FuNGI

V2W292

Protein Details

Accession

V2W292

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
627-650	LDLLKDYIKKHKLKPRDPIPTQPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0003964 F:RNA-directed DNA polymerase activity GO:0015074 P:DNA integration
KEGG	mrr:Moror_15868 -
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE
CDD	cd18972 CD_POL_like cd09274 RNase_HI_RT_Ty3

Amino Acid Sequences

MPDVDKPFVIEADASKWATGAVLRQKGVDGEWHPCRYLSKSFSPAERNYEIYDRELLAIYRALMEWRHYLMGGKFKVVILSDHKNLTYFRTAQKLNRRQARWSLFLSEFDLGLVHVPGKSISQADALSRRSNEQDEIDNDNEDVVVLLDRFFIRGINLELKDDIVERLGPDDFHKSALEQLLHQGVPPIKSALSDWKIENDLLFFQNRVYVLNDTDLRRRIVQSIHETPGVGHPGQWNTTEQVQRDFWWPGMVKFIKSFVDGCATCQQSKINTHPTRTPIQPIQAPQNSFPFQVCTMDLITDLPECDGMDSILVVVDHSSTKGVIFTPCAKTTDATKVAEMLIQHLYKRFGLPDRIISDRDPRFAAEVFQEMGKQLSIKHSMSTAFHPQTDGETERVNRELEVYLRMFCAKEQTRWKEYLSLAEFAHNNRTHSVLKKSPFFMMMGYHPRPLLTVFERTTIPSIEERLQELKRIREETTGLLELARQHMIRREKQKLDVFEKGQKVWLEAKNLATGYPSRKLAPKREGPFAILEVLGPVTYKLDLPHQWKIHPVFHAALLSPYKQTEAHGPSFTEPPPDLIEEFEEYEVDAIAGHRPKKRPREFLVSYTGYDLSHNRWIRMEGMENCLDLLKDYIKKHKLKPRDPIPTQPS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.18
3	0.18
4	0.17
5	0.16
6	0.15
7	0.19
8	0.24
9	0.29
10	0.3
11	0.3
12	0.32
13	0.32
14	0.32
15	0.31
16	0.25
17	0.28
18	0.35
19	0.37
20	0.37
21	0.37
22	0.39
23	0.37
24	0.43
25	0.41
26	0.41
27	0.46
28	0.49
29	0.55
30	0.59
31	0.58
32	0.58
33	0.54
34	0.49
35	0.45
36	0.46
37	0.41
38	0.36
39	0.35
40	0.28
41	0.26
42	0.25
43	0.21
44	0.18
45	0.17
46	0.15
47	0.13
48	0.12
49	0.12
50	0.12
51	0.15
52	0.17
53	0.18
54	0.18
55	0.17
56	0.21
57	0.23
58	0.31
59	0.29
60	0.28
61	0.27
62	0.26
63	0.28
64	0.24
65	0.24
66	0.22
67	0.28
68	0.3
69	0.31
70	0.31
71	0.31
72	0.31
73	0.32
74	0.32
75	0.3
76	0.3
77	0.36
78	0.39
79	0.46
80	0.56
81	0.61
82	0.64
83	0.69
84	0.68
85	0.67
86	0.73
87	0.72
88	0.66
89	0.59
90	0.56
91	0.48
92	0.46
93	0.43
94	0.34
95	0.27
96	0.21
97	0.18
98	0.12
99	0.11
100	0.1
101	0.07
102	0.06
103	0.07
104	0.07
105	0.08
106	0.09
107	0.09
108	0.1
109	0.11
110	0.12
111	0.16
112	0.21
113	0.23
114	0.26
115	0.26
116	0.28
117	0.29
118	0.31
119	0.3
120	0.27
121	0.3
122	0.29
123	0.34
124	0.32
125	0.3
126	0.27
127	0.24
128	0.21
129	0.15
130	0.12
131	0.06
132	0.05
133	0.05
134	0.05
135	0.07
136	0.07
137	0.07
138	0.07
139	0.07
140	0.07
141	0.09
142	0.13
143	0.18
144	0.19
145	0.19
146	0.19
147	0.19
148	0.19
149	0.18
150	0.15
151	0.09
152	0.09
153	0.08
154	0.1
155	0.1
156	0.1
157	0.11
158	0.16
159	0.15
160	0.16
161	0.16
162	0.15
163	0.17
164	0.21
165	0.2
166	0.15
167	0.17
168	0.19
169	0.18
170	0.18
171	0.19
172	0.17
173	0.17
174	0.18
175	0.16
176	0.13
177	0.14
178	0.15
179	0.2
180	0.21
181	0.22
182	0.22
183	0.23
184	0.25
185	0.25
186	0.23
187	0.16
188	0.15
189	0.14
190	0.14
191	0.12
192	0.1
193	0.12
194	0.12
195	0.12
196	0.13
197	0.12
198	0.12
199	0.16
200	0.2
201	0.2
202	0.25
203	0.26
204	0.26
205	0.26
206	0.26
207	0.25
208	0.25
209	0.29
210	0.32
211	0.35
212	0.35
213	0.34
214	0.33
215	0.3
216	0.3
217	0.27
218	0.19
219	0.15
220	0.16
221	0.17
222	0.18
223	0.19
224	0.17
225	0.15
226	0.21
227	0.23
228	0.21
229	0.23
230	0.22
231	0.23
232	0.25
233	0.24
234	0.19
235	0.21
236	0.21
237	0.17
238	0.24
239	0.24
240	0.21
241	0.21
242	0.23
243	0.19
244	0.19
245	0.19
246	0.12
247	0.17
248	0.16
249	0.19
250	0.23
251	0.24
252	0.23
253	0.23
254	0.24
255	0.21
256	0.25
257	0.27
258	0.32
259	0.33
260	0.36
261	0.39
262	0.41
263	0.42
264	0.4
265	0.4
266	0.32
267	0.32
268	0.32
269	0.31
270	0.35
271	0.35
272	0.34
273	0.3
274	0.33
275	0.31
276	0.28
277	0.26
278	0.2
279	0.17
280	0.16
281	0.15
282	0.11
283	0.1
284	0.1
285	0.09
286	0.08
287	0.08
288	0.07
289	0.06
290	0.05
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.04
295	0.04
296	0.03
297	0.03
298	0.03
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.04
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.05
310	0.06
311	0.06
312	0.08
313	0.12
314	0.15
315	0.16
316	0.18
317	0.17
318	0.17
319	0.19
320	0.25
321	0.24
322	0.21
323	0.2
324	0.19
325	0.19
326	0.2
327	0.17
328	0.12
329	0.12
330	0.11
331	0.12
332	0.13
333	0.14
334	0.13
335	0.14
336	0.13
337	0.13
338	0.17
339	0.18
340	0.21
341	0.23
342	0.24
343	0.25
344	0.25
345	0.3
346	0.27
347	0.28
348	0.23
349	0.21
350	0.21
351	0.2
352	0.19
353	0.12
354	0.12
355	0.11
356	0.1
357	0.1
358	0.09
359	0.09
360	0.08
361	0.07
362	0.06
363	0.1
364	0.14
365	0.14
366	0.14
367	0.15
368	0.16
369	0.18
370	0.21
371	0.25
372	0.22
373	0.22
374	0.22
375	0.21
376	0.21
377	0.22
378	0.2
379	0.13
380	0.15
381	0.16
382	0.17
383	0.18
384	0.17
385	0.14
386	0.14
387	0.14
388	0.12
389	0.15
390	0.14
391	0.13
392	0.13
393	0.14
394	0.13
395	0.11
396	0.19
397	0.18
398	0.24
399	0.33
400	0.4
401	0.43
402	0.45
403	0.46
404	0.43
405	0.41
406	0.42
407	0.35
408	0.31
409	0.27
410	0.28
411	0.28
412	0.23
413	0.31
414	0.24
415	0.23
416	0.21
417	0.25
418	0.25
419	0.28
420	0.34
421	0.32
422	0.35
423	0.38
424	0.39
425	0.37
426	0.35
427	0.31
428	0.25
429	0.21
430	0.22
431	0.26
432	0.25
433	0.25
434	0.24
435	0.24
436	0.23
437	0.22
438	0.21
439	0.16
440	0.21
441	0.2
442	0.23
443	0.23
444	0.24
445	0.25
446	0.2
447	0.19
448	0.15
449	0.17
450	0.18
451	0.19
452	0.21
453	0.24
454	0.24
455	0.29
456	0.31
457	0.33
458	0.35
459	0.37
460	0.36
461	0.33
462	0.35
463	0.31
464	0.32
465	0.28
466	0.22
467	0.2
468	0.19
469	0.17
470	0.18
471	0.17
472	0.12
473	0.13
474	0.2
475	0.28
476	0.35
477	0.43
478	0.49
479	0.52
480	0.6
481	0.65
482	0.66
483	0.65
484	0.65
485	0.6
486	0.59
487	0.58
488	0.5
489	0.48
490	0.41
491	0.37
492	0.37
493	0.36
494	0.34
495	0.33
496	0.34
497	0.32
498	0.32
499	0.29
500	0.23
501	0.23
502	0.23
503	0.26
504	0.26
505	0.25
506	0.32
507	0.38
508	0.46
509	0.51
510	0.56
511	0.55
512	0.61
513	0.61
514	0.56
515	0.52
516	0.44
517	0.36
518	0.26
519	0.22
520	0.14
521	0.13
522	0.1
523	0.08
524	0.07
525	0.06
526	0.07
527	0.07
528	0.08
529	0.14
530	0.2
531	0.26
532	0.35
533	0.37
534	0.38
535	0.45
536	0.48
537	0.48
538	0.44
539	0.41
540	0.34
541	0.33
542	0.34
543	0.26
544	0.26
545	0.23
546	0.22
547	0.2
548	0.19
549	0.19
550	0.18
551	0.19
552	0.24
553	0.27
554	0.31
555	0.31
556	0.33
557	0.33
558	0.37
559	0.36
560	0.32
561	0.26
562	0.24
563	0.24
564	0.25
565	0.22
566	0.2
567	0.22
568	0.2
569	0.21
570	0.18
571	0.16
572	0.13
573	0.13
574	0.12
575	0.09
576	0.07
577	0.06
578	0.11
579	0.17
580	0.22
581	0.29
582	0.37
583	0.47
584	0.58
585	0.67
586	0.71
587	0.74
588	0.79
589	0.78
590	0.76
591	0.75
592	0.67
593	0.58
594	0.51
595	0.44
596	0.34
597	0.3
598	0.27
599	0.22
600	0.29
601	0.3
602	0.29
603	0.3
604	0.32
605	0.32
606	0.34
607	0.38
608	0.32
609	0.36
610	0.36
611	0.34
612	0.32
613	0.3
614	0.25
615	0.18
616	0.18
617	0.17
618	0.22
619	0.27
620	0.37
621	0.45
622	0.53
623	0.62
624	0.69
625	0.74
626	0.77
627	0.83
628	0.84
629	0.86
630	0.84

V2W292

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer