Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2XDX9

Protein Details
Accession V2XDX9    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-108AKKPAAKKTAVKKPVKKTVAKKKPAKKTPAKRTLAKKRVAKKKDVRPKFDKQLBasic
189-209FAEIKKKCKAKGKPAPSQPHGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
57-115KKPAAKKTAVKKPVKKTVAKKKPAKKTPAKRTLAKKRVAKKKDVRPKFDKQLLKPPKRP
193-205KKKCKAKGKPAPS
Subcellular Location(s) mito 23.5, cyto_mito 12.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG mrr:Moror_10429  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd22014  HMG-box_CMB1-like  
Amino Acid Sequences MFSSLAARLASRSALSLIRSSSAAFVRHTTLNSTSLSRSYFATPRVLLPTATQSTAKKPAAKKTAVKKPVKKTVAKKKPAKKTPAKRTLAKKRVAKKKDVRPKFDKQLLKPPKRPGTAYGMFLHDKFSGLDLKNKSIVDMAQILKTQAALWHELPESGKQAYRERHQGAMEQWRKDYKKWYMNLPEGAFAEIKKKCKAKGKPAPSQPHGYPKRPPGPFLAYCIEFRAQNPDINVTEASKLAGNQWKKLSDGEKEPYKQRFRAALEQYLTEVEKYKKGDM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.19
4 0.18
5 0.19
6 0.19
7 0.18
8 0.2
9 0.2
10 0.21
11 0.19
12 0.21
13 0.23
14 0.25
15 0.25
16 0.25
17 0.24
18 0.25
19 0.25
20 0.25
21 0.23
22 0.24
23 0.24
24 0.21
25 0.21
26 0.23
27 0.25
28 0.25
29 0.28
30 0.27
31 0.28
32 0.31
33 0.3
34 0.26
35 0.24
36 0.28
37 0.26
38 0.26
39 0.26
40 0.23
41 0.28
42 0.36
43 0.38
44 0.37
45 0.4
46 0.48
47 0.53
48 0.58
49 0.61
50 0.62
51 0.69
52 0.72
53 0.77
54 0.77
55 0.78
56 0.82
57 0.82
58 0.8
59 0.8
60 0.81
61 0.82
62 0.84
63 0.84
64 0.83
65 0.86
66 0.87
67 0.87
68 0.86
69 0.87
70 0.88
71 0.89
72 0.85
73 0.82
74 0.84
75 0.85
76 0.83
77 0.8
78 0.77
79 0.76
80 0.8
81 0.78
82 0.77
83 0.76
84 0.78
85 0.8
86 0.81
87 0.8
88 0.77
89 0.8
90 0.79
91 0.78
92 0.74
93 0.68
94 0.7
95 0.72
96 0.73
97 0.71
98 0.71
99 0.71
100 0.67
101 0.64
102 0.56
103 0.54
104 0.48
105 0.44
106 0.37
107 0.32
108 0.3
109 0.28
110 0.27
111 0.18
112 0.16
113 0.12
114 0.12
115 0.14
116 0.14
117 0.2
118 0.19
119 0.21
120 0.23
121 0.23
122 0.22
123 0.18
124 0.17
125 0.12
126 0.14
127 0.14
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.11
132 0.11
133 0.1
134 0.08
135 0.08
136 0.1
137 0.1
138 0.12
139 0.12
140 0.13
141 0.13
142 0.13
143 0.13
144 0.12
145 0.13
146 0.13
147 0.19
148 0.23
149 0.26
150 0.33
151 0.33
152 0.36
153 0.35
154 0.35
155 0.34
156 0.4
157 0.42
158 0.35
159 0.35
160 0.39
161 0.4
162 0.39
163 0.43
164 0.41
165 0.44
166 0.45
167 0.51
168 0.52
169 0.55
170 0.58
171 0.51
172 0.44
173 0.37
174 0.36
175 0.27
176 0.2
177 0.22
178 0.2
179 0.23
180 0.27
181 0.3
182 0.34
183 0.44
184 0.53
185 0.57
186 0.64
187 0.7
188 0.74
189 0.8
190 0.84
191 0.78
192 0.76
193 0.68
194 0.68
195 0.66
196 0.61
197 0.58
198 0.58
199 0.63
200 0.57
201 0.56
202 0.52
203 0.53
204 0.5
205 0.48
206 0.44
207 0.36
208 0.36
209 0.37
210 0.32
211 0.24
212 0.23
213 0.26
214 0.23
215 0.24
216 0.24
217 0.26
218 0.25
219 0.27
220 0.27
221 0.2
222 0.2
223 0.17
224 0.17
225 0.13
226 0.13
227 0.16
228 0.23
229 0.24
230 0.29
231 0.34
232 0.34
233 0.35
234 0.4
235 0.39
236 0.37
237 0.42
238 0.45
239 0.49
240 0.52
241 0.59
242 0.63
243 0.66
244 0.62
245 0.61
246 0.61
247 0.59
248 0.64
249 0.63
250 0.62
251 0.56
252 0.54
253 0.49
254 0.44
255 0.38
256 0.29
257 0.28
258 0.23
259 0.26