Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2WNE5

Protein Details
Accession V2WNE5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
259-278GGERTKKPSKPETRVNRISDHydrophilic
299-325IVKNCQEKPKNEQKKENPKKSTPEDAYHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12.333, cyto 7, cyto_pero 4.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG mrr:Moror_13408  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSTQETSHISQEPSQEQTSSPTTETVIQTHSSETQSPLLSTNRPLETDTLETPISTTSSSPLPSDSMTTQQTSASLQDLISALWTLMNGEKKKENKVAVPNSYDGSSAKASTFLMEVDLYLMANETLYPNNKDKILFTLSYMKEGQAANWMKAKTNEYKKELKEKEAETSDTKPEDQVHMKLLKQNKKHVDEYIMEFHLLAADAEYDDRALIDHFLAGLHPALLKSCLMQPDQPDTIEEWYDRARKYNNTWLTMMAITGGERTKKPSKPETRVNRISDEDAQEYHQKGLCYKCSKPGHIVKNCQEKPKNEQKKENPKKSTPEDAYYKIRAIYRDFSEEEQTQILDLMEGGGF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.32
3 0.29
4 0.32
5 0.32
6 0.29
7 0.26
8 0.22
9 0.22
10 0.27
11 0.28
12 0.25
13 0.24
14 0.23
15 0.22
16 0.24
17 0.25
18 0.23
19 0.23
20 0.23
21 0.24
22 0.24
23 0.23
24 0.25
25 0.25
26 0.25
27 0.27
28 0.31
29 0.29
30 0.29
31 0.3
32 0.28
33 0.28
34 0.3
35 0.27
36 0.24
37 0.22
38 0.2
39 0.19
40 0.18
41 0.15
42 0.12
43 0.11
44 0.1
45 0.12
46 0.14
47 0.14
48 0.14
49 0.15
50 0.15
51 0.18
52 0.17
53 0.2
54 0.21
55 0.22
56 0.21
57 0.2
58 0.2
59 0.17
60 0.17
61 0.13
62 0.12
63 0.1
64 0.11
65 0.11
66 0.1
67 0.09
68 0.08
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.06
73 0.09
74 0.16
75 0.17
76 0.2
77 0.27
78 0.3
79 0.37
80 0.42
81 0.42
82 0.42
83 0.51
84 0.56
85 0.54
86 0.54
87 0.49
88 0.44
89 0.41
90 0.35
91 0.25
92 0.2
93 0.16
94 0.13
95 0.12
96 0.12
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.08
101 0.08
102 0.07
103 0.07
104 0.07
105 0.07
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.04
110 0.04
111 0.04
112 0.04
113 0.07
114 0.09
115 0.13
116 0.15
117 0.17
118 0.18
119 0.19
120 0.18
121 0.21
122 0.22
123 0.19
124 0.19
125 0.26
126 0.25
127 0.28
128 0.28
129 0.23
130 0.22
131 0.22
132 0.2
133 0.2
134 0.21
135 0.19
136 0.23
137 0.23
138 0.21
139 0.24
140 0.27
141 0.27
142 0.35
143 0.4
144 0.41
145 0.48
146 0.5
147 0.58
148 0.57
149 0.53
150 0.49
151 0.44
152 0.45
153 0.39
154 0.39
155 0.31
156 0.31
157 0.29
158 0.25
159 0.23
160 0.19
161 0.18
162 0.19
163 0.18
164 0.17
165 0.18
166 0.19
167 0.2
168 0.23
169 0.3
170 0.33
171 0.35
172 0.42
173 0.46
174 0.49
175 0.5
176 0.48
177 0.44
178 0.4
179 0.39
180 0.35
181 0.28
182 0.22
183 0.2
184 0.18
185 0.14
186 0.12
187 0.08
188 0.04
189 0.03
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.03
195 0.03
196 0.03
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.04
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.06
211 0.06
212 0.06
213 0.09
214 0.11
215 0.12
216 0.15
217 0.17
218 0.21
219 0.23
220 0.22
221 0.21
222 0.19
223 0.2
224 0.19
225 0.17
226 0.13
227 0.16
228 0.2
229 0.2
230 0.22
231 0.24
232 0.28
233 0.34
234 0.42
235 0.44
236 0.43
237 0.43
238 0.4
239 0.38
240 0.34
241 0.27
242 0.18
243 0.12
244 0.08
245 0.1
246 0.11
247 0.11
248 0.11
249 0.18
250 0.26
251 0.3
252 0.37
253 0.46
254 0.55
255 0.61
256 0.71
257 0.74
258 0.77
259 0.81
260 0.78
261 0.72
262 0.64
263 0.6
264 0.55
265 0.48
266 0.4
267 0.32
268 0.32
269 0.32
270 0.3
271 0.29
272 0.26
273 0.23
274 0.25
275 0.3
276 0.36
277 0.37
278 0.38
279 0.45
280 0.49
281 0.52
282 0.58
283 0.61
284 0.63
285 0.66
286 0.73
287 0.72
288 0.77
289 0.78
290 0.79
291 0.76
292 0.71
293 0.71
294 0.73
295 0.75
296 0.73
297 0.79
298 0.8
299 0.84
300 0.91
301 0.92
302 0.89
303 0.86
304 0.87
305 0.83
306 0.83
307 0.77
308 0.73
309 0.7
310 0.67
311 0.66
312 0.6
313 0.54
314 0.47
315 0.45
316 0.4
317 0.39
318 0.39
319 0.37
320 0.4
321 0.4
322 0.39
323 0.43
324 0.41
325 0.37
326 0.32
327 0.27
328 0.22
329 0.2
330 0.17
331 0.11
332 0.09