Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2WI41

Protein Details
Accession V2WI41    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
394-417LQQADKARERKKEAIKKRFDQMSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
400-410ARERKKEAIKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 4, mito 2, cyto_pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR038729  Rad50/SbcC_AAA  
IPR027131  SMC5  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
KEGG mrr:Moror_9843  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13476  AAA_23  
Amino Acid Sequences MTRRHHQSPTSDNGSLKENKDINLTGCSAVKIKAEKVRQQHQASGRMGKGKKRATEEEEDEDENHDEQDDDAGGDEDDEEGGGSPKGRKRARVNMEGDGRPSQSQAEEVAVIVKTQPRDTDGFIPGQIVRMQLHNFLTYDFTEFACGPYLNMIIGPNGTGKSSIACAIALGLNWPPSILGRAENIQSFVKNDKETGYVEIEMKGPKGKPNLIIRRNINSASKTNSFTLNGKPATGKEVATKMAELNVQISNLCTFLPQDKVSSFAMMSPQQLLKETQRAAGDRNLTAWHETLIKSGSEHRTMLQAIKEEEDQLHQMQERNAAIEKEVERYNERKRIEEQIALFDILIPVARYEELFEKYGRLKLEQRRLHAKVQKLKQKNAPAHELLETLNKDLQQADKARERKKEAIKKRFDQMSSKWNQNTKLASFSPA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.49
3 0.43
4 0.43
5 0.39
6 0.36
7 0.4
8 0.4
9 0.36
10 0.33
11 0.33
12 0.26
13 0.25
14 0.25
15 0.22
16 0.22
17 0.24
18 0.24
19 0.28
20 0.35
21 0.42
22 0.47
23 0.54
24 0.61
25 0.66
26 0.67
27 0.69
28 0.68
29 0.69
30 0.66
31 0.64
32 0.59
33 0.58
34 0.58
35 0.57
36 0.59
37 0.57
38 0.59
39 0.6
40 0.64
41 0.62
42 0.67
43 0.65
44 0.63
45 0.59
46 0.54
47 0.47
48 0.42
49 0.37
50 0.28
51 0.22
52 0.16
53 0.12
54 0.11
55 0.11
56 0.09
57 0.07
58 0.07
59 0.08
60 0.07
61 0.07
62 0.07
63 0.06
64 0.05
65 0.05
66 0.05
67 0.04
68 0.06
69 0.06
70 0.08
71 0.13
72 0.17
73 0.27
74 0.3
75 0.38
76 0.46
77 0.56
78 0.63
79 0.67
80 0.68
81 0.67
82 0.71
83 0.64
84 0.58
85 0.5
86 0.43
87 0.34
88 0.3
89 0.23
90 0.16
91 0.16
92 0.14
93 0.12
94 0.11
95 0.1
96 0.12
97 0.1
98 0.1
99 0.1
100 0.12
101 0.12
102 0.13
103 0.14
104 0.15
105 0.17
106 0.2
107 0.24
108 0.24
109 0.23
110 0.22
111 0.23
112 0.2
113 0.2
114 0.18
115 0.14
116 0.12
117 0.14
118 0.15
119 0.16
120 0.18
121 0.17
122 0.16
123 0.15
124 0.17
125 0.14
126 0.15
127 0.13
128 0.12
129 0.12
130 0.12
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.09
135 0.1
136 0.1
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.07
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.07
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.07
154 0.07
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.06
159 0.07
160 0.07
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.08
167 0.08
168 0.1
169 0.12
170 0.12
171 0.14
172 0.13
173 0.13
174 0.13
175 0.15
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.14
180 0.16
181 0.16
182 0.17
183 0.16
184 0.14
185 0.14
186 0.15
187 0.15
188 0.13
189 0.13
190 0.13
191 0.12
192 0.15
193 0.17
194 0.18
195 0.23
196 0.33
197 0.42
198 0.44
199 0.5
200 0.49
201 0.5
202 0.5
203 0.46
204 0.39
205 0.32
206 0.29
207 0.28
208 0.28
209 0.25
210 0.24
211 0.24
212 0.23
213 0.22
214 0.23
215 0.24
216 0.21
217 0.2
218 0.19
219 0.18
220 0.2
221 0.19
222 0.17
223 0.14
224 0.15
225 0.16
226 0.16
227 0.16
228 0.12
229 0.13
230 0.13
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.09
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.05
241 0.06
242 0.08
243 0.11
244 0.11
245 0.13
246 0.12
247 0.15
248 0.16
249 0.16
250 0.14
251 0.11
252 0.14
253 0.13
254 0.14
255 0.13
256 0.14
257 0.13
258 0.15
259 0.16
260 0.16
261 0.21
262 0.21
263 0.22
264 0.23
265 0.24
266 0.25
267 0.27
268 0.27
269 0.22
270 0.22
271 0.2
272 0.19
273 0.19
274 0.17
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.13
279 0.13
280 0.12
281 0.12
282 0.18
283 0.21
284 0.21
285 0.22
286 0.21
287 0.23
288 0.24
289 0.25
290 0.21
291 0.2
292 0.19
293 0.2
294 0.2
295 0.18
296 0.18
297 0.17
298 0.17
299 0.14
300 0.16
301 0.16
302 0.18
303 0.18
304 0.22
305 0.2
306 0.2
307 0.21
308 0.19
309 0.18
310 0.21
311 0.2
312 0.2
313 0.21
314 0.22
315 0.24
316 0.3
317 0.38
318 0.4
319 0.41
320 0.41
321 0.42
322 0.48
323 0.49
324 0.48
325 0.41
326 0.39
327 0.4
328 0.36
329 0.32
330 0.24
331 0.19
332 0.13
333 0.12
334 0.07
335 0.05
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.09
340 0.13
341 0.15
342 0.17
343 0.17
344 0.2
345 0.22
346 0.26
347 0.25
348 0.26
349 0.32
350 0.39
351 0.5
352 0.52
353 0.56
354 0.63
355 0.65
356 0.71
357 0.69
358 0.69
359 0.68
360 0.72
361 0.75
362 0.73
363 0.77
364 0.77
365 0.8
366 0.79
367 0.75
368 0.74
369 0.66
370 0.61
371 0.54
372 0.46
373 0.37
374 0.37
375 0.31
376 0.26
377 0.25
378 0.22
379 0.22
380 0.22
381 0.24
382 0.24
383 0.28
384 0.32
385 0.39
386 0.47
387 0.53
388 0.6
389 0.65
390 0.67
391 0.74
392 0.78
393 0.8
394 0.83
395 0.85
396 0.83
397 0.85
398 0.84
399 0.77
400 0.74
401 0.7
402 0.7
403 0.66
404 0.69
405 0.66
406 0.64
407 0.63
408 0.62
409 0.62
410 0.54
411 0.54