FuNGI

V2WP46

Protein Details

Accession

V2WP46

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
468-495	VEAIIGHRPKGKKKRKIQKPTHYLMSWK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
474-486	HRPKGKKKRKIQK

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016197 Chromo-like_dom_sf IPR000953 Chromo/chromo_shadow_dom IPR023780 Chromo_domain IPR001584 Integrase_cat-core IPR041588 Integrase_H2C2 IPR012337 RNaseH-like_sf IPR036397 RNaseH_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0015074 P:DNA integration
KEGG	mrr:Moror_8419 -
Pfam	View protein in Pfam PF00385 Chromo PF17921 Integrase_H2C2
PROSITE	View protein in PROSITE PS50013 CHROMO_2 PS50994 INTEGRASE

Amino Acid Sequences

MVQLDALSRRSDLVEDEDTDNEDVVVLPDKLFINTIDTELKNMLEEALPTDEFFKMTIELLLEKGVTPIKSSLQDWRTTDGILYYKNRVYVPNDSKLQKHLVKSIHEALLHGHPGQWNTVDQIQRDYWWPGMTKYIKSFVDGCVACQQMKINTHPTRVPLQPIGGHKDALLFQIITMDLITDLPEVDRSNSILVVVDHAATKGVIFIPCKKKLDAAETAKLLFQHVYKRFGLPDKIISDRDPRFAAEVFTEMGRILGIKQMLSTAYHPQTDGETERVNQEVEIYLHFFCAKEQTKWKDLLHFAEFAHNSRTHSITKQSPFYLMMGYHSRPLPTVFDRTLIPSVEKRIEELKKLREETSALLDISTRRMKERNGRHFNRFKKGQKVWLEGKNLSLGYPSPKLLPKREGPFKIEEVMGPVTYKLKLPFQWRIHPVFHTSLLTPFKENDVHGPNFLEPPPDIVKGQEEFEVEAIIGHRPKGKKKRKIQKPTHYLMSWKEYNSSHNQWKRPSTLKHSMELYLEYKIRHNLP

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.22
2	0.24
3	0.26
4	0.26
5	0.27
6	0.26
7	0.24
8	0.18
9	0.14
10	0.11
11	0.1
12	0.13
13	0.11
14	0.1
15	0.13
16	0.14
17	0.15
18	0.16
19	0.15
20	0.16
21	0.16
22	0.19
23	0.21
24	0.21
25	0.23
26	0.23
27	0.22
28	0.18
29	0.18
30	0.16
31	0.11
32	0.11
33	0.12
34	0.15
35	0.14
36	0.14
37	0.16
38	0.15
39	0.15
40	0.14
41	0.13
42	0.1
43	0.11
44	0.11
45	0.11
46	0.11
47	0.11
48	0.12
49	0.11
50	0.1
51	0.12
52	0.14
53	0.13
54	0.14
55	0.16
56	0.19
57	0.22
58	0.23
59	0.3
60	0.31
61	0.37
62	0.37
63	0.39
64	0.36
65	0.34
66	0.32
67	0.26
68	0.25
69	0.24
70	0.25
71	0.26
72	0.27
73	0.3
74	0.3
75	0.31
76	0.33
77	0.38
78	0.42
79	0.45
80	0.49
81	0.49
82	0.5
83	0.5
84	0.53
85	0.48
86	0.44
87	0.43
88	0.42
89	0.44
90	0.48
91	0.49
92	0.45
93	0.4
94	0.37
95	0.33
96	0.32
97	0.29
98	0.23
99	0.19
100	0.18
101	0.19
102	0.2
103	0.18
104	0.14
105	0.15
106	0.21
107	0.22
108	0.2
109	0.24
110	0.23
111	0.23
112	0.25
113	0.24
114	0.21
115	0.21
116	0.21
117	0.17
118	0.25
119	0.28
120	0.28
121	0.29
122	0.34
123	0.32
124	0.33
125	0.33
126	0.26
127	0.31
128	0.27
129	0.26
130	0.26
131	0.27
132	0.25
133	0.24
134	0.25
135	0.21
136	0.25
137	0.26
138	0.3
139	0.33
140	0.36
141	0.37
142	0.38
143	0.38
144	0.37
145	0.38
146	0.3
147	0.28
148	0.29
149	0.31
150	0.35
151	0.3
152	0.28
153	0.24
154	0.24
155	0.22
156	0.19
157	0.16
158	0.1
159	0.08
160	0.1
161	0.09
162	0.07
163	0.07
164	0.06
165	0.05
166	0.05
167	0.05
168	0.04
169	0.04
170	0.04
171	0.06
172	0.06
173	0.07
174	0.08
175	0.08
176	0.09
177	0.09
178	0.09
179	0.08
180	0.08
181	0.08
182	0.08
183	0.08
184	0.07
185	0.07
186	0.07
187	0.06
188	0.06
189	0.05
190	0.06
191	0.08
192	0.09
193	0.18
194	0.25
195	0.31
196	0.33
197	0.32
198	0.35
199	0.35
200	0.4
201	0.4
202	0.38
203	0.37
204	0.36
205	0.36
206	0.33
207	0.3
208	0.25
209	0.17
210	0.13
211	0.18
212	0.2
213	0.24
214	0.24
215	0.25
216	0.26
217	0.29
218	0.3
219	0.23
220	0.25
221	0.23
222	0.25
223	0.25
224	0.25
225	0.28
226	0.27
227	0.28
228	0.24
229	0.22
230	0.21
231	0.2
232	0.19
233	0.12
234	0.11
235	0.1
236	0.09
237	0.09
238	0.07
239	0.06
240	0.05
241	0.05
242	0.04
243	0.06
244	0.06
245	0.05
246	0.06
247	0.06
248	0.07
249	0.08
250	0.09
251	0.12
252	0.14
253	0.14
254	0.14
255	0.14
256	0.14
257	0.15
258	0.15
259	0.12
260	0.11
261	0.11
262	0.12
263	0.12
264	0.12
265	0.1
266	0.09
267	0.08
268	0.08
269	0.08
270	0.09
271	0.08
272	0.08
273	0.09
274	0.08
275	0.07
276	0.14
277	0.16
278	0.18
279	0.26
280	0.3
281	0.34
282	0.38
283	0.39
284	0.37
285	0.37
286	0.38
287	0.32
288	0.29
289	0.26
290	0.27
291	0.27
292	0.22
293	0.24
294	0.2
295	0.2
296	0.2
297	0.22
298	0.18
299	0.2
300	0.24
301	0.27
302	0.3
303	0.32
304	0.31
305	0.3
306	0.29
307	0.27
308	0.24
309	0.16
310	0.16
311	0.16
312	0.16
313	0.18
314	0.17
315	0.17
316	0.16
317	0.17
318	0.18
319	0.17
320	0.21
321	0.19
322	0.2
323	0.2
324	0.23
325	0.24
326	0.2
327	0.19
328	0.16
329	0.2
330	0.22
331	0.22
332	0.2
333	0.26
334	0.28
335	0.33
336	0.37
337	0.4
338	0.43
339	0.46
340	0.45
341	0.39
342	0.38
343	0.34
344	0.33
345	0.27
346	0.21
347	0.18
348	0.18
349	0.17
350	0.21
351	0.22
352	0.18
353	0.18
354	0.22
355	0.27
356	0.36
357	0.46
358	0.52
359	0.59
360	0.64
361	0.72
362	0.78
363	0.8
364	0.8
365	0.79
366	0.74
367	0.74
368	0.73
369	0.73
370	0.71
371	0.71
372	0.69
373	0.67
374	0.65
375	0.55
376	0.52
377	0.46
378	0.38
379	0.3
380	0.23
381	0.18
382	0.17
383	0.18
384	0.18
385	0.18
386	0.24
387	0.29
388	0.33
389	0.39
390	0.42
391	0.49
392	0.57
393	0.58
394	0.57
395	0.58
396	0.54
397	0.5
398	0.43
399	0.34
400	0.29
401	0.26
402	0.22
403	0.17
404	0.15
405	0.14
406	0.14
407	0.17
408	0.15
409	0.19
410	0.23
411	0.3
412	0.39
413	0.44
414	0.52
415	0.56
416	0.59
417	0.57
418	0.54
419	0.52
420	0.45
421	0.42
422	0.35
423	0.3
424	0.31
425	0.32
426	0.31
427	0.28
428	0.25
429	0.26
430	0.26
431	0.26
432	0.27
433	0.3
434	0.3
435	0.3
436	0.31
437	0.29
438	0.3
439	0.29
440	0.24
441	0.17
442	0.21
443	0.23
444	0.23
445	0.22
446	0.2
447	0.24
448	0.23
449	0.25
450	0.22
451	0.19
452	0.18
453	0.18
454	0.17
455	0.12
456	0.12
457	0.11
458	0.13
459	0.13
460	0.14
461	0.21
462	0.25
463	0.36
464	0.46
465	0.57
466	0.63
467	0.73
468	0.82
469	0.87
470	0.93
471	0.94
472	0.94
473	0.93
474	0.91
475	0.89
476	0.8
477	0.74
478	0.69
479	0.66
480	0.59
481	0.5
482	0.47
483	0.4
484	0.43
485	0.47
486	0.49
487	0.52
488	0.55
489	0.61
490	0.64
491	0.7
492	0.72
493	0.72
494	0.73
495	0.72
496	0.74
497	0.71
498	0.68
499	0.65
500	0.59
501	0.52
502	0.48
503	0.4
504	0.35
505	0.34
506	0.3
507	0.31

V2WP46

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer