FuNGI

U5H8G6

Protein Details

Accession

U5H8G6

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
510-530	LKRLQAAKKLRDKRRKDEELS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
511-525	KRLQAAKKLRDKRRK

Subcellular Location(s)

nucl 21, extr 3, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010997 HRDC-like_sf IPR039780 Mot2 IPR039515 NOT4_mRING-HC-C4C4 IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR006590 RNA_pol_Rpb4/RPC9_core IPR005574 Rpb4/RPC9 IPR038324 Rpb4/RPC9_sf IPR003954 RRM_dom_euk IPR001841 Znf_RING IPR013083 Znf_RING/FYVE/PHD
Gene Ontology	GO:0030014 C:CCR4-NOT complex GO:0000428 C:DNA-directed RNA polymerase complex GO:0005634 C:nucleus GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0000166 F:nucleotide binding GO:0004842 F:ubiquitin-protein transferase activity GO:0006352 P:DNA-templated transcription initiation
Pfam	View protein in Pfam PF03874 RNA_pol_Rpb4 PF14570 zf-RING_4
PROSITE	View protein in PROSITE PS50089 ZF_RING_2
CDD	cd16618 mRING-HC-C4C4_CNOT4

Amino Acid Sequences

MQTIDPRAGLLCNHEVLTILRQQRDDRANQIKKLTQQKAKRVAALKRKAYPNEEEDEERDRLQPQDLHTVTFETIKFLQDPTHPHLRQTTSSVQQLLDKLEQLDLTKAERLQIVNLAPTKLIHFVLSVDEFEERFPGQEERDHLLAIVRDHLSAEPAIEPISRSNDHHPPSTTNNKVSSDARGTFLSSSRKHTTTHVVEEEYEDDMALDEATRDELDAANELMDEGMGEGGMEDVARPPTLSRLTFSRRKDPLDGGPSSSSSSSSSPSTTTNGAGGTLSSSAHHGSQTQPRPAWNTNTRASGTGTGGGLGGGAGHSAPPAVSIAGGLATSQFPPPSSTLQPTTRHEHRINSHHQHHHHHHHHSPNSPHHSSHRGPLYSRENDDDGSTTTTTTTTTSNNPNNPAAAQGHSNDRHHHSSSSQHHYDKVASASTAVDRVMAMLDGFEDDMDCPLCLEEMDLSDLNFKPCPCGYQICRFCYHHIKENLNNRCPACRTPYDDKTVEFKAVKPEELKRLQAAKKLRDKRRKDEELSVKNRANVRVRQRAQVHVQGMTTKIANEDTLAYLKGSEQFGQYGKVVKLFMSKRTTPVAPSQSSTAQHAHFQPVNVYVSYRTPAEASACIAAIDGTTTSDGHKLKAIWGTTRYCPTYLKGLKCNNDSCMQAHEPGEEIEGAGPASREEIYAYHAVSDSEQPRKKDSLGTIRTNTVDAKLPATASWASKNGAPIQPIIPNPSFSLQQTTSSTSTPLAAKPSTPSRQNSSAATTSLTPKPPTTHPLPSKPVLARPNSIDTTRKEAAVSSSPAAAVEAPFSILPTSSTPATTASISADATPQLVDPIASSSSTSAPILSPGTTQENGHAPNGMPTAQTVTPPRPRSPSPVPHVFPELEFGDGGFSFSFDLDTKGKGRAFSDGVFDDRGGALHQQQLQQQQQHLWQQQKRVASPFGFQSEWEAGVRRREPLAFDTTNMFTSIPSYMGSFDPFADTSNSFEVAPSSHSQHHHPHDELRSETPSPTPSFDDQSRRGSRFGFARRSSSNFGVKNGELASALARSAFAETGGRHSPASFTPPPPGIGMPMHSGGLAAQQPTRSLSSSSSLGFGFRSHLDGSQHRATIHNGELWHTSASSAFPPGVVRSLATATSSPSSLSSPQLSPRVRAGMIYGGNNGTGATSTPPGVGVGGMNIGSVTANAALPPGISLNRSSAIAAASFPLPPPAPRTAHQQQQQQQQMQQQQQQQQQQKAAFLAQLAAGGGGGGGGGNNDGHKSTPSFSDPAILNARLAANAPLPPPPNAPYGTNASTGKYLDNGGGLFGSAPGGGGGSTLFAPPGVTRAQAQPRRA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.2
2	0.2
3	0.21
4	0.24
5	0.26
6	0.28
7	0.3
8	0.32
9	0.35
10	0.43
11	0.48
12	0.49
13	0.51
14	0.56
15	0.6
16	0.62
17	0.67
18	0.64
19	0.65
20	0.71
21	0.71
22	0.69
23	0.71
24	0.76
25	0.8
26	0.79
27	0.79
28	0.76
29	0.76
30	0.78
31	0.78
32	0.76
33	0.74
34	0.78
35	0.77
36	0.74
37	0.71
38	0.66
39	0.62
40	0.58
41	0.53
42	0.48
43	0.47
44	0.44
45	0.38
46	0.35
47	0.31
48	0.29
49	0.31
50	0.31
51	0.29
52	0.37
53	0.36
54	0.36
55	0.35
56	0.35
57	0.3
58	0.31
59	0.27
60	0.21
61	0.22
62	0.22
63	0.22
64	0.2
65	0.24
66	0.23
67	0.3
68	0.32
69	0.42
70	0.4
71	0.42
72	0.48
73	0.49
74	0.48
75	0.48
76	0.49
77	0.44
78	0.49
79	0.48
80	0.41
81	0.4
82	0.39
83	0.37
84	0.31
85	0.27
86	0.24
87	0.23
88	0.23
89	0.21
90	0.21
91	0.18
92	0.19
93	0.21
94	0.2
95	0.21
96	0.23
97	0.22
98	0.22
99	0.25
100	0.24
101	0.26
102	0.28
103	0.27
104	0.24
105	0.24
106	0.23
107	0.21
108	0.21
109	0.15
110	0.13
111	0.13
112	0.17
113	0.17
114	0.16
115	0.14
116	0.15
117	0.14
118	0.14
119	0.16
120	0.12
121	0.11
122	0.13
123	0.15
124	0.16
125	0.2
126	0.24
127	0.27
128	0.28
129	0.27
130	0.24
131	0.25
132	0.25
133	0.22
134	0.22
135	0.18
136	0.17
137	0.18
138	0.18
139	0.17
140	0.15
141	0.15
142	0.11
143	0.1
144	0.11
145	0.11
146	0.12
147	0.13
148	0.18
149	0.19
150	0.22
151	0.28
152	0.36
153	0.39
154	0.43
155	0.43
156	0.42
157	0.48
158	0.55
159	0.54
160	0.51
161	0.52
162	0.5
163	0.51
164	0.48
165	0.46
166	0.43
167	0.38
168	0.36
169	0.31
170	0.3
171	0.28
172	0.32
173	0.34
174	0.29
175	0.35
176	0.38
177	0.39
178	0.39
179	0.42
180	0.46
181	0.44
182	0.49
183	0.45
184	0.41
185	0.4
186	0.4
187	0.38
188	0.29
189	0.23
190	0.15
191	0.11
192	0.1
193	0.09
194	0.07
195	0.06
196	0.05
197	0.05
198	0.06
199	0.06
200	0.06
201	0.06
202	0.07
203	0.08
204	0.09
205	0.09
206	0.08
207	0.08
208	0.08
209	0.07
210	0.06
211	0.05
212	0.04
213	0.03
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.05
222	0.07
223	0.07
224	0.07
225	0.08
226	0.13
227	0.18
228	0.19
229	0.19
230	0.26
231	0.34
232	0.41
233	0.46
234	0.51
235	0.52
236	0.55
237	0.57
238	0.55
239	0.56
240	0.55
241	0.51
242	0.45
243	0.42
244	0.38
245	0.35
246	0.31
247	0.23
248	0.18
249	0.18
250	0.16
251	0.16
252	0.16
253	0.16
254	0.17
255	0.19
256	0.18
257	0.18
258	0.17
259	0.15
260	0.14
261	0.13
262	0.11
263	0.09
264	0.08
265	0.08
266	0.07
267	0.08
268	0.09
269	0.1
270	0.1
271	0.1
272	0.15
273	0.25
274	0.31
275	0.36
276	0.37
277	0.39
278	0.45
279	0.48
280	0.52
281	0.49
282	0.48
283	0.46
284	0.49
285	0.47
286	0.42
287	0.4
288	0.34
289	0.28
290	0.24
291	0.2
292	0.15
293	0.14
294	0.12
295	0.1
296	0.07
297	0.05
298	0.03
299	0.03
300	0.03
301	0.03
302	0.03
303	0.03
304	0.03
305	0.04
306	0.04
307	0.04
308	0.04
309	0.04
310	0.04
311	0.05
312	0.05
313	0.04
314	0.05
315	0.05
316	0.06
317	0.07
318	0.08
319	0.08
320	0.1
321	0.13
322	0.17
323	0.19
324	0.23
325	0.28
326	0.34
327	0.39
328	0.41
329	0.47
330	0.47
331	0.52
332	0.5
333	0.52
334	0.53
335	0.55
336	0.61
337	0.62
338	0.66
339	0.65
340	0.68
341	0.69
342	0.71
343	0.73
344	0.72
345	0.69
346	0.68
347	0.69
348	0.7
349	0.68
350	0.67
351	0.66
352	0.66
353	0.61
354	0.56
355	0.52
356	0.53
357	0.48
358	0.47
359	0.46
360	0.4
361	0.39
362	0.44
363	0.48
364	0.45
365	0.46
366	0.42
367	0.35
368	0.34
369	0.34
370	0.27
371	0.2
372	0.19
373	0.16
374	0.13
375	0.12
376	0.12
377	0.11
378	0.11
379	0.11
380	0.1
381	0.15
382	0.23
383	0.29
384	0.32
385	0.35
386	0.35
387	0.34
388	0.32
389	0.3
390	0.24
391	0.19
392	0.17
393	0.15
394	0.22
395	0.25
396	0.26
397	0.27
398	0.31
399	0.35
400	0.34
401	0.34
402	0.29
403	0.34
404	0.41
405	0.45
406	0.45
407	0.41
408	0.42
409	0.42
410	0.41
411	0.34
412	0.28
413	0.2
414	0.15
415	0.14
416	0.14
417	0.12
418	0.12
419	0.09
420	0.08
421	0.07
422	0.07
423	0.06
424	0.05
425	0.05
426	0.04
427	0.04
428	0.04
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.04
433	0.05
434	0.05
435	0.05
436	0.05
437	0.05
438	0.05
439	0.05
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.08
444	0.08
445	0.08
446	0.11
447	0.12
448	0.13
449	0.14
450	0.14
451	0.14
452	0.14
453	0.16
454	0.16
455	0.22
456	0.25
457	0.34
458	0.41
459	0.41
460	0.46
461	0.45
462	0.47
463	0.51
464	0.5
465	0.48
466	0.48
467	0.5
468	0.52
469	0.6
470	0.64
471	0.58
472	0.59
473	0.51
474	0.47
475	0.45
476	0.41
477	0.38
478	0.33
479	0.37
480	0.41
481	0.45
482	0.48
483	0.46
484	0.45
485	0.43
486	0.4
487	0.37
488	0.29
489	0.26
490	0.28
491	0.28
492	0.29
493	0.28
494	0.31
495	0.35
496	0.37
497	0.37
498	0.32
499	0.38
500	0.39
501	0.42
502	0.45
503	0.45
504	0.52
505	0.61
506	0.67
507	0.7
508	0.75
509	0.78
510	0.82
511	0.82
512	0.76
513	0.77
514	0.77
515	0.76
516	0.75
517	0.71
518	0.62
519	0.58
520	0.56
521	0.52
522	0.47
523	0.44
524	0.47
525	0.51
526	0.51
527	0.55
528	0.55
529	0.54
530	0.53
531	0.52
532	0.45
533	0.35
534	0.34
535	0.27
536	0.25
537	0.21
538	0.17
539	0.1
540	0.09
541	0.09
542	0.08
543	0.08
544	0.07
545	0.07
546	0.08
547	0.08
548	0.07
549	0.07
550	0.08
551	0.1
552	0.1
553	0.1
554	0.1
555	0.11
556	0.12
557	0.13
558	0.13
559	0.14
560	0.14
561	0.15
562	0.14
563	0.13
564	0.2
565	0.2
566	0.26
567	0.27
568	0.28
569	0.29
570	0.32
571	0.32
572	0.27
573	0.32
574	0.32
575	0.27
576	0.28
577	0.27
578	0.27
579	0.27
580	0.28
581	0.24
582	0.18
583	0.2
584	0.2
585	0.22
586	0.2
587	0.19
588	0.18
589	0.17
590	0.18
591	0.15
592	0.14
593	0.11
594	0.11
595	0.12
596	0.11
597	0.09
598	0.08
599	0.09
600	0.1
601	0.09
602	0.09
603	0.08
604	0.08
605	0.07
606	0.07
607	0.06
608	0.05
609	0.04
610	0.03
611	0.03
612	0.04
613	0.04
614	0.05
615	0.09
616	0.1
617	0.1
618	0.12
619	0.12
620	0.14
621	0.17
622	0.18
623	0.16
624	0.19
625	0.22
626	0.22
627	0.25
628	0.24
629	0.22
630	0.22
631	0.21
632	0.27
633	0.29
634	0.31
635	0.35
636	0.39
637	0.42
638	0.46
639	0.46
640	0.38
641	0.35
642	0.33
643	0.26
644	0.25
645	0.22
646	0.2
647	0.19
648	0.16
649	0.15
650	0.13
651	0.13
652	0.08
653	0.07
654	0.05
655	0.05
656	0.05
657	0.04
658	0.04
659	0.03
660	0.04
661	0.04
662	0.04
663	0.05
664	0.05
665	0.08
666	0.09
667	0.09
668	0.08
669	0.08
670	0.08
671	0.09
672	0.13
673	0.13
674	0.21
675	0.24
676	0.25
677	0.28
678	0.29
679	0.29
680	0.29
681	0.31
682	0.33
683	0.36
684	0.4
685	0.38
686	0.38
687	0.38
688	0.35
689	0.3
690	0.21
691	0.18
692	0.14
693	0.13
694	0.12
695	0.11
696	0.1
697	0.12
698	0.12
699	0.1
700	0.11
701	0.12
702	0.12
703	0.13
704	0.15
705	0.16
706	0.17
707	0.17
708	0.16
709	0.16
710	0.19
711	0.18
712	0.21
713	0.18
714	0.17
715	0.17
716	0.18
717	0.17
718	0.14
719	0.19
720	0.15
721	0.17
722	0.18
723	0.2
724	0.2
725	0.19
726	0.2
727	0.15
728	0.16
729	0.14
730	0.14
731	0.13
732	0.12
733	0.13
734	0.15
735	0.22
736	0.24
737	0.28
738	0.3
739	0.32
740	0.37
741	0.38
742	0.36
743	0.34
744	0.31
745	0.27
746	0.25
747	0.2
748	0.19
749	0.21
750	0.22
751	0.19
752	0.18
753	0.21
754	0.22
755	0.26
756	0.28
757	0.33
758	0.37
759	0.43
760	0.46
761	0.45
762	0.48
763	0.44
764	0.45
765	0.41
766	0.39
767	0.34
768	0.32
769	0.35
770	0.32
771	0.32
772	0.3
773	0.27
774	0.32
775	0.3
776	0.28
777	0.23
778	0.21
779	0.23
780	0.22
781	0.22
782	0.15
783	0.14
784	0.14
785	0.14
786	0.13
787	0.1
788	0.07
789	0.05
790	0.05
791	0.05
792	0.05
793	0.05
794	0.05
795	0.05
796	0.06
797	0.07
798	0.09
799	0.08
800	0.09
801	0.09
802	0.1
803	0.12
804	0.11
805	0.1
806	0.09
807	0.09
808	0.09
809	0.09
810	0.08
811	0.07
812	0.07
813	0.07
814	0.06
815	0.05
816	0.05
817	0.05
818	0.04
819	0.06
820	0.06
821	0.06
822	0.06
823	0.07
824	0.08
825	0.09
826	0.09
827	0.08
828	0.07
829	0.09
830	0.09
831	0.09
832	0.08
833	0.09
834	0.13
835	0.13
836	0.13
837	0.14
838	0.17
839	0.18
840	0.18
841	0.17
842	0.13
843	0.15
844	0.16
845	0.14
846	0.11
847	0.09
848	0.13
849	0.12
850	0.15
851	0.15
852	0.21
853	0.28
854	0.32
855	0.34
856	0.36
857	0.37
858	0.43
859	0.49
860	0.52
861	0.51
862	0.56
863	0.55
864	0.52
865	0.53
866	0.46
867	0.37
868	0.32
869	0.25
870	0.16
871	0.15
872	0.12
873	0.1
874	0.09
875	0.1
876	0.06
877	0.06
878	0.05
879	0.06
880	0.07
881	0.06
882	0.09
883	0.09
884	0.11
885	0.13
886	0.17
887	0.18
888	0.19
889	0.19
890	0.2
891	0.21
892	0.2
893	0.22
894	0.19
895	0.2
896	0.19
897	0.18
898	0.15
899	0.12
900	0.12
901	0.09
902	0.09
903	0.09
904	0.13
905	0.15
906	0.17
907	0.21
908	0.27
909	0.31
910	0.33
911	0.33
912	0.32
913	0.34
914	0.39
915	0.41
916	0.43
917	0.42
918	0.45
919	0.47
920	0.49
921	0.47
922	0.43
923	0.42
924	0.35
925	0.34
926	0.31
927	0.31
928	0.26
929	0.24
930	0.24
931	0.21
932	0.2
933	0.19
934	0.18
935	0.16
936	0.23
937	0.24
938	0.22
939	0.22
940	0.22
941	0.24
942	0.25
943	0.31
944	0.25
945	0.25
946	0.26
947	0.26
948	0.26
949	0.24
950	0.2
951	0.12
952	0.13
953	0.12
954	0.09
955	0.08
956	0.08
957	0.09
958	0.1
959	0.11
960	0.1
961	0.1
962	0.11
963	0.11
964	0.12
965	0.13
966	0.13
967	0.14
968	0.15
969	0.15
970	0.13
971	0.13
972	0.12
973	0.1
974	0.13
975	0.13
976	0.15
977	0.19
978	0.21
979	0.25
980	0.33
981	0.39
982	0.42
983	0.42
984	0.45
985	0.46
986	0.48
987	0.46
988	0.41
989	0.39
990	0.34
991	0.33
992	0.29
993	0.27
994	0.25
995	0.24
996	0.25
997	0.24
998	0.28
999	0.32
1000	0.37
1001	0.38
1002	0.46
1003	0.5
1004	0.48
1005	0.47
1006	0.43
1007	0.42
1008	0.43
1009	0.47
1010	0.47
1011	0.43
1012	0.46
1013	0.48
1014	0.53
1015	0.54
1016	0.5
1017	0.5
1018	0.42
1019	0.42
1020	0.41
1021	0.37
1022	0.34
1023	0.29
1024	0.25
1025	0.17
1026	0.16
1027	0.14
1028	0.1
1029	0.1
1030	0.07
1031	0.07
1032	0.07
1033	0.07
1034	0.07
1035	0.07
1036	0.09
1037	0.09
1038	0.14
1039	0.17
1040	0.17
1041	0.16
1042	0.17
1043	0.18
1044	0.17
1045	0.25
1046	0.24
1047	0.23
1048	0.27
1049	0.29
1050	0.3
1051	0.29
1052	0.28
1053	0.23
1054	0.2
1055	0.2
1056	0.18
1057	0.18
1058	0.17
1059	0.15
1060	0.14
1061	0.11
1062	0.14
1063	0.13
1064	0.12
1065	0.12
1066	0.13
1067	0.14
1068	0.16
1069	0.18
1070	0.16
1071	0.16
1072	0.17
1073	0.19
1074	0.2
1075	0.2
1076	0.19
1077	0.17
1078	0.17
1079	0.16
1080	0.14
1081	0.13
1082	0.12
1083	0.14
1084	0.13
1085	0.16
1086	0.2
1087	0.23
1088	0.29
1089	0.31
1090	0.32
1091	0.3
1092	0.31
1093	0.31
1094	0.31
1095	0.3
1096	0.27
1097	0.22
1098	0.23
1099	0.24
1100	0.23
1101	0.22
1102	0.17
1103	0.15
1104	0.12
1105	0.13
1106	0.12
1107	0.12
1108	0.1
1109	0.1
1110	0.11
1111	0.12
1112	0.14
1113	0.13
1114	0.12
1115	0.12
1116	0.14
1117	0.13
1118	0.14
1119	0.13
1120	0.13
1121	0.15
1122	0.15
1123	0.13
1124	0.13
1125	0.15
1126	0.15
1127	0.18
1128	0.19
1129	0.2
1130	0.25
1131	0.34
1132	0.34
1133	0.34
1134	0.37
1135	0.38
1136	0.34
1137	0.32
1138	0.29
1139	0.27
1140	0.28
1141	0.26
1142	0.24
1143	0.2
1144	0.2
1145	0.19
1146	0.17
1147	0.11
1148	0.08
1149	0.08
1150	0.08
1151	0.09
1152	0.1
1153	0.1
1154	0.1
1155	0.1
1156	0.1
1157	0.09
1158	0.07
1159	0.07
1160	0.07
1161	0.07
1162	0.06
1163	0.06
1164	0.06
1165	0.05
1166	0.05
1167	0.05
1168	0.05
1169	0.05
1170	0.05
1171	0.06
1172	0.06
1173	0.06
1174	0.07
1175	0.08
1176	0.08
1177	0.09
1178	0.11
1179	0.13
1180	0.15
1181	0.15
1182	0.15
1183	0.14
1184	0.14
1185	0.13
1186	0.12
1187	0.11
1188	0.11
1189	0.11
1190	0.11
1191	0.13
1192	0.13
1193	0.14
1194	0.19
1195	0.24
1196	0.27
1197	0.29
1198	0.38
1199	0.42
1200	0.5
1201	0.56
1202	0.61
1203	0.62
1204	0.68
1205	0.75
1206	0.71
1207	0.68
1208	0.67
1209	0.68
1210	0.66
1211	0.66
1212	0.63
1213	0.63
1214	0.65
1215	0.7
1216	0.7
1217	0.68
1218	0.67
1219	0.62
1220	0.57
1221	0.51
1222	0.45
1223	0.36
1224	0.28
1225	0.23
1226	0.16
1227	0.14
1228	0.12
1229	0.1
1230	0.07
1231	0.06
1232	0.05
1233	0.04
1234	0.03
1235	0.02
1236	0.02
1237	0.03
1238	0.04
1239	0.04
1240	0.05
1241	0.07
1242	0.08
1243	0.09
1244	0.12
1245	0.14
1246	0.16
1247	0.2
1248	0.23
1249	0.25
1250	0.24
1251	0.29
1252	0.27
1253	0.3
1254	0.34
1255	0.29
1256	0.25
1257	0.25
1258	0.26
1259	0.2
1260	0.21
1261	0.17
1262	0.14
1263	0.16
1264	0.17
1265	0.21
1266	0.22
1267	0.24
1268	0.27
1269	0.28
1270	0.3
1271	0.3
1272	0.31
1273	0.3
1274	0.35
1275	0.35
1276	0.36
1277	0.34
1278	0.32
1279	0.32
1280	0.31
1281	0.28
1282	0.22
1283	0.21
1284	0.16
1285	0.17
1286	0.15
1287	0.13
1288	0.12
1289	0.11
1290	0.09
1291	0.08
1292	0.08
1293	0.06
1294	0.06
1295	0.05
1296	0.05
1297	0.05
1298	0.05
1299	0.05
1300	0.05
1301	0.06
1302	0.06
1303	0.06
1304	0.06
1305	0.08
1306	0.08
1307	0.11
1308	0.11
1309	0.12
1310	0.15
1311	0.23
1312	0.34

U5H8G6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer