Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2XVC2

Protein Details
Accession V2XVC2    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
220-247QYKLVMANRKKREPIKPKIARKEKEVTVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-243RKKREPIKPKIARKEK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
KEGG mrr:Moror_8767  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MTTPSGSAVASDVKPKVEHDDTDEQWARTISTAVLQTIDDKKDEASKGPTPDPFLGKQSDTCRFLLDLELYFAMNPVKANTNEKKKMLLLLLVKGNTSEWKQREMMKLFPEDDNPEEKKKAAEETWSSFKQRFQNEWQPVNVVREAQAKIEQIKMTDRADEYVNRFRLIAMDTKYDNEALMRFFREGLPESLQNKIMLRTDGEPETLDEWYKLAIKYDNQYKLVMANRKKREPIKPKIARKEKEVTVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.3
4 0.29
5 0.29
6 0.32
7 0.39
8 0.38
9 0.47
10 0.49
11 0.41
12 0.39
13 0.38
14 0.31
15 0.23
16 0.23
17 0.13
18 0.13
19 0.15
20 0.13
21 0.14
22 0.13
23 0.17
24 0.21
25 0.22
26 0.19
27 0.18
28 0.19
29 0.24
30 0.25
31 0.24
32 0.25
33 0.29
34 0.33
35 0.36
36 0.37
37 0.36
38 0.38
39 0.39
40 0.35
41 0.33
42 0.32
43 0.29
44 0.32
45 0.33
46 0.37
47 0.36
48 0.34
49 0.32
50 0.29
51 0.29
52 0.26
53 0.22
54 0.15
55 0.14
56 0.14
57 0.12
58 0.11
59 0.11
60 0.09
61 0.08
62 0.08
63 0.07
64 0.11
65 0.13
66 0.21
67 0.28
68 0.37
69 0.42
70 0.43
71 0.44
72 0.4
73 0.42
74 0.35
75 0.33
76 0.25
77 0.23
78 0.25
79 0.23
80 0.22
81 0.19
82 0.19
83 0.16
84 0.16
85 0.19
86 0.17
87 0.21
88 0.23
89 0.27
90 0.34
91 0.34
92 0.36
93 0.32
94 0.34
95 0.32
96 0.3
97 0.28
98 0.22
99 0.22
100 0.23
101 0.22
102 0.22
103 0.21
104 0.2
105 0.19
106 0.18
107 0.19
108 0.15
109 0.17
110 0.18
111 0.21
112 0.26
113 0.27
114 0.28
115 0.26
116 0.3
117 0.31
118 0.32
119 0.32
120 0.34
121 0.43
122 0.47
123 0.48
124 0.45
125 0.41
126 0.38
127 0.37
128 0.3
129 0.2
130 0.15
131 0.18
132 0.18
133 0.17
134 0.18
135 0.17
136 0.17
137 0.2
138 0.19
139 0.15
140 0.18
141 0.2
142 0.18
143 0.19
144 0.18
145 0.16
146 0.18
147 0.2
148 0.22
149 0.27
150 0.28
151 0.26
152 0.26
153 0.24
154 0.24
155 0.22
156 0.23
157 0.17
158 0.19
159 0.19
160 0.2
161 0.21
162 0.2
163 0.18
164 0.13
165 0.12
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.12
170 0.13
171 0.13
172 0.16
173 0.17
174 0.19
175 0.21
176 0.25
177 0.25
178 0.27
179 0.28
180 0.27
181 0.25
182 0.24
183 0.23
184 0.18
185 0.2
186 0.19
187 0.22
188 0.21
189 0.21
190 0.19
191 0.19
192 0.19
193 0.18
194 0.16
195 0.12
196 0.11
197 0.12
198 0.14
199 0.13
200 0.14
201 0.17
202 0.2
203 0.27
204 0.36
205 0.41
206 0.4
207 0.4
208 0.38
209 0.39
210 0.44
211 0.45
212 0.46
213 0.49
214 0.57
215 0.64
216 0.72
217 0.75
218 0.78
219 0.79
220 0.81
221 0.82
222 0.84
223 0.87
224 0.9
225 0.92
226 0.86
227 0.83
228 0.81