Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

U5HI28

Protein Details
Accession U5HI28    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-60HAGHRFVDKGGRKRPRRADAQSSHBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
46-53GGRKRPRR
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 7.5, plas 6, mito 4, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR041320  CxC1  
Pfam View protein in Pfam  
PF18802  CxC1  
Amino Acid Sequences MPTSRLKPRFPRVKPSDYLDHPDCPDQYADVPLVHVHAGHRFVDKGGRKRPRRADAQSSHTASATSGVNTTTNQPVPVTSSSVSTSVLVNDLDFAQGDFADGQSTGPWEHQDYEYEDQGGMDSSDHFRYSPDPDLQRPTHQELAEAVLPPPRTSDSPLPPKRDGYLKFISAEAKLRESQRASMIGQYLACRTRTHGRLRPLVSEDDEDDSAAPSPCNCQHEHAITRKVVLYDVIAFYPLALTFCASEPPCVADVVRLAQLGFIASTAARPESAFSFRLIEFAEACWKVSPHAVTGYADGLELYFMRCGWGTKHNYRHPYDKELRKQLQRAIDEFRAVQILESDTGDVMLGTVEALANKCPACFGPKRLNRSHHELQLDYMIALDGNFQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.77
2 0.74
3 0.73
4 0.67
5 0.7
6 0.62
7 0.59
8 0.53
9 0.53
10 0.46
11 0.39
12 0.34
13 0.28
14 0.25
15 0.23
16 0.22
17 0.17
18 0.17
19 0.15
20 0.16
21 0.14
22 0.13
23 0.12
24 0.15
25 0.17
26 0.18
27 0.2
28 0.19
29 0.2
30 0.28
31 0.35
32 0.4
33 0.48
34 0.57
35 0.62
36 0.72
37 0.81
38 0.81
39 0.82
40 0.82
41 0.83
42 0.8
43 0.8
44 0.79
45 0.72
46 0.64
47 0.54
48 0.46
49 0.35
50 0.3
51 0.23
52 0.15
53 0.12
54 0.11
55 0.12
56 0.13
57 0.16
58 0.18
59 0.18
60 0.18
61 0.18
62 0.17
63 0.21
64 0.22
65 0.22
66 0.17
67 0.18
68 0.18
69 0.19
70 0.19
71 0.15
72 0.14
73 0.11
74 0.12
75 0.1
76 0.09
77 0.09
78 0.08
79 0.08
80 0.07
81 0.07
82 0.06
83 0.05
84 0.06
85 0.05
86 0.05
87 0.06
88 0.06
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.07
93 0.08
94 0.09
95 0.1
96 0.12
97 0.13
98 0.15
99 0.19
100 0.22
101 0.22
102 0.21
103 0.19
104 0.17
105 0.16
106 0.14
107 0.09
108 0.06
109 0.07
110 0.08
111 0.1
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.13
116 0.16
117 0.2
118 0.24
119 0.26
120 0.29
121 0.36
122 0.37
123 0.4
124 0.41
125 0.41
126 0.4
127 0.37
128 0.35
129 0.28
130 0.3
131 0.26
132 0.22
133 0.17
134 0.15
135 0.15
136 0.14
137 0.15
138 0.13
139 0.12
140 0.16
141 0.23
142 0.28
143 0.39
144 0.45
145 0.5
146 0.5
147 0.5
148 0.47
149 0.48
150 0.42
151 0.38
152 0.36
153 0.32
154 0.31
155 0.3
156 0.3
157 0.23
158 0.25
159 0.19
160 0.17
161 0.18
162 0.19
163 0.22
164 0.22
165 0.22
166 0.2
167 0.21
168 0.2
169 0.19
170 0.18
171 0.15
172 0.15
173 0.14
174 0.14
175 0.13
176 0.13
177 0.12
178 0.14
179 0.2
180 0.25
181 0.33
182 0.37
183 0.41
184 0.47
185 0.49
186 0.49
187 0.44
188 0.4
189 0.33
190 0.28
191 0.24
192 0.19
193 0.17
194 0.14
195 0.11
196 0.1
197 0.1
198 0.09
199 0.08
200 0.06
201 0.08
202 0.12
203 0.14
204 0.15
205 0.16
206 0.2
207 0.25
208 0.3
209 0.33
210 0.35
211 0.32
212 0.33
213 0.31
214 0.28
215 0.23
216 0.18
217 0.13
218 0.1
219 0.11
220 0.09
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.1
232 0.1
233 0.11
234 0.11
235 0.13
236 0.13
237 0.12
238 0.12
239 0.09
240 0.1
241 0.11
242 0.12
243 0.1
244 0.09
245 0.09
246 0.09
247 0.08
248 0.07
249 0.05
250 0.04
251 0.04
252 0.05
253 0.05
254 0.06
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.1
259 0.13
260 0.13
261 0.14
262 0.16
263 0.16
264 0.18
265 0.17
266 0.15
267 0.13
268 0.13
269 0.18
270 0.16
271 0.17
272 0.16
273 0.16
274 0.16
275 0.19
276 0.19
277 0.14
278 0.16
279 0.17
280 0.17
281 0.18
282 0.18
283 0.14
284 0.13
285 0.11
286 0.08
287 0.07
288 0.06
289 0.06
290 0.05
291 0.05
292 0.06
293 0.07
294 0.08
295 0.11
296 0.2
297 0.27
298 0.36
299 0.46
300 0.53
301 0.61
302 0.65
303 0.71
304 0.67
305 0.69
306 0.7
307 0.71
308 0.72
309 0.75
310 0.79
311 0.78
312 0.78
313 0.74
314 0.73
315 0.67
316 0.61
317 0.58
318 0.52
319 0.46
320 0.41
321 0.36
322 0.29
323 0.24
324 0.2
325 0.15
326 0.14
327 0.13
328 0.13
329 0.12
330 0.11
331 0.11
332 0.1
333 0.08
334 0.06
335 0.05
336 0.04
337 0.03
338 0.04
339 0.04
340 0.06
341 0.07
342 0.08
343 0.11
344 0.11
345 0.11
346 0.13
347 0.14
348 0.2
349 0.25
350 0.32
351 0.4
352 0.47
353 0.56
354 0.64
355 0.71
356 0.7
357 0.74
358 0.75
359 0.71
360 0.69
361 0.61
362 0.55
363 0.51
364 0.45
365 0.35
366 0.27
367 0.19
368 0.14