Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HCT0

Protein Details
Accession U5HCT0    Localization Confidence High Confidence Score 17.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
173-198STPTTTSSTHKRRVKNKPVARMKMSSHydrophilic
207-229GSKAVKAKYAKQNKGTKGRSNKGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-65SKRKKAREAAVRNKA
183-229KRRVKNKPVARMKMSSAEKKERATGSKAVKAKYAKQNKGTKGRSNKG
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 10, mito 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019186  Nucleolar_protein_12  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF09805  Nop25  
Amino Acid Sequences MPKHTKRKSNTPVGTISHPVLNKSGRPAKVKKVKEVVFDPDARKEFLTGFSKRKKAREAAVRNKAIDRERQELNEMRRNIRDERKERAAQNVRNAKVMYGDAGGSDDEAFSESENDDDGLDPNTPDPAPTTTFESTDLVTTVAIEPFSLSRSPSPALPLDRDLPPPPPPRSTSTPTTTSSTHKRRVKNKPVARMKMSSAEKKERATGSKAVKAKYAKQNKGTKGRSNKG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.64
2 0.57
3 0.49
4 0.42
5 0.37
6 0.33
7 0.32
8 0.31
9 0.28
10 0.34
11 0.4
12 0.4
13 0.48
14 0.52
15 0.58
16 0.64
17 0.68
18 0.68
19 0.7
20 0.68
21 0.67
22 0.65
23 0.62
24 0.57
25 0.57
26 0.51
27 0.48
28 0.46
29 0.4
30 0.36
31 0.3
32 0.26
33 0.27
34 0.31
35 0.29
36 0.36
37 0.42
38 0.5
39 0.54
40 0.59
41 0.59
42 0.59
43 0.62
44 0.65
45 0.68
46 0.7
47 0.75
48 0.73
49 0.67
50 0.64
51 0.6
52 0.52
53 0.49
54 0.43
55 0.37
56 0.36
57 0.36
58 0.38
59 0.39
60 0.43
61 0.43
62 0.4
63 0.39
64 0.4
65 0.42
66 0.44
67 0.47
68 0.5
69 0.46
70 0.51
71 0.56
72 0.58
73 0.55
74 0.6
75 0.6
76 0.54
77 0.59
78 0.6
79 0.53
80 0.51
81 0.49
82 0.39
83 0.31
84 0.27
85 0.19
86 0.11
87 0.1
88 0.07
89 0.07
90 0.07
91 0.06
92 0.05
93 0.04
94 0.04
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.05
102 0.05
103 0.04
104 0.05
105 0.05
106 0.06
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.07
111 0.07
112 0.06
113 0.07
114 0.08
115 0.1
116 0.11
117 0.17
118 0.16
119 0.17
120 0.18
121 0.17
122 0.16
123 0.14
124 0.13
125 0.08
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.06
130 0.06
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.11
139 0.12
140 0.12
141 0.15
142 0.17
143 0.2
144 0.21
145 0.23
146 0.23
147 0.25
148 0.27
149 0.26
150 0.25
151 0.3
152 0.35
153 0.36
154 0.37
155 0.38
156 0.41
157 0.47
158 0.49
159 0.48
160 0.46
161 0.47
162 0.46
163 0.46
164 0.41
165 0.41
166 0.46
167 0.48
168 0.52
169 0.55
170 0.61
171 0.68
172 0.77
173 0.82
174 0.83
175 0.83
176 0.84
177 0.88
178 0.87
179 0.82
180 0.75
181 0.67
182 0.66
183 0.64
184 0.62
185 0.59
186 0.6
187 0.59
188 0.58
189 0.6
190 0.56
191 0.54
192 0.51
193 0.51
194 0.49
195 0.53
196 0.55
197 0.5
198 0.52
199 0.52
200 0.56
201 0.59
202 0.62
203 0.63
204 0.68
205 0.76
206 0.79
207 0.84
208 0.83
209 0.82