Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HDN4

Protein Details
Accession U5HDN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
204-224ERDCAKDAKRKLRASKRKAGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
211-223AKRKLRASKRKAG
Subcellular Location(s) cyto 13, nucl 8, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006735  Rtf2  
IPR027799  Rtf2_RING-finger  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1902979  P:mitotic DNA replication termination  
Pfam View protein in Pfam  
PF04641  Rtf2  
CDD cd16653  RING-like_Rtf2  
Amino Acid Sequences MGADGGSFAKRDDLIKTKKATVHADQHELQRLLWHTCALSKEPLRQPVVSCALGKLYNKEALISHLLDPASGSDGHAVASHIRSLKDVTTLKLTTNPALGPSSSPSSDEAAPVNALDAIKFVAPFVCPISLREMNGSTKFVYRRPGGYVISEASLKEIRKAGAEATLLVDVGTSLSTDTSSSQWIVINPRADELEAAKVAWEAERDCAKDAKRKLRASKRKAGDNTGSLHPNKTKPPERTIRMAPVGPAIKAGSSVPLLSSSLAAKLAAEKTTLSPAIASLYVDPTADPNHDKDGRSTWMTRGAFTRYAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.42
3 0.46
4 0.5
5 0.53
6 0.57
7 0.57
8 0.56
9 0.58
10 0.57
11 0.59
12 0.56
13 0.58
14 0.6
15 0.53
16 0.45
17 0.4
18 0.38
19 0.34
20 0.32
21 0.27
22 0.2
23 0.22
24 0.26
25 0.23
26 0.29
27 0.29
28 0.37
29 0.43
30 0.49
31 0.5
32 0.48
33 0.47
34 0.47
35 0.48
36 0.41
37 0.35
38 0.29
39 0.28
40 0.3
41 0.29
42 0.25
43 0.23
44 0.25
45 0.24
46 0.25
47 0.22
48 0.22
49 0.25
50 0.23
51 0.2
52 0.19
53 0.19
54 0.18
55 0.18
56 0.14
57 0.13
58 0.11
59 0.1
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.09
64 0.09
65 0.09
66 0.1
67 0.12
68 0.13
69 0.13
70 0.14
71 0.15
72 0.15
73 0.2
74 0.21
75 0.2
76 0.24
77 0.24
78 0.24
79 0.28
80 0.29
81 0.23
82 0.23
83 0.21
84 0.17
85 0.17
86 0.17
87 0.13
88 0.14
89 0.16
90 0.14
91 0.15
92 0.15
93 0.16
94 0.16
95 0.16
96 0.14
97 0.12
98 0.12
99 0.1
100 0.09
101 0.08
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.06
107 0.06
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.08
115 0.09
116 0.16
117 0.17
118 0.17
119 0.18
120 0.19
121 0.2
122 0.21
123 0.22
124 0.16
125 0.18
126 0.19
127 0.19
128 0.22
129 0.21
130 0.22
131 0.23
132 0.26
133 0.23
134 0.22
135 0.22
136 0.17
137 0.16
138 0.15
139 0.12
140 0.1
141 0.12
142 0.11
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.12
147 0.13
148 0.11
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.07
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.03
161 0.03
162 0.03
163 0.03
164 0.04
165 0.05
166 0.06
167 0.07
168 0.07
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.14
173 0.17
174 0.19
175 0.18
176 0.18
177 0.18
178 0.17
179 0.16
180 0.13
181 0.12
182 0.1
183 0.09
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.06
190 0.1
191 0.13
192 0.14
193 0.16
194 0.2
195 0.22
196 0.29
197 0.36
198 0.43
199 0.49
200 0.55
201 0.64
202 0.71
203 0.79
204 0.8
205 0.82
206 0.78
207 0.79
208 0.75
209 0.72
210 0.66
211 0.59
212 0.55
213 0.49
214 0.48
215 0.39
216 0.39
217 0.37
218 0.35
219 0.38
220 0.43
221 0.47
222 0.47
223 0.56
224 0.61
225 0.62
226 0.65
227 0.64
228 0.62
229 0.57
230 0.53
231 0.44
232 0.41
233 0.38
234 0.31
235 0.27
236 0.2
237 0.16
238 0.16
239 0.15
240 0.11
241 0.1
242 0.1
243 0.09
244 0.1
245 0.11
246 0.1
247 0.11
248 0.09
249 0.1
250 0.1
251 0.1
252 0.09
253 0.12
254 0.14
255 0.14
256 0.14
257 0.14
258 0.15
259 0.2
260 0.2
261 0.16
262 0.14
263 0.14
264 0.16
265 0.15
266 0.14
267 0.11
268 0.12
269 0.13
270 0.13
271 0.12
272 0.12
273 0.14
274 0.16
275 0.18
276 0.18
277 0.26
278 0.3
279 0.31
280 0.33
281 0.36
282 0.38
283 0.41
284 0.41
285 0.36
286 0.42
287 0.41
288 0.4
289 0.38
290 0.38