
69 0.78
70 0.78
71 0.76
72 0.8
73 0.72
74 0.62
75 0.57
76 0.46
77 0.39
78 0.29
79 0.22
80 0.13
81 0.12
82 0.1
83 0.06
84 0.06
85 0.05
86 0.12
87 0.16
88 0.25
89 0.3
90 0.32
91 0.42
92 0.49
93 0.52
94 0.56
95 0.58
96 0.6
97 0.66
98 0.71
99 0.66
100 0.62
101 0.6
102 0.55
103 0.5
104 0.43
105 0.34
106 0.31
107 0.37
108 0.37
109 0.41
110 0.4
111 0.41
112 0.44
113 0.45
114 0.44
115 0.39
116 0.4
117 0.39
118 0.41
119 0.4
120 0.34
121 0.31
122 0.32
123 0.28
124 0.26
125 0.3
126 0.29
127 0.33
128 0.37
129 0.37
130 0.34
131 0.34
132 0.32
133 0.27
134 0.25
135 0.21
136 0.18
137 0.17
138 0.16
139 0.15
140 0.15
141 0.11
142 0.11
143 0.1
144 0.12
145 0.16
146 0.18
147 0.21
148 0.21
149 0.22
150 0.24
151 0.24
152 0.27
153 0.3
154 0.28
155 0.26
156 0.25
157 0.23
158 0.22
159 0.22
160 0.17
161 0.11
162 0.1
163 0.13
164 0.15
165 0.14
166 0.12
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.11
171 0.08
172 0.07
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.14
177 0.14
178 0.17
179 0.17
180 0.2
181 0.23
182 0.25
183 0.27
184 0.22
185 0.24
186 0.24
187 0.29
188 0.34
189 0.34
190 0.32
191 0.36
192 0.39
193 0.38
194 0.34
195 0.3
196 0.27
197 0.27
198 0.28
199 0.23
200 0.22
201 0.21
202 0.21
203 0.2
204 0.19
205 0.17
206 0.16
207 0.2
208 0.24
209 0.27
210 0.28
211 0.29
212 0.27
213 0.27
214 0.28
215 0.32
216 0.29
217 0.36
218 0.44
219 0.5
220 0.56
221 0.63
222 0.68
223 0.61
224 0.65
225 0.66
226 0.68
227 0.71
228 0.75
229 0.76
230 0.71
231 0.75
232 0.73
233 0.69
234 0.69
235 0.68
236 0.66
237 0.63
238 0.67
239 0.63
240 0.59
241 0.52
242 0.43
243 0.35
244 0.3
245 0.29
246 0.24
247 0.24
248 0.25
249 0.24
250 0.28
251 0.34
252 0.39
253 0.44
254 0.49
255 0.52
256 0.59
257 0.61
258 0.56
259 0.57
260 0.51
261 0.47
262 0.49
263 0.54
264 0.54
265 0.59
266 0.61
267 0.56
268 0.61
269 0.56
270 0.47
271 0.4
272 0.36
273 0.35
274 0.42
275 0.42
276 0.42
277 0.5
278 0.57
279 0.66
280 0.67
281 0.64
282 0.63
283 0.65
284 0.64
285 0.66
286 0.64
287 0.58
288 0.62
289 0.62
290 0.57
291 0.54
292 0.47
293 0.38
294 0.33
295 0.29
296 0.22
297 0.2
298 0.18
299 0.18
300 0.17
301 0.22
302 0.21
303 0.21
304 0.18
305 0.17
306 0.15
307 0.12
308 0.12
309 0.07
310 0.06
311 0.04
312 0.05
313 0.07
314 0.06
315 0.07
316 0.1
317 0.1
318 0.1
319 0.12
320 0.13
321 0.14
322 0.16
323 0.19
324 0.18
325 0.21
326 0.24
327 0.23
328 0.29
329 0.26
330 0.24
331 0.21
332 0.19
333 0.16
334 0.13
335 0.13
336 0.06
337 0.06
338 0.07
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.06
356 0.06
357 0.06
358 0.09
359 0.14
360 0.2
361 0.24
362 0.29
363 0.35
364 0.38
365 0.41
366 0.47
367 0.45
368 0.43
369 0.43
370 0.4
371 0.35
372 0.36
373 0.34
374 0.26
375 0.22
376 0.19
377 0.17
378 0.18
379 0.18
380 0.14
381 0.13
382 0.13
383 0.13
384 0.13
385 0.14
386 0.11
387 0.11
388 0.15
389 0.15
390 0.16
391 0.16
392 0.15
393 0.13
394 0.12
395 0.11
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.08
400 0.1
401 0.11
402 0.1
403 0.1
404 0.1
405 0.09
406 0.1
407 0.09
408 0.07
409 0.07
410 0.06
411 0.05
412 0.05
413 0.05
414 0.04
415 0.04
416 0.04
417 0.03
418 0.06
419 0.07
420 0.08
421 0.08
422 0.08
423 0.1
424 0.11
425 0.14
426 0.12
427 0.14
428 0.14
429 0.14
430 0.16
431 0.16
432 0.16
433 0.13
434 0.13
435 0.12
436 0.16
437 0.17
438 0.17
439 0.25
440 0.26
441 0.28
442 0.36
443 0.43
444 0.47
445 0.51
446 0.55
447 0.5
448 0.51
449 0.48
450 0.41
451 0.35
452 0.27
453 0.22
454 0.16
455 0.11
456 0.08
457 0.08
458 0.07
459 0.05
460 0.05
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.05
465 0.09
466 0.11
467 0.12
468 0.13
469 0.13
470 0.17
471 0.2
472 0.26
473 0.25
474 0.25
475 0.25
476 0.28
477 0.3
478 0.29
479 0.28
480 0.23
481 0.22
482 0.2
483 0.2
484 0.15
485 0.14
486 0.12
487 0.11
488 0.09
489 0.1
490 0.1
491 0.09
492 0.1
493 0.1
494 0.11
495 0.1
496 0.11
497 0.12
498 0.12
499 0.13
500 0.13
501 0.14
502 0.13
503 0.14
504 0.19
505 0.18
506 0.18
507 0.17
508 0.18
509 0.17
510 0.18
511 0.18
512 0.2
513 0.22
514 0.22
515 0.26
516 0.28
517 0.3
518 0.31
519 0.36
520 0.31
521 0.33
522 0.32
523 0.31
524 0.29
525 0.27
526 0.27
527 0.23
528 0.26
529 0.22
530 0.23
531 0.2
532 0.2
533 0.19
534 0.18
535 0.16
536 0.1
537 0.1
538 0.1
539 0.1
540 0.09
541 0.09
542 0.08
543 0.08
544 0.07
545 0.07
546 0.05
547 0.05
548 0.06
549 0.08
550 0.08
551 0.12
552 0.12
553 0.14
554 0.16
555 0.18
556 0.26
557 0.32
558 0.36
559 0.37
560 0.41
561 0.45
562 0.48
563 0.53
564 0.5
565 0.48
566 0.46
567 0.43
568 0.41
569 0.36
570 0.32
571 0.27
572 0.25
573 0.26
574 0.28
575 0.31
576 0.36
577 0.42
578 0.5
579 0.56
580 0.59
581 0.63
582 0.67
583 0.72
584 0.76
585 0.76
586 0.72
587 0.73
588 0.68
589 0.59
590 0.59
591 0.53
592 0.49
593 0.44
594 0.42
595 0.37
596 0.34
597 0.33
598 0.25
599 0.21
600 0.17
601 0.15
602 0.14
603 0.11
604 0.12
605 0.12
606 0.14
607 0.14
608 0.11
609 0.1
610 0.12
611 0.12
612 0.11
613 0.12
614 0.15
615 0.15
616 0.16
617 0.22
618 0.22
619 0.28
620 0.34
621 0.37
622 0.4
623 0.44
624 0.45
625 0.46
626 0.51
627 0.47
628 0.44
629 0.4
630 0.35
631 0.38
632 0.4
633 0.33
634 0.3
635 0.28
636 0.28
637 0.29
638 0.32
639 0.29
640 0.27
641 0.34
642 0.35
643 0.38
644 0.38
645 0.39
646 0.33
647 0.34
648 0.34
649 0.25
650 0.22
651 0.19
652 0.16
653 0.12
654 0.13
655 0.1
656 0.09
657 0.1
658 0.08
659 0.09
660 0.1
661 0.1
662 0.09
663 0.08
664 0.09
665 0.09
666 0.09
667 0.09
668 0.09
669 0.08
670 0.09
671 0.09
672 0.07
673 0.06
674 0.06
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.04
679 0.04
680 0.05
681 0.04
682 0.05
683 0.04
684 0.04
685 0.04
686 0.04
687 0.05
688 0.05
689 0.05
690 0.05
691 0.06
692 0.08
693 0.08
694 0.12
695 0.12
696 0.15
697 0.2
698 0.2
699 0.2
700 0.24
701 0.31
702 0.36
703 0.44
704 0.49
705 0.47
706 0.56
707 0.61
708 0.59
709 0.54
710 0.47
711 0.46
712 0.44
713 0.49
714 0.48
715 0.5
716 0.52
717 0.54
718 0.58
719 0.53
720 0.55
721 0.53
722 0.55
723 0.56
724 0.54
725 0.54
726 0.5
727 0.48
728 0.41
729 0.35
730 0.24
731 0.16
732 0.14
733 0.07
734 0.07
735 0.06
736 0.06
737 0.07
738 0.07
739 0.13
740 0.16
741 0.19
742 0.19
743 0.19
744 0.2
745 0.19
746 0.19
747 0.14
748 0.12
749 0.11
750 0.16
751 0.19
752 0.19
753 0.2
754 0.2
755 0.2
756 0.21
757 0.24
758 0.24
759 0.25
760 0.27
761 0.26
762 0.28
763 0.29
764 0.26
765 0.26
766 0.22
767 0.2
768 0.28
769 0.29
770 0.29
771 0.31
772 0.31
773 0.28
774 0.3
775 0.33
776 0.24
777 0.26
778 0.29
779 0.26
780 0.26
781 0.23
782 0.19
783 0.15
784 0.16
785 0.18
786 0.15
787 0.16
788 0.2
789 0.26
790 0.27
791 0.31
792 0.33
793 0.35
794 0.4
795 0.47
796 0.51
797 0.49
798 0.49
799 0.48
800 0.45
801 0.43
802 0.38
803 0.36
804 0.3
805 0.31
806 0.39
807 0.43
808 0.49
809 0.51
810 0.54
811 0.51
812 0.55
813 0.6
814 0.58
815 0.59
816 0.58
817 0.58
818 0.53
819 0.57
820 0.52
821 0.5
822 0.45
823 0.37
824 0.32
825 0.29
826 0.3
827 0.25
828 0.29
829 0.23
830 0.25
831 0.27
832 0.28
833 0.28
834 0.26
835 0.23
836 0.16
837 0.15
838 0.12
839 0.14
840 0.19
841 0.26
842 0.28
843 0.29
844 0.3
845 0.29
846 0.29
847 0.27
848 0.21
849 0.17
850 0.18
851 0.18
852 0.17
853 0.16
854 0.15
855 0.16
856 0.17
857 0.17
858 0.19
859 0.19
860 0.19
861 0.2
862 0.25
863 0.24
864 0.25
865 0.23
866 0.2
867 0.2
868 0.21
869 0.21
870 0.21
871 0.23
872 0.2
873 0.21
874 0.22
875 0.21
876 0.21
877 0.23
878 0.19
879 0.15
880 0.13
881 0.14
882 0.18
883 0.2
884 0.26
885 0.26
886 0.27
887 0.26
888 0.31
889 0.34
890 0.38
891 0.45
892 0.41
893 0.37
894 0.37
895 0.36
896 0.33
897 0.32
898 0.3
899 0.23
900 0.25
901 0.27
902 0.29
903 0.35
904 0.35
905 0.35
906 0.36
907 0.38
908 0.4
909 0.47