FuNGI

U5H995

Protein Details

Accession

U5H995

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
18-43	LTSVCCRARRTPLKSREPHRSQQNTF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

cyto 7, mito 6, cyto_nucl 6, extr 5, nucl 3, E.R. 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR019321 Nucleoporin_Nup88 IPR037700 NUP88/NUP82
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF10168 Nup88

Amino Acid Sequences

MPDETCPKVGPCACAITLTSVCCRARRTPLKSREPHRSQQNTFTMPSWLSSLSSHPIFELPDWPATASSTLSGPGPHPHHDRTSNLTPLAQASSSSSRPSLFGNLSTTPKTSRHGPTLTRSSSATSSVNALASTRSKKPQVGGLGRQSKMVVVAGRDLIVAVGTELRITSLTQAKARMQHERPHANETHHDRGEYKVLHTPLINFEIQQLVLNPTNTFLAVVGAHSIAVVVLPRKGSSSIVGSTVECRSLLVGHYYHGLSGSPLVSQILWHPWGTNSSSLLVLTIDSTVREYDISTDVEEPTQTLSFIEDHPQQTSRSTPSKRSGGPRGFSAEDKNAKKAVAMCLGGGQADWGPLTLFGLMRNGDVVAICPFLPKKASLPASYIHALSSFVSTKVDYLNVTEPTSDSMALTLKNSTPTKSAAAPHLSSLYARQLQYVHQLVRQASRAGASSSNFESEGIDIDPTIQDSLKDHLVHLTAPRFGAGNATPKVQGPFLMQPEPIELDHGEDCELETLATDMMYLYYEPQDRMREGDKEVKIGLGVVGIAYLDGKVDLCLEVEKVEARWEEGFAELRGEGEDALDELPSLCVYETIDLGLVNELDEQQPRASMSLEGGWVSFIKDPLYVDIIYLQHPLGSHCIVLSGWLDDLVDTLNPSLEKGQEDEEKQAHEMNKAVRASEPSQVVWIVKTVNPIAASDDSTTTDATTPLSVPVVGMDLINDVYLGYTMLLVTSSLQLVAIELSLRVDSSLLPSATLSSSTHRGKGLPNEPPPYLSLLESPFKTPSILASSSQHVLPRQVVPKSLANKGALETVTPDSLRFIGKSVEALRTRLSDLVDASDQVQNRIELQLAELGRQLTKVHELRKIIAGGLIQDTSLNAGDEERVLKDRIGKVKERQEVLLKRTDRILQGLMDRHAPSVSTFERNWFDELKRLEGEIEGGKEGEGDGPGLTTRVERLVEKVELLKPGLEEMKKKTEGPSGAGNLVLGGTQLHKVEEKLAEEAELIMEARRKVEKLSQALGALSMA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.31
2	0.31
3	0.29
4	0.28
5	0.27
6	0.27
7	0.29
8	0.31
9	0.33
10	0.37
11	0.38
12	0.46
13	0.54
14	0.6
15	0.64
16	0.72
17	0.8
18	0.84
19	0.85
20	0.85
21	0.83
22	0.84
23	0.84
24	0.83
25	0.77
26	0.78
27	0.79
28	0.72
29	0.66
30	0.58
31	0.51
32	0.41
33	0.37
34	0.3
35	0.22
36	0.19
37	0.18
38	0.2
39	0.22
40	0.23
41	0.22
42	0.2
43	0.21
44	0.21
45	0.21
46	0.22
47	0.19
48	0.21
49	0.21
50	0.21
51	0.2
52	0.2
53	0.2
54	0.16
55	0.14
56	0.12
57	0.12
58	0.12
59	0.13
60	0.13
61	0.2
62	0.23
63	0.29
64	0.34
65	0.38
66	0.45
67	0.48
68	0.5
69	0.51
70	0.54
71	0.53
72	0.48
73	0.45
74	0.38
75	0.35
76	0.34
77	0.26
78	0.19
79	0.18
80	0.22
81	0.23
82	0.24
83	0.24
84	0.22
85	0.23
86	0.24
87	0.25
88	0.22
89	0.23
90	0.26
91	0.28
92	0.32
93	0.33
94	0.33
95	0.3
96	0.31
97	0.32
98	0.35
99	0.38
100	0.41
101	0.46
102	0.49
103	0.54
104	0.61
105	0.6
106	0.54
107	0.48
108	0.44
109	0.39
110	0.37
111	0.3
112	0.21
113	0.21
114	0.21
115	0.2
116	0.17
117	0.16
118	0.15
119	0.2
120	0.24
121	0.27
122	0.32
123	0.35
124	0.38
125	0.4
126	0.44
127	0.49
128	0.52
129	0.54
130	0.58
131	0.62
132	0.6
133	0.58
134	0.51
135	0.41
136	0.35
137	0.29
138	0.21
139	0.14
140	0.16
141	0.16
142	0.16
143	0.15
144	0.14
145	0.11
146	0.09
147	0.07
148	0.05
149	0.05
150	0.05
151	0.05
152	0.05
153	0.06
154	0.06
155	0.07
156	0.11
157	0.16
158	0.19
159	0.22
160	0.25
161	0.29
162	0.35
163	0.39
164	0.44
165	0.43
166	0.47
167	0.55
168	0.6
169	0.59
170	0.59
171	0.59
172	0.53
173	0.57
174	0.57
175	0.57
176	0.49
177	0.47
178	0.41
179	0.41
180	0.44
181	0.37
182	0.32
183	0.29
184	0.29
185	0.3
186	0.29
187	0.28
188	0.25
189	0.27
190	0.25
191	0.18
192	0.18
193	0.18
194	0.18
195	0.16
196	0.14
197	0.14
198	0.16
199	0.17
200	0.16
201	0.15
202	0.16
203	0.15
204	0.13
205	0.09
206	0.08
207	0.07
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.07
212	0.06
213	0.06
214	0.04
215	0.04
216	0.06
217	0.06
218	0.07
219	0.08
220	0.08
221	0.1
222	0.11
223	0.12
224	0.13
225	0.16
226	0.15
227	0.17
228	0.18
229	0.17
230	0.18
231	0.18
232	0.17
233	0.13
234	0.12
235	0.1
236	0.1
237	0.11
238	0.12
239	0.11
240	0.11
241	0.14
242	0.14
243	0.13
244	0.12
245	0.12
246	0.08
247	0.09
248	0.09
249	0.07
250	0.07
251	0.07
252	0.07
253	0.07
254	0.09
255	0.11
256	0.13
257	0.13
258	0.13
259	0.14
260	0.16
261	0.18
262	0.18
263	0.15
264	0.14
265	0.15
266	0.14
267	0.13
268	0.11
269	0.09
270	0.07
271	0.07
272	0.06
273	0.06
274	0.07
275	0.07
276	0.07
277	0.07
278	0.07
279	0.08
280	0.1
281	0.11
282	0.11
283	0.12
284	0.13
285	0.13
286	0.12
287	0.11
288	0.1
289	0.1
290	0.09
291	0.07
292	0.08
293	0.09
294	0.1
295	0.14
296	0.17
297	0.18
298	0.2
299	0.21
300	0.21
301	0.21
302	0.23
303	0.25
304	0.29
305	0.31
306	0.36
307	0.41
308	0.47
309	0.5
310	0.55
311	0.59
312	0.57
313	0.55
314	0.51
315	0.49
316	0.45
317	0.41
318	0.38
319	0.35
320	0.37
321	0.37
322	0.37
323	0.33
324	0.31
325	0.32
326	0.31
327	0.27
328	0.24
329	0.22
330	0.19
331	0.19
332	0.19
333	0.17
334	0.14
335	0.1
336	0.06
337	0.05
338	0.05
339	0.04
340	0.04
341	0.04
342	0.05
343	0.05
344	0.05
345	0.05
346	0.07
347	0.07
348	0.07
349	0.08
350	0.07
351	0.07
352	0.06
353	0.07
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.08
358	0.08
359	0.09
360	0.1
361	0.1
362	0.11
363	0.18
364	0.21
365	0.21
366	0.23
367	0.23
368	0.26
369	0.26
370	0.24
371	0.17
372	0.14
373	0.13
374	0.12
375	0.13
376	0.1
377	0.09
378	0.09
379	0.09
380	0.09
381	0.1
382	0.1
383	0.08
384	0.09
385	0.13
386	0.14
387	0.14
388	0.14
389	0.13
390	0.14
391	0.14
392	0.12
393	0.08
394	0.07
395	0.08
396	0.08
397	0.09
398	0.08
399	0.09
400	0.14
401	0.15
402	0.16
403	0.16
404	0.18
405	0.19
406	0.21
407	0.22
408	0.21
409	0.24
410	0.23
411	0.22
412	0.21
413	0.19
414	0.17
415	0.16
416	0.16
417	0.16
418	0.16
419	0.16
420	0.15
421	0.16
422	0.22
423	0.24
424	0.21
425	0.18
426	0.21
427	0.21
428	0.23
429	0.24
430	0.18
431	0.15
432	0.15
433	0.14
434	0.13
435	0.13
436	0.12
437	0.12
438	0.13
439	0.13
440	0.12
441	0.12
442	0.11
443	0.09
444	0.09
445	0.07
446	0.06
447	0.05
448	0.06
449	0.06
450	0.06
451	0.06
452	0.05
453	0.05
454	0.06
455	0.08
456	0.11
457	0.11
458	0.11
459	0.12
460	0.12
461	0.13
462	0.14
463	0.14
464	0.11
465	0.11
466	0.11
467	0.1
468	0.09
469	0.11
470	0.1
471	0.15
472	0.15
473	0.16
474	0.16
475	0.16
476	0.17
477	0.15
478	0.15
479	0.11
480	0.15
481	0.16
482	0.17
483	0.16
484	0.16
485	0.16
486	0.17
487	0.13
488	0.11
489	0.08
490	0.09
491	0.09
492	0.09
493	0.08
494	0.07
495	0.07
496	0.06
497	0.06
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.03
502	0.03
503	0.03
504	0.03
505	0.03
506	0.03
507	0.03
508	0.04
509	0.06
510	0.07
511	0.08
512	0.1
513	0.12
514	0.12
515	0.14
516	0.16
517	0.16
518	0.19
519	0.26
520	0.24
521	0.24
522	0.24
523	0.21
524	0.18
525	0.16
526	0.13
527	0.05
528	0.04
529	0.03
530	0.03
531	0.02
532	0.02
533	0.02
534	0.02
535	0.02
536	0.02
537	0.03
538	0.03
539	0.03
540	0.03
541	0.04
542	0.04
543	0.04
544	0.05
545	0.05
546	0.05
547	0.05
548	0.07
549	0.07
550	0.08
551	0.08
552	0.09
553	0.09
554	0.09
555	0.1
556	0.08
557	0.09
558	0.07
559	0.07
560	0.07
561	0.07
562	0.06
563	0.04
564	0.04
565	0.04
566	0.04
567	0.04
568	0.03
569	0.04
570	0.04
571	0.04
572	0.04
573	0.03
574	0.04
575	0.04
576	0.05
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.05
581	0.05
582	0.05
583	0.05
584	0.04
585	0.04
586	0.05
587	0.05
588	0.06
589	0.07
590	0.07
591	0.07
592	0.07
593	0.08
594	0.08
595	0.07
596	0.08
597	0.08
598	0.08
599	0.08
600	0.08
601	0.07
602	0.07
603	0.08
604	0.08
605	0.07
606	0.07
607	0.08
608	0.08
609	0.09
610	0.11
611	0.1
612	0.09
613	0.11
614	0.11
615	0.12
616	0.12
617	0.11
618	0.09
619	0.09
620	0.1
621	0.1
622	0.1
623	0.09
624	0.08
625	0.09
626	0.08
627	0.08
628	0.08
629	0.06
630	0.05
631	0.06
632	0.06
633	0.05
634	0.05
635	0.05
636	0.04
637	0.04
638	0.04
639	0.05
640	0.05
641	0.06
642	0.07
643	0.07
644	0.08
645	0.09
646	0.13
647	0.16
648	0.17
649	0.21
650	0.21
651	0.21
652	0.21
653	0.24
654	0.21
655	0.18
656	0.2
657	0.19
658	0.23
659	0.22
660	0.22
661	0.2
662	0.23
663	0.24
664	0.25
665	0.25
666	0.19
667	0.2
668	0.2
669	0.19
670	0.15
671	0.14
672	0.11
673	0.1
674	0.13
675	0.12
676	0.13
677	0.13
678	0.13
679	0.15
680	0.14
681	0.15
682	0.13
683	0.14
684	0.13
685	0.14
686	0.13
687	0.11
688	0.1
689	0.09
690	0.09
691	0.09
692	0.08
693	0.08
694	0.08
695	0.07
696	0.06
697	0.06
698	0.07
699	0.06
700	0.06
701	0.05
702	0.05
703	0.05
704	0.05
705	0.05
706	0.04
707	0.04
708	0.04
709	0.04
710	0.03
711	0.03
712	0.03
713	0.03
714	0.04
715	0.04
716	0.04
717	0.05
718	0.05
719	0.05
720	0.05
721	0.05
722	0.05
723	0.05
724	0.04
725	0.04
726	0.04
727	0.05
728	0.05
729	0.05
730	0.05
731	0.05
732	0.05
733	0.08
734	0.12
735	0.11
736	0.11
737	0.11
738	0.13
739	0.13
740	0.14
741	0.12
742	0.11
743	0.18
744	0.2
745	0.22
746	0.22
747	0.24
748	0.27
749	0.35
750	0.39
751	0.4
752	0.45
753	0.47
754	0.46
755	0.46
756	0.43
757	0.37
758	0.31
759	0.23
760	0.2
761	0.19
762	0.22
763	0.22
764	0.23
765	0.21
766	0.2
767	0.2
768	0.17
769	0.16
770	0.18
771	0.19
772	0.19
773	0.2
774	0.23
775	0.24
776	0.25
777	0.24
778	0.2
779	0.21
780	0.22
781	0.25
782	0.28
783	0.28
784	0.29
785	0.31
786	0.36
787	0.38
788	0.4
789	0.38
790	0.33
791	0.33
792	0.31
793	0.31
794	0.25
795	0.21
796	0.19
797	0.17
798	0.17
799	0.16
800	0.15
801	0.13
802	0.14
803	0.15
804	0.13
805	0.12
806	0.12
807	0.12
808	0.16
809	0.17
810	0.24
811	0.24
812	0.26
813	0.26
814	0.26
815	0.27
816	0.26
817	0.24
818	0.18
819	0.17
820	0.19
821	0.18
822	0.16
823	0.17
824	0.18
825	0.17
826	0.17
827	0.18
828	0.15
829	0.15
830	0.16
831	0.14
832	0.11
833	0.12
834	0.16
835	0.14
836	0.15
837	0.15
838	0.16
839	0.15
840	0.16
841	0.15
842	0.12
843	0.2
844	0.24
845	0.28
846	0.32
847	0.34
848	0.36
849	0.41
850	0.39
851	0.31
852	0.28
853	0.24
854	0.2
855	0.19
856	0.16
857	0.11
858	0.11
859	0.1
860	0.1
861	0.1
862	0.09
863	0.07
864	0.07
865	0.08
866	0.09
867	0.11
868	0.11
869	0.14
870	0.15
871	0.16
872	0.23
873	0.29
874	0.36
875	0.41
876	0.46
877	0.52
878	0.6
879	0.66
880	0.62
881	0.59
882	0.6
883	0.62
884	0.59
885	0.6
886	0.52
887	0.46
888	0.47
889	0.48
890	0.4
891	0.36
892	0.34
893	0.28
894	0.32
895	0.35
896	0.32
897	0.33
898	0.31
899	0.29
900	0.26
901	0.24
902	0.19
903	0.21
904	0.23
905	0.23
906	0.23
907	0.28
908	0.32
909	0.34
910	0.36
911	0.33
912	0.32
913	0.34
914	0.36
915	0.35
916	0.32
917	0.31
918	0.28
919	0.24
920	0.26
921	0.22
922	0.21
923	0.17
924	0.16
925	0.15
926	0.14
927	0.14
928	0.12
929	0.09
930	0.08
931	0.07
932	0.07
933	0.08
934	0.08
935	0.08
936	0.08
937	0.09
938	0.12
939	0.14
940	0.14
941	0.18
942	0.23
943	0.24
944	0.25
945	0.29
946	0.28
947	0.29
948	0.29
949	0.27
950	0.22
951	0.25
952	0.29
953	0.28
954	0.3
955	0.34
956	0.42
957	0.43
958	0.44
959	0.45
960	0.46
961	0.45
962	0.44
963	0.46
964	0.4
965	0.38
966	0.37
967	0.32
968	0.24
969	0.21
970	0.17
971	0.09
972	0.06
973	0.07
974	0.09
975	0.1
976	0.12
977	0.13
978	0.14
979	0.19
980	0.23
981	0.24
982	0.24
983	0.24
984	0.22
985	0.21
986	0.21
987	0.16
988	0.12
989	0.1
990	0.1
991	0.14
992	0.14
993	0.17
994	0.2
995	0.21
996	0.24
997	0.32
998	0.38
999	0.41
1000	0.44
1001	0.44
1002	0.42
1003	0.41

U5H995

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer