Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2XPF1

Protein Details
Accession V2XPF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
263-282SSSPFRQRFKKKFKDLYLPPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
443-465GTRGRGAKRGRNGRGGSRGRGRR
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036279  5-3_exonuclease_C_sf  
IPR008918  HhH2  
IPR029060  PIN-like_dom_sf  
IPR006086  XPG-I_dom  
IPR006084  XPG/Rad2  
IPR019974  XPG_CS  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004519  F:endonuclease activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG mrr:Moror_14270  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00867  XPG_I  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00842  XPG_2  
CDD cd09904  H3TH_XPG  
cd09868  PIN_XPG_RAD2  
Amino Acid Sequences MTEDELEYITDGKGSEKRPSPAPVPVSGATGLLDNKAGGQRRSPSPTNNVNEGGSRPPSPSAEDWDAAQEMDPDAEEGEFARFVSQVKGRDIDDVRREIDEEIKALNEQRKNAMRDSEDITQQMITQIMMMLRLFGIPYITAPMEAEAQCATLVSLGLVNGVITDDSDVFLFGGQRVYKNMFNQSKTVECFLLSDLSRELGLDQGTLIRLAYLLGSDYVEGLPGVGPVVAMELLKEFPGEDGLHKFKDWWTKVQTGRDKEEHSSSPFRQRFKKKFKDLYLPPEWPNSAVRDAYYHPTVDESDEPFKWGLPDLDALREFLREELGWGQSKVDDLLLPIIQRMNKRSKDSASNKQGSLNEFFDVSGGSGTLAPRKRQAYASKRLQQVVSDFRKKRRSASSIPAGDDGDVDNENDAELGGAPPAKRAKSSTSRKGQAQSSPGVTQGTRGRGAKRGRNGRGGSRGRGRRTASAVPSGIGDIDDSDESAEFNQTEATEEPLPLAVDLRPRPKPKPAYRTEASGS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.29
3 0.34
4 0.38
5 0.43
6 0.49
7 0.49
8 0.52
9 0.53
10 0.48
11 0.47
12 0.44
13 0.41
14 0.35
15 0.31
16 0.23
17 0.21
18 0.18
19 0.13
20 0.13
21 0.1
22 0.12
23 0.17
24 0.22
25 0.21
26 0.27
27 0.33
28 0.4
29 0.48
30 0.49
31 0.5
32 0.54
33 0.62
34 0.62
35 0.61
36 0.56
37 0.49
38 0.47
39 0.43
40 0.39
41 0.33
42 0.28
43 0.25
44 0.26
45 0.26
46 0.29
47 0.28
48 0.31
49 0.32
50 0.31
51 0.3
52 0.3
53 0.29
54 0.24
55 0.22
56 0.15
57 0.11
58 0.1
59 0.1
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.07
66 0.07
67 0.07
68 0.07
69 0.08
70 0.09
71 0.14
72 0.18
73 0.21
74 0.24
75 0.27
76 0.27
77 0.34
78 0.36
79 0.38
80 0.4
81 0.39
82 0.37
83 0.35
84 0.36
85 0.29
86 0.31
87 0.24
88 0.19
89 0.17
90 0.16
91 0.16
92 0.2
93 0.26
94 0.24
95 0.25
96 0.32
97 0.38
98 0.41
99 0.43
100 0.44
101 0.4
102 0.4
103 0.43
104 0.39
105 0.34
106 0.31
107 0.29
108 0.23
109 0.21
110 0.19
111 0.14
112 0.09
113 0.07
114 0.08
115 0.07
116 0.08
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.07
121 0.06
122 0.05
123 0.06
124 0.05
125 0.05
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.08
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.09
138 0.08
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.05
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.04
149 0.04
150 0.03
151 0.04
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.06
159 0.05
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.12
164 0.16
165 0.18
166 0.2
167 0.29
168 0.32
169 0.33
170 0.34
171 0.34
172 0.35
173 0.34
174 0.33
175 0.24
176 0.19
177 0.18
178 0.16
179 0.18
180 0.14
181 0.13
182 0.11
183 0.12
184 0.11
185 0.1
186 0.1
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.04
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.03
200 0.03
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.03
211 0.04
212 0.03
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.11
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.15
233 0.16
234 0.24
235 0.25
236 0.27
237 0.29
238 0.35
239 0.39
240 0.47
241 0.51
242 0.46
243 0.49
244 0.47
245 0.45
246 0.4
247 0.4
248 0.33
249 0.31
250 0.32
251 0.29
252 0.36
253 0.38
254 0.4
255 0.45
256 0.53
257 0.6
258 0.65
259 0.73
260 0.73
261 0.78
262 0.8
263 0.81
264 0.76
265 0.74
266 0.69
267 0.63
268 0.54
269 0.47
270 0.42
271 0.33
272 0.29
273 0.23
274 0.18
275 0.15
276 0.14
277 0.14
278 0.15
279 0.18
280 0.17
281 0.15
282 0.13
283 0.14
284 0.14
285 0.14
286 0.14
287 0.13
288 0.16
289 0.15
290 0.17
291 0.16
292 0.16
293 0.14
294 0.13
295 0.11
296 0.08
297 0.11
298 0.11
299 0.14
300 0.14
301 0.14
302 0.13
303 0.13
304 0.12
305 0.1
306 0.1
307 0.07
308 0.09
309 0.1
310 0.12
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.12
315 0.13
316 0.11
317 0.1
318 0.07
319 0.06
320 0.08
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.1
325 0.13
326 0.15
327 0.2
328 0.27
329 0.32
330 0.37
331 0.41
332 0.43
333 0.51
334 0.56
335 0.61
336 0.62
337 0.61
338 0.57
339 0.57
340 0.56
341 0.48
342 0.45
343 0.36
344 0.27
345 0.22
346 0.21
347 0.16
348 0.14
349 0.11
350 0.07
351 0.05
352 0.05
353 0.06
354 0.07
355 0.13
356 0.16
357 0.17
358 0.23
359 0.25
360 0.27
361 0.33
362 0.42
363 0.45
364 0.52
365 0.61
366 0.63
367 0.66
368 0.66
369 0.6
370 0.52
371 0.49
372 0.49
373 0.48
374 0.5
375 0.5
376 0.56
377 0.64
378 0.63
379 0.65
380 0.65
381 0.64
382 0.61
383 0.66
384 0.68
385 0.63
386 0.63
387 0.58
388 0.48
389 0.4
390 0.33
391 0.24
392 0.16
393 0.12
394 0.1
395 0.08
396 0.08
397 0.08
398 0.07
399 0.06
400 0.04
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.08
405 0.08
406 0.13
407 0.17
408 0.18
409 0.19
410 0.22
411 0.3
412 0.38
413 0.48
414 0.54
415 0.6
416 0.65
417 0.69
418 0.72
419 0.69
420 0.65
421 0.6
422 0.55
423 0.49
424 0.44
425 0.39
426 0.35
427 0.3
428 0.29
429 0.29
430 0.29
431 0.3
432 0.32
433 0.34
434 0.4
435 0.48
436 0.51
437 0.56
438 0.62
439 0.63
440 0.69
441 0.71
442 0.71
443 0.73
444 0.7
445 0.68
446 0.68
447 0.7
448 0.66
449 0.7
450 0.66
451 0.62
452 0.63
453 0.63
454 0.57
455 0.56
456 0.51
457 0.43
458 0.4
459 0.34
460 0.27
461 0.19
462 0.14
463 0.08
464 0.09
465 0.09
466 0.08
467 0.09
468 0.08
469 0.09
470 0.09
471 0.11
472 0.09
473 0.09
474 0.1
475 0.1
476 0.13
477 0.13
478 0.17
479 0.16
480 0.16
481 0.17
482 0.17
483 0.17
484 0.14
485 0.15
486 0.12
487 0.19
488 0.25
489 0.32
490 0.4
491 0.46
492 0.51
493 0.6
494 0.69
495 0.72
496 0.76
497 0.77
498 0.77
499 0.74