Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2XHE1

Protein Details
Accession V2XHE1    Localization Confidence High Confidence Score 18
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-58SESQYPGKRPKIEKDTKSKKLTKKNAKKLKKQRQTLPENCSPEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-48GKRPKIEKDTKSKKLTKKNAKKLKKQR
Subcellular Location(s) nucl 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012340  NA-bd_OB-fold  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR002792  TRAM_dom  
IPR010280  U5_MeTrfase_fam  
Gene Ontology GO:0008173  F:RNA methyltransferase activity  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG mrr:Moror_10437  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05958  tRNA_U5-meth_tr  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51687  SAM_MT_RNA_M5U  
PS50926  TRAM  
Amino Acid Sequences MSSSPKTGQVRPLPESESQYPGKRPKIEKDTKSKKLTKKNAKKLKKQRQTLPENCSPEDVQWKDIVSLLGENVINGAIEEGSEFQSPFAYHEVLELEVKMICSNGDGLAQSDREDIRPWVVVVPFAMPGERVRAKIFRNERMHSMADFIEIVRPNLELRDDARIKCKYFSKCGGCQYQMLSYEKQLEFKRDVVVKAYKNYSNLLESSVPTIQPTMPSPLQYGYRTKITPHFQAPPKLDRDVLQKEVSDGKVPDWLKIGFNYQGQNKVIDIEECPIATPILNDALPGVRDNIYKTIHTYKKGATLLLRESIDTSGDADGKACITSNHASIREKVGDFSFEYLAGSFFQNNNSILPSLTSYVRDAIFSLYPPEDSARPTHLIDTYCGSGLFAITLSPYFSQIAGIEISADSILYASHNARLNNIP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.54
3 0.48
4 0.46
5 0.44
6 0.45
7 0.49
8 0.54
9 0.58
10 0.59
11 0.62
12 0.66
13 0.73
14 0.78
15 0.79
16 0.82
17 0.84
18 0.85
19 0.89
20 0.88
21 0.87
22 0.87
23 0.89
24 0.89
25 0.9
26 0.91
27 0.92
28 0.93
29 0.94
30 0.95
31 0.95
32 0.94
33 0.92
34 0.91
35 0.91
36 0.91
37 0.89
38 0.86
39 0.83
40 0.78
41 0.7
42 0.64
43 0.54
44 0.46
45 0.47
46 0.4
47 0.33
48 0.3
49 0.29
50 0.26
51 0.27
52 0.24
53 0.15
54 0.14
55 0.12
56 0.14
57 0.12
58 0.12
59 0.1
60 0.09
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.04
65 0.04
66 0.05
67 0.06
68 0.08
69 0.09
70 0.09
71 0.08
72 0.1
73 0.11
74 0.12
75 0.14
76 0.12
77 0.11
78 0.12
79 0.13
80 0.13
81 0.13
82 0.11
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.09
87 0.08
88 0.06
89 0.06
90 0.07
91 0.07
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.13
99 0.13
100 0.13
101 0.15
102 0.15
103 0.14
104 0.15
105 0.15
106 0.16
107 0.15
108 0.14
109 0.13
110 0.13
111 0.12
112 0.11
113 0.1
114 0.08
115 0.08
116 0.14
117 0.16
118 0.16
119 0.18
120 0.23
121 0.25
122 0.33
123 0.39
124 0.43
125 0.48
126 0.49
127 0.5
128 0.49
129 0.49
130 0.4
131 0.36
132 0.26
133 0.2
134 0.17
135 0.14
136 0.14
137 0.13
138 0.13
139 0.11
140 0.11
141 0.1
142 0.11
143 0.12
144 0.08
145 0.09
146 0.18
147 0.2
148 0.21
149 0.28
150 0.31
151 0.32
152 0.34
153 0.4
154 0.36
155 0.39
156 0.46
157 0.46
158 0.47
159 0.52
160 0.53
161 0.47
162 0.44
163 0.4
164 0.35
165 0.32
166 0.3
167 0.24
168 0.2
169 0.26
170 0.25
171 0.28
172 0.26
173 0.26
174 0.25
175 0.26
176 0.29
177 0.24
178 0.25
179 0.24
180 0.29
181 0.27
182 0.29
183 0.31
184 0.28
185 0.27
186 0.28
187 0.25
188 0.2
189 0.18
190 0.17
191 0.15
192 0.13
193 0.14
194 0.14
195 0.12
196 0.11
197 0.11
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.14
205 0.15
206 0.17
207 0.18
208 0.2
209 0.18
210 0.21
211 0.2
212 0.21
213 0.26
214 0.28
215 0.3
216 0.31
217 0.36
218 0.37
219 0.43
220 0.45
221 0.44
222 0.43
223 0.39
224 0.36
225 0.31
226 0.34
227 0.32
228 0.32
229 0.28
230 0.25
231 0.25
232 0.28
233 0.26
234 0.21
235 0.17
236 0.14
237 0.19
238 0.2
239 0.19
240 0.18
241 0.19
242 0.17
243 0.17
244 0.19
245 0.15
246 0.18
247 0.21
248 0.2
249 0.25
250 0.25
251 0.25
252 0.22
253 0.21
254 0.19
255 0.16
256 0.15
257 0.11
258 0.11
259 0.1
260 0.1
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.07
265 0.06
266 0.08
267 0.08
268 0.07
269 0.07
270 0.08
271 0.09
272 0.09
273 0.1
274 0.1
275 0.11
276 0.13
277 0.16
278 0.17
279 0.17
280 0.21
281 0.29
282 0.32
283 0.34
284 0.35
285 0.33
286 0.39
287 0.39
288 0.37
289 0.3
290 0.3
291 0.3
292 0.32
293 0.3
294 0.22
295 0.23
296 0.21
297 0.19
298 0.15
299 0.13
300 0.1
301 0.1
302 0.1
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.08
307 0.07
308 0.06
309 0.1
310 0.12
311 0.15
312 0.2
313 0.23
314 0.25
315 0.27
316 0.32
317 0.33
318 0.31
319 0.3
320 0.26
321 0.25
322 0.24
323 0.24
324 0.19
325 0.14
326 0.14
327 0.13
328 0.12
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.11
333 0.13
334 0.16
335 0.16
336 0.16
337 0.17
338 0.16
339 0.14
340 0.15
341 0.14
342 0.14
343 0.15
344 0.15
345 0.15
346 0.17
347 0.17
348 0.17
349 0.15
350 0.16
351 0.16
352 0.15
353 0.18
354 0.15
355 0.15
356 0.16
357 0.19
358 0.17
359 0.18
360 0.21
361 0.22
362 0.24
363 0.25
364 0.26
365 0.28
366 0.28
367 0.27
368 0.28
369 0.25
370 0.23
371 0.22
372 0.19
373 0.15
374 0.13
375 0.12
376 0.08
377 0.06
378 0.06
379 0.06
380 0.08
381 0.09
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.12
386 0.12
387 0.13
388 0.12
389 0.11
390 0.1
391 0.09
392 0.1
393 0.08
394 0.08
395 0.06
396 0.05
397 0.05
398 0.05
399 0.09
400 0.09
401 0.15
402 0.19
403 0.2