Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2W4Z3

Protein Details
Accession V2W4Z3    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
284-305VMANRKKKELIKPKIARKEKEIBasic
317-339QTQQSPPPKYEPKKLSPRETFTKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
288-303RKKKELIKPKIARKEK
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
KEGG mrr:Moror_700  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MTLPRTPFTAVEESDLDDQLEVAKQLLNPNPERTPCRITRSKRREAIESLQQERTEPEAKSSEPSPFDEYRNIFHTPTPEMTTPAGSTAAPDIKLKTIDDKKDEASKGPTPDPFLGKQLDTRLFLLDLELYFAMNPVKANTDEKKKMLLLLLVKRNTSEWKQREMMKLFPEDDDPEEKKKAAEETWSSFKQRFRNEWQPVNVVREAQTKIEQIKMTDRADEYVNRFCLIAMDTKYDNEALMRFFREGLPESLQNKIMLRTEGEPEMLDEWYKLAIKYDNQYKLVMANRKKKELIKPKIARKEKEIGHISRDCPTKGQTQQSPPPKYEPKKLSPRETFTKIRALIAEQGEGEQEEIFDLMGKEGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.22
4 0.16
5 0.15
6 0.13
7 0.13
8 0.1
9 0.09
10 0.11
11 0.12
12 0.19
13 0.24
14 0.3
15 0.32
16 0.38
17 0.43
18 0.46
19 0.5
20 0.5
21 0.53
22 0.52
23 0.57
24 0.61
25 0.65
26 0.7
27 0.75
28 0.79
29 0.79
30 0.77
31 0.75
32 0.72
33 0.7
34 0.69
35 0.66
36 0.61
37 0.58
38 0.53
39 0.47
40 0.42
41 0.4
42 0.34
43 0.27
44 0.27
45 0.25
46 0.26
47 0.29
48 0.29
49 0.29
50 0.27
51 0.3
52 0.32
53 0.31
54 0.33
55 0.37
56 0.37
57 0.34
58 0.36
59 0.35
60 0.29
61 0.28
62 0.29
63 0.26
64 0.27
65 0.28
66 0.25
67 0.25
68 0.25
69 0.25
70 0.22
71 0.19
72 0.17
73 0.12
74 0.12
75 0.13
76 0.15
77 0.14
78 0.15
79 0.15
80 0.16
81 0.18
82 0.18
83 0.24
84 0.29
85 0.33
86 0.36
87 0.38
88 0.38
89 0.45
90 0.45
91 0.39
92 0.37
93 0.37
94 0.36
95 0.37
96 0.35
97 0.32
98 0.34
99 0.35
100 0.31
101 0.29
102 0.27
103 0.24
104 0.25
105 0.27
106 0.27
107 0.25
108 0.24
109 0.22
110 0.2
111 0.19
112 0.17
113 0.12
114 0.09
115 0.09
116 0.08
117 0.07
118 0.06
119 0.07
120 0.07
121 0.06
122 0.07
123 0.06
124 0.08
125 0.09
126 0.14
127 0.19
128 0.27
129 0.3
130 0.31
131 0.33
132 0.31
133 0.32
134 0.28
135 0.27
136 0.24
137 0.27
138 0.34
139 0.32
140 0.32
141 0.31
142 0.31
143 0.31
144 0.3
145 0.33
146 0.29
147 0.33
148 0.37
149 0.41
150 0.47
151 0.45
152 0.45
153 0.38
154 0.37
155 0.32
156 0.29
157 0.26
158 0.2
159 0.19
160 0.2
161 0.19
162 0.2
163 0.2
164 0.2
165 0.18
166 0.18
167 0.18
168 0.14
169 0.16
170 0.17
171 0.2
172 0.25
173 0.27
174 0.27
175 0.29
176 0.32
177 0.34
178 0.36
179 0.38
180 0.41
181 0.5
182 0.54
183 0.57
184 0.55
185 0.53
186 0.5
187 0.48
188 0.4
189 0.3
190 0.26
191 0.25
192 0.23
193 0.2
194 0.2
195 0.18
196 0.19
197 0.22
198 0.21
199 0.18
200 0.22
201 0.26
202 0.24
203 0.24
204 0.23
205 0.21
206 0.22
207 0.24
208 0.22
209 0.22
210 0.22
211 0.2
212 0.2
213 0.18
214 0.17
215 0.16
216 0.17
217 0.13
218 0.15
219 0.16
220 0.16
221 0.17
222 0.16
223 0.15
224 0.11
225 0.1
226 0.09
227 0.11
228 0.12
229 0.11
230 0.12
231 0.12
232 0.14
233 0.16
234 0.17
235 0.19
236 0.23
237 0.24
238 0.25
239 0.26
240 0.24
241 0.23
242 0.22
243 0.21
244 0.16
245 0.17
246 0.17
247 0.19
248 0.18
249 0.18
250 0.16
251 0.15
252 0.15
253 0.13
254 0.11
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.1
259 0.09
260 0.1
261 0.13
262 0.15
263 0.22
264 0.3
265 0.34
266 0.35
267 0.36
268 0.34
269 0.35
270 0.4
271 0.42
272 0.42
273 0.47
274 0.51
275 0.56
276 0.6
277 0.63
278 0.66
279 0.68
280 0.69
281 0.7
282 0.75
283 0.79
284 0.85
285 0.87
286 0.8
287 0.76
288 0.75
289 0.68
290 0.69
291 0.66
292 0.58
293 0.57
294 0.58
295 0.53
296 0.51
297 0.51
298 0.42
299 0.37
300 0.38
301 0.39
302 0.41
303 0.48
304 0.49
305 0.54
306 0.63
307 0.7
308 0.72
309 0.66
310 0.68
311 0.7
312 0.68
313 0.7
314 0.69
315 0.69
316 0.75
317 0.8
318 0.82
319 0.8
320 0.82
321 0.8
322 0.78
323 0.75
324 0.67
325 0.68
326 0.59
327 0.52
328 0.46
329 0.41
330 0.41
331 0.36
332 0.34
333 0.25
334 0.24
335 0.22
336 0.21
337 0.18
338 0.11
339 0.09
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.08
344 0.08