Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2WK16

Protein Details
Accession V2WK16    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
229-254ITPPLHHVRKRRFRKRINKRTIESVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
236-248VRKRRFRKRINKR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR037817  TAF7  
IPR006751  TAFII55_prot_cons_reg  
Gene Ontology GO:0005669  C:transcription factor TFIID complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG mrr:Moror_11851  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04658  TAFII55_N  
CDD cd08047  TAF7  
Amino Acid Sequences MDEDLIVVDDVEELAQESTAGLSSHHNASDSDYAQPIPSSAPSGSRTSSRLRNNSQVTMAASDTAERTTRFQAANANKSKVQPKLKLKLSEKAAAQAPGMSFLGQYDRELDSDEEELAFEEQFILRMPAGEDCEKLRKIVASREVPNDVWFKFKDSRRAVFYLGNNSYSSKLVDLPCIIESQKTLDNKQMFKVADICQMLVVEDRIENEADVSHSKVFNIEDFIWPHGITPPLHHVRKRRFRKRINKRTIESVEQEVERLLEADNMASEIKYEVLDNVNPDLSDSEFIEREEPIDAPTPAISDTGDAPTPGDMNEGEEEGEGGGDEEEPEGDIDEELAAELDLALGDEEEADEEDDDDDESEEEEDDDDDDDDSQARKLLNEEIRDLEAAVAKKNSEIASSANPLIRKRFEDALKKLTADLEMKQAQRDELKEKQRMKKEGITLDGDPDSDSDAGDNPQNGVSVAEDDLFGGDQDMDMDQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.05
3 0.05
4 0.05
5 0.06
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.1
10 0.14
11 0.17
12 0.18
13 0.19
14 0.18
15 0.23
16 0.28
17 0.25
18 0.24
19 0.23
20 0.23
21 0.23
22 0.22
23 0.18
24 0.14
25 0.14
26 0.15
27 0.14
28 0.18
29 0.2
30 0.24
31 0.25
32 0.27
33 0.29
34 0.33
35 0.41
36 0.46
37 0.52
38 0.55
39 0.62
40 0.65
41 0.65
42 0.6
43 0.54
44 0.46
45 0.39
46 0.33
47 0.25
48 0.19
49 0.17
50 0.15
51 0.14
52 0.14
53 0.13
54 0.16
55 0.19
56 0.24
57 0.23
58 0.24
59 0.31
60 0.38
61 0.47
62 0.5
63 0.5
64 0.48
65 0.52
66 0.57
67 0.56
68 0.57
69 0.56
70 0.6
71 0.65
72 0.71
73 0.76
74 0.74
75 0.74
76 0.7
77 0.67
78 0.58
79 0.53
80 0.48
81 0.4
82 0.35
83 0.3
84 0.24
85 0.2
86 0.2
87 0.15
88 0.11
89 0.1
90 0.14
91 0.12
92 0.12
93 0.12
94 0.13
95 0.13
96 0.15
97 0.15
98 0.14
99 0.14
100 0.14
101 0.11
102 0.1
103 0.11
104 0.09
105 0.08
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.09
116 0.13
117 0.14
118 0.15
119 0.16
120 0.23
121 0.23
122 0.22
123 0.22
124 0.21
125 0.23
126 0.29
127 0.35
128 0.35
129 0.39
130 0.43
131 0.44
132 0.41
133 0.42
134 0.38
135 0.3
136 0.27
137 0.24
138 0.25
139 0.29
140 0.33
141 0.4
142 0.42
143 0.47
144 0.48
145 0.5
146 0.47
147 0.45
148 0.44
149 0.43
150 0.39
151 0.35
152 0.3
153 0.29
154 0.28
155 0.23
156 0.2
157 0.12
158 0.15
159 0.14
160 0.15
161 0.15
162 0.15
163 0.15
164 0.16
165 0.15
166 0.11
167 0.11
168 0.12
169 0.16
170 0.16
171 0.17
172 0.22
173 0.27
174 0.28
175 0.29
176 0.32
177 0.27
178 0.26
179 0.3
180 0.25
181 0.26
182 0.25
183 0.23
184 0.18
185 0.17
186 0.16
187 0.13
188 0.11
189 0.06
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.06
196 0.06
197 0.07
198 0.07
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.09
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.12
207 0.12
208 0.13
209 0.14
210 0.15
211 0.14
212 0.14
213 0.14
214 0.12
215 0.13
216 0.1
217 0.11
218 0.18
219 0.24
220 0.27
221 0.3
222 0.37
223 0.45
224 0.56
225 0.65
226 0.68
227 0.72
228 0.79
229 0.87
230 0.91
231 0.92
232 0.92
233 0.9
234 0.81
235 0.8
236 0.73
237 0.66
238 0.57
239 0.48
240 0.4
241 0.31
242 0.28
243 0.19
244 0.15
245 0.11
246 0.09
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.07
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.09
274 0.09
275 0.1
276 0.09
277 0.09
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.11
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.08
289 0.06
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.07
305 0.08
306 0.06
307 0.06
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.03
312 0.04
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.04
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.02
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.04
338 0.04
339 0.04
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.07
355 0.07
356 0.07
357 0.07
358 0.07
359 0.08
360 0.09
361 0.08
362 0.1
363 0.1
364 0.1
365 0.12
366 0.2
367 0.24
368 0.26
369 0.28
370 0.28
371 0.29
372 0.29
373 0.27
374 0.2
375 0.19
376 0.17
377 0.18
378 0.16
379 0.15
380 0.15
381 0.18
382 0.17
383 0.14
384 0.15
385 0.15
386 0.19
387 0.22
388 0.24
389 0.24
390 0.26
391 0.28
392 0.33
393 0.34
394 0.32
395 0.33
396 0.38
397 0.43
398 0.5
399 0.54
400 0.56
401 0.54
402 0.52
403 0.48
404 0.42
405 0.38
406 0.3
407 0.26
408 0.26
409 0.29
410 0.3
411 0.32
412 0.32
413 0.31
414 0.34
415 0.36
416 0.35
417 0.38
418 0.47
419 0.53
420 0.61
421 0.67
422 0.72
423 0.74
424 0.74
425 0.73
426 0.72
427 0.7
428 0.66
429 0.61
430 0.53
431 0.51
432 0.44
433 0.36
434 0.28
435 0.22
436 0.2
437 0.14
438 0.13
439 0.1
440 0.11
441 0.13
442 0.15
443 0.16
444 0.14
445 0.15
446 0.16
447 0.15
448 0.14
449 0.13
450 0.11
451 0.12
452 0.11
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.09
458 0.08
459 0.07
460 0.06