Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H477

Protein Details
Accession U5H477    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MPPKRGGARGRPRGRNCGRGRELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
4-15KRGGARGRPRGR
Subcellular Location(s) nucl 10, cyto_nucl 10, mito 9, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019188  SNAPC1  
Pfam View protein in Pfam  
PF09808  SNAPC1  
Amino Acid Sequences MPPKRGGARGRPRGRNCGRGRELGPSTREVSESSEEQAELPVEATPRRKQTAAAAAAAAPTGHEARSRAQRAASTLEDVPSVVAATPTIPLQSTPATTFVLQHHLYFLSADWISSLRLDVDELLDSFVEAYRGLTTGDEQSPFQVFKSCWIAKGWSRIHLFGIMEGRARQTWGESILRGFLERLVPDSTSEPLIQVAAFFAIYTFFSTQADTQEQVYIKIDPPTLEHLLTLPHTLASALDSRTNSDGPSSSSILQPSLDLHRVLLSLLEAQAFFIVPSETFLHPRQLPTVHLVPHNKQAQKQEQKRKDDATITMAIRDELRVAASHEEESIEQTASTVADILAERKAKYTTKKTEALGPWPVEKGAEDDPTSKDMVDRILARAKKATWENLTSNLGKGIDGMGVEGDNLLNLLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.84
2 0.84
3 0.8
4 0.8
5 0.76
6 0.73
7 0.69
8 0.67
9 0.65
10 0.61
11 0.57
12 0.5
13 0.48
14 0.42
15 0.4
16 0.32
17 0.31
18 0.29
19 0.27
20 0.26
21 0.24
22 0.23
23 0.22
24 0.23
25 0.18
26 0.14
27 0.13
28 0.12
29 0.12
30 0.16
31 0.21
32 0.26
33 0.32
34 0.35
35 0.35
36 0.35
37 0.42
38 0.48
39 0.46
40 0.41
41 0.35
42 0.32
43 0.31
44 0.29
45 0.21
46 0.11
47 0.09
48 0.09
49 0.08
50 0.1
51 0.12
52 0.18
53 0.28
54 0.32
55 0.32
56 0.33
57 0.35
58 0.36
59 0.4
60 0.35
61 0.29
62 0.27
63 0.25
64 0.23
65 0.2
66 0.17
67 0.12
68 0.11
69 0.07
70 0.06
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.06
75 0.07
76 0.06
77 0.07
78 0.09
79 0.11
80 0.12
81 0.13
82 0.15
83 0.16
84 0.16
85 0.18
86 0.18
87 0.23
88 0.22
89 0.2
90 0.2
91 0.19
92 0.18
93 0.16
94 0.14
95 0.12
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.1
100 0.1
101 0.1
102 0.1
103 0.06
104 0.06
105 0.07
106 0.07
107 0.07
108 0.08
109 0.08
110 0.08
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.07
115 0.06
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.06
121 0.06
122 0.07
123 0.11
124 0.12
125 0.13
126 0.13
127 0.14
128 0.15
129 0.15
130 0.14
131 0.15
132 0.13
133 0.16
134 0.25
135 0.24
136 0.24
137 0.25
138 0.28
139 0.27
140 0.37
141 0.35
142 0.33
143 0.34
144 0.34
145 0.33
146 0.32
147 0.28
148 0.21
149 0.21
150 0.15
151 0.14
152 0.14
153 0.14
154 0.12
155 0.12
156 0.1
157 0.09
158 0.09
159 0.12
160 0.12
161 0.12
162 0.12
163 0.13
164 0.13
165 0.12
166 0.11
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.11
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.06
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.04
190 0.05
191 0.05
192 0.06
193 0.06
194 0.07
195 0.08
196 0.09
197 0.11
198 0.1
199 0.1
200 0.13
201 0.13
202 0.13
203 0.13
204 0.12
205 0.12
206 0.14
207 0.14
208 0.11
209 0.12
210 0.16
211 0.17
212 0.16
213 0.14
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.08
219 0.06
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.06
224 0.08
225 0.08
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.14
230 0.14
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.14
236 0.15
237 0.14
238 0.15
239 0.16
240 0.15
241 0.15
242 0.13
243 0.11
244 0.13
245 0.14
246 0.13
247 0.12
248 0.12
249 0.12
250 0.12
251 0.1
252 0.07
253 0.06
254 0.06
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.05
261 0.05
262 0.05
263 0.04
264 0.07
265 0.1
266 0.11
267 0.14
268 0.16
269 0.21
270 0.22
271 0.23
272 0.24
273 0.22
274 0.23
275 0.25
276 0.28
277 0.25
278 0.3
279 0.34
280 0.33
281 0.4
282 0.46
283 0.43
284 0.43
285 0.49
286 0.54
287 0.6
288 0.68
289 0.71
290 0.73
291 0.78
292 0.79
293 0.75
294 0.69
295 0.62
296 0.55
297 0.49
298 0.46
299 0.38
300 0.34
301 0.3
302 0.26
303 0.22
304 0.19
305 0.15
306 0.09
307 0.09
308 0.08
309 0.1
310 0.12
311 0.13
312 0.13
313 0.12
314 0.13
315 0.12
316 0.14
317 0.14
318 0.12
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.09
323 0.09
324 0.07
325 0.05
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.13
330 0.15
331 0.15
332 0.17
333 0.21
334 0.25
335 0.34
336 0.43
337 0.48
338 0.53
339 0.58
340 0.58
341 0.63
342 0.62
343 0.6
344 0.57
345 0.5
346 0.45
347 0.41
348 0.39
349 0.3
350 0.26
351 0.24
352 0.2
353 0.22
354 0.21
355 0.22
356 0.25
357 0.26
358 0.26
359 0.22
360 0.19
361 0.17
362 0.17
363 0.2
364 0.19
365 0.21
366 0.29
367 0.31
368 0.33
369 0.36
370 0.35
371 0.38
372 0.42
373 0.45
374 0.44
375 0.48
376 0.49
377 0.5
378 0.54
379 0.47
380 0.43
381 0.38
382 0.32
383 0.25
384 0.22
385 0.17
386 0.13
387 0.12
388 0.11
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.08
393 0.07
394 0.05