Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

B2AFU2

Protein Details
Accession B2AFU2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
351-376EEAPVAKEDRPKKKAKKVLPESNDEKBasic
378-401DKEIAERKARLKKQKASAKKAVEVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
322-397KREQKLIKGEKPNIGKKRKSLDAEPEPAAEEAPVAKEDRPKKKAKKVLPESNDEKLDKEIAERKARLKKQKASAKK
Subcellular Location(s) cyto_nucl 12.833, nucl 12.5, cyto 11, mito_nucl 8.166
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023674  Ribosomal_L1-like  
IPR028364  Ribosomal_L1/biogenesis  
IPR016095  Ribosomal_L1_3-a/b-sand  
Gene Ontology GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
KEGG pan:PODANSg1553  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00687  Ribosomal_L1  
CDD cd00403  Ribosomal_L1  
Amino Acid Sequences MSPSAAVTKTAETTVPVNPDQTLKACKALVAHIKKAAAAPPKDGKQNLLADAETTVAETPVWLTLTTKNHIHENNRLQPGKIALPNPLNTSEEVSVCLITADPQRYYKNAVADEFPEELRKKIGRVIDLTHLKAKFKAYEAQRKLFSEHDVFLADDRIINRLPKALGKTFFKTTTKRPIPVVLMAQREKVDGKRVAVPKGFMVKKNKRDPTENANARPTAEIVKEVEKAIGAALVHLTPSTNTAIKVGYAGWEPEKIAENITVVVKELVERFVPQKWSNVRSFYVKGPETAALPVYQTDELWLDESKVVPNGQEGSSALPGKREQKLIKGEKPNIGKKRKSLDAEPEPAAEEAPVAKEDRPKKKAKKVLPESNDEKLDKEIAERKARLKKQKASAKKAVEV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.25
3 0.24
4 0.23
5 0.24
6 0.25
7 0.26
8 0.28
9 0.29
10 0.26
11 0.29
12 0.28
13 0.28
14 0.28
15 0.32
16 0.38
17 0.39
18 0.42
19 0.42
20 0.42
21 0.42
22 0.42
23 0.41
24 0.4
25 0.35
26 0.38
27 0.42
28 0.46
29 0.51
30 0.5
31 0.47
32 0.45
33 0.47
34 0.43
35 0.37
36 0.32
37 0.26
38 0.25
39 0.23
40 0.16
41 0.12
42 0.09
43 0.07
44 0.07
45 0.06
46 0.07
47 0.07
48 0.08
49 0.08
50 0.09
51 0.15
52 0.2
53 0.24
54 0.27
55 0.27
56 0.33
57 0.39
58 0.42
59 0.46
60 0.51
61 0.57
62 0.62
63 0.61
64 0.55
65 0.52
66 0.5
67 0.47
68 0.42
69 0.34
70 0.31
71 0.35
72 0.36
73 0.36
74 0.35
75 0.3
76 0.26
77 0.28
78 0.24
79 0.19
80 0.19
81 0.17
82 0.14
83 0.13
84 0.12
85 0.08
86 0.09
87 0.14
88 0.15
89 0.16
90 0.2
91 0.22
92 0.23
93 0.28
94 0.29
95 0.29
96 0.29
97 0.29
98 0.27
99 0.27
100 0.28
101 0.24
102 0.21
103 0.21
104 0.2
105 0.19
106 0.22
107 0.22
108 0.19
109 0.23
110 0.26
111 0.24
112 0.26
113 0.28
114 0.32
115 0.36
116 0.37
117 0.38
118 0.35
119 0.33
120 0.32
121 0.32
122 0.25
123 0.24
124 0.29
125 0.31
126 0.41
127 0.45
128 0.48
129 0.49
130 0.48
131 0.48
132 0.42
133 0.38
134 0.3
135 0.25
136 0.21
137 0.19
138 0.18
139 0.16
140 0.15
141 0.11
142 0.1
143 0.09
144 0.1
145 0.1
146 0.11
147 0.11
148 0.12
149 0.13
150 0.15
151 0.19
152 0.21
153 0.24
154 0.28
155 0.31
156 0.32
157 0.35
158 0.36
159 0.35
160 0.36
161 0.43
162 0.44
163 0.43
164 0.41
165 0.4
166 0.39
167 0.38
168 0.37
169 0.31
170 0.32
171 0.3
172 0.3
173 0.27
174 0.25
175 0.24
176 0.2
177 0.22
178 0.18
179 0.19
180 0.25
181 0.27
182 0.3
183 0.29
184 0.29
185 0.24
186 0.31
187 0.31
188 0.29
189 0.36
190 0.41
191 0.5
192 0.59
193 0.63
194 0.58
195 0.62
196 0.61
197 0.6
198 0.62
199 0.58
200 0.52
201 0.48
202 0.45
203 0.4
204 0.36
205 0.28
206 0.2
207 0.15
208 0.13
209 0.11
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.13
214 0.1
215 0.1
216 0.09
217 0.08
218 0.06
219 0.05
220 0.05
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.04
226 0.06
227 0.08
228 0.08
229 0.08
230 0.09
231 0.1
232 0.09
233 0.1
234 0.08
235 0.08
236 0.07
237 0.09
238 0.09
239 0.09
240 0.09
241 0.1
242 0.13
243 0.11
244 0.12
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.12
249 0.1
250 0.08
251 0.08
252 0.07
253 0.08
254 0.08
255 0.08
256 0.08
257 0.1
258 0.11
259 0.15
260 0.2
261 0.2
262 0.27
263 0.31
264 0.37
265 0.38
266 0.4
267 0.39
268 0.39
269 0.4
270 0.37
271 0.39
272 0.34
273 0.31
274 0.3
275 0.28
276 0.24
277 0.23
278 0.2
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.12
283 0.11
284 0.09
285 0.1
286 0.1
287 0.1
288 0.11
289 0.11
290 0.1
291 0.11
292 0.12
293 0.12
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.13
298 0.14
299 0.14
300 0.14
301 0.13
302 0.14
303 0.18
304 0.2
305 0.19
306 0.19
307 0.22
308 0.28
309 0.31
310 0.36
311 0.34
312 0.4
313 0.5
314 0.56
315 0.62
316 0.65
317 0.67
318 0.67
319 0.74
320 0.75
321 0.75
322 0.75
323 0.72
324 0.7
325 0.73
326 0.73
327 0.7
328 0.68
329 0.68
330 0.68
331 0.68
332 0.62
333 0.54
334 0.47
335 0.42
336 0.35
337 0.24
338 0.15
339 0.1
340 0.1
341 0.11
342 0.11
343 0.13
344 0.22
345 0.31
346 0.41
347 0.48
348 0.57
349 0.66
350 0.75
351 0.82
352 0.84
353 0.86
354 0.86
355 0.9
356 0.86
357 0.85
358 0.8
359 0.77
360 0.73
361 0.63
362 0.53
363 0.45
364 0.41
365 0.33
366 0.33
367 0.34
368 0.36
369 0.44
370 0.47
371 0.53
372 0.61
373 0.69
374 0.74
375 0.76
376 0.78
377 0.79
378 0.86
379 0.88
380 0.87
381 0.88