Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2YPU2

Protein Details
Accession V2YPU2    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
109-128GVAPRAKMNQQRSRRFRAAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
969-977RGGRGRGRG
Subcellular Location(s) mito 10, nucl 9, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
KEGG mrr:Moror_1402  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGVPALFRWLSKKYPKIIYPVVEDEEIKVEDENDELVTIPTNMADPNPNGTEFDCLYLDMNGIVHPCTHPEGKPAPETEEDMMVEVFKYTERVVNMVRPRKLLFMAIDGVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAKEKEEARLESVRLWEEMGKTISEEEKNKKAWDSNAITPGTPFMDLLAASLRYWVVQKMNSDPGWKNLQVIISDASVPGEGEHKIMDFIRRQRTNPGHDPNTKHVIYGLDADLIMLALATHEPYFRVLREDVFSDSSNMACRMCGQEGHYAAQCTATPAEVQDRAKKKVTERKPFIFLDVSILREYLEAELNVPQESFPFNLEQAIDDWVLLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLRIWKTELSRMGGYLTNHGRLELARVQIILEGLAKREDDIFKRRREAEERQEQNAKRRKLEKDGTVESISAGAPSRSSSNHDFAAKADSIGLGAPATEESIKHLPSAQQALAGSNHDVVANRRAIRMANMSAAEVLKAELAGLMPVKKSATITKKPDLSLPAKPESSLPLPAASLDAIRMSVDGPPPTAVPATTTTMSTTEDADFDIPGFGGSMTSVATTSVVTSAVPSTTSTQSPTQGSMKVDDIPGAAANADVGDFNDSANVDDSIMGTKRKYEEGPGEVEGDETLEAEEEEPPADGPHDKSALEYKVNPDGTVTQEDTVKLWEPGYRERYYQQKFGVEYTDKEFRKKLTQSYIEGMSWVLCYYYQGTPSWQWYYPYHFAPFAADFEEVDKMNIHFKIGQPFKPYEQLMGVFPAASRKHIPETFHHLMTEEESPIIDFYPTTFQIDMNGKKMAWQGVALLPFIDEKRLLGSMREPYNKLTDDEIRRNTWGNNVIFAADEHPVHPFYEKLYGKGKPKDPVPLDPKLSQGISGTVLPNPDCLPGSTYFSPFTQVNLPDIRNDRSLSVQYFFPKQLSPHHSVLLPGVRRPPRILSQEDIENSRRGGRGRGRGGGGGDWGGGRGGYNNDRSRGSSGNDPFHSRPSNYPPSGYGNDRNRGYQQDNYSSRGGNHSYGGGGYGRGGGGSDGRSRPPNNQGYGGQNSGYSRGPPGGRGGGPSNNPYGSYGANGGGYGGYGGNSAGYGGYGGNTSGYGYGRGNPASYGGGAYGNGGSQQAGQVGNYGVYGGGGRGGGYNQSSRGRGRGW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.58
2 0.62
3 0.66
4 0.68
5 0.65
6 0.62
7 0.59
8 0.55
9 0.48
10 0.44
11 0.37
12 0.34
13 0.29
14 0.23
15 0.18
16 0.15
17 0.14
18 0.14
19 0.13
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.1
26 0.09
27 0.08
28 0.09
29 0.09
30 0.1
31 0.15
32 0.15
33 0.2
34 0.23
35 0.23
36 0.24
37 0.24
38 0.27
39 0.23
40 0.24
41 0.19
42 0.17
43 0.17
44 0.16
45 0.16
46 0.12
47 0.11
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.1
52 0.1
53 0.13
54 0.17
55 0.2
56 0.2
57 0.27
58 0.33
59 0.36
60 0.41
61 0.4
62 0.4
63 0.39
64 0.42
65 0.36
66 0.33
67 0.28
68 0.24
69 0.22
70 0.17
71 0.15
72 0.11
73 0.1
74 0.07
75 0.09
76 0.09
77 0.13
78 0.14
79 0.17
80 0.2
81 0.28
82 0.37
83 0.44
84 0.47
85 0.46
86 0.47
87 0.47
88 0.46
89 0.42
90 0.34
91 0.29
92 0.29
93 0.25
94 0.25
95 0.21
96 0.21
97 0.18
98 0.16
99 0.12
100 0.14
101 0.2
102 0.27
103 0.37
104 0.45
105 0.55
106 0.66
107 0.74
108 0.8
109 0.81
110 0.78
111 0.74
112 0.76
113 0.75
114 0.74
115 0.76
116 0.72
117 0.68
118 0.71
119 0.65
120 0.55
121 0.52
122 0.44
123 0.39
124 0.37
125 0.34
126 0.3
127 0.32
128 0.32
129 0.25
130 0.25
131 0.23
132 0.2
133 0.23
134 0.22
135 0.18
136 0.17
137 0.19
138 0.22
139 0.25
140 0.3
141 0.33
142 0.38
143 0.41
144 0.43
145 0.45
146 0.45
147 0.43
148 0.47
149 0.46
150 0.45
151 0.49
152 0.48
153 0.44
154 0.39
155 0.37
156 0.29
157 0.23
158 0.16
159 0.09
160 0.1
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.12
170 0.14
171 0.14
172 0.17
173 0.2
174 0.24
175 0.31
176 0.32
177 0.37
178 0.35
179 0.37
180 0.4
181 0.38
182 0.34
183 0.3
184 0.3
185 0.25
186 0.26
187 0.22
188 0.16
189 0.16
190 0.14
191 0.13
192 0.1
193 0.1
194 0.08
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.1
201 0.11
202 0.16
203 0.2
204 0.28
205 0.38
206 0.41
207 0.43
208 0.51
209 0.58
210 0.62
211 0.65
212 0.67
213 0.65
214 0.68
215 0.72
216 0.69
217 0.68
218 0.59
219 0.5
220 0.42
221 0.35
222 0.29
223 0.27
224 0.21
225 0.14
226 0.13
227 0.13
228 0.11
229 0.09
230 0.08
231 0.04
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.09
240 0.11
241 0.11
242 0.15
243 0.15
244 0.17
245 0.19
246 0.21
247 0.21
248 0.22
249 0.22
250 0.2
251 0.2
252 0.18
253 0.18
254 0.17
255 0.14
256 0.11
257 0.13
258 0.14
259 0.15
260 0.16
261 0.16
262 0.22
263 0.24
264 0.26
265 0.27
266 0.24
267 0.22
268 0.22
269 0.19
270 0.15
271 0.13
272 0.11
273 0.09
274 0.1
275 0.14
276 0.18
277 0.2
278 0.27
279 0.32
280 0.36
281 0.41
282 0.44
283 0.48
284 0.54
285 0.62
286 0.65
287 0.67
288 0.68
289 0.69
290 0.66
291 0.6
292 0.52
293 0.42
294 0.38
295 0.31
296 0.27
297 0.21
298 0.21
299 0.17
300 0.15
301 0.15
302 0.1
303 0.1
304 0.08
305 0.09
306 0.11
307 0.12
308 0.12
309 0.12
310 0.1
311 0.09
312 0.1
313 0.1
314 0.09
315 0.1
316 0.1
317 0.11
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.12
322 0.11
323 0.09
324 0.09
325 0.08
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.03
334 0.04
335 0.06
336 0.06
337 0.07
338 0.07
339 0.08
340 0.08
341 0.08
342 0.12
343 0.13
344 0.13
345 0.12
346 0.13
347 0.12
348 0.11
349 0.11
350 0.07
351 0.06
352 0.08
353 0.1
354 0.09
355 0.1
356 0.1
357 0.15
358 0.16
359 0.21
360 0.21
361 0.23
362 0.23
363 0.23
364 0.24
365 0.23
366 0.22
367 0.24
368 0.23
369 0.22
370 0.22
371 0.21
372 0.2
373 0.17
374 0.22
375 0.19
376 0.18
377 0.15
378 0.15
379 0.15
380 0.15
381 0.15
382 0.1
383 0.09
384 0.08
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.11
390 0.14
391 0.16
392 0.25
393 0.31
394 0.35
395 0.4
396 0.43
397 0.46
398 0.5
399 0.54
400 0.55
401 0.59
402 0.59
403 0.58
404 0.64
405 0.6
406 0.63
407 0.63
408 0.56
409 0.52
410 0.56
411 0.56
412 0.57
413 0.62
414 0.59
415 0.58
416 0.58
417 0.55
418 0.48
419 0.43
420 0.34
421 0.28
422 0.21
423 0.13
424 0.1
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.08
429 0.08
430 0.13
431 0.16
432 0.18
433 0.21
434 0.22
435 0.21
436 0.21
437 0.24
438 0.2
439 0.16
440 0.13
441 0.1
442 0.1
443 0.09
444 0.08
445 0.04
446 0.03
447 0.03
448 0.03
449 0.04
450 0.04
451 0.04
452 0.08
453 0.11
454 0.11
455 0.11
456 0.12
457 0.13
458 0.16
459 0.19
460 0.15
461 0.15
462 0.15
463 0.16
464 0.15
465 0.15
466 0.13
467 0.1
468 0.1
469 0.08
470 0.09
471 0.1
472 0.13
473 0.16
474 0.16
475 0.16
476 0.17
477 0.16
478 0.18
479 0.2
480 0.16
481 0.15
482 0.14
483 0.14
484 0.14
485 0.14
486 0.11
487 0.08
488 0.07
489 0.05
490 0.04
491 0.04
492 0.03
493 0.03
494 0.04
495 0.04
496 0.05
497 0.05
498 0.06
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.14
503 0.21
504 0.28
505 0.34
506 0.39
507 0.42
508 0.42
509 0.44
510 0.42
511 0.38
512 0.36
513 0.35
514 0.33
515 0.3
516 0.3
517 0.27
518 0.26
519 0.23
520 0.2
521 0.16
522 0.13
523 0.12
524 0.12
525 0.12
526 0.09
527 0.07
528 0.05
529 0.05
530 0.04
531 0.04
532 0.04
533 0.04
534 0.06
535 0.08
536 0.08
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.09
541 0.09
542 0.07
543 0.07
544 0.09
545 0.11
546 0.11
547 0.11
548 0.11
549 0.12
550 0.13
551 0.12
552 0.11
553 0.09
554 0.08
555 0.08
556 0.08
557 0.07
558 0.06
559 0.06
560 0.04
561 0.04
562 0.04
563 0.03
564 0.03
565 0.03
566 0.03
567 0.03
568 0.03
569 0.03
570 0.03
571 0.04
572 0.04
573 0.04
574 0.04
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.04
580 0.05
581 0.05
582 0.08
583 0.09
584 0.1
585 0.12
586 0.13
587 0.15
588 0.16
589 0.17
590 0.16
591 0.18
592 0.18
593 0.17
594 0.17
595 0.16
596 0.15
597 0.13
598 0.11
599 0.09
600 0.08
601 0.06
602 0.05
603 0.04
604 0.04
605 0.03
606 0.03
607 0.03
608 0.03
609 0.04
610 0.04
611 0.05
612 0.05
613 0.05
614 0.06
615 0.07
616 0.07
617 0.05
618 0.05
619 0.06
620 0.07
621 0.08
622 0.08
623 0.08
624 0.09
625 0.11
626 0.13
627 0.13
628 0.15
629 0.18
630 0.2
631 0.23
632 0.22
633 0.21
634 0.19
635 0.19
636 0.15
637 0.11
638 0.08
639 0.06
640 0.05
641 0.03
642 0.03
643 0.04
644 0.04
645 0.04
646 0.04
647 0.04
648 0.05
649 0.05
650 0.05
651 0.06
652 0.07
653 0.09
654 0.1
655 0.1
656 0.11
657 0.15
658 0.17
659 0.17
660 0.17
661 0.17
662 0.23
663 0.23
664 0.22
665 0.18
666 0.18
667 0.19
668 0.2
669 0.19
670 0.13
671 0.14
672 0.14
673 0.14
674 0.14
675 0.12
676 0.1
677 0.09
678 0.11
679 0.12
680 0.18
681 0.24
682 0.24
683 0.24
684 0.27
685 0.36
686 0.38
687 0.4
688 0.36
689 0.35
690 0.34
691 0.34
692 0.36
693 0.28
694 0.26
695 0.26
696 0.31
697 0.28
698 0.29
699 0.3
700 0.27
701 0.34
702 0.35
703 0.37
704 0.38
705 0.42
706 0.42
707 0.44
708 0.44
709 0.36
710 0.32
711 0.27
712 0.18
713 0.13
714 0.1
715 0.07
716 0.04
717 0.05
718 0.08
719 0.09
720 0.1
721 0.11
722 0.13
723 0.15
724 0.19
725 0.21
726 0.19
727 0.21
728 0.21
729 0.28
730 0.29
731 0.3
732 0.28
733 0.25
734 0.24
735 0.24
736 0.23
737 0.16
738 0.15
739 0.12
740 0.1
741 0.11
742 0.13
743 0.11
744 0.1
745 0.1
746 0.09
747 0.13
748 0.13
749 0.13
750 0.13
751 0.15
752 0.24
753 0.27
754 0.3
755 0.31
756 0.33
757 0.34
758 0.37
759 0.36
760 0.28
761 0.25
762 0.23
763 0.19
764 0.19
765 0.17
766 0.11
767 0.11
768 0.15
769 0.14
770 0.15
771 0.16
772 0.17
773 0.23
774 0.26
775 0.29
776 0.28
777 0.38
778 0.39
779 0.38
780 0.36
781 0.3
782 0.27
783 0.27
784 0.24
785 0.14
786 0.1
787 0.09
788 0.1
789 0.09
790 0.09
791 0.07
792 0.05
793 0.06
794 0.1
795 0.11
796 0.13
797 0.13
798 0.12
799 0.17
800 0.24
801 0.25
802 0.23
803 0.24
804 0.22
805 0.24
806 0.26
807 0.24
808 0.17
809 0.15
810 0.15
811 0.16
812 0.18
813 0.15
814 0.12
815 0.11
816 0.12
817 0.12
818 0.11
819 0.08
820 0.07
821 0.09
822 0.11
823 0.11
824 0.11
825 0.15
826 0.21
827 0.27
828 0.31
829 0.31
830 0.31
831 0.36
832 0.36
833 0.33
834 0.31
835 0.32
836 0.35
837 0.42
838 0.44
839 0.41
840 0.41
841 0.41
842 0.38
843 0.36
844 0.36
845 0.29
846 0.27
847 0.25
848 0.23
849 0.22
850 0.21
851 0.17
852 0.11
853 0.11
854 0.09
855 0.11
856 0.11
857 0.11
858 0.12
859 0.1
860 0.11
861 0.2
862 0.2
863 0.22
864 0.27
865 0.32
866 0.4
867 0.47
868 0.51
869 0.47
870 0.49
871 0.56
872 0.53
873 0.58
874 0.56
875 0.55
876 0.54
877 0.5
878 0.49
879 0.42
880 0.39
881 0.3
882 0.24
883 0.19
884 0.16
885 0.16
886 0.15
887 0.13
888 0.15
889 0.14
890 0.15
891 0.14
892 0.14
893 0.13
894 0.12
895 0.15
896 0.15
897 0.21
898 0.21
899 0.23
900 0.23
901 0.22
902 0.25
903 0.22
904 0.22
905 0.21
906 0.21
907 0.23
908 0.25
909 0.26
910 0.28
911 0.32
912 0.33
913 0.3
914 0.3
915 0.27
916 0.27
917 0.3
918 0.27
919 0.25
920 0.25
921 0.25
922 0.28
923 0.28
924 0.26
925 0.24
926 0.24
927 0.31
928 0.35
929 0.38
930 0.37
931 0.38
932 0.36
933 0.35
934 0.37
935 0.35
936 0.3
937 0.26
938 0.33
939 0.36
940 0.38
941 0.4
942 0.41
943 0.42
944 0.46
945 0.47
946 0.42
947 0.42
948 0.46
949 0.45
950 0.44
951 0.39
952 0.35
953 0.31
954 0.31
955 0.3
956 0.25
957 0.31
958 0.34
959 0.41
960 0.45
961 0.49
962 0.48
963 0.47
964 0.47
965 0.4
966 0.33
967 0.23
968 0.18
969 0.13
970 0.11
971 0.09
972 0.07
973 0.06
974 0.07
975 0.11
976 0.15
977 0.24
978 0.27
979 0.3
980 0.32
981 0.34
982 0.36
983 0.35
984 0.34
985 0.35
986 0.37
987 0.42
988 0.44
989 0.48
990 0.46
991 0.49
992 0.51
993 0.44
994 0.44
995 0.46
996 0.53
997 0.48
998 0.48
999 0.44
1000 0.47
1001 0.49
1002 0.48
1003 0.48
1004 0.46
1005 0.52
1006 0.52
1007 0.52
1008 0.49
1009 0.51
1010 0.49
1011 0.47
1012 0.46
1013 0.48
1014 0.5
1015 0.51
1016 0.5
1017 0.44
1018 0.41
1019 0.4
1020 0.36
1021 0.28
1022 0.26
1023 0.23
1024 0.21
1025 0.19
1026 0.19
1027 0.14
1028 0.11
1029 0.1
1030 0.1
1031 0.09
1032 0.08
1033 0.08
1034 0.07
1035 0.09
1036 0.11
1037 0.17
1038 0.18
1039 0.22
1040 0.28
1041 0.3
1042 0.36
1043 0.43
1044 0.49
1045 0.46
1046 0.49
1047 0.49
1048 0.5
1049 0.53
1050 0.48
1051 0.39
1052 0.33
1053 0.3
1054 0.28
1055 0.26
1056 0.2
1057 0.18
1058 0.21
1059 0.22
1060 0.21
1061 0.25
1062 0.28
1063 0.27
1064 0.3
1065 0.33
1066 0.33
1067 0.36
1068 0.38
1069 0.37
1070 0.32
1071 0.32
1072 0.3
1073 0.27
1074 0.22
1075 0.2
1076 0.18
1077 0.15
1078 0.15
1079 0.14
1080 0.12
1081 0.1
1082 0.09
1083 0.08
1084 0.06
1085 0.05
1086 0.05
1087 0.06
1088 0.05
1089 0.05
1090 0.05
1091 0.05
1092 0.04
1093 0.05
1094 0.05
1095 0.05
1096 0.06
1097 0.06
1098 0.06
1099 0.06
1100 0.07
1101 0.08
1102 0.09
1103 0.11
1104 0.12
1105 0.16
1106 0.19
1107 0.2
1108 0.2
1109 0.19
1110 0.2
1111 0.19
1112 0.18
1113 0.15
1114 0.12
1115 0.12
1116 0.11
1117 0.12
1118 0.11
1119 0.09
1120 0.09
1121 0.09
1122 0.08
1123 0.08
1124 0.09
1125 0.1
1126 0.11
1127 0.11
1128 0.12
1129 0.12
1130 0.12
1131 0.12
1132 0.11
1133 0.08
1134 0.08
1135 0.08
1136 0.06
1137 0.06
1138 0.06
1139 0.07
1140 0.07
1141 0.08
1142 0.11
1143 0.14
1144 0.16
1145 0.2
1146 0.25
1147 0.28
1148 0.3