Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HIA3

Protein Details
Accession U5HIA3    Localization Confidence High Confidence Score 20.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
64-83VDLNRAKRSSKEKETKKAADHydrophilic
251-273DAEIKAKPTKKKQKVVASPKAPEHydrophilic
355-382LLVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGDITMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
257-262KPTKKK
363-373FTKEKNKKKRG
Subcellular Location(s) nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MDAKTEALHQTHSHIHLFLLSHKLPKTASALSKELLKKGTPLITDQLDPRPSEGALLALLKAKVDLNRAKRSSKEKETKKAADVLSDSDDSDDSDDSDDSDDDEQEASKVAPKSKDTKAAVNKAETSDSSSSSDLSSGLDSDSASSEDEEADEKPTTLVGKVVDKVKKTASDSDDSSDDSSDEEDKEKKVPVKATAAKVVEALAPKATSNKRKAAESSSDSDSGSSSSSSDSDSSSSSSSSSDSDSSSDSDAEIKAKPTKKKQKVVASPKAPEPVSLLTPVPAVASPKPTTPLMNGINGGNKKKERVINAPFRRVKAEEVTFADPRLKDNSFAARASDLLPAGMSDYGAKASADLLVTRGKGFTKEKNKKKRGSYRGGDITMESHSIKFNYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.26
3 0.26
4 0.26
5 0.26
6 0.28
7 0.26
8 0.3
9 0.3
10 0.33
11 0.3
12 0.32
13 0.33
14 0.32
15 0.36
16 0.36
17 0.38
18 0.37
19 0.45
20 0.45
21 0.43
22 0.39
23 0.34
24 0.31
25 0.33
26 0.37
27 0.3
28 0.31
29 0.32
30 0.31
31 0.33
32 0.34
33 0.36
34 0.34
35 0.33
36 0.31
37 0.28
38 0.25
39 0.24
40 0.2
41 0.14
42 0.12
43 0.12
44 0.11
45 0.13
46 0.13
47 0.11
48 0.12
49 0.14
50 0.15
51 0.21
52 0.28
53 0.33
54 0.43
55 0.47
56 0.5
57 0.55
58 0.62
59 0.64
60 0.67
61 0.69
62 0.69
63 0.75
64 0.81
65 0.8
66 0.74
67 0.72
68 0.61
69 0.56
70 0.48
71 0.41
72 0.35
73 0.3
74 0.26
75 0.2
76 0.19
77 0.15
78 0.14
79 0.11
80 0.08
81 0.09
82 0.09
83 0.08
84 0.1
85 0.09
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.09
90 0.09
91 0.09
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.12
96 0.14
97 0.18
98 0.21
99 0.25
100 0.31
101 0.35
102 0.44
103 0.41
104 0.47
105 0.52
106 0.56
107 0.56
108 0.53
109 0.5
110 0.42
111 0.41
112 0.33
113 0.3
114 0.23
115 0.21
116 0.2
117 0.18
118 0.18
119 0.16
120 0.16
121 0.11
122 0.1
123 0.08
124 0.07
125 0.06
126 0.06
127 0.06
128 0.06
129 0.07
130 0.07
131 0.07
132 0.07
133 0.07
134 0.06
135 0.07
136 0.07
137 0.07
138 0.09
139 0.09
140 0.09
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.08
145 0.09
146 0.08
147 0.1
148 0.13
149 0.19
150 0.22
151 0.22
152 0.24
153 0.25
154 0.27
155 0.27
156 0.31
157 0.28
158 0.28
159 0.29
160 0.29
161 0.27
162 0.25
163 0.23
164 0.16
165 0.13
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.11
173 0.13
174 0.15
175 0.18
176 0.2
177 0.22
178 0.23
179 0.3
180 0.34
181 0.35
182 0.37
183 0.35
184 0.31
185 0.29
186 0.26
187 0.2
188 0.15
189 0.13
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.13
194 0.18
195 0.24
196 0.28
197 0.34
198 0.35
199 0.37
200 0.39
201 0.39
202 0.4
203 0.36
204 0.36
205 0.32
206 0.31
207 0.29
208 0.27
209 0.22
210 0.16
211 0.13
212 0.09
213 0.06
214 0.06
215 0.07
216 0.07
217 0.08
218 0.08
219 0.08
220 0.09
221 0.1
222 0.1
223 0.09
224 0.09
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.1
231 0.1
232 0.11
233 0.12
234 0.12
235 0.11
236 0.1
237 0.1
238 0.1
239 0.11
240 0.11
241 0.13
242 0.19
243 0.25
244 0.32
245 0.42
246 0.52
247 0.6
248 0.68
249 0.74
250 0.78
251 0.83
252 0.86
253 0.85
254 0.81
255 0.75
256 0.7
257 0.66
258 0.56
259 0.45
260 0.38
261 0.3
262 0.24
263 0.23
264 0.19
265 0.15
266 0.15
267 0.14
268 0.11
269 0.1
270 0.11
271 0.1
272 0.16
273 0.16
274 0.17
275 0.2
276 0.21
277 0.22
278 0.21
279 0.27
280 0.24
281 0.25
282 0.25
283 0.23
284 0.29
285 0.32
286 0.33
287 0.32
288 0.31
289 0.32
290 0.37
291 0.41
292 0.4
293 0.46
294 0.53
295 0.58
296 0.64
297 0.72
298 0.7
299 0.66
300 0.65
301 0.57
302 0.52
303 0.48
304 0.44
305 0.38
306 0.39
307 0.42
308 0.38
309 0.37
310 0.38
311 0.3
312 0.29
313 0.3
314 0.26
315 0.23
316 0.26
317 0.33
318 0.32
319 0.32
320 0.31
321 0.26
322 0.26
323 0.26
324 0.24
325 0.16
326 0.13
327 0.12
328 0.1
329 0.11
330 0.1
331 0.09
332 0.07
333 0.07
334 0.08
335 0.09
336 0.08
337 0.07
338 0.08
339 0.09
340 0.09
341 0.09
342 0.1
343 0.13
344 0.14
345 0.15
346 0.16
347 0.15
348 0.21
349 0.26
350 0.34
351 0.43
352 0.53
353 0.63
354 0.73
355 0.82
356 0.84
357 0.9
358 0.91
359 0.9
360 0.9
361 0.87
362 0.86
363 0.85
364 0.79
365 0.69
366 0.59
367 0.5
368 0.41
369 0.36
370 0.27
371 0.19
372 0.19