Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2X6X1

Protein Details
Accession V2X6X1    Localization Confidence Low Confidence Score 7.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-200MLESFLRKCRTRRKVDNQVRSDAKHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 10.5, nucl 10, cyto_nucl 9.333, cyto_mito 9.166, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
IPR019453  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_2  
Gene Ontology GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG mrr:Moror_3184  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10366  Vps39_1  
PF10367  Vps39_2  
Amino Acid Sequences MHSTSTFPRSQILVSGPNSIQSLVPATLISQVESLLESHRIEDATDLADQQRKKIQGNIIVNEDEVEELRYVYQRIGFQCFTETLFEDAGKHFFNGDLDPRLLVSYYPDLRGSMFTQEDTVNVFAGVAEHMPKERSVDDIIVANLVSNYSPHLSPNTRSAPPTAELRKILGMAAQEMLESFLRKCRTRRKVDNQVRSDAKWQSIYSVVDTILVKLFAQFEKTTDLYTLLNEANDVIVSEVEEVLQRNGQYNALCMLYKQGGEDGKLLDAWAKVAEGEWIDEDIKDPLSSIISLVTDKRDRALSQKWGVWLTKRDPDRGLKLLMPKETGKRRNKPEEDKMLLEQLKESNPTAALQFLEHLILQRRSVTPDIHIQYAETCVDQLLELLSQDSVSKLWRAKGSSYSSSRTESSVPFLSYFASTTPDSDAKRVRLKTALFLQGSNLYDARMILDRLSPHEKILKLEMAILHGKLQNHHGALSILANELRDTATAEVYCALGGELIPPKVTSSIIENVPGMQNWKFSPLLAPSKPVDDQLRRQLLKVLLEVYLAEADIHPERAAQLLNSQATSLDVLDVLSIVPPEWPIQLTSSFLARSFRRRLHQCHEGRILKAISAGQNLEVKDRSWLTLREEGFDIEEEEPMNEDEVLNEKARAAVASDPVEIHTDKEARLDRTTDTTVSDIR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.35
3 0.32
4 0.33
5 0.33
6 0.29
7 0.24
8 0.18
9 0.2
10 0.15
11 0.15
12 0.12
13 0.12
14 0.17
15 0.17
16 0.17
17 0.13
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.14
22 0.1
23 0.14
24 0.13
25 0.14
26 0.16
27 0.15
28 0.15
29 0.15
30 0.14
31 0.13
32 0.13
33 0.14
34 0.15
35 0.21
36 0.21
37 0.24
38 0.3
39 0.32
40 0.34
41 0.4
42 0.43
43 0.48
44 0.55
45 0.55
46 0.53
47 0.49
48 0.46
49 0.4
50 0.33
51 0.23
52 0.16
53 0.14
54 0.09
55 0.09
56 0.1
57 0.12
58 0.12
59 0.13
60 0.17
61 0.2
62 0.23
63 0.29
64 0.28
65 0.27
66 0.29
67 0.28
68 0.26
69 0.24
70 0.22
71 0.18
72 0.19
73 0.18
74 0.17
75 0.17
76 0.19
77 0.17
78 0.15
79 0.14
80 0.13
81 0.15
82 0.16
83 0.19
84 0.2
85 0.2
86 0.2
87 0.19
88 0.19
89 0.18
90 0.15
91 0.14
92 0.18
93 0.19
94 0.21
95 0.21
96 0.21
97 0.22
98 0.24
99 0.22
100 0.2
101 0.19
102 0.17
103 0.19
104 0.18
105 0.18
106 0.18
107 0.17
108 0.12
109 0.1
110 0.1
111 0.08
112 0.08
113 0.08
114 0.06
115 0.07
116 0.08
117 0.09
118 0.11
119 0.11
120 0.13
121 0.13
122 0.15
123 0.16
124 0.16
125 0.16
126 0.17
127 0.17
128 0.14
129 0.14
130 0.11
131 0.09
132 0.08
133 0.07
134 0.05
135 0.07
136 0.09
137 0.09
138 0.1
139 0.16
140 0.19
141 0.21
142 0.29
143 0.33
144 0.33
145 0.34
146 0.35
147 0.33
148 0.32
149 0.38
150 0.34
151 0.33
152 0.32
153 0.32
154 0.31
155 0.28
156 0.26
157 0.19
158 0.15
159 0.12
160 0.12
161 0.1
162 0.08
163 0.08
164 0.1
165 0.08
166 0.09
167 0.08
168 0.13
169 0.18
170 0.22
171 0.3
172 0.39
173 0.49
174 0.58
175 0.69
176 0.74
177 0.8
178 0.87
179 0.91
180 0.84
181 0.83
182 0.76
183 0.66
184 0.62
185 0.53
186 0.45
187 0.38
188 0.33
189 0.26
190 0.26
191 0.25
192 0.21
193 0.19
194 0.16
195 0.16
196 0.16
197 0.15
198 0.12
199 0.11
200 0.1
201 0.09
202 0.11
203 0.09
204 0.12
205 0.11
206 0.12
207 0.16
208 0.16
209 0.16
210 0.15
211 0.16
212 0.13
213 0.13
214 0.15
215 0.11
216 0.1
217 0.09
218 0.09
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.05
229 0.06
230 0.06
231 0.08
232 0.08
233 0.09
234 0.1
235 0.12
236 0.11
237 0.11
238 0.12
239 0.12
240 0.11
241 0.1
242 0.11
243 0.11
244 0.11
245 0.1
246 0.12
247 0.11
248 0.13
249 0.14
250 0.12
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.07
258 0.06
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.05
263 0.06
264 0.06
265 0.06
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.07
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.07
280 0.07
281 0.11
282 0.12
283 0.12
284 0.13
285 0.14
286 0.14
287 0.19
288 0.24
289 0.27
290 0.29
291 0.31
292 0.31
293 0.32
294 0.32
295 0.3
296 0.29
297 0.26
298 0.29
299 0.29
300 0.29
301 0.3
302 0.34
303 0.35
304 0.33
305 0.31
306 0.27
307 0.31
308 0.32
309 0.3
310 0.28
311 0.25
312 0.3
313 0.37
314 0.44
315 0.47
316 0.52
317 0.6
318 0.68
319 0.73
320 0.75
321 0.75
322 0.74
323 0.69
324 0.62
325 0.54
326 0.5
327 0.43
328 0.34
329 0.27
330 0.19
331 0.17
332 0.16
333 0.15
334 0.1
335 0.1
336 0.1
337 0.09
338 0.09
339 0.08
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.06
345 0.07
346 0.1
347 0.11
348 0.11
349 0.13
350 0.13
351 0.15
352 0.17
353 0.17
354 0.15
355 0.21
356 0.23
357 0.22
358 0.21
359 0.18
360 0.17
361 0.18
362 0.16
363 0.08
364 0.07
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.05
379 0.08
380 0.1
381 0.13
382 0.16
383 0.18
384 0.19
385 0.25
386 0.3
387 0.34
388 0.36
389 0.36
390 0.35
391 0.36
392 0.35
393 0.3
394 0.27
395 0.21
396 0.22
397 0.2
398 0.19
399 0.17
400 0.16
401 0.16
402 0.14
403 0.13
404 0.1
405 0.11
406 0.1
407 0.1
408 0.13
409 0.16
410 0.16
411 0.2
412 0.23
413 0.25
414 0.32
415 0.32
416 0.32
417 0.33
418 0.33
419 0.35
420 0.37
421 0.39
422 0.33
423 0.32
424 0.31
425 0.3
426 0.3
427 0.26
428 0.19
429 0.13
430 0.12
431 0.12
432 0.12
433 0.09
434 0.09
435 0.08
436 0.1
437 0.11
438 0.16
439 0.2
440 0.19
441 0.2
442 0.24
443 0.25
444 0.24
445 0.27
446 0.24
447 0.2
448 0.21
449 0.2
450 0.18
451 0.18
452 0.17
453 0.16
454 0.17
455 0.17
456 0.17
457 0.19
458 0.2
459 0.19
460 0.19
461 0.17
462 0.15
463 0.15
464 0.14
465 0.12
466 0.08
467 0.08
468 0.08
469 0.07
470 0.08
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.08
475 0.09
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.08
481 0.07
482 0.06
483 0.04
484 0.04
485 0.07
486 0.09
487 0.09
488 0.1
489 0.1
490 0.11
491 0.11
492 0.12
493 0.1
494 0.12
495 0.16
496 0.16
497 0.18
498 0.17
499 0.18
500 0.19
501 0.18
502 0.16
503 0.13
504 0.14
505 0.14
506 0.17
507 0.16
508 0.15
509 0.19
510 0.22
511 0.3
512 0.28
513 0.32
514 0.29
515 0.32
516 0.33
517 0.33
518 0.35
519 0.32
520 0.38
521 0.44
522 0.53
523 0.5
524 0.5
525 0.52
526 0.47
527 0.44
528 0.39
529 0.31
530 0.22
531 0.21
532 0.2
533 0.15
534 0.12
535 0.09
536 0.08
537 0.06
538 0.09
539 0.09
540 0.11
541 0.09
542 0.09
543 0.1
544 0.11
545 0.12
546 0.09
547 0.11
548 0.15
549 0.17
550 0.16
551 0.16
552 0.15
553 0.15
554 0.15
555 0.12
556 0.07
557 0.06
558 0.06
559 0.06
560 0.06
561 0.05
562 0.05
563 0.05
564 0.05
565 0.05
566 0.06
567 0.07
568 0.08
569 0.09
570 0.1
571 0.12
572 0.13
573 0.15
574 0.15
575 0.17
576 0.16
577 0.17
578 0.22
579 0.22
580 0.3
581 0.35
582 0.41
583 0.48
584 0.56
585 0.63
586 0.66
587 0.73
588 0.71
589 0.72
590 0.75
591 0.7
592 0.63
593 0.61
594 0.54
595 0.44
596 0.4
597 0.34
598 0.28
599 0.26
600 0.25
601 0.21
602 0.25
603 0.25
604 0.27
605 0.24
606 0.21
607 0.24
608 0.24
609 0.24
610 0.25
611 0.28
612 0.3
613 0.36
614 0.36
615 0.34
616 0.34
617 0.33
618 0.29
619 0.27
620 0.24
621 0.17
622 0.17
623 0.14
624 0.13
625 0.14
626 0.13
627 0.13
628 0.1
629 0.1
630 0.1
631 0.13
632 0.16
633 0.16
634 0.15
635 0.15
636 0.16
637 0.16
638 0.15
639 0.13
640 0.14
641 0.18
642 0.2
643 0.2
644 0.2
645 0.2
646 0.23
647 0.22
648 0.2
649 0.21
650 0.21
651 0.21
652 0.28
653 0.33
654 0.34
655 0.37
656 0.38
657 0.34
658 0.39
659 0.42
660 0.35
661 0.31