Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HIV5

Protein Details
Accession U5HIV5    Localization Confidence High Confidence Score 17.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
551-576RDFNCPCCPKKFSRRHDRARHCAAVHHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
481-508KAKTAKATTTARRAAPKTRTAKRGGRRG
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036236  Znf_C2H2_sf  
IPR013087  Znf_C2H2_type  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00028  ZINC_FINGER_C2H2_1  
PS50157  ZINC_FINGER_C2H2_2  
Amino Acid Sequences MSLLSKDVYPSSSCLPLSELQLPSEAPDLDHQCLPFSPLSAAAAAFFGSHDYHSLQHSTQVDPNLGSNASSPPFSDSCSGYSSSSASDASSFPDSPPRFSFDADAAAGVFSASAPSAAAVNVTASTARARAQNQAAHAHVHAQAHPGLSSAAGNAPSLATPIATTTDGSSYYSTYDSDYCPSTRSTSPASSFVHASPKLDQQAFAALNGFDLPQARHAQNAQAESDSTFASRNQSAPMPYYTDAQQQQLQQGAPMYQQASALPFAYANSSSPAYLQQTPAVQQQQQYYYNQAIQRQQQQQQQQAQRHMYAQQQQVQMSHMQHQQQQQQPHQVPQQTPVALAPAFETASGTYYFVPSTAINPSVAHAAEPWSAMPEQMQQPRQMISQAPPQQQQHDVIQQARQLPAHQISPVMSSPVASLSRADSPLAAPLARVPVRDYTISGLTKAASTISTSRSQSNSPVMHSEVDELLPTQSDAPPSPKAKTAKATTTARRAAPKTRTAKRGGRRGAFYGESTGKSETKRFVCPYEDCGRAFSRNFNMQSHLKSHLNIRDFNCPCCPKKFSRRHDRARHCAAVHNMHDLADNPDHQSESTSSHRRSALASSGGDESDEFEDDKDSTYRG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.23
2 0.26
3 0.26
4 0.29
5 0.33
6 0.3
7 0.26
8 0.28
9 0.27
10 0.25
11 0.26
12 0.21
13 0.15
14 0.21
15 0.24
16 0.26
17 0.28
18 0.27
19 0.25
20 0.25
21 0.28
22 0.21
23 0.19
24 0.17
25 0.15
26 0.16
27 0.15
28 0.15
29 0.12
30 0.11
31 0.1
32 0.09
33 0.07
34 0.08
35 0.08
36 0.08
37 0.1
38 0.11
39 0.13
40 0.16
41 0.19
42 0.17
43 0.23
44 0.25
45 0.26
46 0.29
47 0.3
48 0.29
49 0.27
50 0.28
51 0.24
52 0.22
53 0.19
54 0.16
55 0.17
56 0.16
57 0.16
58 0.15
59 0.18
60 0.18
61 0.2
62 0.21
63 0.19
64 0.2
65 0.23
66 0.24
67 0.19
68 0.2
69 0.19
70 0.17
71 0.17
72 0.15
73 0.12
74 0.12
75 0.11
76 0.14
77 0.17
78 0.16
79 0.16
80 0.25
81 0.26
82 0.29
83 0.31
84 0.33
85 0.3
86 0.31
87 0.33
88 0.24
89 0.27
90 0.22
91 0.2
92 0.15
93 0.14
94 0.12
95 0.09
96 0.08
97 0.04
98 0.04
99 0.04
100 0.04
101 0.04
102 0.04
103 0.05
104 0.05
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.1
115 0.14
116 0.15
117 0.21
118 0.27
119 0.29
120 0.31
121 0.35
122 0.34
123 0.31
124 0.3
125 0.27
126 0.24
127 0.23
128 0.21
129 0.19
130 0.19
131 0.18
132 0.18
133 0.15
134 0.12
135 0.1
136 0.1
137 0.08
138 0.08
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.07
144 0.08
145 0.07
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.08
150 0.08
151 0.08
152 0.08
153 0.1
154 0.1
155 0.12
156 0.11
157 0.1
158 0.11
159 0.11
160 0.1
161 0.11
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.15
166 0.15
167 0.15
168 0.16
169 0.19
170 0.19
171 0.21
172 0.23
173 0.26
174 0.28
175 0.32
176 0.32
177 0.3
178 0.3
179 0.29
180 0.32
181 0.27
182 0.27
183 0.24
184 0.26
185 0.3
186 0.28
187 0.27
188 0.2
189 0.25
190 0.24
191 0.21
192 0.18
193 0.13
194 0.12
195 0.12
196 0.12
197 0.06
198 0.07
199 0.07
200 0.1
201 0.14
202 0.14
203 0.15
204 0.16
205 0.2
206 0.22
207 0.23
208 0.2
209 0.17
210 0.17
211 0.16
212 0.16
213 0.12
214 0.09
215 0.09
216 0.08
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.15
222 0.16
223 0.17
224 0.18
225 0.18
226 0.18
227 0.19
228 0.18
229 0.22
230 0.23
231 0.23
232 0.24
233 0.22
234 0.23
235 0.24
236 0.22
237 0.17
238 0.16
239 0.15
240 0.12
241 0.12
242 0.11
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.09
259 0.1
260 0.12
261 0.13
262 0.14
263 0.13
264 0.14
265 0.15
266 0.19
267 0.2
268 0.18
269 0.19
270 0.21
271 0.23
272 0.25
273 0.24
274 0.22
275 0.21
276 0.24
277 0.23
278 0.24
279 0.24
280 0.26
281 0.34
282 0.37
283 0.42
284 0.43
285 0.46
286 0.5
287 0.54
288 0.56
289 0.52
290 0.52
291 0.48
292 0.44
293 0.4
294 0.36
295 0.32
296 0.32
297 0.31
298 0.31
299 0.31
300 0.31
301 0.3
302 0.28
303 0.27
304 0.21
305 0.23
306 0.2
307 0.2
308 0.24
309 0.28
310 0.34
311 0.36
312 0.4
313 0.38
314 0.44
315 0.43
316 0.43
317 0.42
318 0.39
319 0.36
320 0.33
321 0.34
322 0.26
323 0.24
324 0.2
325 0.18
326 0.14
327 0.13
328 0.11
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.05
334 0.07
335 0.07
336 0.07
337 0.06
338 0.07
339 0.07
340 0.07
341 0.08
342 0.07
343 0.08
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.11
351 0.09
352 0.08
353 0.09
354 0.09
355 0.09
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.09
361 0.11
362 0.16
363 0.21
364 0.24
365 0.24
366 0.25
367 0.26
368 0.26
369 0.24
370 0.2
371 0.17
372 0.24
373 0.3
374 0.33
375 0.36
376 0.37
377 0.38
378 0.38
379 0.38
380 0.32
381 0.29
382 0.28
383 0.25
384 0.26
385 0.26
386 0.26
387 0.25
388 0.22
389 0.19
390 0.2
391 0.2
392 0.19
393 0.17
394 0.15
395 0.14
396 0.17
397 0.16
398 0.13
399 0.11
400 0.1
401 0.1
402 0.12
403 0.12
404 0.1
405 0.1
406 0.11
407 0.14
408 0.14
409 0.14
410 0.11
411 0.11
412 0.13
413 0.14
414 0.12
415 0.09
416 0.09
417 0.16
418 0.16
419 0.16
420 0.16
421 0.18
422 0.2
423 0.21
424 0.21
425 0.17
426 0.22
427 0.22
428 0.2
429 0.18
430 0.16
431 0.15
432 0.14
433 0.12
434 0.07
435 0.09
436 0.1
437 0.13
438 0.18
439 0.19
440 0.22
441 0.24
442 0.25
443 0.27
444 0.32
445 0.3
446 0.28
447 0.29
448 0.27
449 0.26
450 0.25
451 0.23
452 0.17
453 0.15
454 0.13
455 0.11
456 0.1
457 0.09
458 0.09
459 0.08
460 0.09
461 0.1
462 0.12
463 0.15
464 0.22
465 0.25
466 0.26
467 0.32
468 0.34
469 0.37
470 0.43
471 0.45
472 0.45
473 0.5
474 0.56
475 0.56
476 0.61
477 0.61
478 0.57
479 0.59
480 0.56
481 0.57
482 0.56
483 0.59
484 0.6
485 0.63
486 0.66
487 0.67
488 0.72
489 0.73
490 0.76
491 0.75
492 0.72
493 0.68
494 0.65
495 0.63
496 0.55
497 0.47
498 0.43
499 0.37
500 0.32
501 0.3
502 0.29
503 0.27
504 0.27
505 0.3
506 0.31
507 0.32
508 0.37
509 0.39
510 0.4
511 0.43
512 0.43
513 0.47
514 0.46
515 0.46
516 0.4
517 0.4
518 0.39
519 0.38
520 0.37
521 0.36
522 0.36
523 0.4
524 0.43
525 0.41
526 0.44
527 0.43
528 0.46
529 0.43
530 0.42
531 0.36
532 0.35
533 0.41
534 0.42
535 0.42
536 0.45
537 0.44
538 0.49
539 0.49
540 0.51
541 0.52
542 0.52
543 0.51
544 0.52
545 0.55
546 0.54
547 0.63
548 0.7
549 0.72
550 0.77
551 0.84
552 0.88
553 0.93
554 0.93
555 0.92
556 0.91
557 0.88
558 0.78
559 0.75
560 0.71
561 0.69
562 0.6
563 0.55
564 0.46
565 0.39
566 0.38
567 0.32
568 0.3
569 0.25
570 0.24
571 0.22
572 0.23
573 0.23
574 0.22
575 0.24
576 0.2
577 0.22
578 0.3
579 0.36
580 0.36
581 0.41
582 0.43
583 0.41
584 0.42
585 0.41
586 0.39
587 0.36
588 0.34
589 0.31
590 0.31
591 0.29
592 0.27
593 0.22
594 0.18
595 0.15
596 0.15
597 0.13
598 0.12
599 0.14
600 0.14
601 0.17