Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2XHD4

Protein Details
Accession V2XHD4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-285PQPPAPVRTRRPPPKKPSPPPPRQPAAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
203-281PPKAPVRSRPQPAPASKSAAPASVQPSKKGRRPEPSGGEETRNPPSKRSRPSPPPQPQPPAPVRTRRPPPKKPSPPPPR
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 12.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027093  EAF_fam  
IPR019194  Tscrpt_elong_fac_Eaf_N  
Gene Ontology GO:0032783  C:super elongation complex  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG mrr:Moror_8830  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09816  EAF  
Amino Acid Sequences MASTSQWTPAPGRHKVNIGSSLGRALKARKNGGPSQKRSNLPDRDFYSLRYNFKPSSIDSSKSGSIQVKKNKDATHNSIIVEHPVSQTNDVHVYKGREEPAKEWACVLIFDEETGGYTLEKIESFVALEHVEKRAASVSEPSPAPTPSTNRPTTPERENDDLTEMLLNDLTSPQPTPKTNSNPDSEEDIPLTSRVPSRPSQHPPKAPVRSRPQPAPASKSAAPASVQPSKKGRRPEPSGGEETRNPPSKRSRPSPPPQPQPPAPVRTRRPPPKKPSPPPPRQPAALELPGTSSSFIPPAPPSHNVPSPQPPPPEPEPASTVASDSEDDDMVEVSAQPEAEAEPVPDQLSHKIVMIEETGEEHYNDNENEGGEEIDIGELETLMAQHLGEDGQDDGQDYGQDYGHDYGQEDADEGLFPDSPAPEQEIPIPVPMTGGGPISLNQFAGGGAEYDDYSSSEDSDEDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.5
2 0.52
3 0.56
4 0.55
5 0.51
6 0.46
7 0.4
8 0.43
9 0.38
10 0.35
11 0.32
12 0.32
13 0.35
14 0.4
15 0.46
16 0.44
17 0.5
18 0.57
19 0.65
20 0.69
21 0.7
22 0.72
23 0.74
24 0.75
25 0.75
26 0.76
27 0.75
28 0.7
29 0.71
30 0.65
31 0.64
32 0.59
33 0.55
34 0.55
35 0.51
36 0.51
37 0.47
38 0.49
39 0.42
40 0.44
41 0.44
42 0.37
43 0.41
44 0.4
45 0.39
46 0.36
47 0.39
48 0.38
49 0.36
50 0.38
51 0.35
52 0.37
53 0.43
54 0.5
55 0.53
56 0.57
57 0.63
58 0.63
59 0.64
60 0.66
61 0.65
62 0.64
63 0.59
64 0.53
65 0.49
66 0.45
67 0.39
68 0.32
69 0.25
70 0.19
71 0.2
72 0.21
73 0.21
74 0.21
75 0.2
76 0.26
77 0.25
78 0.25
79 0.25
80 0.27
81 0.27
82 0.31
83 0.33
84 0.31
85 0.33
86 0.33
87 0.39
88 0.39
89 0.37
90 0.33
91 0.3
92 0.25
93 0.23
94 0.22
95 0.15
96 0.11
97 0.11
98 0.11
99 0.09
100 0.1
101 0.1
102 0.09
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.07
111 0.07
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.1
117 0.11
118 0.12
119 0.11
120 0.12
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.16
125 0.15
126 0.19
127 0.2
128 0.2
129 0.19
130 0.19
131 0.21
132 0.19
133 0.23
134 0.26
135 0.33
136 0.34
137 0.34
138 0.38
139 0.41
140 0.44
141 0.45
142 0.44
143 0.42
144 0.44
145 0.44
146 0.4
147 0.37
148 0.32
149 0.26
150 0.2
151 0.15
152 0.1
153 0.09
154 0.08
155 0.05
156 0.06
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.08
161 0.12
162 0.14
163 0.18
164 0.25
165 0.33
166 0.39
167 0.43
168 0.45
169 0.43
170 0.43
171 0.45
172 0.38
173 0.31
174 0.24
175 0.2
176 0.17
177 0.15
178 0.14
179 0.09
180 0.11
181 0.11
182 0.14
183 0.18
184 0.23
185 0.31
186 0.39
187 0.48
188 0.53
189 0.57
190 0.6
191 0.65
192 0.69
193 0.66
194 0.66
195 0.64
196 0.65
197 0.64
198 0.62
199 0.59
200 0.57
201 0.56
202 0.53
203 0.47
204 0.44
205 0.41
206 0.4
207 0.34
208 0.27
209 0.25
210 0.21
211 0.23
212 0.25
213 0.24
214 0.24
215 0.31
216 0.35
217 0.39
218 0.45
219 0.46
220 0.48
221 0.55
222 0.59
223 0.59
224 0.59
225 0.6
226 0.53
227 0.5
228 0.43
229 0.39
230 0.37
231 0.39
232 0.34
233 0.33
234 0.41
235 0.46
236 0.51
237 0.54
238 0.58
239 0.59
240 0.68
241 0.74
242 0.74
243 0.75
244 0.75
245 0.75
246 0.68
247 0.66
248 0.63
249 0.58
250 0.53
251 0.53
252 0.51
253 0.54
254 0.61
255 0.65
256 0.69
257 0.73
258 0.78
259 0.8
260 0.86
261 0.86
262 0.87
263 0.87
264 0.87
265 0.86
266 0.85
267 0.77
268 0.69
269 0.62
270 0.55
271 0.5
272 0.43
273 0.35
274 0.26
275 0.24
276 0.22
277 0.21
278 0.17
279 0.11
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.13
286 0.16
287 0.18
288 0.22
289 0.26
290 0.31
291 0.31
292 0.33
293 0.38
294 0.38
295 0.41
296 0.41
297 0.37
298 0.39
299 0.42
300 0.46
301 0.4
302 0.38
303 0.36
304 0.35
305 0.35
306 0.29
307 0.25
308 0.18
309 0.17
310 0.15
311 0.12
312 0.1
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.1
333 0.11
334 0.12
335 0.14
336 0.14
337 0.14
338 0.14
339 0.13
340 0.14
341 0.13
342 0.11
343 0.09
344 0.11
345 0.11
346 0.11
347 0.12
348 0.11
349 0.12
350 0.15
351 0.14
352 0.14
353 0.13
354 0.12
355 0.12
356 0.12
357 0.11
358 0.07
359 0.07
360 0.06
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.05
374 0.05
375 0.05
376 0.05
377 0.06
378 0.06
379 0.07
380 0.08
381 0.08
382 0.08
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.1
387 0.1
388 0.12
389 0.13
390 0.14
391 0.14
392 0.14
393 0.14
394 0.14
395 0.14
396 0.12
397 0.1
398 0.1
399 0.09
400 0.09
401 0.09
402 0.08
403 0.08
404 0.09
405 0.1
406 0.1
407 0.11
408 0.16
409 0.16
410 0.17
411 0.21
412 0.23
413 0.23
414 0.25
415 0.24
416 0.18
417 0.18
418 0.17
419 0.15
420 0.12
421 0.11
422 0.09
423 0.1
424 0.11
425 0.14
426 0.14
427 0.13
428 0.12
429 0.11
430 0.11
431 0.11
432 0.1
433 0.07
434 0.07
435 0.08
436 0.08
437 0.09
438 0.09
439 0.09
440 0.11
441 0.11
442 0.11
443 0.11
444 0.11