Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2WRD9

Protein Details
Accession V2WRD9    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-22MPPTRTQKQKRSKKEDDGVEEIHydrophilic
223-242NKDIDKRGKFSRKRLNEDEGBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 23.5, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG mrr:Moror_5624  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPTRTQKQKRSKKEDDGVEEIHEEEEEAVAQDEMTEEQAEDKPEGSKMTMEERKAKLEQLKKRMAASSKANRASLIEESAKSKITARDAARLERQRKLAEMLRTKADAEERGEDVERAKNWEYTIEENDNWEKKLARKARRADFEFHDDAHASHRKYKKDLDMVKPDLAAYQQQKDLALGVLPTSHEQQLAAENLYRDANTLMYGDSKPSEEAIDRVVSKINKDIDKRGKFSRKRLNEDEGDITYINEHNRVFNKKIARYYDKYTTEIRNSFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.9
2 0.88
3 0.85
4 0.8
5 0.7
6 0.62
7 0.53
8 0.43
9 0.34
10 0.24
11 0.17
12 0.11
13 0.09
14 0.07
15 0.07
16 0.07
17 0.06
18 0.06
19 0.06
20 0.06
21 0.06
22 0.07
23 0.07
24 0.06
25 0.09
26 0.12
27 0.13
28 0.13
29 0.14
30 0.14
31 0.15
32 0.16
33 0.15
34 0.14
35 0.14
36 0.23
37 0.28
38 0.3
39 0.37
40 0.38
41 0.43
42 0.42
43 0.45
44 0.44
45 0.48
46 0.54
47 0.55
48 0.61
49 0.58
50 0.59
51 0.59
52 0.55
53 0.52
54 0.53
55 0.53
56 0.54
57 0.54
58 0.52
59 0.47
60 0.44
61 0.41
62 0.33
63 0.27
64 0.21
65 0.18
66 0.2
67 0.21
68 0.21
69 0.18
70 0.2
71 0.19
72 0.2
73 0.26
74 0.26
75 0.32
76 0.34
77 0.38
78 0.43
79 0.48
80 0.49
81 0.46
82 0.48
83 0.42
84 0.41
85 0.41
86 0.38
87 0.38
88 0.41
89 0.38
90 0.37
91 0.37
92 0.35
93 0.32
94 0.28
95 0.22
96 0.18
97 0.18
98 0.16
99 0.17
100 0.17
101 0.16
102 0.16
103 0.16
104 0.14
105 0.16
106 0.16
107 0.16
108 0.16
109 0.18
110 0.18
111 0.18
112 0.21
113 0.2
114 0.19
115 0.2
116 0.23
117 0.22
118 0.21
119 0.19
120 0.16
121 0.17
122 0.25
123 0.32
124 0.37
125 0.44
126 0.51
127 0.58
128 0.64
129 0.65
130 0.6
131 0.55
132 0.53
133 0.46
134 0.39
135 0.32
136 0.24
137 0.21
138 0.22
139 0.23
140 0.18
141 0.23
142 0.28
143 0.3
144 0.33
145 0.38
146 0.4
147 0.44
148 0.51
149 0.52
150 0.56
151 0.57
152 0.54
153 0.49
154 0.42
155 0.33
156 0.26
157 0.23
158 0.17
159 0.16
160 0.16
161 0.17
162 0.17
163 0.16
164 0.16
165 0.12
166 0.09
167 0.07
168 0.05
169 0.06
170 0.06
171 0.07
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.12
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.12
182 0.13
183 0.13
184 0.13
185 0.1
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.08
190 0.07
191 0.09
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.11
196 0.11
197 0.11
198 0.13
199 0.11
200 0.12
201 0.13
202 0.15
203 0.15
204 0.15
205 0.2
206 0.19
207 0.2
208 0.25
209 0.28
210 0.31
211 0.34
212 0.43
213 0.49
214 0.54
215 0.57
216 0.62
217 0.67
218 0.68
219 0.75
220 0.76
221 0.76
222 0.78
223 0.8
224 0.78
225 0.72
226 0.69
227 0.64
228 0.54
229 0.46
230 0.37
231 0.31
232 0.24
233 0.22
234 0.18
235 0.17
236 0.16
237 0.19
238 0.25
239 0.32
240 0.33
241 0.38
242 0.45
243 0.48
244 0.56
245 0.59
246 0.62
247 0.61
248 0.65
249 0.69
250 0.64
251 0.61
252 0.59
253 0.57
254 0.57
255 0.55
256 0.51
257 0.48
258 0.48
259 0.46