FuNGI

V2XP47

Protein Details

Accession

V2XP47

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
158-184	DTMRATKSQKRELKRKRKQKGDLDVVE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
165-177	SQKRELKRKRKQK
228-234	KKAKPKR

Subcellular Location(s)

cysk 13, nucl 7, cyto 4, mito_nucl 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR020472 G-protein_beta_WD-40_rep IPR032847 PRPF17 IPR015943 WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf IPR001680 WD40_repeat IPR019775 WD40_repeat_CS IPR036322 WD40_repeat_dom_sf
Gene Ontology	GO:0071013 C:catalytic step 2 spliceosome GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	mrr:Moror_12708 -
Pfam	View protein in Pfam PF00400 WD40
PROSITE	View protein in PROSITE PS00678 WD_REPEATS_1 PS50082 WD_REPEATS_2 PS50294 WD_REPEATS_REGION
CDD	cd00200 WD40

Amino Acid Sequences

MSLVQGYSSGEDEDVNPADVFGLSSIPAAKKIRTEESTTSTPMTTEAAPHVLAEDPLHQTSLVTRPTDTQMNVNIPYQDMMLPLQGPENPFGDKKRFLNQNALAGHVEEQSMTEHAFRAQHLTHSILGYSANPSIDPNAPAVLGSLEKAQANGFATLDTMRATKSQKRELKRKRKQKGDLDVVEGEGAYVGPWASWEGDEPENHFLTGIEAREGEEEEESEEEEVVPKKAKPKRGAHGQETSVFHGKQMTDYQGRTYMSPPVAEAPNLLQEAGSQECFIPKVCIHTWTGHTQGVSVVRLFPETGHLMLSGSMDTKIKLWDVYTHGNCLRTFHGHVKAVKDVTFSNDGRQFLSCSYDRSIKLWDTETGQCLKRFGNGKIPYVVRFHPDQDKQNIFLAGMSDKKIIQYDMNSGEITQEYDQHLGPVNTITFVDENRRFVTTSDDKTIRAWDFDIPVVIKYIAEPHMHSMPAVTLHPSKRYFAAQSLDNQILIYSTDNFRQNRKKRFAGHSVAGYACQVGFSPDGKWISSGDGEGNVVFWDWKTGRIKSRLKAHSKVVIAHEWLPHETSKVVTASWDGLIKLWD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.16
3	0.15
4	0.14
5	0.14
6	0.14
7	0.13
8	0.09
9	0.08
10	0.07
11	0.08
12	0.12
13	0.12
14	0.18
15	0.2
16	0.22
17	0.26
18	0.32
19	0.39
20	0.4
21	0.46
22	0.45
23	0.5
24	0.52
25	0.49
26	0.45
27	0.37
28	0.33
29	0.27
30	0.24
31	0.17
32	0.15
33	0.15
34	0.16
35	0.16
36	0.15
37	0.15
38	0.14
39	0.14
40	0.13
41	0.14
42	0.16
43	0.17
44	0.17
45	0.16
46	0.15
47	0.18
48	0.24
49	0.24
50	0.21
51	0.22
52	0.24
53	0.28
54	0.33
55	0.31
56	0.29
57	0.3
58	0.34
59	0.35
60	0.34
61	0.31
62	0.26
63	0.25
64	0.22
65	0.17
66	0.13
67	0.12
68	0.11
69	0.11
70	0.1
71	0.12
72	0.13
73	0.14
74	0.15
75	0.16
76	0.17
77	0.19
78	0.24
79	0.28
80	0.32
81	0.34
82	0.4
83	0.47
84	0.47
85	0.55
86	0.54
87	0.56
88	0.51
89	0.5
90	0.42
91	0.34
92	0.32
93	0.23
94	0.19
95	0.11
96	0.11
97	0.1
98	0.1
99	0.1
100	0.09
101	0.09
102	0.11
103	0.12
104	0.12
105	0.16
106	0.16
107	0.18
108	0.2
109	0.22
110	0.22
111	0.21
112	0.2
113	0.16
114	0.15
115	0.13
116	0.13
117	0.12
118	0.1
119	0.1
120	0.11
121	0.13
122	0.15
123	0.15
124	0.14
125	0.13
126	0.12
127	0.12
128	0.12
129	0.1
130	0.08
131	0.08
132	0.08
133	0.09
134	0.09
135	0.09
136	0.09
137	0.1
138	0.12
139	0.12
140	0.11
141	0.09
142	0.1
143	0.1
144	0.1
145	0.09
146	0.07
147	0.07
148	0.11
149	0.15
150	0.21
151	0.28
152	0.37
153	0.44
154	0.53
155	0.64
156	0.71
157	0.79
158	0.83
159	0.87
160	0.87
161	0.9
162	0.91
163	0.9
164	0.89
165	0.88
166	0.8
167	0.74
168	0.64
169	0.54
170	0.44
171	0.33
172	0.22
173	0.12
174	0.09
175	0.04
176	0.03
177	0.03
178	0.03
179	0.03
180	0.04
181	0.05
182	0.05
183	0.06
184	0.09
185	0.11
186	0.12
187	0.14
188	0.17
189	0.17
190	0.17
191	0.16
192	0.12
193	0.12
194	0.14
195	0.12
196	0.09
197	0.09
198	0.1
199	0.1
200	0.11
201	0.09
202	0.07
203	0.07
204	0.07
205	0.07
206	0.07
207	0.06
208	0.06
209	0.05
210	0.07
211	0.08
212	0.09
213	0.1
214	0.11
215	0.2
216	0.24
217	0.33
218	0.39
219	0.46
220	0.54
221	0.63
222	0.69
223	0.66
224	0.67
225	0.62
226	0.58
227	0.52
228	0.47
229	0.4
230	0.33
231	0.27
232	0.23
233	0.21
234	0.18
235	0.18
236	0.19
237	0.18
238	0.19
239	0.2
240	0.21
241	0.21
242	0.2
243	0.19
244	0.19
245	0.17
246	0.17
247	0.16
248	0.15
249	0.15
250	0.14
251	0.13
252	0.1
253	0.12
254	0.12
255	0.11
256	0.08
257	0.07
258	0.09
259	0.1
260	0.09
261	0.07
262	0.06
263	0.07
264	0.08
265	0.08
266	0.08
267	0.07
268	0.12
269	0.12
270	0.14
271	0.16
272	0.18
273	0.2
274	0.21
275	0.24
276	0.2
277	0.19
278	0.17
279	0.17
280	0.16
281	0.14
282	0.11
283	0.09
284	0.08
285	0.09
286	0.08
287	0.07
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.08
292	0.08
293	0.08
294	0.08
295	0.08
296	0.06
297	0.05
298	0.06
299	0.06
300	0.06
301	0.07
302	0.07
303	0.07
304	0.07
305	0.07
306	0.1
307	0.14
308	0.21
309	0.21
310	0.24
311	0.25
312	0.28
313	0.27
314	0.26
315	0.24
316	0.19
317	0.22
318	0.24
319	0.28
320	0.29
321	0.32
322	0.32
323	0.33
324	0.32
325	0.29
326	0.25
327	0.2
328	0.19
329	0.23
330	0.2
331	0.22
332	0.25
333	0.25
334	0.24
335	0.24
336	0.22
337	0.16
338	0.21
339	0.17
340	0.16
341	0.18
342	0.22
343	0.23
344	0.23
345	0.26
346	0.22
347	0.24
348	0.23
349	0.22
350	0.2
351	0.22
352	0.23
353	0.24
354	0.25
355	0.24
356	0.23
357	0.22
358	0.24
359	0.26
360	0.26
361	0.31
362	0.32
363	0.34
364	0.38
365	0.39
366	0.36
367	0.35
368	0.34
369	0.26
370	0.25
371	0.26
372	0.29
373	0.33
374	0.36
375	0.41
376	0.42
377	0.41
378	0.42
379	0.39
380	0.3
381	0.26
382	0.21
383	0.15
384	0.14
385	0.14
386	0.12
387	0.12
388	0.13
389	0.13
390	0.13
391	0.13
392	0.14
393	0.17
394	0.18
395	0.2
396	0.19
397	0.18
398	0.18
399	0.16
400	0.16
401	0.12
402	0.12
403	0.12
404	0.13
405	0.13
406	0.13
407	0.16
408	0.14
409	0.14
410	0.13
411	0.12
412	0.11
413	0.11
414	0.11
415	0.09
416	0.1
417	0.18
418	0.19
419	0.21
420	0.22
421	0.24
422	0.23
423	0.23
424	0.3
425	0.29
426	0.31
427	0.36
428	0.36
429	0.35
430	0.36
431	0.41
432	0.33
433	0.28
434	0.24
435	0.2
436	0.21
437	0.2
438	0.22
439	0.17
440	0.16
441	0.16
442	0.15
443	0.12
444	0.1
445	0.14
446	0.15
447	0.15
448	0.16
449	0.18
450	0.21
451	0.21
452	0.21
453	0.17
454	0.15
455	0.15
456	0.15
457	0.15
458	0.18
459	0.21
460	0.27
461	0.29
462	0.29
463	0.3
464	0.33
465	0.32
466	0.32
467	0.33
468	0.3
469	0.33
470	0.36
471	0.35
472	0.3
473	0.27
474	0.22
475	0.19
476	0.16
477	0.13
478	0.11
479	0.12
480	0.17
481	0.24
482	0.26
483	0.35
484	0.45
485	0.53
486	0.6
487	0.67
488	0.7
489	0.72
490	0.79
491	0.8
492	0.77
493	0.73
494	0.67
495	0.62
496	0.55
497	0.46
498	0.37
499	0.28
500	0.2
501	0.14
502	0.1
503	0.08
504	0.1
505	0.11
506	0.11
507	0.16
508	0.18
509	0.18
510	0.19
511	0.18
512	0.19
513	0.19
514	0.19
515	0.15
516	0.14
517	0.15
518	0.14
519	0.13
520	0.1
521	0.09
522	0.09
523	0.07
524	0.13
525	0.13
526	0.21
527	0.26
528	0.32
529	0.41
530	0.5
531	0.58
532	0.59
533	0.7
534	0.73
535	0.75
536	0.76
537	0.74
538	0.72
539	0.68
540	0.65
541	0.6
542	0.55
543	0.5
544	0.47
545	0.43
546	0.38
547	0.36
548	0.33
549	0.29
550	0.25
551	0.23
552	0.2
553	0.21
554	0.19
555	0.17
556	0.16
557	0.17
558	0.18
559	0.19
560	0.2
561	0.16

V2XP47

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer