Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

V2X1B3

Protein Details
Accession V2X1B3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-247KLVMANRKKREPIKPKITRKEKEVTVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
228-242RKKREPIKPKITRKE
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
KEGG mrr:Moror_9046  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
Amino Acid Sequences MTTPSGSAAASDVKLKVEHDDTDEQWARTISMAILQTIDDKKDEASKGPTLDPFLGKQSDTRRFLLDLELYFAMNPVKANTNEKKKMLLLSLVKGNTSKWKQRETMKLFPEDDDPEEKKKAAEETWSSFKQRFQNEWQPVNVVREAQAKIEQIRMTDRADEYVNRFRLIAMDTKYDDEALMRFFREGLPESLQTKIMLRTEGEPETLEEWYKLAIKYDNQYKLVMANRKKREPIKPKITRKEKEVTVGRMLSESDRKDYMVAGKCFCCAKTGHIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.2
4 0.21
5 0.21
6 0.25
7 0.29
8 0.28
9 0.37
10 0.4
11 0.35
12 0.34
13 0.32
14 0.27
15 0.23
16 0.23
17 0.13
18 0.14
19 0.15
20 0.13
21 0.13
22 0.13
23 0.17
24 0.18
25 0.19
26 0.15
27 0.15
28 0.15
29 0.21
30 0.22
31 0.21
32 0.24
33 0.27
34 0.29
35 0.31
36 0.31
37 0.29
38 0.3
39 0.28
40 0.24
41 0.25
42 0.24
43 0.22
44 0.25
45 0.3
46 0.37
47 0.39
48 0.39
49 0.37
50 0.37
51 0.37
52 0.36
53 0.31
54 0.22
55 0.21
56 0.2
57 0.18
58 0.17
59 0.17
60 0.13
61 0.1
62 0.1
63 0.08
64 0.12
65 0.14
66 0.22
67 0.29
68 0.39
69 0.43
70 0.44
71 0.46
72 0.43
73 0.43
74 0.37
75 0.36
76 0.29
77 0.26
78 0.3
79 0.28
80 0.27
81 0.24
82 0.24
83 0.26
84 0.29
85 0.33
86 0.33
87 0.38
88 0.43
89 0.5
90 0.59
91 0.59
92 0.62
93 0.58
94 0.58
95 0.53
96 0.49
97 0.45
98 0.36
99 0.3
100 0.27
101 0.25
102 0.24
103 0.24
104 0.23
105 0.2
106 0.2
107 0.2
108 0.15
109 0.18
110 0.18
111 0.21
112 0.27
113 0.28
114 0.29
115 0.28
116 0.31
117 0.33
118 0.33
119 0.33
120 0.34
121 0.43
122 0.47
123 0.48
124 0.44
125 0.4
126 0.37
127 0.35
128 0.28
129 0.18
130 0.14
131 0.16
132 0.16
133 0.15
134 0.16
135 0.15
136 0.16
137 0.19
138 0.18
139 0.14
140 0.16
141 0.17
142 0.16
143 0.17
144 0.16
145 0.14
146 0.15
147 0.16
148 0.18
149 0.24
150 0.24
151 0.22
152 0.22
153 0.2
154 0.21
155 0.21
156 0.21
157 0.15
158 0.17
159 0.18
160 0.19
161 0.19
162 0.18
163 0.16
164 0.12
165 0.1
166 0.1
167 0.1
168 0.09
169 0.09
170 0.09
171 0.1
172 0.12
173 0.13
174 0.14
175 0.17
176 0.19
177 0.2
178 0.21
179 0.21
180 0.19
181 0.18
182 0.18
183 0.16
184 0.15
185 0.15
186 0.16
187 0.19
188 0.2
189 0.19
190 0.16
191 0.17
192 0.17
193 0.16
194 0.15
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.13
199 0.11
200 0.12
201 0.15
202 0.17
203 0.24
204 0.33
205 0.37
206 0.36
207 0.36
208 0.34
209 0.36
210 0.4
211 0.43
212 0.43
213 0.47
214 0.54
215 0.6
216 0.67
217 0.71
218 0.74
219 0.76
220 0.78
221 0.79
222 0.82
223 0.86
224 0.89
225 0.92
226 0.86
227 0.83
228 0.81
229 0.73
230 0.72
231 0.69
232 0.63
233 0.6
234 0.55
235 0.49
236 0.41
237 0.39
238 0.34
239 0.33
240 0.3
241 0.28
242 0.27
243 0.27
244 0.27
245 0.28
246 0.32
247 0.34
248 0.35
249 0.35
250 0.35
251 0.37
252 0.38
253 0.36
254 0.3
255 0.23