Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2XRF6

Protein Details
Accession V2XRF6    Localization Confidence High Confidence Score 23.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
103-124SASTTRRATRSHKKDEEREDESHydrophilic
138-159VTSERVTTTKRKRDENKETEEVHydrophilic
165-185DDETNKPPRRRVRGNAPGSESHydrophilic
288-317DPEPERKTRSTSPNKRSRGRPPKAVKEAQPHydrophilic
452-474GPVSKAQKPSQRKKPRSAKLDCVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-61KAKRR
294-335KTRSTSPNKRSRGRPPKAVKEAQPQSKGQIRSTSPTKRGRGR
363-371KRGRGRPRK
433-469AKEKEKARASGQRSVRYKPGPVSKAQKPSQRKKPRSA
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 15
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG mrr:Moror_1000  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
Amino Acid Sequences MGPSHAREVFQKLKATTIRDVVRELGDTNWAKATKDEMIETLVKSMVGEDGMAEEKKAKRRTLAGSSREKAPGTQTAPVPGLATRKRKHAAEEVEADEGADESASTTRRATRSHKKDEEREDESISAVRTTRSGVQAVTSERVTTTKRKRDENKETEEVGDSISDDETNKPPRRRVRGNAPGSESISSPARLAREAATSRTTRTEIQSVEESPSRITRSKAQTQKTVSQSTRTTRDATRKTDNESPSRATRNRGATSSRVESSTRGRRAATSASDAEEAEEEGEEEEDPEPERKTRSTSPNKRSRGRPPKAVKEAQPQSKGQIRSTSPTKRGRGRPPNVEDENVDESAESTQVDESVSVAPAKRGRGRPRKTAQLAEDVEEAPQDGPSTDEPRRGRGRPANPSEPAETASTRAHRSIKRPNPYPAYASPVSAAKEKEKARASGQRSVRYKPGPVSKAQKPSQRKKPRSAKLDCVEVPHVPHSWKDDVDGEYDSDPEFVGNSKKEGAGVNMTDATQERAPVPDEEGYQSSAGDDWTLELADGRIRGGRVEMNHQQAAETVAEEHISARIEEIQDAQDVLQASGSDQAGSAQTEETRAEQDAPEDNGSEAGVNGGGGRIEEIQEEPEAQQVLQPEAVIEERSAQVEEIEEAEQEQALEPPVPPQGEEQQVAVDPTRDGAEPSEAVVNQLTPKSTVSQTLEGEEQQLIVEQDTIQSPSSKLQVLASNDEREQTPTSQTPLAPADEQLPDDTENTKLTSLSRSEQEHPGEKADDVVSDEGRAATDAGVEMDKADSPAEIQDATVMEVANGDATETPIAAPSDINEAGPLEQVQVQETVIPVVQRVQETTQETVTNTESETGSTVVAKELVHETVVTTSTADVEMTVDEEPARIDVHETSATVTENEGATLGELGLDVPQEQGEDQVENVGDYSTAAVGDLGRDAEGSANPDTKQATATDPENPQVDLETLVPDVGDRGEQTQLNAPSLLDLHSGPVAVEEQEASPASGLSLDQYAESNEDESAGPEVIPSPAVDGGTELTEDKLPDSPALKPDTLSLHDFHSRPKEPSGPSLMDLHSRPEQDDDFEEFGEEEPEQEIPEAPKSQTTPSLLDLPADKPEALPSVSKEPSPQTPSLLDLHSRPGPGEEEDFDELDPEDDMNGVSVGATPEALGIEIEHDLPNMPSASALESDFGGGTPEALGEVSLASDEMYDYDRMDFGDGFSVGDSVFDVNAHSTTTTGH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.52
3 0.49
4 0.49
5 0.48
6 0.44
7 0.46
8 0.41
9 0.38
10 0.34
11 0.3
12 0.23
13 0.27
14 0.26
15 0.25
16 0.28
17 0.27
18 0.26
19 0.26
20 0.3
21 0.26
22 0.28
23 0.27
24 0.23
25 0.26
26 0.28
27 0.28
28 0.25
29 0.2
30 0.17
31 0.16
32 0.15
33 0.12
34 0.09
35 0.08
36 0.07
37 0.08
38 0.12
39 0.12
40 0.12
41 0.17
42 0.23
43 0.32
44 0.39
45 0.4
46 0.42
47 0.5
48 0.58
49 0.63
50 0.67
51 0.67
52 0.71
53 0.7
54 0.7
55 0.67
56 0.59
57 0.5
58 0.45
59 0.45
60 0.38
61 0.41
62 0.36
63 0.37
64 0.37
65 0.36
66 0.32
67 0.26
68 0.31
69 0.33
70 0.41
71 0.39
72 0.47
73 0.53
74 0.55
75 0.59
76 0.6
77 0.59
78 0.57
79 0.6
80 0.54
81 0.5
82 0.47
83 0.4
84 0.3
85 0.23
86 0.15
87 0.09
88 0.06
89 0.05
90 0.08
91 0.09
92 0.1
93 0.12
94 0.19
95 0.22
96 0.28
97 0.37
98 0.45
99 0.54
100 0.64
101 0.72
102 0.76
103 0.82
104 0.86
105 0.85
106 0.8
107 0.73
108 0.65
109 0.55
110 0.47
111 0.4
112 0.31
113 0.24
114 0.19
115 0.16
116 0.14
117 0.16
118 0.2
119 0.21
120 0.21
121 0.2
122 0.21
123 0.25
124 0.27
125 0.27
126 0.23
127 0.2
128 0.19
129 0.22
130 0.24
131 0.3
132 0.38
133 0.44
134 0.5
135 0.6
136 0.69
137 0.77
138 0.84
139 0.83
140 0.82
141 0.78
142 0.74
143 0.65
144 0.58
145 0.47
146 0.36
147 0.27
148 0.18
149 0.13
150 0.12
151 0.1
152 0.09
153 0.12
154 0.18
155 0.28
156 0.35
157 0.4
158 0.48
159 0.57
160 0.66
161 0.72
162 0.75
163 0.77
164 0.79
165 0.82
166 0.81
167 0.77
168 0.7
169 0.63
170 0.55
171 0.44
172 0.36
173 0.3
174 0.24
175 0.19
176 0.18
177 0.17
178 0.16
179 0.18
180 0.17
181 0.21
182 0.23
183 0.26
184 0.28
185 0.28
186 0.3
187 0.32
188 0.33
189 0.28
190 0.31
191 0.33
192 0.29
193 0.32
194 0.33
195 0.31
196 0.32
197 0.32
198 0.28
199 0.24
200 0.27
201 0.27
202 0.25
203 0.27
204 0.32
205 0.38
206 0.47
207 0.54
208 0.56
209 0.6
210 0.64
211 0.69
212 0.67
213 0.67
214 0.59
215 0.57
216 0.57
217 0.56
218 0.55
219 0.5
220 0.47
221 0.45
222 0.53
223 0.54
224 0.55
225 0.58
226 0.55
227 0.59
228 0.63
229 0.63
230 0.58
231 0.56
232 0.54
233 0.51
234 0.56
235 0.52
236 0.5
237 0.51
238 0.53
239 0.52
240 0.5
241 0.48
242 0.44
243 0.48
244 0.48
245 0.42
246 0.36
247 0.33
248 0.32
249 0.37
250 0.43
251 0.41
252 0.38
253 0.37
254 0.37
255 0.4
256 0.42
257 0.36
258 0.31
259 0.28
260 0.28
261 0.28
262 0.26
263 0.23
264 0.18
265 0.15
266 0.1
267 0.08
268 0.07
269 0.06
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.08
276 0.1
277 0.12
278 0.13
279 0.16
280 0.17
281 0.23
282 0.3
283 0.4
284 0.49
285 0.58
286 0.67
287 0.74
288 0.81
289 0.83
290 0.83
291 0.83
292 0.83
293 0.8
294 0.8
295 0.79
296 0.82
297 0.83
298 0.82
299 0.77
300 0.76
301 0.78
302 0.75
303 0.7
304 0.6
305 0.57
306 0.57
307 0.53
308 0.45
309 0.44
310 0.38
311 0.39
312 0.47
313 0.5
314 0.51
315 0.57
316 0.62
317 0.63
318 0.7
319 0.74
320 0.77
321 0.77
322 0.79
323 0.76
324 0.78
325 0.72
326 0.64
327 0.54
328 0.48
329 0.44
330 0.34
331 0.28
332 0.18
333 0.16
334 0.15
335 0.14
336 0.09
337 0.06
338 0.06
339 0.06
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.11
348 0.14
349 0.19
350 0.25
351 0.32
352 0.42
353 0.52
354 0.58
355 0.66
356 0.7
357 0.76
358 0.73
359 0.72
360 0.64
361 0.62
362 0.57
363 0.49
364 0.44
365 0.33
366 0.28
367 0.21
368 0.19
369 0.1
370 0.09
371 0.07
372 0.05
373 0.07
374 0.09
375 0.15
376 0.16
377 0.23
378 0.24
379 0.31
380 0.37
381 0.37
382 0.44
383 0.48
384 0.54
385 0.57
386 0.64
387 0.64
388 0.6
389 0.61
390 0.55
391 0.47
392 0.4
393 0.32
394 0.25
395 0.21
396 0.21
397 0.21
398 0.2
399 0.23
400 0.27
401 0.29
402 0.36
403 0.45
404 0.5
405 0.57
406 0.61
407 0.65
408 0.65
409 0.63
410 0.61
411 0.52
412 0.5
413 0.42
414 0.36
415 0.3
416 0.25
417 0.24
418 0.22
419 0.22
420 0.17
421 0.24
422 0.25
423 0.31
424 0.32
425 0.33
426 0.36
427 0.43
428 0.45
429 0.47
430 0.51
431 0.52
432 0.52
433 0.53
434 0.54
435 0.48
436 0.46
437 0.44
438 0.46
439 0.4
440 0.43
441 0.47
442 0.48
443 0.55
444 0.57
445 0.6
446 0.61
447 0.68
448 0.74
449 0.78
450 0.78
451 0.79
452 0.84
453 0.85
454 0.85
455 0.81
456 0.8
457 0.72
458 0.72
459 0.62
460 0.56
461 0.49
462 0.4
463 0.35
464 0.27
465 0.25
466 0.18
467 0.18
468 0.19
469 0.18
470 0.18
471 0.18
472 0.19
473 0.18
474 0.19
475 0.19
476 0.15
477 0.13
478 0.14
479 0.12
480 0.09
481 0.08
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.09
486 0.09
487 0.1
488 0.11
489 0.11
490 0.12
491 0.13
492 0.13
493 0.13
494 0.12
495 0.12
496 0.12
497 0.12
498 0.11
499 0.11
500 0.11
501 0.09
502 0.09
503 0.08
504 0.09
505 0.11
506 0.11
507 0.12
508 0.12
509 0.12
510 0.13
511 0.14
512 0.14
513 0.13
514 0.12
515 0.1
516 0.08
517 0.08
518 0.06
519 0.05
520 0.04
521 0.04
522 0.04
523 0.04
524 0.04
525 0.04
526 0.05
527 0.05
528 0.05
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.07
533 0.09
534 0.1
535 0.16
536 0.2
537 0.23
538 0.24
539 0.24
540 0.23
541 0.21
542 0.21
543 0.15
544 0.1
545 0.07
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.06
550 0.05
551 0.06
552 0.05
553 0.05
554 0.07
555 0.07
556 0.07
557 0.08
558 0.08
559 0.08
560 0.08
561 0.07
562 0.08
563 0.08
564 0.07
565 0.07
566 0.06
567 0.06
568 0.08
569 0.08
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.07
574 0.07
575 0.07
576 0.05
577 0.05
578 0.06
579 0.07
580 0.07
581 0.07
582 0.08
583 0.08
584 0.08
585 0.09
586 0.11
587 0.12
588 0.11
589 0.11
590 0.1
591 0.1
592 0.09
593 0.08
594 0.05
595 0.04
596 0.03
597 0.03
598 0.03
599 0.03
600 0.03
601 0.02
602 0.03
603 0.03
604 0.04
605 0.04
606 0.05
607 0.05
608 0.06
609 0.06
610 0.06
611 0.07
612 0.07
613 0.06
614 0.07
615 0.07
616 0.08
617 0.07
618 0.07
619 0.06
620 0.06
621 0.07
622 0.06
623 0.05
624 0.06
625 0.06
626 0.07
627 0.07
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.06
634 0.05
635 0.05
636 0.05
637 0.05
638 0.05
639 0.05
640 0.04
641 0.04
642 0.05
643 0.05
644 0.06
645 0.08
646 0.08
647 0.08
648 0.1
649 0.13
650 0.15
651 0.16
652 0.15
653 0.13
654 0.13
655 0.14
656 0.12
657 0.09
658 0.06
659 0.06
660 0.07
661 0.06
662 0.07
663 0.07
664 0.08
665 0.07
666 0.08
667 0.09
668 0.08
669 0.08
670 0.08
671 0.08
672 0.08
673 0.08
674 0.08
675 0.07
676 0.08
677 0.1
678 0.1
679 0.14
680 0.15
681 0.18
682 0.18
683 0.19
684 0.19
685 0.17
686 0.18
687 0.14
688 0.11
689 0.07
690 0.08
691 0.06
692 0.06
693 0.06
694 0.05
695 0.05
696 0.06
697 0.07
698 0.07
699 0.08
700 0.08
701 0.09
702 0.11
703 0.11
704 0.11
705 0.12
706 0.16
707 0.18
708 0.22
709 0.23
710 0.24
711 0.23
712 0.24
713 0.22
714 0.2
715 0.2
716 0.16
717 0.17
718 0.16
719 0.18
720 0.19
721 0.18
722 0.19
723 0.18
724 0.18
725 0.15
726 0.15
727 0.15
728 0.14
729 0.14
730 0.12
731 0.11
732 0.1
733 0.11
734 0.11
735 0.1
736 0.1
737 0.1
738 0.1
739 0.1
740 0.1
741 0.12
742 0.14
743 0.15
744 0.18
745 0.21
746 0.24
747 0.29
748 0.31
749 0.32
750 0.31
751 0.31
752 0.28
753 0.24
754 0.22
755 0.17
756 0.14
757 0.11
758 0.11
759 0.09
760 0.09
761 0.09
762 0.07
763 0.07
764 0.07
765 0.06
766 0.04
767 0.04
768 0.04
769 0.05
770 0.05
771 0.05
772 0.05
773 0.05
774 0.05
775 0.05
776 0.05
777 0.04
778 0.05
779 0.06
780 0.06
781 0.06
782 0.05
783 0.06
784 0.06
785 0.07
786 0.08
787 0.07
788 0.06
789 0.06
790 0.06
791 0.05
792 0.05
793 0.04
794 0.03
795 0.04
796 0.04
797 0.04
798 0.04
799 0.06
800 0.06
801 0.06
802 0.06
803 0.06
804 0.1
805 0.1
806 0.1
807 0.09
808 0.1
809 0.1
810 0.1
811 0.1
812 0.06
813 0.08
814 0.08
815 0.09
816 0.09
817 0.09
818 0.09
819 0.09
820 0.08
821 0.07
822 0.07
823 0.06
824 0.08
825 0.1
826 0.1
827 0.12
828 0.13
829 0.17
830 0.2
831 0.21
832 0.2
833 0.19
834 0.19
835 0.2
836 0.19
837 0.15
838 0.12
839 0.13
840 0.11
841 0.1
842 0.11
843 0.09
844 0.09
845 0.08
846 0.09
847 0.07
848 0.08
849 0.08
850 0.08
851 0.09
852 0.09
853 0.09
854 0.09
855 0.09
856 0.09
857 0.1
858 0.09
859 0.07
860 0.07
861 0.07
862 0.07
863 0.07
864 0.05
865 0.05
866 0.05
867 0.06
868 0.06
869 0.06
870 0.06
871 0.06
872 0.06
873 0.06
874 0.07
875 0.05
876 0.07
877 0.07
878 0.1
879 0.11
880 0.11
881 0.11
882 0.12
883 0.12
884 0.11
885 0.11
886 0.09
887 0.09
888 0.09
889 0.08
890 0.06
891 0.06
892 0.06
893 0.06
894 0.04
895 0.04
896 0.04
897 0.04
898 0.04
899 0.04
900 0.04
901 0.04
902 0.05
903 0.05
904 0.06
905 0.07
906 0.07
907 0.07
908 0.08
909 0.08
910 0.08
911 0.08
912 0.07
913 0.06
914 0.05
915 0.06
916 0.04
917 0.04
918 0.04
919 0.04
920 0.04
921 0.05
922 0.05
923 0.05
924 0.05
925 0.05
926 0.05
927 0.06
928 0.07
929 0.1
930 0.11
931 0.13
932 0.13
933 0.15
934 0.16
935 0.15
936 0.16
937 0.14
938 0.15
939 0.16
940 0.18
941 0.22
942 0.23
943 0.25
944 0.25
945 0.24
946 0.21
947 0.19
948 0.18
949 0.13
950 0.12
951 0.1
952 0.09
953 0.09
954 0.08
955 0.07
956 0.07
957 0.06
958 0.06
959 0.06
960 0.07
961 0.11
962 0.11
963 0.13
964 0.2
965 0.21
966 0.21
967 0.21
968 0.19
969 0.17
970 0.17
971 0.16
972 0.11
973 0.09
974 0.09
975 0.09
976 0.09
977 0.08
978 0.09
979 0.08
980 0.07
981 0.08
982 0.07
983 0.07
984 0.09
985 0.09
986 0.09
987 0.08
988 0.07
989 0.07
990 0.07
991 0.06
992 0.06
993 0.07
994 0.07
995 0.07
996 0.08
997 0.08
998 0.09
999 0.1
1000 0.1
1001 0.08
1002 0.1
1003 0.09
1004 0.1
1005 0.11
1006 0.1
1007 0.09
1008 0.08
1009 0.09
1010 0.08
1011 0.08
1012 0.07
1013 0.08
1014 0.08
1015 0.09
1016 0.08
1017 0.08
1018 0.09
1019 0.09
1020 0.09
1021 0.08
1022 0.08
1023 0.1
1024 0.1
1025 0.11
1026 0.12
1027 0.13
1028 0.15
1029 0.16
1030 0.18
1031 0.22
1032 0.26
1033 0.26
1034 0.23
1035 0.25
1036 0.27
1037 0.29
1038 0.29
1039 0.25
1040 0.24
1041 0.3
1042 0.3
1043 0.33
1044 0.38
1045 0.39
1046 0.39
1047 0.43
1048 0.46
1049 0.43
1050 0.49
1051 0.5
1052 0.43
1053 0.4
1054 0.42
1055 0.38
1056 0.35
1057 0.33
1058 0.32
1059 0.3
1060 0.28
1061 0.28
1062 0.28
1063 0.27
1064 0.25
1065 0.28
1066 0.29
1067 0.25
1068 0.24
1069 0.24
1070 0.2
1071 0.19
1072 0.18
1073 0.14
1074 0.09
1075 0.09
1076 0.09
1077 0.09
1078 0.09
1079 0.11
1080 0.11
1081 0.16
1082 0.18
1083 0.18
1084 0.22
1085 0.23
1086 0.26
1087 0.29
1088 0.31
1089 0.29
1090 0.29
1091 0.34
1092 0.3
1093 0.3
1094 0.29
1095 0.25
1096 0.26
1097 0.25
1098 0.22
1099 0.17
1100 0.19
1101 0.2
1102 0.19
1103 0.19
1104 0.2
1105 0.26
1106 0.27
1107 0.27
1108 0.28
1109 0.3
1110 0.37
1111 0.41
1112 0.38
1113 0.34
1114 0.34
1115 0.37
1116 0.37
1117 0.34
1118 0.29
1119 0.24
1120 0.29
1121 0.29
1122 0.28
1123 0.25
1124 0.24
1125 0.24
1126 0.25
1127 0.26
1128 0.22
1129 0.24
1130 0.25
1131 0.25
1132 0.23
1133 0.21
1134 0.18
1135 0.16
1136 0.14
1137 0.09
1138 0.07
1139 0.07
1140 0.07
1141 0.07
1142 0.06
1143 0.05
1144 0.05
1145 0.06
1146 0.07
1147 0.07
1148 0.07
1149 0.06
1150 0.07
1151 0.07
1152 0.07
1153 0.06
1154 0.05
1155 0.07
1156 0.07
1157 0.09
1158 0.09
1159 0.09
1160 0.1
1161 0.1
1162 0.12
1163 0.11
1164 0.11
1165 0.1
1166 0.1
1167 0.12
1168 0.13
1169 0.13
1170 0.11
1171 0.11
1172 0.12
1173 0.11
1174 0.1
1175 0.1
1176 0.09
1177 0.08
1178 0.08
1179 0.07
1180 0.07
1181 0.07
1182 0.07
1183 0.05
1184 0.05
1185 0.05
1186 0.05
1187 0.05
1188 0.04
1189 0.05
1190 0.05
1191 0.06
1192 0.08
1193 0.09
1194 0.1
1195 0.11
1196 0.12
1197 0.12
1198 0.14
1199 0.13
1200 0.11
1201 0.15
1202 0.15
1203 0.14
1204 0.14
1205 0.13
1206 0.11
1207 0.11
1208 0.1
1209 0.07
1210 0.07
1211 0.07
1212 0.07
1213 0.09
1214 0.09
1215 0.1
1216 0.1