FuNGI

V2W4M1

Protein Details

Accession

V2W4M1

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
616-637	CITPNPIQTKRGPRKKLPKTTA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
625-633	KRGPRKKLP

Subcellular Location(s)

cyto 10, nucl 9, mito 7

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR043502 DNA/RNA_pol_sf IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR043128 Rev_trsase/Diguanyl_cyclase IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf IPR041373 RT_RNaseH
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
KEGG	mrr:Moror_11553 -
Pfam	View protein in Pfam PF17921 Integrase_H2C2 PF17917 RT_RNaseH PF00665 rve
PROSITE	View protein in PROSITE PS50994 INTEGRASE
CDD	cd09274 RNase_HI_RT_Ty3

Amino Acid Sequences

MDPVKLAGIRDWKPPTTVRGVRSFLGFGNFYWKFIGWFSELARPLNELTKKDKKFEWTKECQVAFNALKWKFLSEPVLIMPDTEKPFLIECDASKWATGVVLRQQGMDGEWHPCGYISHSLTPTERNYEIYDRELFSIVRALESWRHYLMGGKHPITILSDHKNLMFFKTAQKLNRRQARWSLFLSQFDLQLIHTPGTKMTQSDALSRRPDHIDNNENDNDNVVMLPDKFFLRAMDVKLQNDLIENLKGETLYDDAMRTILKEGPPPIKSALEDWTTRDGLLFYKNRCYVPNKGNLRREIVKTIHEAKGIGHPGQFNTLEQVSREYWWPGMAKFVKMFVDGCARCQESKSITHPTKAPLLPIEGEKDVLPFSKITMDLITDLPESGGYDTILVVVDHSSTKGVIFTPCNKTIDAEQTATLLLNNVYKRFGLPNKIISDRDPRFAAKVFQELGKQLGVKHIMSTAFHPQTDGESERVNQELEVFLRLFCSRQQDKWTELLPFAEFAHNNRTHSTMKKSPFYLMMGYNLRPLPTAFTKTTIPSVETRLSELKKLREETYSLMDGTKGVVRRKEPQLRISIEEVGTKKGRTLQNRVSTRTGDVQVDSPRTMESSPCLPCITPNPIQTKRGPRKKLPKTTA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.45
2	0.46
3	0.48
4	0.52
5	0.49
6	0.51
7	0.53
8	0.51
9	0.5
10	0.45
11	0.36
12	0.34
13	0.3
14	0.22
15	0.28
16	0.26
17	0.25
18	0.25
19	0.24
20	0.2
21	0.2
22	0.24
23	0.17
24	0.19
25	0.21
26	0.27
27	0.29
28	0.29
29	0.29
30	0.27
31	0.27
32	0.32
33	0.35
34	0.3
35	0.37
36	0.46
37	0.49
38	0.52
39	0.55
40	0.56
41	0.62
42	0.69
43	0.69
44	0.68
45	0.74
46	0.78
47	0.75
48	0.67
49	0.58
50	0.56
51	0.48
52	0.44
53	0.44
54	0.35
55	0.37
56	0.36
57	0.36
58	0.29
59	0.31
60	0.31
61	0.23
62	0.25
63	0.23
64	0.25
65	0.22
66	0.21
67	0.19
68	0.2
69	0.22
70	0.21
71	0.2
72	0.18
73	0.2
74	0.2
75	0.22
76	0.18
77	0.15
78	0.19
79	0.22
80	0.21
81	0.19
82	0.18
83	0.15
84	0.15
85	0.15
86	0.14
87	0.18
88	0.24
89	0.24
90	0.24
91	0.24
92	0.23
93	0.23
94	0.22
95	0.17
96	0.14
97	0.14
98	0.14
99	0.14
100	0.14
101	0.13
102	0.14
103	0.2
104	0.2
105	0.25
106	0.26
107	0.28
108	0.29
109	0.33
110	0.32
111	0.3
112	0.28
113	0.25
114	0.27
115	0.29
116	0.3
117	0.29
118	0.3
119	0.26
120	0.27
121	0.26
122	0.22
123	0.18
124	0.2
125	0.16
126	0.14
127	0.13
128	0.14
129	0.18
130	0.2
131	0.23
132	0.19
133	0.2
134	0.19
135	0.24
136	0.27
137	0.31
138	0.34
139	0.32
140	0.33
141	0.32
142	0.33
143	0.29
144	0.27
145	0.23
146	0.22
147	0.24
148	0.24
149	0.25
150	0.27
151	0.26
152	0.26
153	0.24
154	0.19
155	0.23
156	0.3
157	0.34
158	0.38
159	0.46
160	0.53
161	0.59
162	0.67
163	0.64
164	0.61
165	0.66
166	0.66
167	0.61
168	0.55
169	0.53
170	0.47
171	0.46
172	0.45
173	0.36
174	0.3
175	0.26
176	0.22
177	0.15
178	0.16
179	0.16
180	0.13
181	0.13
182	0.13
183	0.13
184	0.15
185	0.15
186	0.12
187	0.12
188	0.17
189	0.17
190	0.24
191	0.27
192	0.3
193	0.34
194	0.34
195	0.36
196	0.34
197	0.35
198	0.33
199	0.36
200	0.39
201	0.38
202	0.43
203	0.42
204	0.39
205	0.37
206	0.32
207	0.25
208	0.17
209	0.14
210	0.08
211	0.07
212	0.06
213	0.07
214	0.08
215	0.08
216	0.08
217	0.09
218	0.09
219	0.12
220	0.14
221	0.16
222	0.23
223	0.25
224	0.25
225	0.26
226	0.26
227	0.22
228	0.2
229	0.18
230	0.12
231	0.11
232	0.1
233	0.1
234	0.1
235	0.09
236	0.09
237	0.08
238	0.07
239	0.06
240	0.06
241	0.06
242	0.06
243	0.07
244	0.07
245	0.06
246	0.07
247	0.09
248	0.1
249	0.12
250	0.16
251	0.21
252	0.22
253	0.23
254	0.23
255	0.22
256	0.21
257	0.21
258	0.21
259	0.18
260	0.18
261	0.19
262	0.2
263	0.19
264	0.19
265	0.17
266	0.14
267	0.12
268	0.18
269	0.2
270	0.17
271	0.24
272	0.26
273	0.27
274	0.29
275	0.33
276	0.34
277	0.36
278	0.44
279	0.47
280	0.52
281	0.57
282	0.57
283	0.57
284	0.54
285	0.5
286	0.46
287	0.38
288	0.33
289	0.31
290	0.34
291	0.31
292	0.27
293	0.25
294	0.2
295	0.24
296	0.24
297	0.2
298	0.16
299	0.15
300	0.15
301	0.18
302	0.17
303	0.11
304	0.12
305	0.11
306	0.1
307	0.1
308	0.12
309	0.1
310	0.11
311	0.12
312	0.1
313	0.1
314	0.12
315	0.12
316	0.1
317	0.16
318	0.16
319	0.16
320	0.16
321	0.18
322	0.16
323	0.16
324	0.16
325	0.11
326	0.19
327	0.17
328	0.18
329	0.2
330	0.21
331	0.2
332	0.21
333	0.22
334	0.16
335	0.2
336	0.23
337	0.29
338	0.29
339	0.31
340	0.32
341	0.32
342	0.36
343	0.32
344	0.29
345	0.21
346	0.21
347	0.2
348	0.19
349	0.19
350	0.13
351	0.13
352	0.12
353	0.11
354	0.1
355	0.1
356	0.09
357	0.07
358	0.07
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.09
364	0.09
365	0.1
366	0.1
367	0.08
368	0.08
369	0.07
370	0.07
371	0.07
372	0.06
373	0.06
374	0.05
375	0.05
376	0.05
377	0.05
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.05
383	0.05
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.06
389	0.07
390	0.09
391	0.12
392	0.18
393	0.25
394	0.28
395	0.29
396	0.28
397	0.29
398	0.29
399	0.32
400	0.28
401	0.23
402	0.2
403	0.19
404	0.19
405	0.18
406	0.15
407	0.09
408	0.07
409	0.1
410	0.11
411	0.11
412	0.12
413	0.12
414	0.14
415	0.18
416	0.22
417	0.24
418	0.27
419	0.32
420	0.36
421	0.39
422	0.39
423	0.37
424	0.43
425	0.38
426	0.38
427	0.34
428	0.31
429	0.3
430	0.3
431	0.31
432	0.23
433	0.25
434	0.23
435	0.23
436	0.23
437	0.22
438	0.22
439	0.19
440	0.18
441	0.14
442	0.18
443	0.18
444	0.17
445	0.17
446	0.18
447	0.17
448	0.17
449	0.2
450	0.24
451	0.23
452	0.23
453	0.23
454	0.2
455	0.22
456	0.25
457	0.24
458	0.16
459	0.16
460	0.17
461	0.18
462	0.19
463	0.17
464	0.13
465	0.12
466	0.12
467	0.11
468	0.13
469	0.12
470	0.1
471	0.12
472	0.13
473	0.13
474	0.14
475	0.22
476	0.23
477	0.27
478	0.35
479	0.37
480	0.4
481	0.43
482	0.43
483	0.36
484	0.33
485	0.31
486	0.24
487	0.21
488	0.19
489	0.19
490	0.17
491	0.17
492	0.26
493	0.27
494	0.28
495	0.28
496	0.31
497	0.31
498	0.35
499	0.42
500	0.4
501	0.44
502	0.49
503	0.49
504	0.47
505	0.47
506	0.44
507	0.39
508	0.33
509	0.33
510	0.3
511	0.29
512	0.31
513	0.29
514	0.26
515	0.23
516	0.22
517	0.22
518	0.23
519	0.28
520	0.25
521	0.27
522	0.29
523	0.31
524	0.35
525	0.3
526	0.28
527	0.24
528	0.28
529	0.3
530	0.28
531	0.3
532	0.33
533	0.34
534	0.38
535	0.41
536	0.42
537	0.45
538	0.48
539	0.47
540	0.43
541	0.44
542	0.41
543	0.42
544	0.37
545	0.3
546	0.27
547	0.25
548	0.21
549	0.2
550	0.2
551	0.19
552	0.22
553	0.27
554	0.31
555	0.39
556	0.5
557	0.58
558	0.6
559	0.63
560	0.66
561	0.65
562	0.66
563	0.61
564	0.55
565	0.46
566	0.46
567	0.4
568	0.37
569	0.35
570	0.31
571	0.29
572	0.32
573	0.39
574	0.41
575	0.49
576	0.53
577	0.61
578	0.67
579	0.71
580	0.68
581	0.62
582	0.59
583	0.56
584	0.5
585	0.42
586	0.37
587	0.37
588	0.38
589	0.4
590	0.36
591	0.29
592	0.26
593	0.26
594	0.25
595	0.22
596	0.19
597	0.23
598	0.25
599	0.27
600	0.28
601	0.26
602	0.29
603	0.34
604	0.37
605	0.37
606	0.41
607	0.49
608	0.53
609	0.58
610	0.63
611	0.67
612	0.71
613	0.75
614	0.77
615	0.78
616	0.83
617	0.89

V2W4M1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer