Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HCX3

Protein Details
Accession U5HCX3    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
54-82RNVFDIPFRSLRRRRRRRRLTEDRYDSSEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
64-72LRRRRRRRR
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto 7, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR025340  DUF4246  
Pfam View protein in Pfam  
PF14033  DUF4246  
Amino Acid Sequences MDWNAALRYRGNLTRGASAAALVAQAGVDPSFPREVVDECDAAEIDRVQRDYGRNVFDIPFRSLRRRRRRRRLTEDRYDSSEFDEDEWMENYGSDFEEAIIQDALDEARERWEMSREITLPAPQGVFHPAPEDAIRRKIENPTFTIKGRTVQVIVKLDNIVLTPDQPTYTGGVWHVEGMKNESIVATGIYYYDQVNIDGSSLAFRGTFDETELPYEQNDEGRVEIVFGIHGDGPTMQSYNSVATTHNRIASLRFPCATAPSRGTARSSSFFLVDPLRPRIPSTRDVAPQQREWIERALCESTPGADTEADDSAPSRGSLIDRLPNELWDRILDLTDGLITQDEAKEHRNKLMFERKFKLKELSTEVYEREFSLCEH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.35
3 0.33
4 0.27
5 0.23
6 0.21
7 0.16
8 0.13
9 0.08
10 0.07
11 0.05
12 0.05
13 0.05
14 0.05
15 0.05
16 0.06
17 0.09
18 0.11
19 0.11
20 0.12
21 0.13
22 0.15
23 0.19
24 0.22
25 0.2
26 0.18
27 0.2
28 0.19
29 0.17
30 0.17
31 0.13
32 0.13
33 0.16
34 0.17
35 0.16
36 0.21
37 0.24
38 0.29
39 0.33
40 0.34
41 0.31
42 0.33
43 0.34
44 0.34
45 0.34
46 0.33
47 0.34
48 0.35
49 0.44
50 0.5
51 0.59
52 0.67
53 0.74
54 0.81
55 0.85
56 0.92
57 0.93
58 0.95
59 0.96
60 0.95
61 0.95
62 0.92
63 0.85
64 0.8
65 0.71
66 0.6
67 0.52
68 0.44
69 0.33
70 0.25
71 0.23
72 0.17
73 0.17
74 0.17
75 0.14
76 0.12
77 0.12
78 0.11
79 0.1
80 0.09
81 0.08
82 0.07
83 0.06
84 0.08
85 0.08
86 0.09
87 0.08
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.07
92 0.06
93 0.06
94 0.05
95 0.08
96 0.09
97 0.1
98 0.11
99 0.15
100 0.15
101 0.17
102 0.22
103 0.2
104 0.21
105 0.22
106 0.22
107 0.19
108 0.19
109 0.17
110 0.12
111 0.12
112 0.15
113 0.14
114 0.13
115 0.13
116 0.12
117 0.13
118 0.15
119 0.18
120 0.16
121 0.22
122 0.23
123 0.23
124 0.25
125 0.32
126 0.36
127 0.35
128 0.36
129 0.36
130 0.38
131 0.37
132 0.38
133 0.31
134 0.29
135 0.27
136 0.24
137 0.2
138 0.19
139 0.23
140 0.23
141 0.22
142 0.2
143 0.19
144 0.17
145 0.16
146 0.14
147 0.1
148 0.07
149 0.07
150 0.07
151 0.07
152 0.07
153 0.07
154 0.08
155 0.09
156 0.09
157 0.09
158 0.08
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.12
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.1
170 0.08
171 0.07
172 0.07
173 0.04
174 0.03
175 0.04
176 0.04
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.05
192 0.06
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.1
197 0.1
198 0.13
199 0.14
200 0.12
201 0.11
202 0.12
203 0.11
204 0.1
205 0.11
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.04
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.06
221 0.07
222 0.07
223 0.06
224 0.06
225 0.07
226 0.08
227 0.09
228 0.08
229 0.09
230 0.11
231 0.16
232 0.18
233 0.19
234 0.18
235 0.18
236 0.2
237 0.25
238 0.26
239 0.24
240 0.22
241 0.21
242 0.21
243 0.26
244 0.26
245 0.23
246 0.22
247 0.23
248 0.25
249 0.25
250 0.27
251 0.25
252 0.26
253 0.25
254 0.25
255 0.23
256 0.22
257 0.21
258 0.21
259 0.21
260 0.21
261 0.23
262 0.26
263 0.27
264 0.26
265 0.29
266 0.33
267 0.35
268 0.36
269 0.36
270 0.37
271 0.39
272 0.45
273 0.51
274 0.49
275 0.47
276 0.48
277 0.48
278 0.43
279 0.41
280 0.41
281 0.33
282 0.29
283 0.3
284 0.28
285 0.23
286 0.23
287 0.21
288 0.16
289 0.16
290 0.16
291 0.14
292 0.11
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.08
303 0.08
304 0.1
305 0.14
306 0.17
307 0.23
308 0.23
309 0.29
310 0.29
311 0.32
312 0.33
313 0.31
314 0.28
315 0.21
316 0.23
317 0.18
318 0.18
319 0.14
320 0.11
321 0.1
322 0.1
323 0.09
324 0.07
325 0.07
326 0.06
327 0.08
328 0.09
329 0.1
330 0.12
331 0.19
332 0.26
333 0.28
334 0.35
335 0.39
336 0.39
337 0.48
338 0.57
339 0.58
340 0.59
341 0.65
342 0.68
343 0.68
344 0.7
345 0.68
346 0.62
347 0.62
348 0.62
349 0.6
350 0.55
351 0.53
352 0.51
353 0.45
354 0.41
355 0.34
356 0.28