Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2X5W0

Protein Details
Accession V2X5W0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
385-411RAPRELALKKPPPRNKRQKAKGEFINEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
381-405KGTLRAPRELALKKPPPRNKRQKAK
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 10.833, mito_nucl 9.666, cyto 8, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR006225  PsdUridine_synth_RluC/D  
IPR006145  PsdUridine_synth_RsuA/RluA  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
KEGG mrr:Moror_15298  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00849  PseudoU_synth_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50889  S4  
CDD cd02557  PseudoU_synth_ScRIB2  
Amino Acid Sequences MTSLGGAPPLSVNKTAPGLKKIPAYWYPYTTYAKERWLGRELLEVVSTEFRDRSMEYYRYALESGVTTINGETAKPDTVIQNGDRIENVVHRHEPPVTATPVKVLLEDKEREFLIVDKPGSIPVHACGRYHRNTLVAILNHDFGYEKVYTVNRLDRLTSGLMIIPTSANCARRLTEEFVSGTVRKEYVARCIGKFPEGEIVCEEPLLTVDRQMGLNIVHPEGKPAETLFQLIRYDPNTDTSVVHCKPMTGRSHQIRVHLQYLGHPIANDPVYSELKIWGDNLGKGGIDIIPTEERSPPKPPEHLTEHGNSESLSRPSESEDGERSTKAAKKLLPRETGEDIGMGSPVPLSSEAVGVITRLRNMKDEAEDWSRWRDVIFKAKGTLRAPRELALKKPPPRNKRQKAKGEFINEQLNKYMGAMSVKDPTTEPSSELSSEVSTPLAHEADKQPVLSTTTPSIAQDPTQLTTSEAVERARSIIASSTDPNAESSSTPEQSTKTHVDETVKLDQAVEEGEGGEKQLYCPECYLPLHPDPKPESLYIFLHALRYTTSLGTFETEMPEWSAEGWEWDRS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.32
3 0.34
4 0.37
5 0.38
6 0.4
7 0.46
8 0.44
9 0.47
10 0.47
11 0.49
12 0.47
13 0.47
14 0.47
15 0.47
16 0.5
17 0.46
18 0.46
19 0.42
20 0.43
21 0.45
22 0.45
23 0.45
24 0.45
25 0.44
26 0.39
27 0.42
28 0.38
29 0.34
30 0.3
31 0.25
32 0.22
33 0.23
34 0.23
35 0.18
36 0.16
37 0.15
38 0.16
39 0.17
40 0.19
41 0.24
42 0.26
43 0.26
44 0.29
45 0.3
46 0.3
47 0.29
48 0.25
49 0.18
50 0.16
51 0.16
52 0.14
53 0.13
54 0.11
55 0.11
56 0.13
57 0.12
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.13
62 0.13
63 0.14
64 0.14
65 0.16
66 0.21
67 0.2
68 0.23
69 0.23
70 0.23
71 0.22
72 0.21
73 0.2
74 0.2
75 0.23
76 0.22
77 0.25
78 0.25
79 0.28
80 0.28
81 0.28
82 0.28
83 0.3
84 0.3
85 0.28
86 0.27
87 0.26
88 0.28
89 0.27
90 0.24
91 0.19
92 0.18
93 0.24
94 0.27
95 0.26
96 0.26
97 0.25
98 0.24
99 0.23
100 0.22
101 0.19
102 0.22
103 0.21
104 0.19
105 0.19
106 0.23
107 0.23
108 0.21
109 0.17
110 0.15
111 0.23
112 0.23
113 0.23
114 0.26
115 0.33
116 0.37
117 0.4
118 0.38
119 0.32
120 0.31
121 0.34
122 0.34
123 0.27
124 0.26
125 0.24
126 0.24
127 0.21
128 0.21
129 0.18
130 0.12
131 0.14
132 0.11
133 0.1
134 0.12
135 0.13
136 0.16
137 0.19
138 0.24
139 0.23
140 0.24
141 0.25
142 0.23
143 0.25
144 0.23
145 0.2
146 0.16
147 0.14
148 0.13
149 0.12
150 0.11
151 0.08
152 0.07
153 0.11
154 0.13
155 0.14
156 0.15
157 0.17
158 0.17
159 0.21
160 0.25
161 0.26
162 0.25
163 0.26
164 0.25
165 0.24
166 0.26
167 0.23
168 0.2
169 0.17
170 0.15
171 0.13
172 0.16
173 0.15
174 0.2
175 0.26
176 0.28
177 0.27
178 0.31
179 0.32
180 0.31
181 0.3
182 0.24
183 0.25
184 0.22
185 0.22
186 0.2
187 0.21
188 0.18
189 0.18
190 0.17
191 0.08
192 0.09
193 0.1
194 0.08
195 0.07
196 0.08
197 0.09
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.08
202 0.12
203 0.12
204 0.12
205 0.13
206 0.13
207 0.15
208 0.15
209 0.15
210 0.12
211 0.11
212 0.12
213 0.1
214 0.12
215 0.1
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.13
220 0.13
221 0.15
222 0.14
223 0.17
224 0.16
225 0.16
226 0.17
227 0.17
228 0.23
229 0.21
230 0.22
231 0.19
232 0.18
233 0.19
234 0.25
235 0.26
236 0.23
237 0.31
238 0.34
239 0.42
240 0.42
241 0.45
242 0.44
243 0.43
244 0.4
245 0.34
246 0.29
247 0.24
248 0.27
249 0.24
250 0.19
251 0.16
252 0.14
253 0.15
254 0.15
255 0.12
256 0.08
257 0.1
258 0.11
259 0.11
260 0.12
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.11
268 0.11
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.06
274 0.05
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.07
279 0.08
280 0.11
281 0.12
282 0.14
283 0.19
284 0.22
285 0.25
286 0.29
287 0.3
288 0.33
289 0.37
290 0.38
291 0.36
292 0.34
293 0.34
294 0.3
295 0.28
296 0.22
297 0.17
298 0.17
299 0.14
300 0.13
301 0.11
302 0.11
303 0.13
304 0.15
305 0.14
306 0.14
307 0.15
308 0.18
309 0.19
310 0.18
311 0.16
312 0.18
313 0.21
314 0.21
315 0.23
316 0.24
317 0.31
318 0.4
319 0.47
320 0.49
321 0.47
322 0.49
323 0.48
324 0.45
325 0.37
326 0.28
327 0.21
328 0.15
329 0.13
330 0.08
331 0.05
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.05
340 0.06
341 0.06
342 0.05
343 0.07
344 0.07
345 0.09
346 0.11
347 0.12
348 0.13
349 0.16
350 0.18
351 0.18
352 0.19
353 0.22
354 0.25
355 0.25
356 0.25
357 0.27
358 0.25
359 0.22
360 0.21
361 0.2
362 0.19
363 0.28
364 0.29
365 0.27
366 0.31
367 0.34
368 0.39
369 0.37
370 0.41
371 0.35
372 0.37
373 0.36
374 0.35
375 0.4
376 0.37
377 0.4
378 0.42
379 0.47
380 0.5
381 0.58
382 0.65
383 0.67
384 0.76
385 0.83
386 0.84
387 0.86
388 0.89
389 0.9
390 0.88
391 0.87
392 0.84
393 0.79
394 0.72
395 0.65
396 0.64
397 0.54
398 0.47
399 0.4
400 0.32
401 0.25
402 0.22
403 0.19
404 0.1
405 0.11
406 0.11
407 0.12
408 0.17
409 0.17
410 0.17
411 0.17
412 0.19
413 0.22
414 0.21
415 0.21
416 0.18
417 0.2
418 0.19
419 0.2
420 0.18
421 0.14
422 0.14
423 0.12
424 0.11
425 0.09
426 0.09
427 0.1
428 0.1
429 0.09
430 0.12
431 0.15
432 0.2
433 0.22
434 0.21
435 0.2
436 0.2
437 0.24
438 0.22
439 0.22
440 0.18
441 0.18
442 0.19
443 0.19
444 0.2
445 0.17
446 0.17
447 0.19
448 0.19
449 0.19
450 0.2
451 0.19
452 0.18
453 0.19
454 0.19
455 0.18
456 0.17
457 0.17
458 0.16
459 0.16
460 0.16
461 0.15
462 0.14
463 0.12
464 0.13
465 0.14
466 0.17
467 0.18
468 0.19
469 0.19
470 0.2
471 0.2
472 0.18
473 0.17
474 0.14
475 0.18
476 0.22
477 0.22
478 0.23
479 0.24
480 0.24
481 0.25
482 0.31
483 0.3
484 0.28
485 0.29
486 0.31
487 0.34
488 0.37
489 0.41
490 0.42
491 0.39
492 0.35
493 0.32
494 0.29
495 0.25
496 0.22
497 0.16
498 0.09
499 0.07
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.1
504 0.09
505 0.09
506 0.15
507 0.17
508 0.18
509 0.2
510 0.2
511 0.23
512 0.26
513 0.29
514 0.3
515 0.36
516 0.41
517 0.41
518 0.47
519 0.47
520 0.5
521 0.5
522 0.44
523 0.39
524 0.37
525 0.37
526 0.32
527 0.3
528 0.26
529 0.25
530 0.24
531 0.22
532 0.18
533 0.19
534 0.18
535 0.16
536 0.17
537 0.15
538 0.15
539 0.17
540 0.18
541 0.17
542 0.19
543 0.18
544 0.18
545 0.19
546 0.19
547 0.16
548 0.15
549 0.16
550 0.12
551 0.16