Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

V2W4Y4

Protein Details
Accession V2W4Y4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MAEDKKPSGSRPKKEEPKVEEAVHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
263-271LKKLSKKER
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043502  DNA/RNA_pol_sf  
IPR032567  LDOC1-rel  
IPR021109  Peptidase_aspartic_dom_sf  
IPR005162  Retrotrans_gag_dom  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG mrr:Moror_709  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF03732  Retrotrans_gag  
PF08284  RVP_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd00303  retropepsin_like  
Amino Acid Sequences MAEDKKPSGSRPKKEEPKVEEAVIGSAMPVQDAKKFLQEVLIYIALNPKAFPNDRSKKLFLLSYIIDGPGEFWKNDKTDLLLAFDPEAEKVTWSEFIDDFRTSFKPLDPALKAQLELKDLRMKDRADEYTYQFTYLAKQTGYNDAAQIVAFKRGLPWSLALKIMTRPEGVPTTIKDWMNAAILFNKSYKQALEYGKTWDEEHGTKKPQRNFQKKDDVAIKQITDIDQKEYMAKGLCFRCGRNRHCIKDCLDMPKKDERKQEELKKLSKKERFARIRALVNDQTEEEKNLLIDMMEQKTKMDQNSMHIPLQYKVGTKTIETKALLDSGAGGRFISTGLARTLGKRWIQLLEKIRVFNIDGTANKTAWITHVVELEFRIAGKEFQENFMISGIGDEEMILGLLWLRYHNSQIDWETGEIQFPPRRRVQIKRFRGVLDNIDSEVLIGAKITASQEMAHQQQAVKRDIDKLIPKYLLGYRDCFEKGKAERFPPSRNYDHVIDLKPDFVPRNCKLYPLSPAEQIEQDKFLEENLWKGYIRKSKSPMASPFFFVAKKEKGAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.87
3 0.84
4 0.83
5 0.78
6 0.69
7 0.6
8 0.51
9 0.42
10 0.33
11 0.24
12 0.15
13 0.12
14 0.11
15 0.09
16 0.1
17 0.1
18 0.13
19 0.16
20 0.17
21 0.21
22 0.23
23 0.23
24 0.27
25 0.27
26 0.25
27 0.27
28 0.27
29 0.21
30 0.21
31 0.26
32 0.21
33 0.21
34 0.19
35 0.16
36 0.22
37 0.24
38 0.28
39 0.34
40 0.42
41 0.49
42 0.56
43 0.57
44 0.54
45 0.55
46 0.54
47 0.44
48 0.41
49 0.34
50 0.3
51 0.28
52 0.25
53 0.21
54 0.18
55 0.18
56 0.18
57 0.19
58 0.15
59 0.16
60 0.21
61 0.23
62 0.25
63 0.24
64 0.21
65 0.24
66 0.25
67 0.27
68 0.23
69 0.22
70 0.21
71 0.21
72 0.18
73 0.14
74 0.14
75 0.1
76 0.1
77 0.1
78 0.11
79 0.14
80 0.14
81 0.17
82 0.16
83 0.18
84 0.2
85 0.2
86 0.19
87 0.19
88 0.2
89 0.19
90 0.2
91 0.2
92 0.21
93 0.23
94 0.3
95 0.29
96 0.31
97 0.35
98 0.34
99 0.33
100 0.32
101 0.32
102 0.28
103 0.27
104 0.27
105 0.28
106 0.27
107 0.31
108 0.33
109 0.31
110 0.31
111 0.36
112 0.36
113 0.34
114 0.38
115 0.38
116 0.4
117 0.4
118 0.37
119 0.31
120 0.27
121 0.27
122 0.26
123 0.23
124 0.16
125 0.18
126 0.19
127 0.25
128 0.27
129 0.23
130 0.2
131 0.18
132 0.18
133 0.16
134 0.16
135 0.1
136 0.12
137 0.11
138 0.11
139 0.13
140 0.14
141 0.15
142 0.14
143 0.16
144 0.17
145 0.18
146 0.2
147 0.18
148 0.18
149 0.21
150 0.22
151 0.21
152 0.18
153 0.17
154 0.19
155 0.2
156 0.2
157 0.19
158 0.18
159 0.2
160 0.25
161 0.25
162 0.22
163 0.21
164 0.21
165 0.2
166 0.19
167 0.16
168 0.14
169 0.14
170 0.15
171 0.15
172 0.14
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.12
177 0.18
178 0.21
179 0.24
180 0.24
181 0.28
182 0.29
183 0.29
184 0.28
185 0.22
186 0.22
187 0.2
188 0.24
189 0.25
190 0.3
191 0.35
192 0.41
193 0.46
194 0.53
195 0.61
196 0.67
197 0.68
198 0.7
199 0.76
200 0.7
201 0.69
202 0.67
203 0.58
204 0.52
205 0.47
206 0.39
207 0.28
208 0.29
209 0.24
210 0.2
211 0.19
212 0.17
213 0.15
214 0.15
215 0.16
216 0.15
217 0.15
218 0.13
219 0.12
220 0.16
221 0.16
222 0.21
223 0.22
224 0.23
225 0.31
226 0.39
227 0.42
228 0.47
229 0.54
230 0.55
231 0.59
232 0.62
233 0.56
234 0.55
235 0.55
236 0.54
237 0.53
238 0.47
239 0.46
240 0.5
241 0.53
242 0.5
243 0.54
244 0.5
245 0.52
246 0.6
247 0.65
248 0.65
249 0.65
250 0.67
251 0.68
252 0.69
253 0.69
254 0.66
255 0.65
256 0.63
257 0.67
258 0.67
259 0.62
260 0.64
261 0.6
262 0.59
263 0.53
264 0.51
265 0.43
266 0.37
267 0.34
268 0.26
269 0.24
270 0.19
271 0.18
272 0.13
273 0.1
274 0.09
275 0.08
276 0.07
277 0.05
278 0.06
279 0.08
280 0.09
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.13
285 0.15
286 0.14
287 0.14
288 0.14
289 0.17
290 0.24
291 0.27
292 0.26
293 0.25
294 0.26
295 0.23
296 0.25
297 0.22
298 0.17
299 0.15
300 0.17
301 0.16
302 0.16
303 0.22
304 0.21
305 0.25
306 0.23
307 0.23
308 0.21
309 0.21
310 0.2
311 0.12
312 0.12
313 0.08
314 0.09
315 0.08
316 0.07
317 0.06
318 0.06
319 0.06
320 0.06
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.08
325 0.08
326 0.1
327 0.12
328 0.17
329 0.18
330 0.18
331 0.19
332 0.22
333 0.24
334 0.3
335 0.34
336 0.36
337 0.37
338 0.36
339 0.35
340 0.31
341 0.3
342 0.24
343 0.19
344 0.16
345 0.14
346 0.18
347 0.2
348 0.18
349 0.18
350 0.17
351 0.15
352 0.13
353 0.15
354 0.13
355 0.13
356 0.16
357 0.15
358 0.16
359 0.16
360 0.16
361 0.12
362 0.1
363 0.09
364 0.07
365 0.08
366 0.09
367 0.15
368 0.15
369 0.17
370 0.19
371 0.18
372 0.18
373 0.18
374 0.16
375 0.09
376 0.09
377 0.08
378 0.06
379 0.05
380 0.04
381 0.04
382 0.04
383 0.04
384 0.03
385 0.03
386 0.03
387 0.04
388 0.04
389 0.04
390 0.07
391 0.08
392 0.1
393 0.12
394 0.13
395 0.16
396 0.17
397 0.19
398 0.19
399 0.18
400 0.18
401 0.17
402 0.17
403 0.14
404 0.17
405 0.19
406 0.2
407 0.25
408 0.28
409 0.36
410 0.42
411 0.51
412 0.57
413 0.64
414 0.71
415 0.74
416 0.73
417 0.67
418 0.67
419 0.6
420 0.55
421 0.49
422 0.41
423 0.34
424 0.3
425 0.27
426 0.22
427 0.18
428 0.12
429 0.06
430 0.05
431 0.04
432 0.04
433 0.05
434 0.06
435 0.06
436 0.07
437 0.07
438 0.1
439 0.14
440 0.17
441 0.17
442 0.18
443 0.2
444 0.22
445 0.27
446 0.28
447 0.26
448 0.26
449 0.29
450 0.3
451 0.35
452 0.4
453 0.39
454 0.42
455 0.4
456 0.38
457 0.37
458 0.39
459 0.39
460 0.33
461 0.32
462 0.27
463 0.31
464 0.34
465 0.31
466 0.29
467 0.31
468 0.34
469 0.39
470 0.45
471 0.45
472 0.53
473 0.57
474 0.63
475 0.62
476 0.63
477 0.6
478 0.57
479 0.57
480 0.5
481 0.51
482 0.51
483 0.46
484 0.42
485 0.39
486 0.36
487 0.32
488 0.33
489 0.32
490 0.3
491 0.36
492 0.35
493 0.42
494 0.41
495 0.43
496 0.44
497 0.44
498 0.47
499 0.46
500 0.46
501 0.44
502 0.46
503 0.45
504 0.46
505 0.44
506 0.39
507 0.33
508 0.3
509 0.25
510 0.23
511 0.21
512 0.2
513 0.17
514 0.19
515 0.2
516 0.22
517 0.21
518 0.24
519 0.32
520 0.36
521 0.42
522 0.46
523 0.49
524 0.56
525 0.63
526 0.69
527 0.69
528 0.68
529 0.65
530 0.6
531 0.57
532 0.52
533 0.46
534 0.4
535 0.38
536 0.36