Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A090CDX4

Protein Details
Accession A0A090CDX4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
19-38GGYNRKRRYRDDNEDDNHYRBasic
775-794LVRRWGTRWLRVFKRRQAIEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
822-836RREERERKEAEEKER
Subcellular Location(s) cyto 10.5, cyto_nucl 10, nucl 8.5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027159  CBP80  
IPR015172  MIF4G-like_typ-1  
IPR015174  MIF4G-like_typ-2  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0016070  P:RNA metabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF09088  MIF4G_like  
PF09090  MIF4G_like_2  
Amino Acid Sequences MADYDRRGGGGGGRGGGGGGYNRKRRYRDDNEDDNHYRGNNSRRRYDAPPHVRLRKQLIAIAENPMIERHDEISQIANLFTDNWDDDVLLRGNFTDLVLQLCVEQPLKTPFLAGVLMVVNTNKPEAMDLLLEKAARLIEDKLREGGWRDVKLYLKLVGCLQGVLEGEGVFGVLGELFERAVGLQTASSEDTIGTEIVKIILLTLPYVMAAGSPEQVQQEWQQKAADLLENTAIIASEPHPLQAVIEPYHPEAGEENPAQSQSLISLLQAQLQAEAAQGWALSCLPRPWQFPVGEVETVAKLASAKKHVLPNIVIPKTVVRGPRPLFPEVYISVYGQQEVESVPPPTSLASSLIRDALLDTINVLHFNRNATARQLIEVDCYFAPRTFALRGTPFDRLRDIEKSKSTWKPEDVAVDAVFTQLFLLPNPEHKLVYYHSVLTEACKLAPAAIAPSLGRAIRYLYRNAPRMDLELAYRFMDWFSHHLSNFGFTWKWTEWVDDVELSGLHPRKAFIVGSIDKEIRLSFAQRIKNTLPEPYQKLIGPEKEKDVPDFKFANDDTPFAAEGREIAALLKRKAPDEEIDAVIQRIQSQAIDRDLDALVASTDVFVTCVLYVGSKSLSHVLAAIERTKDRLADAGAASDASRTQIIEAVMTYWSVHPGVALSIVEKLLNYSILTPLTVINWALNVQAGKTRGEALAWAHMYELVFNTVIKVTGRVRQLVVKASQPDEMVDDETRDNEVRNMRELFRAIEDSLGAWAGGTKDEMLESNARGEEDGLVRRWGTRWLRVFKRRQAIEEAFLVEAVRERERREEVRKEWEVVERQRREERERKEAEEKERNGANGAEEKKKENGVEGEVNIIE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.18
3 0.17
4 0.15
5 0.12
6 0.19
7 0.27
8 0.36
9 0.43
10 0.51
11 0.56
12 0.63
13 0.7
14 0.71
15 0.74
16 0.76
17 0.79
18 0.76
19 0.8
20 0.76
21 0.68
22 0.59
23 0.49
24 0.42
25 0.39
26 0.45
27 0.43
28 0.46
29 0.51
30 0.55
31 0.6
32 0.65
33 0.68
34 0.69
35 0.71
36 0.74
37 0.76
38 0.79
39 0.78
40 0.77
41 0.75
42 0.71
43 0.64
44 0.57
45 0.53
46 0.48
47 0.45
48 0.44
49 0.37
50 0.3
51 0.27
52 0.25
53 0.21
54 0.17
55 0.17
56 0.15
57 0.15
58 0.16
59 0.16
60 0.19
61 0.19
62 0.19
63 0.17
64 0.15
65 0.13
66 0.13
67 0.13
68 0.12
69 0.11
70 0.11
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.15
75 0.16
76 0.13
77 0.12
78 0.11
79 0.12
80 0.12
81 0.12
82 0.1
83 0.09
84 0.11
85 0.11
86 0.11
87 0.11
88 0.12
89 0.14
90 0.13
91 0.12
92 0.14
93 0.19
94 0.21
95 0.2
96 0.19
97 0.17
98 0.18
99 0.18
100 0.13
101 0.11
102 0.1
103 0.1
104 0.1
105 0.1
106 0.09
107 0.1
108 0.1
109 0.09
110 0.08
111 0.09
112 0.09
113 0.1
114 0.12
115 0.12
116 0.14
117 0.15
118 0.15
119 0.14
120 0.14
121 0.13
122 0.11
123 0.12
124 0.13
125 0.17
126 0.21
127 0.23
128 0.24
129 0.24
130 0.26
131 0.28
132 0.33
133 0.34
134 0.32
135 0.32
136 0.35
137 0.37
138 0.38
139 0.37
140 0.33
141 0.27
142 0.26
143 0.26
144 0.25
145 0.22
146 0.19
147 0.17
148 0.14
149 0.13
150 0.13
151 0.12
152 0.08
153 0.07
154 0.07
155 0.07
156 0.04
157 0.04
158 0.03
159 0.03
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.04
166 0.04
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.05
171 0.06
172 0.08
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.09
179 0.08
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.06
186 0.05
187 0.07
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.04
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.06
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.11
204 0.16
205 0.24
206 0.24
207 0.25
208 0.24
209 0.24
210 0.25
211 0.25
212 0.23
213 0.15
214 0.15
215 0.14
216 0.14
217 0.13
218 0.12
219 0.1
220 0.06
221 0.07
222 0.06
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.12
230 0.15
231 0.13
232 0.14
233 0.16
234 0.16
235 0.18
236 0.17
237 0.15
238 0.12
239 0.13
240 0.16
241 0.15
242 0.15
243 0.14
244 0.14
245 0.14
246 0.13
247 0.11
248 0.06
249 0.08
250 0.07
251 0.06
252 0.09
253 0.09
254 0.12
255 0.13
256 0.12
257 0.11
258 0.11
259 0.11
260 0.08
261 0.08
262 0.05
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.05
269 0.06
270 0.07
271 0.12
272 0.15
273 0.18
274 0.22
275 0.27
276 0.27
277 0.28
278 0.31
279 0.3
280 0.26
281 0.24
282 0.21
283 0.15
284 0.15
285 0.13
286 0.09
287 0.06
288 0.08
289 0.11
290 0.14
291 0.16
292 0.2
293 0.25
294 0.26
295 0.29
296 0.28
297 0.32
298 0.38
299 0.36
300 0.32
301 0.28
302 0.27
303 0.26
304 0.28
305 0.24
306 0.17
307 0.25
308 0.27
309 0.32
310 0.35
311 0.35
312 0.33
313 0.3
314 0.31
315 0.24
316 0.25
317 0.2
318 0.16
319 0.17
320 0.16
321 0.16
322 0.12
323 0.11
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.07
328 0.08
329 0.08
330 0.08
331 0.08
332 0.08
333 0.08
334 0.08
335 0.09
336 0.1
337 0.11
338 0.12
339 0.12
340 0.11
341 0.11
342 0.1
343 0.09
344 0.07
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.08
353 0.09
354 0.11
355 0.12
356 0.13
357 0.14
358 0.16
359 0.15
360 0.15
361 0.16
362 0.14
363 0.14
364 0.14
365 0.14
366 0.11
367 0.12
368 0.12
369 0.1
370 0.11
371 0.09
372 0.12
373 0.1
374 0.12
375 0.13
376 0.15
377 0.17
378 0.19
379 0.25
380 0.24
381 0.24
382 0.24
383 0.23
384 0.24
385 0.29
386 0.3
387 0.27
388 0.29
389 0.31
390 0.36
391 0.4
392 0.41
393 0.38
394 0.36
395 0.34
396 0.33
397 0.32
398 0.27
399 0.23
400 0.18
401 0.15
402 0.13
403 0.11
404 0.09
405 0.06
406 0.05
407 0.05
408 0.05
409 0.04
410 0.07
411 0.07
412 0.11
413 0.14
414 0.14
415 0.13
416 0.13
417 0.15
418 0.14
419 0.18
420 0.16
421 0.13
422 0.12
423 0.14
424 0.13
425 0.13
426 0.14
427 0.1
428 0.09
429 0.09
430 0.09
431 0.08
432 0.08
433 0.07
434 0.05
435 0.06
436 0.06
437 0.05
438 0.06
439 0.07
440 0.07
441 0.07
442 0.06
443 0.08
444 0.12
445 0.14
446 0.16
447 0.22
448 0.27
449 0.32
450 0.33
451 0.33
452 0.29
453 0.29
454 0.28
455 0.22
456 0.18
457 0.15
458 0.15
459 0.14
460 0.13
461 0.11
462 0.1
463 0.1
464 0.09
465 0.1
466 0.13
467 0.16
468 0.16
469 0.17
470 0.17
471 0.18
472 0.18
473 0.17
474 0.12
475 0.09
476 0.14
477 0.13
478 0.15
479 0.14
480 0.15
481 0.14
482 0.15
483 0.16
484 0.11
485 0.11
486 0.09
487 0.08
488 0.07
489 0.12
490 0.11
491 0.11
492 0.11
493 0.12
494 0.12
495 0.14
496 0.14
497 0.1
498 0.16
499 0.17
500 0.19
501 0.22
502 0.21
503 0.19
504 0.2
505 0.18
506 0.13
507 0.12
508 0.12
509 0.14
510 0.21
511 0.26
512 0.26
513 0.31
514 0.31
515 0.36
516 0.35
517 0.34
518 0.32
519 0.33
520 0.37
521 0.34
522 0.35
523 0.29
524 0.32
525 0.32
526 0.34
527 0.32
528 0.29
529 0.32
530 0.35
531 0.35
532 0.34
533 0.34
534 0.29
535 0.3
536 0.29
537 0.25
538 0.26
539 0.25
540 0.28
541 0.24
542 0.23
543 0.18
544 0.18
545 0.19
546 0.14
547 0.14
548 0.08
549 0.07
550 0.08
551 0.07
552 0.06
553 0.06
554 0.1
555 0.13
556 0.15
557 0.18
558 0.18
559 0.2
560 0.21
561 0.23
562 0.21
563 0.22
564 0.24
565 0.22
566 0.22
567 0.21
568 0.2
569 0.18
570 0.16
571 0.11
572 0.08
573 0.07
574 0.07
575 0.09
576 0.12
577 0.13
578 0.14
579 0.13
580 0.15
581 0.15
582 0.14
583 0.12
584 0.09
585 0.07
586 0.06
587 0.06
588 0.04
589 0.04
590 0.04
591 0.04
592 0.04
593 0.04
594 0.04
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.06
600 0.07
601 0.07
602 0.08
603 0.11
604 0.11
605 0.1
606 0.11
607 0.11
608 0.12
609 0.14
610 0.15
611 0.15
612 0.15
613 0.17
614 0.17
615 0.17
616 0.15
617 0.15
618 0.14
619 0.15
620 0.15
621 0.14
622 0.13
623 0.13
624 0.12
625 0.1
626 0.09
627 0.07
628 0.07
629 0.06
630 0.06
631 0.09
632 0.09
633 0.09
634 0.09
635 0.09
636 0.09
637 0.09
638 0.1
639 0.07
640 0.08
641 0.08
642 0.08
643 0.07
644 0.07
645 0.07
646 0.07
647 0.07
648 0.06
649 0.07
650 0.08
651 0.08
652 0.07
653 0.08
654 0.07
655 0.08
656 0.08
657 0.08
658 0.09
659 0.1
660 0.1
661 0.1
662 0.09
663 0.09
664 0.1
665 0.09
666 0.07
667 0.08
668 0.08
669 0.08
670 0.09
671 0.08
672 0.08
673 0.12
674 0.13
675 0.13
676 0.14
677 0.16
678 0.14
679 0.14
680 0.15
681 0.13
682 0.19
683 0.18
684 0.17
685 0.15
686 0.17
687 0.16
688 0.15
689 0.15
690 0.09
691 0.09
692 0.09
693 0.1
694 0.09
695 0.11
696 0.1
697 0.13
698 0.14
699 0.19
700 0.22
701 0.23
702 0.25
703 0.29
704 0.31
705 0.34
706 0.34
707 0.34
708 0.35
709 0.34
710 0.35
711 0.3
712 0.28
713 0.23
714 0.22
715 0.2
716 0.17
717 0.17
718 0.15
719 0.16
720 0.18
721 0.17
722 0.16
723 0.18
724 0.23
725 0.23
726 0.28
727 0.31
728 0.3
729 0.33
730 0.34
731 0.31
732 0.29
733 0.3
734 0.24
735 0.22
736 0.2
737 0.16
738 0.16
739 0.13
740 0.09
741 0.06
742 0.07
743 0.07
744 0.07
745 0.08
746 0.07
747 0.07
748 0.08
749 0.09
750 0.11
751 0.13
752 0.14
753 0.16
754 0.17
755 0.17
756 0.17
757 0.16
758 0.16
759 0.18
760 0.21
761 0.2
762 0.21
763 0.21
764 0.22
765 0.22
766 0.29
767 0.3
768 0.35
769 0.42
770 0.5
771 0.6
772 0.69
773 0.78
774 0.78
775 0.83
776 0.78
777 0.73
778 0.73
779 0.67
780 0.61
781 0.54
782 0.47
783 0.37
784 0.33
785 0.28
786 0.19
787 0.18
788 0.17
789 0.19
790 0.2
791 0.22
792 0.29
793 0.36
794 0.44
795 0.5
796 0.56
797 0.56
798 0.64
799 0.66
800 0.63
801 0.59
802 0.6
803 0.59
804 0.6
805 0.65
806 0.6
807 0.62
808 0.67
809 0.71
810 0.72
811 0.72
812 0.7
813 0.71
814 0.71
815 0.72
816 0.73
817 0.74
818 0.75
819 0.76
820 0.71
821 0.68
822 0.65
823 0.58
824 0.51
825 0.44
826 0.38
827 0.36
828 0.38
829 0.39
830 0.38
831 0.41
832 0.42
833 0.46
834 0.42
835 0.4
836 0.39
837 0.37
838 0.4
839 0.37