FuNGI

B2ABZ6

Protein Details

Accession

B2ABZ6

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
12-41	VTIPDSQKVEKKHKRSKSEKKRSRDEDDAA	Basic
66-91	SQVAADEPSKKKKKKKDQLGNGEAQT	Hydrophilic
96-120	VDEEKSSRKKSSKSKKEPKEEPEDA	Basic
122-173	QIDTPEKSKSEKKRKEKKSKKDNLETEANVDGQEKKKKKKSKDKTGIETETP	Basic
426-451	ALAKEEREYEKRRRNKQNPSGLLKPL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
21-35	EKKHKRSKSEKKRSR
50-51	PK
74-81	SKKKKKKK
102-114	SRKKSSKSKKEPK
127-142	EKSKSEKKRKEKKSKK
155-164	EKKKKKKSKD

Subcellular Location(s)

nucl 21.5, mito_nucl 11.5, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR036898 RNA_pol_Rpb7-like_N_sf IPR041901 RNAP_I_Rpa43_N IPR041178 RPA43_OB IPR045113 Rpb7-like IPR005576 Rpb7-like_N
Gene Ontology	GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005730 C:nucleolus GO:0003677 F:DNA binding GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
KEGG	pan:PODANSg230 -
Pfam	View protein in Pfam PF17875 RPA43_OB PF03876 SHS2_Rpb7-N
CDD	cd04328 RNAP_I_Rpa43_N

Amino Acid Sequences

MSATLDEGAQPVTIPDSQKVEKKHKRSKSEKKRSRDEDDAAVVEETPRKPKKTKNGDLELPVRLGSQVAADEPSKKKKKKKDQLGNGEAQTDEVVVDEEKSSRKKSSKSKKEPKEEPEDAMQIDTPEKSKSEKKRKEKKSKKDNLETEANVDGQEKKKKKKSKDKTGIETETPTQASHEVATELPSSDSEYPFFTQTVSLYVPFYPIGFDKPLTNVAAQHLDPLLNHYSPLLRGVLLSYSNLNLSERPAKASITNPPTDETPAWLHSVDEYAVGFGWLTFDAQLFVPSRGKWMEGVVQLQSEGHIGVVCWNKFNASIEAKRLPQGWKWVDISKDDPFARSNSSQPETDENGEEKEGQQQEEEDILDGEELQVVEQMHTTGYWVNEKGRKVGGKLRFRIMNFDVGQAGDYGYLSIEGTCLELNEELALAKEEREYEKRRRNKQNPSGLLKPLSRRVPEFSMTKFGKDDEEEDGTKKTVLYKASRPGTPDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.15
2	0.17
3	0.23
4	0.27
5	0.33
6	0.41
7	0.5
8	0.57
9	0.65
10	0.73
11	0.76
12	0.83
13	0.88
14	0.92
15	0.92
16	0.94
17	0.92
18	0.92
19	0.93
20	0.91
21	0.89
22	0.86
23	0.79
24	0.74
25	0.69
26	0.6
27	0.51
28	0.42
29	0.34
30	0.27
31	0.28
32	0.23
33	0.28
34	0.33
35	0.37
36	0.43
37	0.52
38	0.61
39	0.67
40	0.75
41	0.76
42	0.79
43	0.79
44	0.8
45	0.75
46	0.66
47	0.56
48	0.46
49	0.36
50	0.27
51	0.21
52	0.14
53	0.1
54	0.08
55	0.08
56	0.11
57	0.11
58	0.18
59	0.23
60	0.34
61	0.43
62	0.5
63	0.59
64	0.68
65	0.78
66	0.83
67	0.88
68	0.89
69	0.9
70	0.93
71	0.92
72	0.88
73	0.78
74	0.68
75	0.57
76	0.46
77	0.34
78	0.23
79	0.15
80	0.07
81	0.07
82	0.06
83	0.07
84	0.07
85	0.09
86	0.13
87	0.18
88	0.21
89	0.27
90	0.32
91	0.4
92	0.5
93	0.6
94	0.67
95	0.75
96	0.82
97	0.86
98	0.9
99	0.91
100	0.88
101	0.87
102	0.79
103	0.71
104	0.64
105	0.56
106	0.46
107	0.38
108	0.3
109	0.21
110	0.19
111	0.16
112	0.13
113	0.12
114	0.12
115	0.16
116	0.24
117	0.34
118	0.45
119	0.54
120	0.64
121	0.74
122	0.84
123	0.91
124	0.93
125	0.94
126	0.94
127	0.94
128	0.93
129	0.93
130	0.88
131	0.82
132	0.79
133	0.68
134	0.6
135	0.5
136	0.4
137	0.3
138	0.25
139	0.23
140	0.21
141	0.3
142	0.33
143	0.41
144	0.5
145	0.59
146	0.68
147	0.76
148	0.81
149	0.84
150	0.88
151	0.88
152	0.88
153	0.88
154	0.81
155	0.72
156	0.63
157	0.53
158	0.45
159	0.36
160	0.27
161	0.19
162	0.15
163	0.14
164	0.11
165	0.11
166	0.08
167	0.08
168	0.1
169	0.09
170	0.09
171	0.09
172	0.09
173	0.11
174	0.11
175	0.12
176	0.11
177	0.12
178	0.13
179	0.14
180	0.14
181	0.11
182	0.1
183	0.1
184	0.12
185	0.1
186	0.1
187	0.1
188	0.1
189	0.1
190	0.1
191	0.1
192	0.08
193	0.08
194	0.09
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.11
199	0.13
200	0.13
201	0.13
202	0.12
203	0.12
204	0.15
205	0.14
206	0.13
207	0.11
208	0.1
209	0.1
210	0.13
211	0.13
212	0.1
213	0.1
214	0.1
215	0.1
216	0.1
217	0.11
218	0.08
219	0.06
220	0.06
221	0.07
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.06
226	0.06
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.06
231	0.08
232	0.13
233	0.13
234	0.15
235	0.15
236	0.15
237	0.17
238	0.19
239	0.24
240	0.23
241	0.24
242	0.23
243	0.23
244	0.23
245	0.24
246	0.22
247	0.17
248	0.15
249	0.14
250	0.15
251	0.14
252	0.13
253	0.11
254	0.12
255	0.09
256	0.07
257	0.06
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.04
262	0.03
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.05
269	0.05
270	0.07
271	0.08
272	0.1
273	0.12
274	0.11
275	0.14
276	0.13
277	0.14
278	0.13
279	0.13
280	0.16
281	0.15
282	0.17
283	0.15
284	0.14
285	0.14
286	0.13
287	0.12
288	0.08
289	0.06
290	0.04
291	0.04
292	0.04
293	0.09
294	0.14
295	0.14
296	0.15
297	0.15
298	0.15
299	0.16
300	0.18
301	0.18
302	0.19
303	0.21
304	0.25
305	0.29
306	0.29
307	0.3
308	0.31
309	0.29
310	0.26
311	0.33
312	0.31
313	0.32
314	0.34
315	0.35
316	0.34
317	0.34
318	0.35
319	0.28
320	0.32
321	0.28
322	0.26
323	0.24
324	0.24
325	0.27
326	0.25
327	0.26
328	0.26
329	0.29
330	0.28
331	0.29
332	0.32
333	0.31
334	0.31
335	0.3
336	0.24
337	0.23
338	0.23
339	0.21
340	0.17
341	0.2
342	0.2
343	0.18
344	0.17
345	0.16
346	0.17
347	0.17
348	0.17
349	0.1
350	0.09
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.06
355	0.06
356	0.05
357	0.05
358	0.07
359	0.07
360	0.07
361	0.08
362	0.08
363	0.07
364	0.07
365	0.08
366	0.08
367	0.09
368	0.13
369	0.14
370	0.2
371	0.25
372	0.27
373	0.29
374	0.33
375	0.34
376	0.34
377	0.41
378	0.44
379	0.49
380	0.52
381	0.56
382	0.56
383	0.54
384	0.57
385	0.51
386	0.5
387	0.41
388	0.38
389	0.32
390	0.26
391	0.26
392	0.19
393	0.17
394	0.09
395	0.08
396	0.06
397	0.05
398	0.06
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.06
404	0.06
405	0.06
406	0.07
407	0.07
408	0.07
409	0.07
410	0.07
411	0.06
412	0.07
413	0.09
414	0.08
415	0.08
416	0.1
417	0.12
418	0.18
419	0.26
420	0.32
421	0.41
422	0.51
423	0.6
424	0.69
425	0.78
426	0.83
427	0.86
428	0.9
429	0.9
430	0.9
431	0.88
432	0.84
433	0.78
434	0.74
435	0.68
436	0.64
437	0.61
438	0.6
439	0.56
440	0.53
441	0.53
442	0.53
443	0.52
444	0.5
445	0.46
446	0.48
447	0.45
448	0.44
449	0.39
450	0.35
451	0.34
452	0.32
453	0.31
454	0.27
455	0.31
456	0.3
457	0.31
458	0.32
459	0.29
460	0.27
461	0.25
462	0.25
463	0.23
464	0.28
465	0.33
466	0.39
467	0.48
468	0.53
469	0.55

B2ABZ6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer