Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HDC1

Protein Details
Accession U5HDC1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
274-293KPPIPLSKKPSKSTDRPESDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013246  SAGA_su_Sgf11  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0070461  C:SAGA-type complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF08209  Sgf11  
Amino Acid Sequences MSSESDEPTVASLASALMRTMLHELVTDIAIEEHRLAWRRRTSMQANEAQAKANAAERLLGPNGESSSSSSGAATASTSNLSRPASPFGHPSPHKKDDALYECMICGRQIGAPRFASHLSSCMGLTGRSKRTATNKAPINGKLRQLSSDRASSYASDEDSLSGTEKRNGTKASSNGLKRSANLSGFNGTSKHKKAKASTPSHPANALQAQIASIGSHPLAKTLSAPAAPPISKTASKTIVSSLSGPSNTKSTPSPSKPLPSASLTSSISPASKKPPIPLSKKPSKSTDRPESDSEEDSPD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.07
4 0.08
5 0.08
6 0.09
7 0.12
8 0.11
9 0.1
10 0.11
11 0.11
12 0.11
13 0.12
14 0.1
15 0.08
16 0.08
17 0.08
18 0.09
19 0.09
20 0.09
21 0.13
22 0.2
23 0.22
24 0.29
25 0.36
26 0.4
27 0.43
28 0.5
29 0.53
30 0.56
31 0.61
32 0.6
33 0.58
34 0.58
35 0.56
36 0.49
37 0.42
38 0.34
39 0.26
40 0.23
41 0.19
42 0.13
43 0.14
44 0.13
45 0.16
46 0.16
47 0.15
48 0.12
49 0.14
50 0.14
51 0.14
52 0.13
53 0.12
54 0.15
55 0.15
56 0.15
57 0.13
58 0.13
59 0.12
60 0.11
61 0.09
62 0.07
63 0.07
64 0.08
65 0.08
66 0.08
67 0.12
68 0.13
69 0.13
70 0.15
71 0.19
72 0.2
73 0.22
74 0.26
75 0.25
76 0.34
77 0.36
78 0.42
79 0.45
80 0.48
81 0.48
82 0.44
83 0.44
84 0.44
85 0.46
86 0.42
87 0.34
88 0.29
89 0.28
90 0.28
91 0.25
92 0.16
93 0.11
94 0.07
95 0.08
96 0.14
97 0.16
98 0.2
99 0.2
100 0.21
101 0.23
102 0.23
103 0.23
104 0.17
105 0.16
106 0.13
107 0.12
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.09
112 0.12
113 0.17
114 0.19
115 0.22
116 0.23
117 0.26
118 0.33
119 0.41
120 0.42
121 0.44
122 0.46
123 0.46
124 0.5
125 0.5
126 0.48
127 0.42
128 0.42
129 0.37
130 0.32
131 0.31
132 0.29
133 0.29
134 0.26
135 0.26
136 0.22
137 0.2
138 0.2
139 0.17
140 0.17
141 0.14
142 0.12
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.08
149 0.08
150 0.09
151 0.12
152 0.14
153 0.15
154 0.18
155 0.18
156 0.2
157 0.24
158 0.25
159 0.27
160 0.32
161 0.33
162 0.32
163 0.36
164 0.33
165 0.29
166 0.3
167 0.28
168 0.24
169 0.23
170 0.22
171 0.2
172 0.2
173 0.2
174 0.18
175 0.17
176 0.21
177 0.24
178 0.3
179 0.32
180 0.37
181 0.41
182 0.49
183 0.57
184 0.58
185 0.6
186 0.61
187 0.6
188 0.57
189 0.53
190 0.44
191 0.38
192 0.32
193 0.26
194 0.18
195 0.14
196 0.13
197 0.12
198 0.11
199 0.07
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.08
204 0.07
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.13
211 0.12
212 0.12
213 0.13
214 0.17
215 0.17
216 0.17
217 0.18
218 0.21
219 0.22
220 0.24
221 0.27
222 0.28
223 0.29
224 0.29
225 0.29
226 0.27
227 0.27
228 0.26
229 0.23
230 0.22
231 0.23
232 0.23
233 0.21
234 0.22
235 0.21
236 0.21
237 0.21
238 0.25
239 0.33
240 0.37
241 0.43
242 0.44
243 0.51
244 0.52
245 0.53
246 0.5
247 0.45
248 0.42
249 0.38
250 0.38
251 0.33
252 0.31
253 0.28
254 0.25
255 0.23
256 0.22
257 0.23
258 0.25
259 0.31
260 0.32
261 0.37
262 0.46
263 0.54
264 0.6
265 0.67
266 0.7
267 0.73
268 0.79
269 0.79
270 0.79
271 0.78
272 0.8
273 0.8
274 0.81
275 0.78
276 0.75
277 0.74
278 0.72
279 0.66
280 0.6