Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5GY38

Protein Details
Accession U5GY38    Localization Confidence High Confidence Score 17.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
217-240QERERERRSGKRGPHRKEVRMSKTBasic
545-571VDRNDKEREREVRRKRRQTKGRGVTLPBasic
736-757LCGQCGKFFHRYRRNRPCTYTTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
214-237KTEQERERERRSGKRGPHRKEVRM
552-566REREVRRKRRQTKGR
Subcellular Location(s) nucl 9.5, cyto_nucl 8.5, cyto 6.5, mito 6, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006939  SNF5  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0070603  C:SWI/SNF superfamily-type complex  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006338  P:chromatin remodeling  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04855  SNF5  
Amino Acid Sequences MNGHGPAVAPPPSAMDGSHQPRGGTRPSLAPLTTPGPSGSPSYHPAHPMAGPSSSNGLASGFETAVPGSTLLSAVPSASAMSLSATTMAQYSVAARQQARLAGNVPSPLPRTEPDDGGPPFKVPMHALFTRITVLEPGVEFPAIADERDQQRVKQWMQRDLDYERTNLYKKRARTLEAQSLFDEATVGQDWLGPRLANEGSGAKSTPSNRLRIKTEQERERERRSGKRGPHRKEVRMSKTQLREIAKSKECLVPIRLEIEHEVYRLRDTFTWNLKETMVTPEIFASHLCEDLRLPYVHFYKEVVAQIKRAIEDAQMTENYDAYLADDLGLTRELNRRWFEEGQHKLIDEGELEARPDPDEPPEAGHSALDPMDEIIEMDYRQTIDHLDTKPSSDFVLGLRDGLGPAQEVSGVVKEKSDVPAHSDDYANEELRVTIQLDITIDSVQLVDRFEWDLSEAQNSPEQFAETFATELGLNGDFQTAICHSIREQLDVFTRSLCILGHTQGLTVADEELRRQFLTPISEPIRFESAADYTPLLNQLTPDEVDRNDKEREREVRRKRRQTKGRGVTLPDRDFVRTHRTIVPKSTGVPIISYQDARGETVYPMGEIGMPYPIVAPFSIEKPPDLEIHAASPLKLIQPKAQLGIDHTVDGKPNKNVLKRSLGDGLGHSTSGDGSGQTLGDAAKRPGGQGRGRRTNLEALGLHPHIIEGAWFCANCGVPDSIAVGRRKGPTGANSLCGQCGKFFHRYRRNRPCTYTTDLETHRHAKAALDTAAAAAKLAKNQAAAQARAAAAAAAAAAAAAAAAAAVAAIGDDATMASARLNMLSAASDRGGTATRDNSSDESGHDDDDSDDGSSVPGRSARPTPSNRSPRGPSPFVREGTNDSDLRSASDSPRRPTPSDVRTMSIGGKGIPPLPMHAPVGSPANLPRPAQSADVGPPIPPTWMHTAAAELRAKQIDDRFDIIPRPRPVDPTAVQEWRIRCLDCPGKLYNVGPGETLNNFSVHFKNRVHRGNVEARLKGLPPPPLG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.18
3 0.26
4 0.31
5 0.37
6 0.36
7 0.34
8 0.37
9 0.42
10 0.43
11 0.38
12 0.34
13 0.34
14 0.36
15 0.4
16 0.37
17 0.33
18 0.32
19 0.31
20 0.3
21 0.25
22 0.22
23 0.19
24 0.21
25 0.22
26 0.21
27 0.22
28 0.26
29 0.3
30 0.32
31 0.33
32 0.33
33 0.33
34 0.32
35 0.31
36 0.29
37 0.27
38 0.24
39 0.23
40 0.25
41 0.22
42 0.21
43 0.17
44 0.15
45 0.13
46 0.13
47 0.14
48 0.1
49 0.09
50 0.1
51 0.09
52 0.09
53 0.09
54 0.09
55 0.07
56 0.07
57 0.07
58 0.06
59 0.07
60 0.07
61 0.06
62 0.07
63 0.06
64 0.06
65 0.06
66 0.06
67 0.05
68 0.07
69 0.07
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.08
75 0.08
76 0.07
77 0.07
78 0.09
79 0.12
80 0.15
81 0.19
82 0.19
83 0.22
84 0.24
85 0.29
86 0.28
87 0.26
88 0.25
89 0.25
90 0.27
91 0.26
92 0.24
93 0.23
94 0.25
95 0.24
96 0.25
97 0.23
98 0.28
99 0.29
100 0.31
101 0.29
102 0.34
103 0.35
104 0.35
105 0.34
106 0.28
107 0.26
108 0.25
109 0.25
110 0.19
111 0.22
112 0.25
113 0.25
114 0.27
115 0.26
116 0.26
117 0.26
118 0.24
119 0.2
120 0.14
121 0.13
122 0.12
123 0.12
124 0.12
125 0.12
126 0.11
127 0.1
128 0.09
129 0.14
130 0.13
131 0.13
132 0.13
133 0.18
134 0.22
135 0.3
136 0.31
137 0.27
138 0.34
139 0.42
140 0.45
141 0.46
142 0.49
143 0.5
144 0.53
145 0.55
146 0.53
147 0.49
148 0.53
149 0.48
150 0.42
151 0.36
152 0.36
153 0.38
154 0.38
155 0.42
156 0.4
157 0.42
158 0.51
159 0.54
160 0.53
161 0.56
162 0.61
163 0.63
164 0.6
165 0.58
166 0.49
167 0.45
168 0.4
169 0.32
170 0.23
171 0.12
172 0.11
173 0.09
174 0.09
175 0.07
176 0.09
177 0.1
178 0.11
179 0.13
180 0.1
181 0.1
182 0.14
183 0.14
184 0.12
185 0.14
186 0.14
187 0.14
188 0.15
189 0.16
190 0.13
191 0.17
192 0.18
193 0.27
194 0.29
195 0.35
196 0.4
197 0.45
198 0.5
199 0.53
200 0.61
201 0.61
202 0.67
203 0.67
204 0.69
205 0.74
206 0.75
207 0.75
208 0.74
209 0.7
210 0.7
211 0.71
212 0.71
213 0.71
214 0.75
215 0.78
216 0.77
217 0.81
218 0.81
219 0.8
220 0.82
221 0.82
222 0.79
223 0.78
224 0.77
225 0.74
226 0.72
227 0.69
228 0.66
229 0.59
230 0.57
231 0.53
232 0.57
233 0.52
234 0.47
235 0.45
236 0.42
237 0.4
238 0.38
239 0.35
240 0.29
241 0.26
242 0.28
243 0.25
244 0.23
245 0.23
246 0.23
247 0.22
248 0.19
249 0.19
250 0.15
251 0.17
252 0.17
253 0.17
254 0.14
255 0.18
256 0.25
257 0.31
258 0.36
259 0.35
260 0.36
261 0.34
262 0.33
263 0.29
264 0.28
265 0.23
266 0.18
267 0.16
268 0.15
269 0.16
270 0.15
271 0.14
272 0.11
273 0.1
274 0.12
275 0.11
276 0.11
277 0.11
278 0.13
279 0.16
280 0.13
281 0.13
282 0.17
283 0.2
284 0.2
285 0.21
286 0.2
287 0.18
288 0.22
289 0.25
290 0.25
291 0.23
292 0.23
293 0.25
294 0.26
295 0.24
296 0.21
297 0.18
298 0.14
299 0.15
300 0.15
301 0.15
302 0.14
303 0.15
304 0.14
305 0.14
306 0.12
307 0.1
308 0.09
309 0.07
310 0.07
311 0.05
312 0.05
313 0.05
314 0.05
315 0.06
316 0.07
317 0.06
318 0.08
319 0.13
320 0.15
321 0.2
322 0.22
323 0.24
324 0.29
325 0.31
326 0.33
327 0.38
328 0.41
329 0.4
330 0.39
331 0.36
332 0.31
333 0.3
334 0.25
335 0.16
336 0.12
337 0.1
338 0.09
339 0.1
340 0.1
341 0.1
342 0.1
343 0.1
344 0.09
345 0.1
346 0.12
347 0.12
348 0.14
349 0.15
350 0.15
351 0.14
352 0.14
353 0.11
354 0.1
355 0.1
356 0.07
357 0.06
358 0.05
359 0.05
360 0.05
361 0.05
362 0.04
363 0.05
364 0.05
365 0.05
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.08
372 0.14
373 0.15
374 0.18
375 0.18
376 0.2
377 0.2
378 0.2
379 0.18
380 0.12
381 0.12
382 0.09
383 0.13
384 0.11
385 0.1
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.09
390 0.09
391 0.05
392 0.05
393 0.05
394 0.04
395 0.04
396 0.05
397 0.07
398 0.08
399 0.07
400 0.07
401 0.08
402 0.09
403 0.12
404 0.14
405 0.12
406 0.16
407 0.19
408 0.2
409 0.21
410 0.2
411 0.17
412 0.2
413 0.22
414 0.18
415 0.14
416 0.13
417 0.12
418 0.12
419 0.12
420 0.08
421 0.07
422 0.07
423 0.07
424 0.07
425 0.08
426 0.08
427 0.07
428 0.06
429 0.05
430 0.06
431 0.05
432 0.06
433 0.06
434 0.05
435 0.06
436 0.07
437 0.07
438 0.07
439 0.08
440 0.08
441 0.08
442 0.1
443 0.1
444 0.1
445 0.12
446 0.12
447 0.11
448 0.11
449 0.11
450 0.09
451 0.1
452 0.1
453 0.08
454 0.08
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.07
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.05
463 0.05
464 0.05
465 0.05
466 0.06
467 0.05
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.14
473 0.15
474 0.16
475 0.16
476 0.15
477 0.18
478 0.2
479 0.2
480 0.13
481 0.13
482 0.11
483 0.11
484 0.1
485 0.08
486 0.07
487 0.08
488 0.09
489 0.09
490 0.09
491 0.09
492 0.09
493 0.08
494 0.07
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.07
499 0.07
500 0.08
501 0.07
502 0.08
503 0.08
504 0.1
505 0.14
506 0.14
507 0.19
508 0.21
509 0.23
510 0.23
511 0.23
512 0.23
513 0.19
514 0.18
515 0.14
516 0.12
517 0.11
518 0.11
519 0.1
520 0.08
521 0.08
522 0.09
523 0.08
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.08
529 0.08
530 0.08
531 0.09
532 0.13
533 0.14
534 0.17
535 0.2
536 0.22
537 0.23
538 0.28
539 0.36
540 0.41
541 0.5
542 0.57
543 0.65
544 0.73
545 0.82
546 0.85
547 0.88
548 0.89
549 0.89
550 0.89
551 0.87
552 0.85
553 0.77
554 0.72
555 0.68
556 0.66
557 0.57
558 0.47
559 0.39
560 0.32
561 0.3
562 0.27
563 0.28
564 0.22
565 0.24
566 0.28
567 0.32
568 0.32
569 0.35
570 0.36
571 0.29
572 0.29
573 0.29
574 0.25
575 0.2
576 0.19
577 0.17
578 0.15
579 0.15
580 0.14
581 0.12
582 0.12
583 0.12
584 0.12
585 0.11
586 0.1
587 0.09
588 0.1
589 0.1
590 0.08
591 0.07
592 0.07
593 0.07
594 0.06
595 0.06
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.05
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.07
604 0.07
605 0.09
606 0.12
607 0.12
608 0.12
609 0.13
610 0.15
611 0.14
612 0.15
613 0.14
614 0.11
615 0.12
616 0.15
617 0.14
618 0.12
619 0.12
620 0.11
621 0.12
622 0.15
623 0.15
624 0.16
625 0.21
626 0.22
627 0.23
628 0.23
629 0.21
630 0.21
631 0.24
632 0.2
633 0.16
634 0.16
635 0.14
636 0.16
637 0.18
638 0.18
639 0.16
640 0.22
641 0.26
642 0.31
643 0.34
644 0.36
645 0.42
646 0.4
647 0.42
648 0.41
649 0.36
650 0.32
651 0.28
652 0.27
653 0.19
654 0.18
655 0.14
656 0.1
657 0.09
658 0.09
659 0.08
660 0.04
661 0.05
662 0.05
663 0.05
664 0.05
665 0.06
666 0.05
667 0.07
668 0.09
669 0.09
670 0.12
671 0.12
672 0.13
673 0.16
674 0.22
675 0.27
676 0.33
677 0.42
678 0.48
679 0.5
680 0.51
681 0.5
682 0.5
683 0.44
684 0.4
685 0.31
686 0.23
687 0.26
688 0.25
689 0.22
690 0.16
691 0.15
692 0.11
693 0.11
694 0.09
695 0.05
696 0.07
697 0.08
698 0.08
699 0.08
700 0.1
701 0.1
702 0.1
703 0.12
704 0.1
705 0.09
706 0.1
707 0.12
708 0.12
709 0.17
710 0.18
711 0.18
712 0.22
713 0.24
714 0.25
715 0.25
716 0.25
717 0.24
718 0.31
719 0.31
720 0.3
721 0.3
722 0.3
723 0.29
724 0.27
725 0.23
726 0.16
727 0.18
728 0.2
729 0.27
730 0.33
731 0.42
732 0.52
733 0.61
734 0.71
735 0.79
736 0.84
737 0.82
738 0.82
739 0.78
740 0.74
741 0.71
742 0.64
743 0.56
744 0.53
745 0.49
746 0.46
747 0.44
748 0.42
749 0.35
750 0.31
751 0.29
752 0.24
753 0.24
754 0.25
755 0.21
756 0.17
757 0.17
758 0.16
759 0.17
760 0.15
761 0.11
762 0.08
763 0.08
764 0.09
765 0.11
766 0.11
767 0.11
768 0.12
769 0.2
770 0.23
771 0.23
772 0.22
773 0.24
774 0.23
775 0.22
776 0.21
777 0.13
778 0.08
779 0.07
780 0.06
781 0.03
782 0.02
783 0.02
784 0.02
785 0.02
786 0.02
787 0.01
788 0.01
789 0.01
790 0.01
791 0.01
792 0.01
793 0.01
794 0.01
795 0.01
796 0.02
797 0.02
798 0.02
799 0.02
800 0.02
801 0.03
802 0.03
803 0.03
804 0.03
805 0.04
806 0.05
807 0.05
808 0.06
809 0.06
810 0.06
811 0.07
812 0.08
813 0.09
814 0.09
815 0.09
816 0.09
817 0.1
818 0.11
819 0.11
820 0.14
821 0.16
822 0.17
823 0.18
824 0.2
825 0.21
826 0.22
827 0.21
828 0.19
829 0.22
830 0.21
831 0.21
832 0.19
833 0.17
834 0.15
835 0.15
836 0.15
837 0.09
838 0.08
839 0.08
840 0.08
841 0.09
842 0.09
843 0.09
844 0.12
845 0.12
846 0.16
847 0.21
848 0.27
849 0.34
850 0.41
851 0.49
852 0.56
853 0.65
854 0.66
855 0.69
856 0.69
857 0.69
858 0.71
859 0.68
860 0.61
861 0.6
862 0.62
863 0.56
864 0.53
865 0.46
866 0.43
867 0.43
868 0.45
869 0.36
870 0.3
871 0.31
872 0.28
873 0.28
874 0.25
875 0.22
876 0.22
877 0.31
878 0.36
879 0.38
880 0.47
881 0.51
882 0.5
883 0.56
884 0.59
885 0.57
886 0.6
887 0.58
888 0.52
889 0.49
890 0.48
891 0.42
892 0.35
893 0.28
894 0.2
895 0.19
896 0.18
897 0.18
898 0.19
899 0.17
900 0.18
901 0.21
902 0.23
903 0.22
904 0.21
905 0.2
906 0.19
907 0.23
908 0.21
909 0.19
910 0.19
911 0.25
912 0.28
913 0.28
914 0.28
915 0.28
916 0.29
917 0.3
918 0.28
919 0.25
920 0.25
921 0.29
922 0.27
923 0.23
924 0.23
925 0.22
926 0.22
927 0.18
928 0.19
929 0.21
930 0.24
931 0.24
932 0.22
933 0.26
934 0.28
935 0.34
936 0.32
937 0.26
938 0.27
939 0.28
940 0.29
941 0.29
942 0.31
943 0.3
944 0.32
945 0.34
946 0.32
947 0.33
948 0.39
949 0.41
950 0.45
951 0.44
952 0.45
953 0.43
954 0.47
955 0.47
956 0.48
957 0.45
958 0.43
959 0.46
960 0.45
961 0.46
962 0.46
963 0.45
964 0.42
965 0.43
966 0.37
967 0.31
968 0.37
969 0.42
970 0.41
971 0.45
972 0.42
973 0.43
974 0.45
975 0.44
976 0.42
977 0.37
978 0.33
979 0.29
980 0.27
981 0.25
982 0.24
983 0.26
984 0.2
985 0.17
986 0.18
987 0.21
988 0.25
989 0.28
990 0.33
991 0.35
992 0.42
993 0.51
994 0.59
995 0.61
996 0.59
997 0.62
998 0.65
999 0.69
1000 0.68
1001 0.59
1002 0.53
1003 0.51
1004 0.48
1005 0.46
1006 0.41