Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2YSF4

Protein Details
Accession V2YSF4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
288-316GYDRHSSSRYDDRRRDRDRSRSPRSSRRYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
239-240KR
301-314RRDRDRSRSPRSSR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12, cyto 8.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004882  Luc7-rel  
Gene Ontology GO:0005685  C:U1 snRNP  
GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0006376  P:mRNA splice site selection  
KEGG mrr:Moror_1038  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03194  LUC7  
Amino Acid Sequences MGRLAEMQRKLLEQMMGPEAMGVANQNLVWSDEKVCRNFLCGTCPHALFTNTKMDLGACPKSHTERLKQEFLAEREKNPNDPIFHRFQMEYEANIFAFVDECDRRIRAAHRRLEKTPEENAKTTNLMREIAEIELAIQGGTEKIETLGEQGKVEESMREMAAIEALKSEKAEKERELQQLTDTSGASGHQKLRVCDVCGAYLSVLDSDRRLADHFGGKMHLGYHELRNMLAKFKEEREKRKSGPGGGSGSSAPANGNGSVALPTPARSGSDYRSRDEHRDRDRDRDRGYDRHSSSRYDDRRRDRDRSRSPRSSRRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.24
3 0.23
4 0.21
5 0.19
6 0.15
7 0.13
8 0.12
9 0.08
10 0.05
11 0.06
12 0.06
13 0.07
14 0.07
15 0.09
16 0.11
17 0.12
18 0.16
19 0.22
20 0.28
21 0.3
22 0.33
23 0.31
24 0.33
25 0.37
26 0.35
27 0.33
28 0.3
29 0.33
30 0.34
31 0.34
32 0.32
33 0.29
34 0.3
35 0.26
36 0.27
37 0.31
38 0.27
39 0.27
40 0.25
41 0.23
42 0.24
43 0.27
44 0.3
45 0.22
46 0.23
47 0.26
48 0.31
49 0.38
50 0.41
51 0.44
52 0.49
53 0.54
54 0.58
55 0.55
56 0.56
57 0.55
58 0.53
59 0.54
60 0.46
61 0.43
62 0.46
63 0.48
64 0.45
65 0.42
66 0.42
67 0.36
68 0.37
69 0.39
70 0.36
71 0.35
72 0.35
73 0.31
74 0.28
75 0.31
76 0.28
77 0.24
78 0.2
79 0.19
80 0.17
81 0.16
82 0.16
83 0.09
84 0.08
85 0.07
86 0.09
87 0.09
88 0.1
89 0.12
90 0.13
91 0.13
92 0.15
93 0.22
94 0.28
95 0.37
96 0.44
97 0.51
98 0.56
99 0.58
100 0.63
101 0.6
102 0.54
103 0.53
104 0.53
105 0.48
106 0.44
107 0.42
108 0.37
109 0.35
110 0.31
111 0.27
112 0.2
113 0.17
114 0.16
115 0.16
116 0.15
117 0.12
118 0.12
119 0.08
120 0.07
121 0.06
122 0.06
123 0.05
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.04
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.04
132 0.04
133 0.06
134 0.09
135 0.09
136 0.09
137 0.09
138 0.09
139 0.1
140 0.1
141 0.08
142 0.06
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.06
151 0.05
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.09
157 0.12
158 0.15
159 0.15
160 0.2
161 0.27
162 0.32
163 0.32
164 0.3
165 0.28
166 0.27
167 0.26
168 0.23
169 0.16
170 0.11
171 0.09
172 0.1
173 0.1
174 0.11
175 0.12
176 0.15
177 0.17
178 0.18
179 0.24
180 0.26
181 0.26
182 0.27
183 0.26
184 0.23
185 0.21
186 0.21
187 0.14
188 0.12
189 0.1
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.08
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.12
200 0.16
201 0.16
202 0.16
203 0.17
204 0.17
205 0.16
206 0.15
207 0.13
208 0.12
209 0.13
210 0.15
211 0.17
212 0.17
213 0.17
214 0.21
215 0.21
216 0.22
217 0.21
218 0.21
219 0.22
220 0.27
221 0.37
222 0.4
223 0.49
224 0.52
225 0.6
226 0.59
227 0.66
228 0.65
229 0.61
230 0.59
231 0.56
232 0.52
233 0.44
234 0.43
235 0.33
236 0.29
237 0.23
238 0.18
239 0.13
240 0.1
241 0.11
242 0.09
243 0.1
244 0.08
245 0.09
246 0.09
247 0.1
248 0.1
249 0.09
250 0.1
251 0.11
252 0.12
253 0.13
254 0.15
255 0.17
256 0.22
257 0.31
258 0.33
259 0.35
260 0.42
261 0.45
262 0.52
263 0.58
264 0.62
265 0.61
266 0.69
267 0.69
268 0.73
269 0.77
270 0.76
271 0.71
272 0.71
273 0.67
274 0.65
275 0.68
276 0.67
277 0.64
278 0.65
279 0.63
280 0.58
281 0.58
282 0.6
283 0.64
284 0.64
285 0.69
286 0.7
287 0.78
288 0.82
289 0.85
290 0.84
291 0.86
292 0.86
293 0.87
294 0.87
295 0.87
296 0.89