Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2W5W0

Protein Details
Accession V2W5W0    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
266-295HIRDCPDAPKKDKRKQEEPKKLTREERFAKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
275-290KKDKRKQEEPKKLTRE
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 14, cyto 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR025829  Zn_knuckle_CX2CX3GHX4C  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG mrr:Moror_14469  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13696  zf-CCHC_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MAEDKRPSGSRPKREEPAAEEAVIGSAMPVQVVSAVKEVKAALPRAFTGAQKDAKKFLREVLIYIALNLKAFPDNRSKKLFLLSYMTDGPGEFWKNDKTDLLLAYDADAEKVTWSEFLDDFRTSFKPLDPALKAQLEPKDLRMKDRADEYTYQFTYLAKQTRYNDAAQIVAFKRGLPRSLALKIMTRPEGAPTTIKDWMNAAILFDESYKQALEYGKTWDDEHGGKKLQRSFRKKEDVAIKQITEIDRKEYMAKGLCFRCGKSGHHIRDCPDAPKKDKRKQEEPKKLTREERFAKIRALVNEQPKEDKDFLLDLMEQEGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.75
3 0.69
4 0.68
5 0.6
6 0.51
7 0.43
8 0.35
9 0.29
10 0.23
11 0.17
12 0.08
13 0.06
14 0.05
15 0.05
16 0.05
17 0.04
18 0.07
19 0.08
20 0.1
21 0.12
22 0.13
23 0.13
24 0.15
25 0.16
26 0.17
27 0.22
28 0.24
29 0.22
30 0.24
31 0.24
32 0.27
33 0.28
34 0.26
35 0.26
36 0.3
37 0.35
38 0.38
39 0.4
40 0.43
41 0.47
42 0.49
43 0.44
44 0.42
45 0.43
46 0.38
47 0.38
48 0.35
49 0.34
50 0.3
51 0.3
52 0.28
53 0.2
54 0.19
55 0.17
56 0.14
57 0.13
58 0.14
59 0.17
60 0.25
61 0.31
62 0.36
63 0.42
64 0.43
65 0.41
66 0.46
67 0.44
68 0.36
69 0.35
70 0.31
71 0.29
72 0.28
73 0.26
74 0.21
75 0.19
76 0.18
77 0.16
78 0.16
79 0.13
80 0.14
81 0.17
82 0.18
83 0.2
84 0.19
85 0.17
86 0.18
87 0.18
88 0.18
89 0.14
90 0.13
91 0.12
92 0.13
93 0.11
94 0.09
95 0.08
96 0.06
97 0.06
98 0.06
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.08
103 0.08
104 0.1
105 0.12
106 0.12
107 0.13
108 0.15
109 0.15
110 0.15
111 0.15
112 0.15
113 0.16
114 0.17
115 0.22
116 0.21
117 0.22
118 0.24
119 0.25
120 0.25
121 0.25
122 0.26
123 0.24
124 0.23
125 0.25
126 0.29
127 0.28
128 0.31
129 0.32
130 0.31
131 0.29
132 0.33
133 0.32
134 0.26
135 0.28
136 0.29
137 0.3
138 0.28
139 0.27
140 0.22
141 0.2
142 0.19
143 0.21
144 0.22
145 0.17
146 0.21
147 0.23
148 0.28
149 0.31
150 0.29
151 0.26
152 0.22
153 0.22
154 0.17
155 0.19
156 0.14
157 0.14
158 0.13
159 0.12
160 0.15
161 0.15
162 0.17
163 0.14
164 0.16
165 0.18
166 0.19
167 0.21
168 0.18
169 0.2
170 0.21
171 0.23
172 0.22
173 0.19
174 0.18
175 0.18
176 0.18
177 0.17
178 0.17
179 0.14
180 0.17
181 0.21
182 0.21
183 0.19
184 0.18
185 0.18
186 0.18
187 0.17
188 0.14
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.08
194 0.06
195 0.07
196 0.07
197 0.06
198 0.09
199 0.1
200 0.11
201 0.12
202 0.16
203 0.17
204 0.18
205 0.19
206 0.17
207 0.19
208 0.2
209 0.21
210 0.21
211 0.23
212 0.24
213 0.29
214 0.35
215 0.42
216 0.49
217 0.55
218 0.59
219 0.65
220 0.73
221 0.68
222 0.69
223 0.7
224 0.67
225 0.66
226 0.62
227 0.53
228 0.44
229 0.46
230 0.41
231 0.35
232 0.29
233 0.26
234 0.23
235 0.24
236 0.25
237 0.23
238 0.26
239 0.27
240 0.28
241 0.31
242 0.32
243 0.37
244 0.37
245 0.37
246 0.39
247 0.36
248 0.37
249 0.4
250 0.49
251 0.51
252 0.58
253 0.6
254 0.56
255 0.62
256 0.61
257 0.59
258 0.57
259 0.56
260 0.55
261 0.62
262 0.7
263 0.7
264 0.77
265 0.78
266 0.8
267 0.84
268 0.88
269 0.89
270 0.86
271 0.88
272 0.87
273 0.86
274 0.84
275 0.81
276 0.8
277 0.75
278 0.76
279 0.73
280 0.67
281 0.63
282 0.6
283 0.57
284 0.51
285 0.53
286 0.5
287 0.53
288 0.56
289 0.55
290 0.54
291 0.51
292 0.53
293 0.47
294 0.41
295 0.34
296 0.3
297 0.28
298 0.26
299 0.25
300 0.18