Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H8I7

Protein Details
Accession U5H8I7    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
198-223NGNGDVIKGRKRRNKKARTEEDESESHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
179-187KEGKRGKRK
205-215KGRKRRNKKAR
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11.5, cyto 5.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003958  CBFA_NFYB_domain  
IPR009072  Histone-fold  
IPR027113  Transc_fact_NFYB/HAP3  
Gene Ontology GO:0016602  C:CCAAT-binding factor complex  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF00808  CBFD_NFYB_HMF  
Amino Acid Sequences MASPPFAPLSLPRPPTPSLPTTEDATVESGLLPEQQQQQQQRQRAWANIRPRAAEDQDDLPPDLEGQEPEAASMKISDQDVDGYKEQDRFLPIANVARVMKRVLPSSTKVSKESKEIVQECTSEFISFITSEAAERCSAEKRKTINGEDLLFAMNSLGFENYAEVMKIYLSKWRALGTKEGKRGKRKNSTTGDLSNQNGNGDVIKGRKRRNKKARTEEDESESTSRSEDQLDGDQGDAADEEEEDDDEDQDEYEGDEDGRRVYGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.41
3 0.43
4 0.42
5 0.39
6 0.4
7 0.41
8 0.4
9 0.38
10 0.34
11 0.29
12 0.27
13 0.21
14 0.16
15 0.13
16 0.1
17 0.09
18 0.1
19 0.09
20 0.12
21 0.18
22 0.22
23 0.28
24 0.35
25 0.44
26 0.52
27 0.58
28 0.57
29 0.59
30 0.59
31 0.61
32 0.62
33 0.6
34 0.61
35 0.62
36 0.6
37 0.54
38 0.53
39 0.51
40 0.45
41 0.41
42 0.34
43 0.3
44 0.3
45 0.3
46 0.28
47 0.22
48 0.19
49 0.16
50 0.14
51 0.11
52 0.09
53 0.09
54 0.1
55 0.1
56 0.1
57 0.12
58 0.11
59 0.1
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.1
64 0.09
65 0.08
66 0.11
67 0.12
68 0.15
69 0.16
70 0.15
71 0.17
72 0.19
73 0.19
74 0.18
75 0.18
76 0.16
77 0.16
78 0.16
79 0.15
80 0.17
81 0.17
82 0.18
83 0.17
84 0.17
85 0.17
86 0.16
87 0.17
88 0.15
89 0.17
90 0.17
91 0.19
92 0.22
93 0.28
94 0.33
95 0.32
96 0.34
97 0.36
98 0.35
99 0.36
100 0.36
101 0.32
102 0.33
103 0.33
104 0.33
105 0.31
106 0.3
107 0.26
108 0.24
109 0.21
110 0.14
111 0.12
112 0.09
113 0.08
114 0.07
115 0.07
116 0.06
117 0.05
118 0.06
119 0.06
120 0.07
121 0.06
122 0.07
123 0.08
124 0.13
125 0.17
126 0.19
127 0.23
128 0.25
129 0.31
130 0.35
131 0.36
132 0.36
133 0.35
134 0.34
135 0.3
136 0.27
137 0.22
138 0.17
139 0.14
140 0.09
141 0.06
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.05
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.06
155 0.06
156 0.1
157 0.12
158 0.13
159 0.14
160 0.17
161 0.2
162 0.2
163 0.29
164 0.33
165 0.39
166 0.47
167 0.54
168 0.59
169 0.66
170 0.73
171 0.74
172 0.76
173 0.74
174 0.76
175 0.75
176 0.74
177 0.69
178 0.65
179 0.6
180 0.53
181 0.49
182 0.42
183 0.35
184 0.29
185 0.24
186 0.2
187 0.15
188 0.12
189 0.13
190 0.15
191 0.22
192 0.29
193 0.37
194 0.47
195 0.57
196 0.67
197 0.76
198 0.81
199 0.85
200 0.9
201 0.91
202 0.9
203 0.88
204 0.81
205 0.77
206 0.68
207 0.6
208 0.5
209 0.4
210 0.32
211 0.25
212 0.21
213 0.16
214 0.16
215 0.13
216 0.15
217 0.18
218 0.2
219 0.19
220 0.18
221 0.18
222 0.16
223 0.15
224 0.12
225 0.08
226 0.07
227 0.06
228 0.07
229 0.06
230 0.07
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.07
242 0.07
243 0.09
244 0.09
245 0.1