Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5H6V0

Protein Details
Accession U5H6V0    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-34IIAPAKPKNARSKRAQQAREPQMIEHydrophilic
301-324ALKKAEPKSKTSKPKNKNIDIDEMHydrophilic
341-360LQARKFKGLKVEKKGKRAADBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
303-315KKAEPKSKTSKPK
345-357KFKGLKVEKKGKR
Subcellular Location(s) mito 25, mito_nucl 13.833, cyto_mito 13.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:1902626  P:assembly of large subunit precursor of preribosome  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MSATTSAIPIIAPAKPKNARSKRAQQAREPQMIEKGAKTAMIVRGSSISEKVKVALSELNQLKKPHSISFSKPNQIRPFEDSSSLSFWSTKNDASLFLVGTHTKKRPHVLIWVRCFANEVMEMLEVGIEEVMPMSAFKGIKSTPGSTPLFHFASTSSHANLWESHPTFTQYKSLMLDFFRGVEMDGVALKGLERVISITIGHNTLDANTESLQDALNRESTQNKGQAALSSLLTSSSQAKSGTHDSEEDPTLPLIHFRTYTVKFLRSGVSTPLVALEPHGPHFSFRLRRSQLPSSEMWKLALKKAEPKSKTSKPKNKNIDIDEMGDKVGRVYVDKQDMGTLQARKFKGLKVEKKGKRAADNEGEAHEEEPEEKSSNKRSRRSEAQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.36
3 0.43
4 0.53
5 0.6
6 0.66
7 0.7
8 0.78
9 0.8
10 0.84
11 0.84
12 0.83
13 0.84
14 0.84
15 0.83
16 0.74
17 0.66
18 0.62
19 0.59
20 0.51
21 0.41
22 0.35
23 0.27
24 0.25
25 0.23
26 0.22
27 0.23
28 0.24
29 0.23
30 0.22
31 0.23
32 0.25
33 0.26
34 0.24
35 0.21
36 0.21
37 0.21
38 0.21
39 0.22
40 0.21
41 0.21
42 0.22
43 0.21
44 0.27
45 0.32
46 0.35
47 0.37
48 0.38
49 0.38
50 0.39
51 0.41
52 0.37
53 0.38
54 0.38
55 0.41
56 0.5
57 0.56
58 0.59
59 0.6
60 0.63
61 0.65
62 0.65
63 0.62
64 0.58
65 0.56
66 0.49
67 0.49
68 0.41
69 0.36
70 0.34
71 0.31
72 0.26
73 0.21
74 0.19
75 0.21
76 0.21
77 0.19
78 0.19
79 0.18
80 0.19
81 0.2
82 0.21
83 0.15
84 0.14
85 0.15
86 0.14
87 0.17
88 0.21
89 0.24
90 0.27
91 0.3
92 0.34
93 0.37
94 0.38
95 0.45
96 0.5
97 0.54
98 0.56
99 0.58
100 0.53
101 0.49
102 0.48
103 0.38
104 0.3
105 0.21
106 0.16
107 0.11
108 0.11
109 0.11
110 0.08
111 0.08
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.03
116 0.02
117 0.03
118 0.03
119 0.03
120 0.03
121 0.03
122 0.06
123 0.07
124 0.07
125 0.1
126 0.1
127 0.15
128 0.18
129 0.2
130 0.18
131 0.25
132 0.26
133 0.24
134 0.26
135 0.26
136 0.24
137 0.21
138 0.2
139 0.14
140 0.16
141 0.18
142 0.18
143 0.14
144 0.14
145 0.14
146 0.15
147 0.15
148 0.15
149 0.19
150 0.18
151 0.18
152 0.18
153 0.21
154 0.21
155 0.21
156 0.23
157 0.16
158 0.17
159 0.17
160 0.17
161 0.16
162 0.15
163 0.16
164 0.12
165 0.12
166 0.1
167 0.09
168 0.08
169 0.07
170 0.06
171 0.05
172 0.05
173 0.04
174 0.04
175 0.03
176 0.03
177 0.03
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.05
185 0.06
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.08
193 0.07
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.08
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.09
205 0.1
206 0.12
207 0.14
208 0.18
209 0.2
210 0.19
211 0.19
212 0.19
213 0.19
214 0.19
215 0.18
216 0.14
217 0.11
218 0.11
219 0.1
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.09
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.14
228 0.19
229 0.2
230 0.18
231 0.19
232 0.18
233 0.21
234 0.22
235 0.19
236 0.15
237 0.13
238 0.13
239 0.11
240 0.12
241 0.1
242 0.11
243 0.1
244 0.11
245 0.18
246 0.19
247 0.26
248 0.27
249 0.28
250 0.28
251 0.29
252 0.3
253 0.25
254 0.25
255 0.22
256 0.21
257 0.19
258 0.17
259 0.17
260 0.14
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.12
265 0.14
266 0.16
267 0.15
268 0.15
269 0.18
270 0.25
271 0.28
272 0.3
273 0.38
274 0.41
275 0.47
276 0.53
277 0.59
278 0.55
279 0.51
280 0.52
281 0.46
282 0.46
283 0.41
284 0.36
285 0.33
286 0.31
287 0.32
288 0.34
289 0.32
290 0.37
291 0.45
292 0.52
293 0.5
294 0.54
295 0.59
296 0.63
297 0.72
298 0.74
299 0.76
300 0.76
301 0.84
302 0.88
303 0.88
304 0.87
305 0.8
306 0.78
307 0.69
308 0.64
309 0.56
310 0.46
311 0.37
312 0.28
313 0.23
314 0.15
315 0.14
316 0.1
317 0.11
318 0.14
319 0.2
320 0.26
321 0.26
322 0.26
323 0.27
324 0.27
325 0.28
326 0.31
327 0.3
328 0.28
329 0.35
330 0.35
331 0.38
332 0.4
333 0.4
334 0.44
335 0.49
336 0.55
337 0.58
338 0.69
339 0.71
340 0.78
341 0.83
342 0.79
343 0.77
344 0.72
345 0.7
346 0.68
347 0.66
348 0.6
349 0.54
350 0.49
351 0.41
352 0.37
353 0.28
354 0.2
355 0.16
356 0.16
357 0.17
358 0.16
359 0.17
360 0.23
361 0.33
362 0.42
363 0.5
364 0.57
365 0.62
366 0.69