Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2XWD7

Protein Details
Accession V2XWD7    Localization Confidence High Confidence Score 23.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-24MSSTRKLTKKQKKAFAFRERKTGKHydrophilic
89-114IDERITASSRPKKRKRENEKESGEEKBasic
223-249SEARISKLRERNKKLHDQKKGTKSAKTHydrophilic
284-310SENGAVHRGGKRRKTRKPAAKDWGTGVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
7-24LTKKQKKAFAFRERKTGK
97-108SRPKKRKRENEK
229-249KLRERNKKLHDQKKGTKSAKT
291-303RGGKRRKTRKPAA
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034228  Nop6_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG mrr:Moror_413  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12400  RRM_Nop6  
Amino Acid Sequences MSSTRKLTKKQKKAFAFRERKTGKSAKNVSNDMEGNEVPTMENQDMLDLQGDKVEDQAMGGVQEGPKETKKSNVISGSGEGRAKEKVDIDERITASSRPKKRKRENEKESGEEKVESLDQQKSKRRKMDEDKPRYILFLGNLKYTTSVESITAHFSTCDPPPSVRLLTPKTASSSKLTAKSKGCAFLEFANRTALQQALKMHHSKLDGRTINVELTVGGGGNSEARISKLRERNKKLHDQKKGTKSAKTREGESEAPRSQRYSSTSGVGDAPKTKRTWTVGDSSENGAVHRGGKRRKTRKPAAKDWGTGVNAIPVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.91
2 0.92
3 0.91
4 0.84
5 0.85
6 0.79
7 0.72
8 0.69
9 0.68
10 0.64
11 0.64
12 0.69
13 0.66
14 0.7
15 0.7
16 0.64
17 0.61
18 0.55
19 0.46
20 0.4
21 0.32
22 0.26
23 0.23
24 0.2
25 0.14
26 0.14
27 0.16
28 0.12
29 0.14
30 0.11
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.14
35 0.11
36 0.1
37 0.11
38 0.11
39 0.1
40 0.1
41 0.11
42 0.08
43 0.07
44 0.08
45 0.06
46 0.06
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.11
52 0.13
53 0.17
54 0.2
55 0.2
56 0.25
57 0.31
58 0.33
59 0.38
60 0.39
61 0.37
62 0.36
63 0.38
64 0.33
65 0.31
66 0.28
67 0.22
68 0.2
69 0.19
70 0.18
71 0.17
72 0.17
73 0.19
74 0.22
75 0.25
76 0.26
77 0.3
78 0.29
79 0.29
80 0.28
81 0.25
82 0.29
83 0.35
84 0.42
85 0.47
86 0.56
87 0.65
88 0.75
89 0.85
90 0.88
91 0.9
92 0.9
93 0.9
94 0.86
95 0.81
96 0.72
97 0.64
98 0.54
99 0.43
100 0.33
101 0.24
102 0.19
103 0.13
104 0.15
105 0.17
106 0.2
107 0.25
108 0.34
109 0.41
110 0.48
111 0.54
112 0.56
113 0.61
114 0.67
115 0.71
116 0.74
117 0.75
118 0.73
119 0.7
120 0.65
121 0.55
122 0.46
123 0.37
124 0.27
125 0.24
126 0.2
127 0.17
128 0.17
129 0.17
130 0.17
131 0.16
132 0.15
133 0.1
134 0.09
135 0.08
136 0.09
137 0.1
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.09
142 0.1
143 0.11
144 0.11
145 0.12
146 0.11
147 0.11
148 0.13
149 0.16
150 0.16
151 0.16
152 0.2
153 0.21
154 0.23
155 0.24
156 0.23
157 0.24
158 0.24
159 0.24
160 0.22
161 0.23
162 0.24
163 0.3
164 0.31
165 0.34
166 0.34
167 0.37
168 0.36
169 0.37
170 0.33
171 0.26
172 0.26
173 0.25
174 0.31
175 0.28
176 0.27
177 0.24
178 0.23
179 0.22
180 0.21
181 0.18
182 0.11
183 0.12
184 0.14
185 0.15
186 0.19
187 0.21
188 0.2
189 0.22
190 0.24
191 0.25
192 0.26
193 0.32
194 0.3
195 0.3
196 0.32
197 0.3
198 0.28
199 0.24
200 0.2
201 0.11
202 0.1
203 0.09
204 0.06
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.06
213 0.1
214 0.13
215 0.22
216 0.3
217 0.4
218 0.5
219 0.58
220 0.66
221 0.71
222 0.79
223 0.81
224 0.82
225 0.83
226 0.83
227 0.85
228 0.85
229 0.87
230 0.8
231 0.77
232 0.76
233 0.74
234 0.74
235 0.67
236 0.61
237 0.56
238 0.57
239 0.55
240 0.52
241 0.51
242 0.45
243 0.46
244 0.44
245 0.4
246 0.36
247 0.35
248 0.35
249 0.32
250 0.3
251 0.3
252 0.3
253 0.29
254 0.3
255 0.27
256 0.25
257 0.27
258 0.28
259 0.29
260 0.3
261 0.31
262 0.33
263 0.36
264 0.4
265 0.37
266 0.41
267 0.4
268 0.44
269 0.44
270 0.41
271 0.4
272 0.34
273 0.3
274 0.24
275 0.21
276 0.21
277 0.25
278 0.3
279 0.36
280 0.46
281 0.57
282 0.66
283 0.75
284 0.82
285 0.87
286 0.89
287 0.91
288 0.92
289 0.91
290 0.89
291 0.82
292 0.75
293 0.72
294 0.62
295 0.53
296 0.43