Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2WMJ6

Protein Details
Accession V2WMJ6    Localization Confidence High Confidence Score 22
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-29MSSASPAKPRREKEKKEKSQQQQGLEKLKHydrophilic
317-340VGAKAKKEREKEKQKEANKEKDQEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-18KPRREKEKKEK
204-249HAAETRKEEAKKKAAAKATDSPPTSKKAKKAAAAEGAGRKGPKAPR
319-336AKAKKEREKEKQKEANKE
419-446PPPGFGRGRGRGRGRGGRGGPPPGRGAP
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR039722  Upf3  
IPR005120  UPF3_dom  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0000184  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay  
KEGG mrr:Moror_5626  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03467  Smg4_UPF3  
CDD cd12455  RRM_like_Smg4_UPF3  
Amino Acid Sequences MSSASPAKPRREKEKKEKSQQQQGLEKLKIVIRRLPPNLPEDIFWQSVQNWVTDDTVTWKVYYRGKFRSRLNKENVPSRAYVAFKTEEQLTTFHREYDGHVFRDKSGNESQAVVEFAPYQKVPSDKKKADARNATIEQDEDYISFVQSLNQLTTEPTSIEVLIAASQAPPQPKTTPLLEALKAEKTAVKEAKESKEKMIIMRNHAAETRKEEAKKKAAAKATDSPPTSKKAKKAAAAEGAGRKGPKAPRVMREQQSASGQSPVMATKPVPASPSAAPSPSNETSTGAPTTAAPRRGRPILGLGSRQFEAALIGAAGVGAKAKKEREKEKQKEANKEKDQEEKSNEPSVSGFTSKPKEPPTSPKRDRTAKHKDNASASKIQAPVPSILQRNDAPAIILQPNKAPVAGKAPAEQGAAVPGPPPGFGRGRGRGRGRGGRGGPPPGRGAPV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.89
2 0.89
3 0.92
4 0.95
5 0.94
6 0.94
7 0.9
8 0.87
9 0.84
10 0.82
11 0.79
12 0.69
13 0.61
14 0.54
15 0.5
16 0.46
17 0.42
18 0.41
19 0.41
20 0.49
21 0.52
22 0.55
23 0.55
24 0.54
25 0.56
26 0.49
27 0.42
28 0.37
29 0.37
30 0.32
31 0.29
32 0.27
33 0.21
34 0.26
35 0.25
36 0.22
37 0.18
38 0.17
39 0.18
40 0.16
41 0.16
42 0.16
43 0.2
44 0.2
45 0.19
46 0.19
47 0.23
48 0.3
49 0.37
50 0.4
51 0.45
52 0.52
53 0.59
54 0.66
55 0.73
56 0.75
57 0.78
58 0.78
59 0.77
60 0.76
61 0.77
62 0.72
63 0.64
64 0.56
65 0.49
66 0.46
67 0.38
68 0.34
69 0.29
70 0.27
71 0.24
72 0.25
73 0.25
74 0.21
75 0.21
76 0.22
77 0.22
78 0.26
79 0.26
80 0.24
81 0.23
82 0.22
83 0.25
84 0.33
85 0.34
86 0.29
87 0.33
88 0.33
89 0.33
90 0.4
91 0.36
92 0.31
93 0.3
94 0.3
95 0.28
96 0.28
97 0.27
98 0.21
99 0.22
100 0.17
101 0.13
102 0.11
103 0.11
104 0.12
105 0.12
106 0.11
107 0.13
108 0.18
109 0.24
110 0.32
111 0.42
112 0.42
113 0.5
114 0.58
115 0.63
116 0.68
117 0.7
118 0.65
119 0.64
120 0.63
121 0.57
122 0.49
123 0.41
124 0.33
125 0.25
126 0.2
127 0.11
128 0.11
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.08
134 0.1
135 0.11
136 0.1
137 0.1
138 0.1
139 0.1
140 0.11
141 0.11
142 0.09
143 0.08
144 0.09
145 0.08
146 0.08
147 0.07
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.05
152 0.04
153 0.06
154 0.08
155 0.1
156 0.11
157 0.13
158 0.14
159 0.16
160 0.19
161 0.19
162 0.2
163 0.22
164 0.25
165 0.23
166 0.24
167 0.24
168 0.22
169 0.21
170 0.18
171 0.16
172 0.14
173 0.2
174 0.21
175 0.2
176 0.23
177 0.28
178 0.35
179 0.4
180 0.4
181 0.35
182 0.38
183 0.38
184 0.36
185 0.39
186 0.35
187 0.34
188 0.37
189 0.36
190 0.31
191 0.33
192 0.32
193 0.25
194 0.27
195 0.26
196 0.26
197 0.28
198 0.32
199 0.36
200 0.4
201 0.45
202 0.43
203 0.45
204 0.45
205 0.44
206 0.44
207 0.45
208 0.43
209 0.42
210 0.39
211 0.36
212 0.33
213 0.36
214 0.36
215 0.33
216 0.35
217 0.37
218 0.41
219 0.44
220 0.46
221 0.47
222 0.46
223 0.43
224 0.41
225 0.35
226 0.31
227 0.27
228 0.23
229 0.18
230 0.18
231 0.2
232 0.22
233 0.28
234 0.32
235 0.36
236 0.45
237 0.53
238 0.52
239 0.55
240 0.51
241 0.45
242 0.43
243 0.4
244 0.32
245 0.25
246 0.21
247 0.16
248 0.15
249 0.13
250 0.1
251 0.09
252 0.08
253 0.1
254 0.12
255 0.12
256 0.13
257 0.13
258 0.16
259 0.16
260 0.2
261 0.17
262 0.17
263 0.16
264 0.17
265 0.23
266 0.21
267 0.22
268 0.19
269 0.19
270 0.19
271 0.21
272 0.2
273 0.13
274 0.12
275 0.11
276 0.16
277 0.19
278 0.25
279 0.24
280 0.26
281 0.31
282 0.33
283 0.33
284 0.29
285 0.3
286 0.3
287 0.31
288 0.33
289 0.3
290 0.3
291 0.3
292 0.28
293 0.23
294 0.16
295 0.13
296 0.09
297 0.07
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.03
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.09
308 0.14
309 0.2
310 0.28
311 0.38
312 0.48
313 0.59
314 0.66
315 0.74
316 0.79
317 0.81
318 0.84
319 0.84
320 0.84
321 0.8
322 0.79
323 0.72
324 0.72
325 0.69
326 0.65
327 0.63
328 0.58
329 0.55
330 0.54
331 0.5
332 0.41
333 0.37
334 0.32
335 0.28
336 0.24
337 0.21
338 0.21
339 0.26
340 0.28
341 0.33
342 0.36
343 0.4
344 0.42
345 0.52
346 0.56
347 0.62
348 0.68
349 0.71
350 0.75
351 0.77
352 0.78
353 0.78
354 0.79
355 0.77
356 0.77
357 0.75
358 0.72
359 0.72
360 0.73
361 0.69
362 0.63
363 0.56
364 0.54
365 0.48
366 0.45
367 0.38
368 0.34
369 0.3
370 0.28
371 0.32
372 0.31
373 0.3
374 0.33
375 0.31
376 0.32
377 0.32
378 0.27
379 0.23
380 0.19
381 0.22
382 0.22
383 0.23
384 0.2
385 0.21
386 0.24
387 0.23
388 0.24
389 0.2
390 0.17
391 0.23
392 0.25
393 0.24
394 0.24
395 0.26
396 0.27
397 0.27
398 0.25
399 0.18
400 0.18
401 0.17
402 0.14
403 0.12
404 0.12
405 0.12
406 0.13
407 0.14
408 0.15
409 0.18
410 0.24
411 0.32
412 0.39
413 0.47
414 0.55
415 0.6
416 0.63
417 0.69
418 0.73
419 0.7
420 0.7
421 0.67
422 0.66
423 0.65
424 0.67
425 0.61
426 0.55
427 0.54