Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2WJB0

Protein Details
Accession V2WJB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
115-139KLVMANRKKREPIKPKIARKEKEVTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
121-136RKKREPIKPKIARKEK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12, cyto 2.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
KEGG mrr:Moror_15549  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MNPVKANTDEKKKAAEETWSSFKQRFRAEWQPVNVVREAQAKIEQIRMTDRADEYVNRFRLIAMDTKYDDEALMRFFREGLPESLQTKIMLRTDGEPETLDEWYKLAIKYDNQYKLVMANRKKREPIKPKIARKEKEVTVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.45
2 0.45
3 0.41
4 0.41
5 0.47
6 0.44
7 0.46
8 0.46
9 0.47
10 0.46
11 0.45
12 0.43
13 0.43
14 0.51
15 0.56
16 0.59
17 0.59
18 0.6
19 0.57
20 0.56
21 0.48
22 0.38
23 0.32
24 0.3
25 0.27
26 0.21
27 0.21
28 0.2
29 0.21
30 0.24
31 0.23
32 0.19
33 0.21
34 0.21
35 0.2
36 0.2
37 0.19
38 0.17
39 0.17
40 0.18
41 0.2
42 0.26
43 0.25
44 0.23
45 0.23
46 0.21
47 0.21
48 0.21
49 0.2
50 0.14
51 0.16
52 0.16
53 0.17
54 0.17
55 0.16
56 0.14
57 0.1
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.09
66 0.11
67 0.11
68 0.14
69 0.16
70 0.17
71 0.18
72 0.18
73 0.16
74 0.16
75 0.16
76 0.14
77 0.13
78 0.13
79 0.14
80 0.17
81 0.17
82 0.17
83 0.15
84 0.15
85 0.15
86 0.15
87 0.13
88 0.1
89 0.09
90 0.1
91 0.12
92 0.1
93 0.11
94 0.14
95 0.16
96 0.23
97 0.31
98 0.35
99 0.35
100 0.35
101 0.33
102 0.35
103 0.4
104 0.42
105 0.42
106 0.47
107 0.54
108 0.6
109 0.68
110 0.71
111 0.75
112 0.76
113 0.78
114 0.8
115 0.82
116 0.85
117 0.89
118 0.91
119 0.85
120 0.82
121 0.8