Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HC49

Protein Details
Accession U5HC49    Localization Confidence High Confidence Score 17.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
93-116ALNSGRGRSRTRSRSRRSSMSSLSHydrophilic
369-399ETEKAGKPKKEKSVKRKAKPRVEKKNEAGQQBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
372-434KAGKPKKEKSVKRKAKPRVEKKNEAGQQPGSKKLGASTNGKPTKGTAKAAKTKEPKASQSRKG
474-483RRNPPPRAPK
959-969RKARKNKKRRF
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 8.5, mito 6, cyto 3.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040221  CDCA7/CDA7L  
IPR018866  Znf-4CXXC_R1  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF10497  zf-4CXXC_R1  
Amino Acid Sequences MSSPPIITSSSRSTLDSSSQHGPAASASASAPAAQPTAPAVISRDELGSEDGASSDDPLDVLPPSSSSPIALHKPSVCASRHSNSQDLSPSLALNSGRGRSRTRSRSRRSSMSSLSSLDSEPDEMETRRIDHEGALEGAHPGSAKTNGARRNIFANGHGSSSKKRASSPSHFGFVSPKRRTTEAITFDDSQDEIDELEDDDDDNNTGRQADDEEIDELDQIQGTTSISHGKSKTKGKLVAVASSSKFKAKATTTAVKGQQNASDDGGKRVYCHQDHQAHDSLKETMWRCSAIKASAKGSHRACGLSYCEKCLKSRYEPEASGMNAPGARKNWSCPLCRGICNCSVCRKKQNLAPVGYLKSQTEKAVAEETEKAGKPKKEKSVKRKAKPRVEKKNEAGQQPGSKKLGASTNGKPTKGTAKAAKTKEPKASQSRKGVRGPFSMNVDTESSLSSLSSDEDKPSATTAGAAVVVPVKRRNPPPRAPKFVRPPKTYPLTRSTVIPSNGLLMARLHLRSFILRFSGFAPVLTTESAKIRSVLGALADDRDGWVWSREGDVVQRFMLQALCELLDQEEENIATEEGSAKLLRRLAREAIGSQIEKDRAWDTLREIVEQENVWDDGGWGEEVVKWEAEREEADRVQFGGQRETRGRRGETGPDERLALMLALVELAYAAECVRKDFTDGVEAEKTAMVTHNRSKFQYRHDCEDRRKAILAEKPEKPKLHIDDMLTDKDQAKPNHDRELAEWAAKCADIDDRLKEEEKKWQKELNEIHRDVYLVTAENRLRFAPTGTDVHDNQYWLMCPSTASKFPTEADPATDDYPLSWSILVHGSPFSEIDPVADAANGNKGKTIAAPPPSPPPTPDTVASINASRVDHKDSWFVVTDPEEMIQLVSHLEWQQKWAEYEVRLARHEKSDAGTRSLTPLGGEDDESTVKSISDLVAELRIFADYVAAEKEDAMNGNRKARKNKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.32
2 0.37
3 0.34
4 0.33
5 0.33
6 0.33
7 0.32
8 0.3
9 0.27
10 0.22
11 0.21
12 0.16
13 0.12
14 0.11
15 0.12
16 0.12
17 0.12
18 0.13
19 0.11
20 0.12
21 0.11
22 0.11
23 0.11
24 0.13
25 0.12
26 0.12
27 0.13
28 0.15
29 0.16
30 0.17
31 0.16
32 0.14
33 0.15
34 0.16
35 0.15
36 0.12
37 0.11
38 0.1
39 0.1
40 0.1
41 0.1
42 0.09
43 0.08
44 0.08
45 0.07
46 0.08
47 0.08
48 0.09
49 0.08
50 0.09
51 0.11
52 0.13
53 0.14
54 0.14
55 0.16
56 0.21
57 0.27
58 0.28
59 0.31
60 0.3
61 0.34
62 0.36
63 0.4
64 0.35
65 0.35
66 0.39
67 0.4
68 0.47
69 0.47
70 0.49
71 0.44
72 0.46
73 0.46
74 0.41
75 0.38
76 0.3
77 0.26
78 0.22
79 0.24
80 0.2
81 0.18
82 0.21
83 0.22
84 0.26
85 0.29
86 0.33
87 0.38
88 0.48
89 0.56
90 0.63
91 0.69
92 0.74
93 0.82
94 0.85
95 0.87
96 0.84
97 0.82
98 0.77
99 0.73
100 0.66
101 0.57
102 0.51
103 0.43
104 0.35
105 0.28
106 0.22
107 0.16
108 0.14
109 0.14
110 0.15
111 0.15
112 0.17
113 0.17
114 0.18
115 0.19
116 0.2
117 0.19
118 0.17
119 0.18
120 0.18
121 0.17
122 0.16
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.11
127 0.09
128 0.07
129 0.09
130 0.1
131 0.12
132 0.16
133 0.23
134 0.28
135 0.35
136 0.37
137 0.36
138 0.39
139 0.41
140 0.39
141 0.34
142 0.33
143 0.28
144 0.28
145 0.28
146 0.26
147 0.26
148 0.31
149 0.33
150 0.3
151 0.32
152 0.38
153 0.45
154 0.51
155 0.56
156 0.55
157 0.54
158 0.52
159 0.5
160 0.5
161 0.49
162 0.51
163 0.47
164 0.48
165 0.47
166 0.49
167 0.51
168 0.5
169 0.51
170 0.48
171 0.48
172 0.47
173 0.45
174 0.43
175 0.41
176 0.34
177 0.25
178 0.18
179 0.13
180 0.09
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.09
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.12
204 0.1
205 0.08
206 0.08
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.06
212 0.06
213 0.12
214 0.13
215 0.18
216 0.2
217 0.25
218 0.32
219 0.4
220 0.47
221 0.49
222 0.53
223 0.5
224 0.55
225 0.52
226 0.5
227 0.43
228 0.41
229 0.35
230 0.33
231 0.33
232 0.27
233 0.26
234 0.21
235 0.25
236 0.23
237 0.29
238 0.33
239 0.39
240 0.4
241 0.46
242 0.51
243 0.48
244 0.48
245 0.42
246 0.38
247 0.33
248 0.32
249 0.27
250 0.27
251 0.24
252 0.25
253 0.26
254 0.23
255 0.21
256 0.25
257 0.3
258 0.27
259 0.3
260 0.37
261 0.41
262 0.44
263 0.48
264 0.5
265 0.44
266 0.43
267 0.4
268 0.33
269 0.26
270 0.29
271 0.25
272 0.2
273 0.21
274 0.23
275 0.21
276 0.23
277 0.25
278 0.24
279 0.28
280 0.28
281 0.3
282 0.35
283 0.37
284 0.41
285 0.39
286 0.37
287 0.34
288 0.31
289 0.28
290 0.24
291 0.27
292 0.29
293 0.28
294 0.3
295 0.33
296 0.34
297 0.35
298 0.37
299 0.38
300 0.36
301 0.44
302 0.46
303 0.47
304 0.47
305 0.47
306 0.45
307 0.4
308 0.34
309 0.26
310 0.2
311 0.16
312 0.16
313 0.16
314 0.14
315 0.17
316 0.17
317 0.2
318 0.27
319 0.31
320 0.33
321 0.33
322 0.39
323 0.38
324 0.42
325 0.42
326 0.38
327 0.4
328 0.41
329 0.4
330 0.43
331 0.45
332 0.46
333 0.52
334 0.53
335 0.51
336 0.51
337 0.58
338 0.56
339 0.53
340 0.52
341 0.47
342 0.45
343 0.41
344 0.38
345 0.29
346 0.25
347 0.23
348 0.19
349 0.17
350 0.15
351 0.15
352 0.16
353 0.16
354 0.15
355 0.15
356 0.16
357 0.18
358 0.18
359 0.19
360 0.22
361 0.26
362 0.3
363 0.36
364 0.45
365 0.51
366 0.6
367 0.69
368 0.74
369 0.81
370 0.84
371 0.87
372 0.87
373 0.88
374 0.89
375 0.89
376 0.89
377 0.88
378 0.87
379 0.82
380 0.82
381 0.76
382 0.67
383 0.6
384 0.52
385 0.5
386 0.43
387 0.42
388 0.34
389 0.29
390 0.27
391 0.25
392 0.27
393 0.23
394 0.27
395 0.27
396 0.36
397 0.39
398 0.39
399 0.36
400 0.33
401 0.37
402 0.34
403 0.34
404 0.3
405 0.35
406 0.43
407 0.46
408 0.52
409 0.51
410 0.53
411 0.57
412 0.54
413 0.54
414 0.56
415 0.62
416 0.61
417 0.65
418 0.67
419 0.65
420 0.67
421 0.65
422 0.58
423 0.54
424 0.5
425 0.42
426 0.39
427 0.34
428 0.28
429 0.25
430 0.22
431 0.18
432 0.15
433 0.13
434 0.09
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.05
439 0.06
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.09
444 0.09
445 0.09
446 0.1
447 0.09
448 0.07
449 0.06
450 0.06
451 0.06
452 0.06
453 0.05
454 0.05
455 0.07
456 0.07
457 0.08
458 0.11
459 0.12
460 0.17
461 0.25
462 0.34
463 0.39
464 0.48
465 0.58
466 0.64
467 0.71
468 0.71
469 0.72
470 0.74
471 0.76
472 0.76
473 0.71
474 0.67
475 0.64
476 0.66
477 0.6
478 0.54
479 0.5
480 0.45
481 0.4
482 0.37
483 0.34
484 0.32
485 0.3
486 0.26
487 0.2
488 0.18
489 0.18
490 0.16
491 0.13
492 0.07
493 0.07
494 0.09
495 0.09
496 0.08
497 0.07
498 0.08
499 0.09
500 0.1
501 0.1
502 0.1
503 0.1
504 0.1
505 0.11
506 0.14
507 0.13
508 0.12
509 0.12
510 0.1
511 0.11
512 0.11
513 0.1
514 0.07
515 0.09
516 0.11
517 0.1
518 0.1
519 0.09
520 0.09
521 0.09
522 0.09
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.06
533 0.07
534 0.06
535 0.07
536 0.08
537 0.08
538 0.08
539 0.11
540 0.12
541 0.12
542 0.12
543 0.12
544 0.11
545 0.12
546 0.12
547 0.08
548 0.07
549 0.07
550 0.07
551 0.06
552 0.06
553 0.06
554 0.06
555 0.06
556 0.05
557 0.05
558 0.05
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.05
563 0.05
564 0.06
565 0.05
566 0.07
567 0.06
568 0.06
569 0.09
570 0.12
571 0.15
572 0.16
573 0.19
574 0.2
575 0.22
576 0.23
577 0.21
578 0.21
579 0.21
580 0.19
581 0.17
582 0.19
583 0.17
584 0.16
585 0.17
586 0.15
587 0.14
588 0.15
589 0.16
590 0.15
591 0.2
592 0.21
593 0.2
594 0.2
595 0.19
596 0.19
597 0.17
598 0.15
599 0.1
600 0.1
601 0.09
602 0.08
603 0.07
604 0.06
605 0.06
606 0.06
607 0.04
608 0.04
609 0.06
610 0.07
611 0.08
612 0.08
613 0.07
614 0.08
615 0.09
616 0.1
617 0.09
618 0.1
619 0.13
620 0.14
621 0.15
622 0.14
623 0.14
624 0.15
625 0.17
626 0.17
627 0.2
628 0.21
629 0.25
630 0.3
631 0.34
632 0.38
633 0.4
634 0.41
635 0.37
636 0.39
637 0.42
638 0.44
639 0.46
640 0.42
641 0.38
642 0.37
643 0.32
644 0.29
645 0.22
646 0.14
647 0.07
648 0.05
649 0.04
650 0.03
651 0.03
652 0.03
653 0.02
654 0.02
655 0.02
656 0.02
657 0.03
658 0.05
659 0.05
660 0.07
661 0.08
662 0.09
663 0.11
664 0.12
665 0.13
666 0.17
667 0.18
668 0.2
669 0.2
670 0.2
671 0.18
672 0.17
673 0.16
674 0.11
675 0.14
676 0.12
677 0.16
678 0.23
679 0.29
680 0.32
681 0.34
682 0.41
683 0.41
684 0.49
685 0.56
686 0.54
687 0.57
688 0.63
689 0.7
690 0.71
691 0.77
692 0.71
693 0.62
694 0.59
695 0.51
696 0.49
697 0.45
698 0.47
699 0.44
700 0.47
701 0.51
702 0.56
703 0.56
704 0.52
705 0.55
706 0.51
707 0.51
708 0.48
709 0.42
710 0.42
711 0.44
712 0.45
713 0.37
714 0.34
715 0.28
716 0.29
717 0.34
718 0.29
719 0.33
720 0.39
721 0.42
722 0.5
723 0.51
724 0.46
725 0.41
726 0.47
727 0.41
728 0.36
729 0.32
730 0.24
731 0.22
732 0.21
733 0.19
734 0.12
735 0.13
736 0.14
737 0.16
738 0.18
739 0.2
740 0.23
741 0.27
742 0.29
743 0.29
744 0.35
745 0.43
746 0.46
747 0.48
748 0.5
749 0.49
750 0.55
751 0.62
752 0.62
753 0.62
754 0.57
755 0.53
756 0.48
757 0.47
758 0.38
759 0.3
760 0.2
761 0.12
762 0.12
763 0.17
764 0.18
765 0.19
766 0.2
767 0.2
768 0.2
769 0.19
770 0.19
771 0.17
772 0.19
773 0.2
774 0.22
775 0.26
776 0.25
777 0.29
778 0.29
779 0.26
780 0.23
781 0.22
782 0.2
783 0.16
784 0.16
785 0.12
786 0.11
787 0.15
788 0.2
789 0.23
790 0.25
791 0.25
792 0.26
793 0.27
794 0.31
795 0.31
796 0.27
797 0.25
798 0.25
799 0.25
800 0.24
801 0.24
802 0.19
803 0.15
804 0.16
805 0.14
806 0.12
807 0.1
808 0.09
809 0.11
810 0.13
811 0.13
812 0.12
813 0.12
814 0.12
815 0.12
816 0.13
817 0.11
818 0.1
819 0.1
820 0.09
821 0.11
822 0.11
823 0.1
824 0.1
825 0.1
826 0.09
827 0.17
828 0.18
829 0.16
830 0.16
831 0.17
832 0.17
833 0.2
834 0.24
835 0.23
836 0.28
837 0.3
838 0.31
839 0.4
840 0.44
841 0.42
842 0.4
843 0.38
844 0.37
845 0.38
846 0.37
847 0.33
848 0.31
849 0.33
850 0.33
851 0.29
852 0.26
853 0.25
854 0.25
855 0.23
856 0.23
857 0.27
858 0.28
859 0.29
860 0.33
861 0.31
862 0.33
863 0.32
864 0.29
865 0.26
866 0.25
867 0.24
868 0.19
869 0.18
870 0.15
871 0.13
872 0.13
873 0.1
874 0.08
875 0.08
876 0.07
877 0.1
878 0.12
879 0.16
880 0.16
881 0.19
882 0.23
883 0.26
884 0.28
885 0.29
886 0.31
887 0.28
888 0.36
889 0.39
890 0.39
891 0.39
892 0.4
893 0.39
894 0.39
895 0.4
896 0.34
897 0.32
898 0.38
899 0.38
900 0.39
901 0.38
902 0.34
903 0.36
904 0.35
905 0.31
906 0.22
907 0.2
908 0.19
909 0.18
910 0.19
911 0.15
912 0.17
913 0.18
914 0.18
915 0.18
916 0.14
917 0.13
918 0.12
919 0.12
920 0.1
921 0.1
922 0.1
923 0.1
924 0.15
925 0.14
926 0.15
927 0.14
928 0.14
929 0.12
930 0.11
931 0.11
932 0.07
933 0.09
934 0.1
935 0.1
936 0.1
937 0.11
938 0.12
939 0.12
940 0.15
941 0.17
942 0.24
943 0.27
944 0.37
945 0.44
946 0.5
947 0.59
948 0.68
949 0.76