FuNGI

U5H1A3

Protein Details

Accession

U5H1A3

Localization Confidence

High

Confidence Score

21.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
81-100	SEFVRPLRLNRKDPRTVRRL	Hydrophilic
165-186	APQQQRQKKHGGRFEKKIKRVF	Basic
692-712	LNYFRRQLKGNEKNKERIKGA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
172-184	KKHGGRFEKKIKR

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MFHSSQPLIKSEPSPSASGSLTDATSLKPAPSPTPPVSTPQGSYTDFVLRSSAPGSQTGWKYNVMKFAALANKSVDPLDESEFVRPLRLNRKDPRTVRRLTDQEREKIRNKSMGLLDEDGNLIDQSTVDGVKKEGEAAAAAAAAEPAKEAINPDLVGTGVTGALAPQQQRQKKHGGRFEKKIKRVFVSSEESRRLRREEWQPWVLEDDEGNERWIGRLEGGASERSMAIEQEKKRQELENKGQATMAGWRPASEGSATGGGGSSYVAFVFGPDGDEFQVVPIHRWYKFSQGPRYVTLGNDEAEAEYERQQKSHEAERWMMHKRNPNHASSSTGQGSRPPSGAATPHLPLGDDGGLPRLPTDIKPRIKRETSAEPSTIRSRLLDKSELSGRRAGSEARSAAAGRPKLRSVDTGSRAENDDDELYGRKRGDEGRGQDQDDDEFDYDEEFQDDEEGVAKIDDLADEQETKELEERIRKEMRAVERAASEPEEDDDDEEHLTATGKDLKRLVRKQDQDGIYGSDDDDDLSSSDSSVAEDDDSKSVTSASGDPSTPRPASQQQQQNKPRPSTDSIHRTHSSSSSRPHSTQTSRHPSRAASPSSGSALLAKRATSPTRSNPGSRATSPNPSGNGANGKRKRDDHDGFSKRRALSPSAGTAAVGGWDAPSDALIEDRHLIDFFKTKASEPNKSTTKEVLNYFRRQLKGNEKNKERIKGALHNVASMQDKFLVLKAGM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.35
2	0.33
3	0.33
4	0.3
5	0.27
6	0.26
7	0.2
8	0.17
9	0.17
10	0.17
11	0.14
12	0.17
13	0.17
14	0.16
15	0.17
16	0.2
17	0.22
18	0.28
19	0.35
20	0.35
21	0.41
22	0.41
23	0.43
24	0.47
25	0.46
26	0.42
27	0.38
28	0.39
29	0.34
30	0.34
31	0.32
32	0.32
33	0.29
34	0.27
35	0.25
36	0.2
37	0.2
38	0.2
39	0.21
40	0.16
41	0.18
42	0.2
43	0.26
44	0.29
45	0.32
46	0.33
47	0.36
48	0.38
49	0.39
50	0.44
51	0.38
52	0.35
53	0.31
54	0.35
55	0.36
56	0.33
57	0.32
58	0.27
59	0.27
60	0.27
61	0.27
62	0.21
63	0.16
64	0.17
65	0.19
66	0.2
67	0.2
68	0.21
69	0.24
70	0.23
71	0.24
72	0.24
73	0.27
74	0.34
75	0.42
76	0.49
77	0.55
78	0.65
79	0.72
80	0.78
81	0.81
82	0.79
83	0.76
84	0.73
85	0.73
86	0.74
87	0.7
88	0.72
89	0.7
90	0.7
91	0.72
92	0.73
93	0.7
94	0.68
95	0.67
96	0.64
97	0.58
98	0.56
99	0.52
100	0.49
101	0.46
102	0.41
103	0.36
104	0.3
105	0.29
106	0.22
107	0.18
108	0.13
109	0.09
110	0.07
111	0.06
112	0.05
113	0.06
114	0.07
115	0.08
116	0.08
117	0.09
118	0.11
119	0.11
120	0.11
121	0.1
122	0.1
123	0.09
124	0.09
125	0.08
126	0.07
127	0.07
128	0.06
129	0.05
130	0.05
131	0.04
132	0.04
133	0.05
134	0.05
135	0.05
136	0.07
137	0.08
138	0.11
139	0.11
140	0.11
141	0.11
142	0.11
143	0.1
144	0.09
145	0.08
146	0.05
147	0.05
148	0.04
149	0.04
150	0.06
151	0.08
152	0.1
153	0.15
154	0.24
155	0.29
156	0.35
157	0.39
158	0.48
159	0.54
160	0.62
161	0.65
162	0.68
163	0.71
164	0.76
165	0.83
166	0.82
167	0.82
168	0.8
169	0.76
170	0.69
171	0.64
172	0.58
173	0.53
174	0.51
175	0.5
176	0.49
177	0.51
178	0.49
179	0.5
180	0.49
181	0.47
182	0.41
183	0.44
184	0.47
185	0.48
186	0.54
187	0.55
188	0.52
189	0.48
190	0.49
191	0.41
192	0.31
193	0.23
194	0.18
195	0.16
196	0.15
197	0.15
198	0.13
199	0.12
200	0.12
201	0.13
202	0.11
203	0.08
204	0.08
205	0.08
206	0.1
207	0.12
208	0.12
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.1
213	0.1
214	0.08
215	0.11
216	0.17
217	0.19
218	0.28
219	0.32
220	0.32
221	0.34
222	0.4
223	0.43
224	0.46
225	0.53
226	0.53
227	0.51
228	0.5
229	0.48
230	0.41
231	0.35
232	0.3
233	0.24
234	0.18
235	0.17
236	0.16
237	0.17
238	0.18
239	0.17
240	0.12
241	0.1
242	0.08
243	0.09
244	0.09
245	0.08
246	0.07
247	0.06
248	0.06
249	0.05
250	0.04
251	0.03
252	0.03
253	0.04
254	0.03
255	0.04
256	0.04
257	0.04
258	0.06
259	0.06
260	0.07
261	0.07
262	0.07
263	0.07
264	0.07
265	0.1
266	0.08
267	0.09
268	0.12
269	0.15
270	0.16
271	0.19
272	0.2
273	0.26
274	0.32
275	0.38
276	0.43
277	0.47
278	0.49
279	0.48
280	0.49
281	0.42
282	0.36
283	0.32
284	0.24
285	0.18
286	0.15
287	0.13
288	0.1
289	0.1
290	0.11
291	0.09
292	0.11
293	0.17
294	0.16
295	0.17
296	0.18
297	0.2
298	0.23
299	0.3
300	0.31
301	0.29
302	0.32
303	0.34
304	0.38
305	0.41
306	0.41
307	0.38
308	0.41
309	0.42
310	0.49
311	0.5
312	0.47
313	0.45
314	0.43
315	0.43
316	0.37
317	0.37
318	0.29
319	0.27
320	0.24
321	0.23
322	0.25
323	0.21
324	0.2
325	0.16
326	0.14
327	0.14
328	0.15
329	0.13
330	0.13
331	0.12
332	0.13
333	0.12
334	0.12
335	0.11
336	0.11
337	0.1
338	0.07
339	0.07
340	0.08
341	0.08
342	0.07
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.08
347	0.16
348	0.23
349	0.3
350	0.37
351	0.42
352	0.48
353	0.49
354	0.5
355	0.48
356	0.49
357	0.48
358	0.45
359	0.42
360	0.36
361	0.37
362	0.38
363	0.33
364	0.23
365	0.18
366	0.18
367	0.19
368	0.21
369	0.21
370	0.19
371	0.21
372	0.27
373	0.28
374	0.27
375	0.27
376	0.24
377	0.22
378	0.22
379	0.2
380	0.15
381	0.17
382	0.15
383	0.12
384	0.13
385	0.12
386	0.14
387	0.18
388	0.19
389	0.18
390	0.19
391	0.2
392	0.22
393	0.22
394	0.23
395	0.24
396	0.29
397	0.32
398	0.33
399	0.32
400	0.32
401	0.32
402	0.3
403	0.24
404	0.17
405	0.13
406	0.1
407	0.1
408	0.11
409	0.1
410	0.13
411	0.12
412	0.11
413	0.13
414	0.15
415	0.2
416	0.24
417	0.28
418	0.34
419	0.37
420	0.38
421	0.36
422	0.34
423	0.29
424	0.23
425	0.2
426	0.12
427	0.09
428	0.08
429	0.08
430	0.08
431	0.08
432	0.08
433	0.06
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.06
439	0.06
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.05
444	0.05
445	0.04
446	0.04
447	0.05
448	0.06
449	0.06
450	0.07
451	0.08
452	0.08
453	0.09
454	0.1
455	0.11
456	0.13
457	0.19
458	0.21
459	0.27
460	0.31
461	0.3
462	0.31
463	0.36
464	0.39
465	0.38
466	0.37
467	0.33
468	0.31
469	0.32
470	0.3
471	0.25
472	0.19
473	0.14
474	0.13
475	0.13
476	0.11
477	0.11
478	0.1
479	0.1
480	0.09
481	0.09
482	0.08
483	0.07
484	0.07
485	0.06
486	0.07
487	0.14
488	0.15
489	0.17
490	0.21
491	0.27
492	0.36
493	0.42
494	0.49
495	0.51
496	0.55
497	0.59
498	0.64
499	0.59
500	0.52
501	0.47
502	0.41
503	0.32
504	0.28
505	0.22
506	0.14
507	0.12
508	0.1
509	0.09
510	0.06
511	0.06
512	0.07
513	0.07
514	0.07
515	0.07
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.07
520	0.06
521	0.08
522	0.09
523	0.09
524	0.1
525	0.1
526	0.1
527	0.09
528	0.09
529	0.09
530	0.1
531	0.12
532	0.14
533	0.14
534	0.16
535	0.19
536	0.24
537	0.23
538	0.22
539	0.24
540	0.29
541	0.35
542	0.42
543	0.48
544	0.51
545	0.61
546	0.7
547	0.74
548	0.75
549	0.73
550	0.68
551	0.64
552	0.62
553	0.57
554	0.57
555	0.57
556	0.52
557	0.56
558	0.54
559	0.5
560	0.46
561	0.46
562	0.43
563	0.38
564	0.42
565	0.43
566	0.46
567	0.46
568	0.48
569	0.5
570	0.5
571	0.54
572	0.57
573	0.61
574	0.6
575	0.62
576	0.6
577	0.53
578	0.55
579	0.55
580	0.48
581	0.41
582	0.38
583	0.37
584	0.37
585	0.35
586	0.27
587	0.24
588	0.21
589	0.22
590	0.21
591	0.19
592	0.2
593	0.24
594	0.27
595	0.29
596	0.34
597	0.38
598	0.46
599	0.49
600	0.49
601	0.48
602	0.52
603	0.53
604	0.5
605	0.5
606	0.45
607	0.5
608	0.51
609	0.52
610	0.47
611	0.43
612	0.4
613	0.36
614	0.41
615	0.38
616	0.45
617	0.47
618	0.5
619	0.54
620	0.58
621	0.61
622	0.61
623	0.62
624	0.6
625	0.64
626	0.68
627	0.67
628	0.69
629	0.69
630	0.6
631	0.59
632	0.55
633	0.49
634	0.45
635	0.45
636	0.43
637	0.39
638	0.37
639	0.32
640	0.28
641	0.23
642	0.18
643	0.13
644	0.07
645	0.05
646	0.05
647	0.05
648	0.05
649	0.05
650	0.05
651	0.05
652	0.07
653	0.08
654	0.1
655	0.11
656	0.12
657	0.13
658	0.13
659	0.14
660	0.15
661	0.2
662	0.19
663	0.23
664	0.24
665	0.24
666	0.33
667	0.4
668	0.46
669	0.45
670	0.54
671	0.54
672	0.56
673	0.59
674	0.56
675	0.56
676	0.53
677	0.55
678	0.56
679	0.57
680	0.6
681	0.63
682	0.64
683	0.6
684	0.58
685	0.6
686	0.61
687	0.64
688	0.67
689	0.7
690	0.7
691	0.78
692	0.82
693	0.82
694	0.73
695	0.69
696	0.67
697	0.66
698	0.66
699	0.65
700	0.58
701	0.51
702	0.49
703	0.46
704	0.43
705	0.34
706	0.28
707	0.2
708	0.21
709	0.2
710	0.2

U5H1A3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer