Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2YSA5

Protein Details
Accession V2YSA5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-120KAGNKDSKKDGEKKEKKKPMRLDETRLLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
93-113KAGNKDSKKDGEKKEKKKPMR
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012923  Csm3  
IPR040038  TIPIN/Csm3/Swi3  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0007049  P:cell cycle  
GO:0006974  P:DNA damage response  
GO:0000076  P:DNA replication checkpoint signaling  
GO:0031297  P:replication fork processing  
KEGG mrr:Moror_8016  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07962  Swi3  
Amino Acid Sequences MEPLFLPDEEEQIQNSRNSPPAPPPEDIDIDAIFKEFEEETVDDHVFDLAATRRRAEARYKNAPLPKATQREILPSRSPPRDLDDSGAGGSSKAGNKDSKKDGEKKEKKKPMRLDETRLLGPTGFRQLIKDTKDFKPKGKGHEARDLDRLLQVYQFWAHRMYPKSQFSDTIERIEKLCHSKRMNVALSVWRDEAHGKNIPSGAEDEDQVIDLTDNEGGATEGNHSDAAQYASSSPVPPTRPPSSPDTSGRSAIGAEDDDELDAVMRDLEERRQRELAAKTDETPTNTNGRSLASSSSHGGGSMDVDDDELWAAFDDIQDSGLTTSTSATDSSAVLTSGNVSGTLDDDEEMWDVVREIGQAEGGSKPAIQPATPAQEVLKDSTPGAGPGSGNTSIGAPGDDDWEDMYI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.25
3 0.25
4 0.28
5 0.29
6 0.31
7 0.37
8 0.43
9 0.46
10 0.45
11 0.45
12 0.46
13 0.46
14 0.44
15 0.38
16 0.29
17 0.25
18 0.23
19 0.19
20 0.14
21 0.11
22 0.12
23 0.09
24 0.09
25 0.12
26 0.12
27 0.14
28 0.18
29 0.19
30 0.16
31 0.16
32 0.16
33 0.11
34 0.11
35 0.12
36 0.13
37 0.2
38 0.21
39 0.22
40 0.26
41 0.29
42 0.33
43 0.4
44 0.44
45 0.47
46 0.56
47 0.61
48 0.64
49 0.68
50 0.68
51 0.62
52 0.59
53 0.59
54 0.56
55 0.53
56 0.51
57 0.46
58 0.52
59 0.52
60 0.51
61 0.47
62 0.47
63 0.53
64 0.51
65 0.52
66 0.45
67 0.47
68 0.47
69 0.44
70 0.4
71 0.34
72 0.31
73 0.29
74 0.27
75 0.2
76 0.14
77 0.13
78 0.13
79 0.12
80 0.13
81 0.16
82 0.22
83 0.26
84 0.33
85 0.4
86 0.44
87 0.5
88 0.57
89 0.64
90 0.69
91 0.76
92 0.79
93 0.83
94 0.86
95 0.86
96 0.87
97 0.87
98 0.86
99 0.87
100 0.84
101 0.81
102 0.77
103 0.73
104 0.65
105 0.55
106 0.45
107 0.34
108 0.28
109 0.22
110 0.21
111 0.18
112 0.16
113 0.17
114 0.21
115 0.27
116 0.3
117 0.34
118 0.34
119 0.39
120 0.49
121 0.5
122 0.51
123 0.56
124 0.56
125 0.58
126 0.63
127 0.64
128 0.59
129 0.66
130 0.65
131 0.57
132 0.57
133 0.49
134 0.39
135 0.34
136 0.29
137 0.2
138 0.17
139 0.14
140 0.11
141 0.12
142 0.12
143 0.11
144 0.12
145 0.13
146 0.18
147 0.21
148 0.25
149 0.3
150 0.34
151 0.37
152 0.36
153 0.38
154 0.36
155 0.42
156 0.38
157 0.36
158 0.33
159 0.3
160 0.3
161 0.28
162 0.27
163 0.26
164 0.29
165 0.31
166 0.31
167 0.36
168 0.4
169 0.46
170 0.45
171 0.38
172 0.36
173 0.33
174 0.33
175 0.3
176 0.26
177 0.18
178 0.17
179 0.19
180 0.18
181 0.17
182 0.19
183 0.17
184 0.18
185 0.19
186 0.18
187 0.17
188 0.16
189 0.14
190 0.11
191 0.11
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.07
197 0.05
198 0.04
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.03
203 0.04
204 0.03
205 0.03
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.05
213 0.06
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.06
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.09
222 0.11
223 0.14
224 0.16
225 0.22
226 0.25
227 0.27
228 0.29
229 0.35
230 0.36
231 0.39
232 0.4
233 0.4
234 0.38
235 0.37
236 0.34
237 0.28
238 0.23
239 0.18
240 0.15
241 0.09
242 0.08
243 0.07
244 0.07
245 0.06
246 0.06
247 0.06
248 0.05
249 0.05
250 0.04
251 0.03
252 0.03
253 0.04
254 0.06
255 0.12
256 0.19
257 0.21
258 0.25
259 0.26
260 0.27
261 0.33
262 0.37
263 0.37
264 0.36
265 0.36
266 0.34
267 0.37
268 0.39
269 0.35
270 0.33
271 0.29
272 0.28
273 0.27
274 0.26
275 0.22
276 0.22
277 0.2
278 0.19
279 0.19
280 0.15
281 0.17
282 0.17
283 0.18
284 0.16
285 0.15
286 0.14
287 0.11
288 0.1
289 0.09
290 0.08
291 0.06
292 0.07
293 0.06
294 0.06
295 0.06
296 0.05
297 0.05
298 0.04
299 0.05
300 0.05
301 0.05
302 0.06
303 0.06
304 0.06
305 0.06
306 0.06
307 0.06
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.07
315 0.08
316 0.08
317 0.08
318 0.1
319 0.1
320 0.09
321 0.08
322 0.08
323 0.09
324 0.09
325 0.09
326 0.07
327 0.07
328 0.07
329 0.08
330 0.09
331 0.08
332 0.07
333 0.08
334 0.09
335 0.09
336 0.09
337 0.08
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.07
343 0.07
344 0.07
345 0.08
346 0.07
347 0.08
348 0.09
349 0.09
350 0.09
351 0.09
352 0.1
353 0.14
354 0.15
355 0.13
356 0.16
357 0.21
358 0.28
359 0.28
360 0.28
361 0.24
362 0.28
363 0.3
364 0.31
365 0.28
366 0.22
367 0.22
368 0.25
369 0.24
370 0.2
371 0.2
372 0.18
373 0.15
374 0.15
375 0.2
376 0.17
377 0.17
378 0.16
379 0.16
380 0.14
381 0.14
382 0.13
383 0.09
384 0.09
385 0.12
386 0.12
387 0.12