Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2XHE6

Protein Details
Accession V2XHE6    Localization Confidence Low Confidence Score 7.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
6-25RGYGGRRRYRDDYDDRRREPBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 7.5, cyto_nucl 6, pero 4, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027159  CBP80  
IPR015172  MIF4G-like_typ-1  
IPR015174  MIF4G-like_typ-2  
IPR003890  MIF4G-like_typ-3  
Gene Ontology GO:0005846  C:nuclear cap binding complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0000339  F:RNA cap binding  
GO:0006406  P:mRNA export from nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG mrr:Moror_8845  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09088  MIF4G_like  
PF09090  MIF4G_like_2  
Amino Acid Sequences MSYERRGYGGRRRYRDDYDDRRREPIETPQDKLKAAIIKLGEVDPVQELPHIQTQIRGLPPVLSNLSEAFHISVTEQPFKIPYYAALLRLLHEKASEDDTGPLLGKQILEEFWKGFQAYVDKLAWRETRFCVHFFAHLTAAGLVSAESFTALLQSFTAVLDEFGVSHGRGKRAALCAAEGLMIAGTSIKAHSATSVSDIITAIQTFIDTTGNPKWLVQPTLKLHSPTVDADSADELLDSALAALRALEAVDFDGPYPRPYLDYSELDPTFTPFDLPSVLVTPEVIELDGLSNETEESEPGTSIKKDEWPEYYLRLFSDDITPDPNTPAGYAVRTGLLAIIDIFEVNRKECARLLLEYPKWTLPGTFKPKPGAPPPEHEPIVSKDWQLESTLLEILLGSSFVLPESTQKQIYYIGLITEVCKLAPSTGGPAVGKSIRRLFSMLSDGLDVEIARRYSEWFSTHMSNFNFQWVWKEWIPDLALCDKHPKRNFIRRALELEIRLSYYDRIAKSIPQEMHPAEAFCLPSQAPGPDFEYDDPAKPHHDAAQSILNLFRGRAQAGDVIAHLDTLKNNLENESSDSGQLVNVDTAMRSIAIQSLLHIGSRSFSHLLNAIERYLSLLRFIANGGVSEAPGGGIPEAKSDILNAVAAFWKNDKLMVNIVFDKLMQYQIVDPADVVKWTFTNVSETEDELKTPLTLTAFEWSLLKGALDKANGRVTIARRKLAALRKEDDETKARANAGTTGDMDVDDVKPVTETSGAENPALASAIKALSILTREQKNTLSRTLEGFTNCLAPPLSSVSPEAQAILTEKSWHNRANWGRDEWNFWETWAWYRHFCRTYSPYLRSYSATLSTVSFARLEGSKDPAAELLQKIWNVAIGQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.74
2 0.76
3 0.76
4 0.77
5 0.78
6 0.81
7 0.76
8 0.76
9 0.69
10 0.63
11 0.56
12 0.56
13 0.56
14 0.5
15 0.51
16 0.53
17 0.55
18 0.53
19 0.5
20 0.45
21 0.4
22 0.36
23 0.37
24 0.29
25 0.27
26 0.29
27 0.28
28 0.24
29 0.17
30 0.18
31 0.14
32 0.14
33 0.13
34 0.12
35 0.12
36 0.14
37 0.2
38 0.21
39 0.19
40 0.22
41 0.25
42 0.31
43 0.32
44 0.3
45 0.25
46 0.26
47 0.27
48 0.29
49 0.28
50 0.22
51 0.21
52 0.2
53 0.2
54 0.17
55 0.17
56 0.13
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.14
61 0.18
62 0.23
63 0.22
64 0.22
65 0.24
66 0.25
67 0.25
68 0.21
69 0.18
70 0.2
71 0.23
72 0.24
73 0.26
74 0.25
75 0.26
76 0.3
77 0.29
78 0.22
79 0.2
80 0.2
81 0.18
82 0.21
83 0.21
84 0.17
85 0.18
86 0.18
87 0.19
88 0.17
89 0.15
90 0.13
91 0.12
92 0.11
93 0.11
94 0.12
95 0.12
96 0.14
97 0.16
98 0.16
99 0.16
100 0.18
101 0.18
102 0.16
103 0.17
104 0.18
105 0.18
106 0.22
107 0.22
108 0.22
109 0.22
110 0.29
111 0.31
112 0.3
113 0.32
114 0.3
115 0.37
116 0.38
117 0.39
118 0.37
119 0.34
120 0.35
121 0.34
122 0.33
123 0.26
124 0.23
125 0.23
126 0.19
127 0.17
128 0.13
129 0.1
130 0.07
131 0.06
132 0.06
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.08
145 0.06
146 0.06
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.07
151 0.08
152 0.08
153 0.14
154 0.17
155 0.18
156 0.19
157 0.21
158 0.25
159 0.28
160 0.32
161 0.27
162 0.24
163 0.23
164 0.22
165 0.21
166 0.15
167 0.11
168 0.07
169 0.06
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.07
179 0.08
180 0.08
181 0.11
182 0.13
183 0.12
184 0.12
185 0.12
186 0.12
187 0.12
188 0.11
189 0.08
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.06
196 0.1
197 0.13
198 0.15
199 0.16
200 0.16
201 0.21
202 0.24
203 0.28
204 0.26
205 0.3
206 0.33
207 0.39
208 0.41
209 0.38
210 0.34
211 0.33
212 0.33
213 0.27
214 0.26
215 0.21
216 0.18
217 0.17
218 0.17
219 0.15
220 0.13
221 0.11
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.04
226 0.03
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.03
231 0.04
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.03
236 0.04
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.09
241 0.1
242 0.11
243 0.12
244 0.11
245 0.13
246 0.14
247 0.19
248 0.21
249 0.23
250 0.24
251 0.3
252 0.3
253 0.29
254 0.28
255 0.24
256 0.2
257 0.17
258 0.16
259 0.09
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.08
269 0.08
270 0.07
271 0.06
272 0.05
273 0.04
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.04
279 0.04
280 0.05
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.07
286 0.07
287 0.1
288 0.09
289 0.1
290 0.12
291 0.16
292 0.18
293 0.21
294 0.23
295 0.24
296 0.26
297 0.28
298 0.28
299 0.23
300 0.21
301 0.21
302 0.18
303 0.16
304 0.18
305 0.15
306 0.14
307 0.16
308 0.17
309 0.15
310 0.16
311 0.15
312 0.12
313 0.11
314 0.12
315 0.1
316 0.1
317 0.1
318 0.09
319 0.09
320 0.09
321 0.08
322 0.07
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.06
331 0.07
332 0.07
333 0.11
334 0.11
335 0.12
336 0.13
337 0.16
338 0.16
339 0.17
340 0.2
341 0.24
342 0.26
343 0.26
344 0.27
345 0.25
346 0.24
347 0.22
348 0.2
349 0.17
350 0.24
351 0.31
352 0.34
353 0.35
354 0.38
355 0.4
356 0.43
357 0.46
358 0.46
359 0.4
360 0.41
361 0.43
362 0.46
363 0.44
364 0.39
365 0.35
366 0.3
367 0.31
368 0.27
369 0.22
370 0.18
371 0.18
372 0.19
373 0.17
374 0.14
375 0.1
376 0.1
377 0.1
378 0.08
379 0.07
380 0.06
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.03
388 0.03
389 0.03
390 0.06
391 0.08
392 0.1
393 0.11
394 0.11
395 0.12
396 0.13
397 0.13
398 0.12
399 0.1
400 0.08
401 0.08
402 0.08
403 0.08
404 0.08
405 0.08
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.07
413 0.08
414 0.1
415 0.09
416 0.09
417 0.11
418 0.12
419 0.13
420 0.13
421 0.17
422 0.17
423 0.17
424 0.18
425 0.17
426 0.16
427 0.19
428 0.17
429 0.12
430 0.11
431 0.11
432 0.1
433 0.1
434 0.07
435 0.05
436 0.06
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.08
441 0.09
442 0.11
443 0.12
444 0.12
445 0.15
446 0.18
447 0.19
448 0.22
449 0.21
450 0.22
451 0.2
452 0.21
453 0.18
454 0.15
455 0.18
456 0.16
457 0.2
458 0.19
459 0.2
460 0.18
461 0.2
462 0.21
463 0.17
464 0.16
465 0.15
466 0.15
467 0.14
468 0.24
469 0.24
470 0.31
471 0.34
472 0.4
473 0.45
474 0.54
475 0.61
476 0.61
477 0.65
478 0.6
479 0.61
480 0.58
481 0.52
482 0.43
483 0.37
484 0.27
485 0.21
486 0.19
487 0.15
488 0.11
489 0.1
490 0.14
491 0.13
492 0.14
493 0.15
494 0.17
495 0.18
496 0.24
497 0.23
498 0.21
499 0.25
500 0.23
501 0.25
502 0.23
503 0.21
504 0.15
505 0.16
506 0.15
507 0.1
508 0.12
509 0.09
510 0.1
511 0.1
512 0.1
513 0.09
514 0.1
515 0.12
516 0.12
517 0.13
518 0.13
519 0.17
520 0.17
521 0.18
522 0.18
523 0.16
524 0.18
525 0.17
526 0.18
527 0.18
528 0.19
529 0.17
530 0.19
531 0.24
532 0.22
533 0.21
534 0.21
535 0.18
536 0.16
537 0.15
538 0.15
539 0.11
540 0.11
541 0.11
542 0.11
543 0.11
544 0.12
545 0.12
546 0.09
547 0.09
548 0.09
549 0.09
550 0.07
551 0.06
552 0.06
553 0.08
554 0.09
555 0.09
556 0.1
557 0.11
558 0.12
559 0.12
560 0.16
561 0.17
562 0.16
563 0.15
564 0.15
565 0.14
566 0.13
567 0.12
568 0.09
569 0.06
570 0.06
571 0.06
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.04
577 0.05
578 0.06
579 0.07
580 0.07
581 0.07
582 0.1
583 0.1
584 0.1
585 0.1
586 0.09
587 0.09
588 0.1
589 0.12
590 0.11
591 0.11
592 0.12
593 0.15
594 0.16
595 0.18
596 0.18
597 0.15
598 0.14
599 0.14
600 0.16
601 0.14
602 0.12
603 0.1
604 0.1
605 0.1
606 0.1
607 0.11
608 0.09
609 0.08
610 0.08
611 0.09
612 0.08
613 0.08
614 0.08
615 0.07
616 0.06
617 0.05
618 0.06
619 0.04
620 0.06
621 0.06
622 0.07
623 0.09
624 0.09
625 0.09
626 0.09
627 0.09
628 0.08
629 0.09
630 0.07
631 0.07
632 0.09
633 0.1
634 0.1
635 0.11
636 0.12
637 0.12
638 0.14
639 0.15
640 0.14
641 0.19
642 0.2
643 0.22
644 0.22
645 0.22
646 0.2
647 0.19
648 0.18
649 0.14
650 0.13
651 0.1
652 0.09
653 0.1
654 0.14
655 0.15
656 0.13
657 0.12
658 0.13
659 0.13
660 0.13
661 0.12
662 0.08
663 0.08
664 0.09
665 0.11
666 0.09
667 0.13
668 0.13
669 0.17
670 0.17
671 0.19
672 0.22
673 0.21
674 0.2
675 0.17
676 0.17
677 0.13
678 0.12
679 0.12
680 0.09
681 0.09
682 0.1
683 0.13
684 0.13
685 0.13
686 0.13
687 0.12
688 0.12
689 0.11
690 0.1
691 0.08
692 0.11
693 0.14
694 0.16
695 0.17
696 0.2
697 0.24
698 0.24
699 0.24
700 0.26
701 0.28
702 0.37
703 0.4
704 0.38
705 0.35
706 0.38
707 0.44
708 0.48
709 0.5
710 0.47
711 0.46
712 0.47
713 0.5
714 0.5
715 0.48
716 0.44
717 0.4
718 0.37
719 0.35
720 0.32
721 0.29
722 0.28
723 0.27
724 0.25
725 0.23
726 0.2
727 0.18
728 0.18
729 0.17
730 0.16
731 0.13
732 0.11
733 0.1
734 0.09
735 0.08
736 0.09
737 0.09
738 0.09
739 0.1
740 0.1
741 0.14
742 0.19
743 0.2
744 0.2
745 0.2
746 0.19
747 0.17
748 0.17
749 0.12
750 0.07
751 0.07
752 0.08
753 0.07
754 0.07
755 0.07
756 0.08
757 0.1
758 0.14
759 0.19
760 0.25
761 0.26
762 0.29
763 0.35
764 0.4
765 0.42
766 0.44
767 0.41
768 0.38
769 0.39
770 0.39
771 0.37
772 0.32
773 0.29
774 0.24
775 0.24
776 0.22
777 0.21
778 0.19
779 0.15
780 0.15
781 0.2
782 0.2
783 0.17
784 0.19
785 0.2
786 0.21
787 0.21
788 0.2
789 0.14
790 0.14
791 0.15
792 0.15
793 0.14
794 0.16
795 0.19
796 0.24
797 0.29
798 0.32
799 0.32
800 0.39
801 0.47
802 0.52
803 0.55
804 0.55
805 0.56
806 0.55
807 0.59
808 0.54
809 0.49
810 0.39
811 0.33
812 0.31
813 0.26
814 0.31
815 0.3
816 0.29
817 0.33
818 0.37
819 0.46
820 0.46
821 0.45
822 0.48
823 0.48
824 0.56
825 0.59
826 0.6
827 0.56
828 0.57
829 0.59
830 0.52
831 0.49
832 0.43
833 0.37
834 0.32
835 0.28
836 0.25
837 0.24
838 0.23
839 0.21
840 0.17
841 0.13
842 0.15
843 0.15
844 0.18
845 0.19
846 0.24
847 0.25
848 0.25
849 0.25
850 0.24
851 0.24
852 0.25
853 0.24
854 0.23
855 0.25
856 0.25
857 0.25
858 0.24
859 0.24