Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2XIR3

Protein Details
Accession V2XIR3    Localization Confidence High Confidence Score 15.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
134-159YSLKTEYSKEKYKKRKEAKYSKSFTTHydrophilic
404-429DPNANSVVSHRQRNKKAKAENSDEGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
146-149KKRK
285-293QKSRLKKRK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 13.333, cyto 9, mito_nucl 8.666
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR017423  TRM6  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0031515  C:tRNA (m1A) methyltransferase complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0030488  P:tRNA methylation  
KEGG mrr:Moror_15969  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04189  Gcd10p  
Amino Acid Sequences MDTQPEASTSQPTSSSSLKIQSGDIVMVRQPNGDVRSIKIERDSTVQVGRIGSFHANELMGQLYGFTYEIVSKKLKIIPTRSLEEVEDTDATNELINDGQFVQPLTLAEITALKQSGVHASDIIKKQIEQHANYSLKTEYSKEKYKKRKEAKYSKSFTTIEPTLFNVCDYWFKKDQNRIRDIRPDSLSQMLLLANIRPGGRYLAVDDASGLVVASILDRLGGEGRLLTICDTDSPPAYPVMANFNFRPEQTSIMTSLNWATAQEEYTPIMAPTEVPSAEIKSERQKSRLKKRKLVSDALMRTREELFAGEFEGLIVASQYDPTVIVERLAPYLAGSASIIVHSPHLQVVADLQAELRSLPGFLAPTVTEVWLRQYQVLPGRTHPTMNTSGSGGYILHVVKVYDDPNANSVVSHRQRNKKAKAENSDEGSSTPGPGASNKVES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.28
3 0.27
4 0.31
5 0.31
6 0.31
7 0.3
8 0.28
9 0.27
10 0.25
11 0.22
12 0.19
13 0.18
14 0.21
15 0.2
16 0.18
17 0.18
18 0.22
19 0.23
20 0.27
21 0.26
22 0.25
23 0.34
24 0.35
25 0.36
26 0.36
27 0.36
28 0.33
29 0.36
30 0.37
31 0.31
32 0.32
33 0.33
34 0.29
35 0.28
36 0.27
37 0.22
38 0.21
39 0.2
40 0.17
41 0.16
42 0.15
43 0.14
44 0.14
45 0.14
46 0.12
47 0.1
48 0.09
49 0.08
50 0.06
51 0.07
52 0.07
53 0.06
54 0.06
55 0.09
56 0.11
57 0.14
58 0.16
59 0.17
60 0.21
61 0.26
62 0.31
63 0.35
64 0.4
65 0.45
66 0.49
67 0.52
68 0.5
69 0.47
70 0.42
71 0.38
72 0.33
73 0.27
74 0.21
75 0.17
76 0.16
77 0.14
78 0.13
79 0.11
80 0.09
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.08
88 0.09
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.1
98 0.11
99 0.11
100 0.08
101 0.09
102 0.09
103 0.13
104 0.13
105 0.13
106 0.12
107 0.14
108 0.22
109 0.24
110 0.26
111 0.22
112 0.21
113 0.26
114 0.33
115 0.37
116 0.32
117 0.33
118 0.4
119 0.41
120 0.41
121 0.38
122 0.31
123 0.26
124 0.25
125 0.24
126 0.22
127 0.27
128 0.37
129 0.42
130 0.52
131 0.61
132 0.7
133 0.78
134 0.81
135 0.85
136 0.86
137 0.9
138 0.9
139 0.9
140 0.85
141 0.77
142 0.73
143 0.64
144 0.54
145 0.5
146 0.41
147 0.32
148 0.27
149 0.26
150 0.21
151 0.2
152 0.19
153 0.12
154 0.11
155 0.17
156 0.18
157 0.23
158 0.25
159 0.29
160 0.35
161 0.44
162 0.5
163 0.52
164 0.58
165 0.56
166 0.56
167 0.61
168 0.59
169 0.55
170 0.51
171 0.43
172 0.37
173 0.36
174 0.31
175 0.22
176 0.19
177 0.13
178 0.11
179 0.1
180 0.08
181 0.06
182 0.08
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.09
190 0.1
191 0.11
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.06
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.02
203 0.02
204 0.02
205 0.02
206 0.03
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.04
213 0.05
214 0.05
215 0.04
216 0.04
217 0.06
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.09
225 0.07
226 0.07
227 0.14
228 0.15
229 0.16
230 0.16
231 0.19
232 0.2
233 0.19
234 0.22
235 0.16
236 0.18
237 0.17
238 0.18
239 0.17
240 0.17
241 0.17
242 0.14
243 0.13
244 0.11
245 0.09
246 0.08
247 0.07
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.06
259 0.07
260 0.09
261 0.08
262 0.09
263 0.1
264 0.1
265 0.12
266 0.13
267 0.13
268 0.2
269 0.29
270 0.3
271 0.36
272 0.43
273 0.52
274 0.63
275 0.71
276 0.71
277 0.72
278 0.76
279 0.8
280 0.79
281 0.75
282 0.7
283 0.69
284 0.66
285 0.64
286 0.6
287 0.49
288 0.44
289 0.39
290 0.33
291 0.23
292 0.17
293 0.12
294 0.1
295 0.11
296 0.09
297 0.07
298 0.07
299 0.06
300 0.05
301 0.04
302 0.04
303 0.03
304 0.03
305 0.04
306 0.04
307 0.04
308 0.04
309 0.06
310 0.08
311 0.08
312 0.09
313 0.1
314 0.11
315 0.12
316 0.11
317 0.1
318 0.08
319 0.09
320 0.08
321 0.07
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.06
326 0.07
327 0.06
328 0.07
329 0.08
330 0.09
331 0.09
332 0.09
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.11
337 0.1
338 0.09
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.09
343 0.08
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.08
349 0.07
350 0.1
351 0.09
352 0.11
353 0.12
354 0.12
355 0.12
356 0.11
357 0.17
358 0.18
359 0.19
360 0.2
361 0.2
362 0.25
363 0.32
364 0.37
365 0.34
366 0.34
367 0.39
368 0.38
369 0.39
370 0.34
371 0.32
372 0.32
373 0.32
374 0.29
375 0.24
376 0.23
377 0.22
378 0.21
379 0.16
380 0.11
381 0.12
382 0.11
383 0.11
384 0.11
385 0.11
386 0.12
387 0.15
388 0.15
389 0.16
390 0.19
391 0.19
392 0.2
393 0.22
394 0.21
395 0.18
396 0.2
397 0.26
398 0.29
399 0.38
400 0.45
401 0.54
402 0.64
403 0.75
404 0.82
405 0.82
406 0.85
407 0.86
408 0.86
409 0.85
410 0.82
411 0.78
412 0.71
413 0.62
414 0.53
415 0.47
416 0.37
417 0.29
418 0.22
419 0.16
420 0.15
421 0.16
422 0.21