Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2XBM0

Protein Details
Accession V2XBM0    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-59TQYASGTQRKSRREREQELAEAKHydrophilic
290-309TSSASRSKRRSRSRSLSASRHydrophilic
312-340DHSRGRSQSRERRRARSRSRDSRSRSPRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
295-351RSKRRSRSRSLSASRSRDHSRGRSQSRERRRARSRSRDSRSRSPRGYHSHSPRHRRS
442-454TRKVKLGRLARRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 14, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
IPR000061  Surp  
IPR035967  SWAP/Surp_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
KEGG mrr:Moror_6813  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF04818  CID  
PF00076  RRM_1  
PF01805  Surp  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
PS50102  RRM  
PS50128  SURP  
Amino Acid Sequences MDKTKAKLASKLSNFFDNDDEESAFPHKAAVDDAKLTQYASGTQRKSRREREQELAEAKKREEEAHAAKAYAEFLDAFEGEGVGRKSASTFVKAGAEGSGSMYSPASRPTSGGMSVISRDGMSPTHVTSAPRPKGKREMDMFLEELKKDQAEREAKYSRSSHGRSATAMAAYDGQSGSKDRGDPQTSNVFVANLPPHVTEQSLGNFFARVGPVGSVKIMWPRNDSSSGPGADMTASRRSKNAGLSGFVSFMTRRDAEEALREFDGFDWGGSILRVGWSKAVPIAAKPMFTSSASRSKRRSRSRSLSASRSRDHSRGRSQSRERRRARSRSRDSRSRSPRGYHSHSPRHRRSRSTDQEDVVTDTFIRAVAAEVKGHGKKYEESLWKREANNSKYSFMKREHRRHAFYRGLIEDERHMSPEFEDDGYNSVYSTDSAEESERERTRKVKLGRLARRRFEAMLRALSGKRGEIARCMAFSLEHAEAAHEVADIIVSSLLVDSTPVPRKVARLHLICDILHNSAASVPSAWKFRQEFQSRLGIVFDHMANIYHSFPGRITAETFKKQITAIVDIWEDWIVFPLDFTTELRERLEGMSVEGQIGTEGKPKDDKTSASYASRFKSSSFQKAEDYVESESTRSSCKADIGEEPIDDLDGEPLKDNLGGEPFDDVDGVPMDDTDGKPVEEDIDGAPLDEGIFDREDDDVDGEPMDMGDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.53
3 0.48
4 0.41
5 0.36
6 0.31
7 0.29
8 0.22
9 0.23
10 0.23
11 0.2
12 0.17
13 0.15
14 0.13
15 0.13
16 0.17
17 0.19
18 0.2
19 0.22
20 0.24
21 0.25
22 0.25
23 0.24
24 0.21
25 0.17
26 0.19
27 0.24
28 0.31
29 0.33
30 0.41
31 0.49
32 0.57
33 0.67
34 0.71
35 0.75
36 0.77
37 0.81
38 0.82
39 0.82
40 0.81
41 0.79
42 0.77
43 0.73
44 0.66
45 0.59
46 0.55
47 0.49
48 0.42
49 0.38
50 0.38
51 0.38
52 0.42
53 0.43
54 0.38
55 0.37
56 0.35
57 0.32
58 0.23
59 0.18
60 0.1
61 0.09
62 0.11
63 0.1
64 0.1
65 0.09
66 0.09
67 0.08
68 0.12
69 0.12
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.11
74 0.17
75 0.2
76 0.19
77 0.2
78 0.21
79 0.24
80 0.24
81 0.24
82 0.19
83 0.16
84 0.13
85 0.14
86 0.12
87 0.1
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.14
93 0.15
94 0.14
95 0.15
96 0.17
97 0.2
98 0.2
99 0.2
100 0.17
101 0.16
102 0.16
103 0.16
104 0.14
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.1
109 0.12
110 0.13
111 0.13
112 0.16
113 0.18
114 0.2
115 0.26
116 0.36
117 0.41
118 0.48
119 0.49
120 0.52
121 0.61
122 0.64
123 0.65
124 0.6
125 0.58
126 0.55
127 0.56
128 0.51
129 0.45
130 0.42
131 0.33
132 0.29
133 0.24
134 0.2
135 0.17
136 0.18
137 0.22
138 0.26
139 0.29
140 0.35
141 0.39
142 0.39
143 0.44
144 0.44
145 0.41
146 0.44
147 0.44
148 0.43
149 0.44
150 0.44
151 0.4
152 0.41
153 0.37
154 0.28
155 0.25
156 0.19
157 0.15
158 0.14
159 0.14
160 0.11
161 0.09
162 0.09
163 0.11
164 0.12
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.24
169 0.28
170 0.28
171 0.31
172 0.37
173 0.36
174 0.36
175 0.33
176 0.25
177 0.2
178 0.24
179 0.2
180 0.13
181 0.14
182 0.14
183 0.14
184 0.15
185 0.15
186 0.12
187 0.13
188 0.15
189 0.15
190 0.15
191 0.14
192 0.13
193 0.13
194 0.14
195 0.12
196 0.09
197 0.08
198 0.09
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.09
203 0.09
204 0.16
205 0.19
206 0.2
207 0.22
208 0.24
209 0.28
210 0.31
211 0.3
212 0.27
213 0.28
214 0.27
215 0.24
216 0.21
217 0.18
218 0.15
219 0.15
220 0.14
221 0.18
222 0.19
223 0.19
224 0.2
225 0.23
226 0.25
227 0.27
228 0.3
229 0.23
230 0.24
231 0.25
232 0.25
233 0.23
234 0.2
235 0.18
236 0.12
237 0.11
238 0.13
239 0.12
240 0.12
241 0.14
242 0.15
243 0.14
244 0.2
245 0.21
246 0.2
247 0.2
248 0.19
249 0.16
250 0.15
251 0.16
252 0.1
253 0.08
254 0.06
255 0.06
256 0.07
257 0.06
258 0.06
259 0.04
260 0.06
261 0.07
262 0.06
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.11
268 0.09
269 0.09
270 0.16
271 0.15
272 0.16
273 0.15
274 0.16
275 0.16
276 0.16
277 0.18
278 0.15
279 0.25
280 0.29
281 0.33
282 0.38
283 0.46
284 0.56
285 0.64
286 0.68
287 0.68
288 0.73
289 0.77
290 0.81
291 0.77
292 0.77
293 0.75
294 0.72
295 0.63
296 0.6
297 0.55
298 0.5
299 0.5
300 0.48
301 0.48
302 0.52
303 0.56
304 0.6
305 0.65
306 0.69
307 0.75
308 0.78
309 0.75
310 0.76
311 0.8
312 0.81
313 0.82
314 0.84
315 0.84
316 0.84
317 0.86
318 0.84
319 0.83
320 0.82
321 0.81
322 0.78
323 0.71
324 0.64
325 0.64
326 0.63
327 0.63
328 0.61
329 0.61
330 0.63
331 0.66
332 0.73
333 0.74
334 0.77
335 0.74
336 0.71
337 0.7
338 0.71
339 0.74
340 0.72
341 0.67
342 0.57
343 0.54
344 0.49
345 0.43
346 0.32
347 0.21
348 0.13
349 0.09
350 0.08
351 0.06
352 0.06
353 0.03
354 0.04
355 0.06
356 0.07
357 0.07
358 0.08
359 0.12
360 0.13
361 0.14
362 0.14
363 0.13
364 0.14
365 0.17
366 0.25
367 0.29
368 0.32
369 0.37
370 0.41
371 0.44
372 0.44
373 0.48
374 0.48
375 0.43
376 0.48
377 0.45
378 0.42
379 0.42
380 0.44
381 0.41
382 0.38
383 0.44
384 0.46
385 0.53
386 0.61
387 0.65
388 0.68
389 0.68
390 0.7
391 0.66
392 0.58
393 0.53
394 0.44
395 0.39
396 0.33
397 0.3
398 0.23
399 0.21
400 0.19
401 0.16
402 0.15
403 0.13
404 0.12
405 0.14
406 0.13
407 0.11
408 0.11
409 0.09
410 0.11
411 0.11
412 0.11
413 0.09
414 0.08
415 0.07
416 0.07
417 0.08
418 0.07
419 0.06
420 0.07
421 0.08
422 0.09
423 0.1
424 0.17
425 0.19
426 0.2
427 0.22
428 0.25
429 0.28
430 0.36
431 0.39
432 0.4
433 0.45
434 0.54
435 0.61
436 0.69
437 0.73
438 0.69
439 0.67
440 0.62
441 0.56
442 0.48
443 0.45
444 0.38
445 0.32
446 0.3
447 0.28
448 0.26
449 0.27
450 0.24
451 0.18
452 0.16
453 0.17
454 0.16
455 0.16
456 0.2
457 0.18
458 0.18
459 0.18
460 0.16
461 0.13
462 0.13
463 0.15
464 0.11
465 0.1
466 0.1
467 0.1
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.05
472 0.05
473 0.04
474 0.04
475 0.03
476 0.04
477 0.03
478 0.03
479 0.03
480 0.03
481 0.03
482 0.03
483 0.04
484 0.04
485 0.1
486 0.16
487 0.17
488 0.19
489 0.2
490 0.23
491 0.28
492 0.36
493 0.38
494 0.35
495 0.37
496 0.4
497 0.41
498 0.38
499 0.36
500 0.29
501 0.22
502 0.19
503 0.16
504 0.12
505 0.11
506 0.12
507 0.09
508 0.08
509 0.09
510 0.11
511 0.15
512 0.15
513 0.21
514 0.23
515 0.28
516 0.37
517 0.42
518 0.42
519 0.42
520 0.5
521 0.44
522 0.42
523 0.37
524 0.27
525 0.22
526 0.22
527 0.18
528 0.1
529 0.1
530 0.1
531 0.1
532 0.12
533 0.12
534 0.11
535 0.12
536 0.11
537 0.11
538 0.15
539 0.15
540 0.15
541 0.17
542 0.23
543 0.29
544 0.32
545 0.34
546 0.3
547 0.3
548 0.29
549 0.29
550 0.25
551 0.24
552 0.21
553 0.22
554 0.21
555 0.2
556 0.21
557 0.18
558 0.15
559 0.1
560 0.1
561 0.09
562 0.08
563 0.08
564 0.07
565 0.08
566 0.09
567 0.09
568 0.14
569 0.15
570 0.17
571 0.18
572 0.18
573 0.18
574 0.18
575 0.21
576 0.15
577 0.16
578 0.18
579 0.17
580 0.17
581 0.15
582 0.14
583 0.11
584 0.12
585 0.1
586 0.13
587 0.13
588 0.15
589 0.21
590 0.22
591 0.28
592 0.31
593 0.33
594 0.32
595 0.4
596 0.42
597 0.41
598 0.45
599 0.43
600 0.43
601 0.44
602 0.39
603 0.33
604 0.38
605 0.4
606 0.45
607 0.45
608 0.45
609 0.44
610 0.47
611 0.49
612 0.42
613 0.39
614 0.31
615 0.29
616 0.27
617 0.24
618 0.22
619 0.2
620 0.2
621 0.19
622 0.18
623 0.16
624 0.19
625 0.21
626 0.22
627 0.25
628 0.28
629 0.29
630 0.27
631 0.26
632 0.23
633 0.21
634 0.18
635 0.15
636 0.12
637 0.11
638 0.12
639 0.12
640 0.12
641 0.13
642 0.14
643 0.14
644 0.12
645 0.14
646 0.14
647 0.13
648 0.15
649 0.14
650 0.14
651 0.14
652 0.11
653 0.1
654 0.1
655 0.1
656 0.08
657 0.08
658 0.09
659 0.12
660 0.12
661 0.15
662 0.15
663 0.15
664 0.15
665 0.16
666 0.16
667 0.13
668 0.15
669 0.11
670 0.13
671 0.13
672 0.13
673 0.12
674 0.1
675 0.1
676 0.09
677 0.09
678 0.08
679 0.09
680 0.09
681 0.1
682 0.1
683 0.11
684 0.12
685 0.13
686 0.11
687 0.11
688 0.11
689 0.11
690 0.1
691 0.09